SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001814_2.0
Identity
TranscriptSelenocysteine synthase (SecS)
SpeciesOreochromis niloticus (Tilapia)
Transcript IDSPT00001814
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001719_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00001814_2.0 # Transcript # Selenocysteine synthase (SecS) # Tilapia (Oreochromis niloticus) # Full length # Forward
ATGAACAGCGACAACTTCAACCTGAGCGAGAAGATTGTGTCACCTTCCTACATCCGGCAG
GGATCGCAGGCTCGCCGTGGCCATGAGCAACTCATCAGACAGTTACTGGAACAAGTACGC
TCAAGGCTTTCTTTTGTTTCCTTATACCACTGCAGTGAAGACACTTCCTCTCTCATGTTG
TGTGTTGCAGGGAAAGTGTCCTGAGGAAGGATGGAGCGAGAGCACTGTTGAGCTCTTCCT
CAACGAGCTAGCTGTGATGGACAGCAACAACTTCCTGGGTAACTGTGGAGTAGGAGAGAG
AGAAGGCCGGGTGGCGTCCAGCCTTGTGGCAAGACGACATTACAGGTTCAAGTTTGCCTG
CCAGGCCTTATCCGTTATTAGCGATTCACTATTAAACCCCGACTGATGGATTGTGAGGCA
GATAAAAAGCAAGCAGATCTTTTGTTGTTGTTGTTTTTTCTCTACAACAAATATTTTGTA
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GTCTATCTGAAGCTCCTTCAGCAGCAAGAACCTCCTTGGAATTTGTACAGTGATAAAGAA
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GCCACCTTCAGTTTGTGGGCCTCTGCCTTCAGTTTAGGCTTAAGTAACTGAAAAGCTGCT
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GTACTCGATTCCTTTGGCGGCTATGCAGTACAGTACTGTATGCTACTCTGCCTTACATGT
TGGTTTCATTGGTCCCATGATTTTCTCCATGTCTGTGCAGGCTCTGTTAGATGCTTTCTT
GTAAAGTCTGTTCTTCCCGTCCTTGGGTGTAACCAGCAGTTTGCACATCACTGTAAACCC
TCCGTATTTCTGTTCATGAATGCATCTCTTGATTTTGGACTTTGTCAATGATGTGCCTGA
CTCCTTGAGTGTTTTTCATTTGACTAGAAGTTGTGAAGAGTTTTTTTCTTAGCTAAGAAA
AGAATTTGAAATCTTTCCTAATTATAGTCTGTGGTCTTTAAGGCCTTATGGTGTTGCTGG
GGTGATCAGTGCATGGCTTATTTCTAACAGTGTACCAGATTGTTGAATTAGCCACTTCTA
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GTTAACTAACATTCTGATTGTTGAAAATTCACGGTGGTGGTATATAGAGGCAAAACTACA
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TTATGGTGAGGGCATCACAAGTTTTAGCAAGTTGTAGAGATTTCTGCAGGTGATTCTTTG
TCCACTCTTAACTTGGTGTGATCCTAGAGAGAGTTGGAGGAGCTCTGCTACACACACTTC
AGACCTCATTTCCTTAACAGGGACACTTGATTCCAGGTTGCTTTTGGGGAAATGCCAACT
GAAATTGACTGTGTTTGATAAAGACATGAAAACTTTTTGTGTGTTATTACTTTAAAAAGA
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AATAGATTTTGTTGCAGTTTGTCTGTAACGAGGTAAAATCATCTATACTGATATACAGAT
AAGGACAAAATTATTAGCCCCCCTATGAAATGTAATTGGCCTTTTTAACAGAACAAGTGA
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CTTTGTAATGCTCACTGCTTGTAAAATCAAGGTAAAACTGAAAGTTTTCTTCCAATTTAC
ATACAGTATAAAAACGTCGGAGTTTGAGCTGTCACTTGAAAAAGCACCATTACAAAATCA
TAAGTTTAGAGAAAAGGATTTGTTGCAGGAGATGGATAATAATTTAGCTTATTTGTGCAA
AGTAACATGAGCACCCAATGCTGCGTTTAACTAAAGAAGGAAAAAAAGAAAATGCTTGCT
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AATTCTGTCCTCACCTGTGTCTGTGGGATTCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTTCAA
AGGCCTTGCACACAGATTTATTACACTGGGCTGTGAAATGTCAGCTTTGAGCTCGTCACG
GAGTTTAGGAAGTCGTTTAACGGCTCGTGTTGTGACATTCAGCTGTTTTGTCTAGGCTGA
TCCACGGCATCGGCCGGTCAGGTGACATCGCTGCTATTCAGCCTAAAGCTGCAGGATCCA
GTCTGCTTAACAAACTGACGAACTCGGTTGTCCTGGATGTCTTAAAGCTTGCAGGTGTGT
AGATCTTATCAGTTACACTAGTTTTTGTGGTACAGTAGATGTTTAATTTAGCCTTTTCCT
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TCATTATGCTTGAAAAAATATAAAAATCGGAGTCTTATTTTCAGTTGGTCTGCTGCTTGT
GCGTTACAGGTGTCCGGAGTGTGGCCAGCTGCTTCGTGGTACCCATGGCTACAGGGATGA
GTTTGACTCTCTGCTTCCTGACCCTTCGTCACAGGAGACCCAAAGCTCGCTACATCATTT
GGCCTCGCATTGACCAGAAGTCCTGTTTCAAGTCTATGATCACAGCAGGTGACGATATGA
CTCGTATCCAGTGTCCTGTCAAGCTTACATCCTGATCAGCGAGCACGTCTGTGTTTGAAG
ATATTGAAGGGGAATATTCAATCAGATTAATTATGAAAATGTTTCACTTTATTGCCATCT
TTAAATCGTTTGCCTGTTTTCTCAGGCTTTGAACCTGTGGTCGTGGAGAATGTGCTCGAG
GGTGATGAGCTGCGGACAGATTTGGAAGCAGTTGAACGCAAGATTGAAGAGCTTGGAGCT
GAAAATATCCTGTGTGTTCATTCAACGACTTCTTGCTTCGCCCCACGGGTCCCTGACAGG
TCTTGTAAGCTTTCATTCATGCCCTCAGGTTTTATTATGTTATGTTATGTTATGTATGTG
TTGATGTAGGCTGCCTGCAGGATTTCTTACTTTCAAAGGAAACATAATGTATGTTGCTTG
TTTTGGCTCACAGTGTGGGAATAAGGTATGCACCATTTCTAATATTGTTTGTTTTGGGGT
CTTGCAGGCTTGAGGAGCTGTCATGTCTCTGCAGCAAGCATGATATTCCCCACATAGTTA
ACAATGCATATGGCGTGCAGTCGTCCAAATGCATGCACCTCATTCAGCAGGTATCAACAC
TCTTCACTGCACAGTGCATGTAGCAAGTTGATCTGGAGCTCTCCTTTGAATGTTACGATG
TGATGCACTTTCACACTGGTTACAGATAAATATTTTCTTGGATTGTCTGTCATCAGGGCG
CCCGTGTGGGAAGAATCGACGCCTTTGTACAGAGCCTGGACAAAAACTTTATGGTTCCAG
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ACCCAGGTGAGTGTTAACGCTCACTGGTATGAAACAATAACCAGGTGGGCATGTGTACCC
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TTTTTGGTTTTTATGCACTGCCACATTTAAGTAAATTGGTAATAAAGCATGAAAATGTTT
GAACGATACAAAATGGGATAACTGATGTAGTATGAAGAAACAGGTCCTTGTTGTTGTTTG
TTTAACTTCAAACCTATTCAGCACAAATTTCCCACTTTCCTACTTTTTCTTCTTGACCTG
AGACTGCAAAGACAACCTCATTGTTCCCGCTCTAAATGTTAGATCCATGATTTCTAACAA
AATCTCACCACTAGTGCATTTTAACCATCATCGCTGAAACTGGAGTGTATTTCGTTGGGA
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TGGAAGCAGCACACATGATGTCCCCATGGTAACTGAATTCACTACAATCCTACCTGCACT
GTTCTCACACTGTCACAAATCCATCCAGTCAGAGATGGTATGAACTTTGCACGAGGGAAC
TGGGAGGTTAAAGGCCAATGTTTGAACCAGCTGCACTGGACAACTGTGTTGTCGCCGCCA
TCAGATAATGTCTAGAGAAGTTCATTGATGTGCTTTTTAAACATTTTGGGCAACAGAGCC
CTCTCAGAAAGCAGAAGTGGGACTGTGCACTGCTCTGTGTGACTAATCTGAATCTGCCTA
AGCCAGCTTTTCACTTTGGTTTATTTGTTTAATTTTCTCATCAAGCTTCTGTCAGTGCTT
GGAAAGTGTCCAGCTCTGATACCTTCCACTAACTGTCATCTGTGGGTATACTGTTACACA
TTTTCTTTTCTGTCAGGCCAAATCTGAGCTGGAGTTATACCAGCTCATAGAAAAATGACA
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CAGCAATCAGACTGATGAACTCTCAGTAACCCCGGCAAACATTTTATTTTATTTTGGGTT
TTTAGTTTCTTTACTTGTCAAAAAGACATTAAATTATTTCACCAAAACCTCAAACTACCA
GGTCAAACTTATTACCCAATACTCCAGTGGGATTCAACTCGGGCTTTATGCAGGCCAATC
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GAGGTTTTCTTCATGATTCCTGCAACCCTGACGAGATCACAGTTCCAGACACATTTCAGC
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GGATAGCCCAGTCTGGCTTGAATGTGACTCTTCTGACAACGTGGAGATTTTCTCAGTCTG
AAACCTCGAAGTCAACAAAGACACTGCGTTTAGTTGTCGTGCAGCTTCCCTGCCTGGACG
TCTGTGTCCTGAGCTCCATCGCCCTTCTACAGTCCTCGACACACTGCTCTGAGACTCTTG
ATGCTTAATCAGCATATTTGAAGCATATAAATGTCAAAAACTGTGTTTAAAAGCCTGCAC
TCATCTTCTTTTACTCCCCTGCCCTTTCTAATTGATCCCAGAGGTGGATGTGTGAAGCAC
AAGCCGGCTAACTCATCCACCAATGTGTCGACAGCTGTTCTGCGGTCTTTAGACACCTCT
CACTCTAGTTTTCTTTCAAGAGTCTTTAAAATGTTCCTACCTCTGCCGGGCTTGTTGTTT
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TCGTTGTTAAACGTTAATAACAATGCTTCTACTTCAGTTTGACAGCAGGTTTGTTTTTTA
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TACCCTCCTCACGCTGGGAGTCAGTGGCTATAAGAAATACTTGTCAGAACGAAAGGTGAG
AGTGGTGCACACGTCACCTTTTTATACGGCTTAAAATAGTTCCTCACTTAGTTAAACGTG
GCTGTTATGTCTGCTGGATGTTTCCAACATGTATGATGAGAACATTAGGGGACTGCAGGA
GTATCAGGTGTATATTGTAGTCGGTCTGAATATGTCTCCGTGCCGTGTCAGCATCTTTCC
TACTAAAAATGGCAATAACTTATATAAGTTGTATTGAGTTGCAGTTGGCTATATGTTACA
GTTTTCTGTGTGTGTGTCCTTTTTTGCTTCACCTGCATTCTCACTGATGATGGAGACTGT
GGACTTGAGTGTGTAGTGAGCTCTGTGAAGGAAGGAGTACACTATAGAAAGATAAAATTG
ATTCTAAAGTTTGAGAAAACCTCCCCTGGTGGCTTCTTGCTTTAAAGCAGAGTTGCTCAC
AATGCAGCATCCTCCTCTTTAGATGATCAGCACTGCAGCATTCTCTCTCCTCTAAACTGC
TGCTGCGCCGTAAATGTGCTGCAACTGAGAGAATCTGTTTGTCCTCACACTCGGAGCACA
GAAACTCGAAAAGGAGTAACACTTTAAAGTTGAAGGTTTTTTTTAGAAATTACCCCGGAT
ACATATATAGAAATTACACGTGGCTTAAAGATCTCATATTTAAAAATGATGCCATACAAT
ACTCAAAGTGGGATATCGGTGTACAACCTAATCTGTAGCTGAAATGTATACCTAGGAGAT
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CTTTATGCATAATTAATGTACAGAACCATTTTTTTCCCATAGAGTCTGCAGAACGTCTCT
CCCAGAATCACGAGCTTTAATAATTCAAGCGTTTCATCTGTTTAGGTTCATTTACTGCCT
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GTGCTTTTGTTTCAGTCGGGGCGGCCTTTGACTCGTCACAAACACAAACTTATTGTCCTG
CACTCTCACCACCACTTACGCTGTTCTCCTCCTCCGGCATAATAAAGTCATCCTTTGTTA
TTAGAGGACAATGGACACTTAGAGACACTTGACATCATTGAAATGCTGTTTGTGTTTGAC
TCTTGACAGGGAAAATATTTTCCCTCTTGATGCTTTCAAACAAGGACAGTATGAGTCAGC
AGAGTGCACCCTCGCTCACACAGACACACACACCTGCAGTGAAGAAAGCTTTGGGGAATC
TGGAGCTGGTAGCTAGCAACAAAAGCACTGTGTTTAGTTGTCGTGTAGCTTCCCTGTTTG
GACGTCTGTGTCCTAAACCCCATCGTCCTATTTCAGTCTTCCACACGCTGCTCTGAGACT
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CTTCTTTTACTCTCCTGCCCCTTTTAATTGATCCCAGAGGTGGATGTGTTAAGAACAAGC
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TCCTTGTGTGTATCGGCATGGTGTGCAGGAGATTTATTCGTTCCTGGCTGAGCAGCTGAA
GAGTCTGGCTTCTGCACACGGGGAGAGGTTGCTTCACACCCCGCACAACCCCATTTCTCT
GGGTAAGCTCAAAGTGCTGGTTACGTATCAATAGATCCTTGCGCTGCTTTTCTGAGACGG
CATAAGTCTTTCTAGCTTTGCGTTTGGTCTCAGATGTTTACTGACATAACTATGCGCCTC
TCTCTTCCAGCCATGTCTCTAGATGGTCTCCAGGCCAACAGCGACAAGGCGGTGACTCAG
CTAGGATCCATGTTGTTCACCCGACAAGTGTCAGGAGCCAGGTAAGGCCATGTTGATGAT
GTGGCCTGGAAATGGACATAGAGGGGGGAGAGAGAGAATAACAGGATAGGGGAGTGTGTG
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GATGGATCTGCTGAATACTGAGCAGCGGAAACTACTTTAGAAAATTAGACAGCCCTTCCT
ATCACAGCCGCATCCTAAATAAAACAGGATGTTTCCATTAGATGTTGAAGGATGTGGTCT
CCTCTGGGGCAGTGGGCACCAGCTGTGAAAGCAGCAGCATTAGTGAGGAGGATTTGTCAG
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TTTCAAATTAGGAGCATCCCCCCCCCCCATCCCCCACCCCACATTTCATTTTGTGTTTTT
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TCGCAGTTGGATTTTTCCAAGGTCCTAGTGTGAAGTGTAGTCAAATGTTTTAGCCTTGTA
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AACAGTTTGCAGATGTGGACGTGGCATTAAATGAAATGCTCTCAGAGCCAAACACGAATA
CCGTGGCAGGCGCCCGGCTTTGCCTTTTCACATCAATAATGAGCTGTTCTCTTCTCCAGC
TGAAGAGATTAATAGAGATCTTCATCTGATTCTAGTGCATTCTGCTACCATTATGCTGCG
TGCACAGTCCTTATAGCTGGGCAGTAATTGATTTCACATTAAAGTGAGTCTAAACTCTGC
TGACAGTGGTGAAACCTTACCAAAATTTATGGCCACGATTATTATTTACAGTGTTGCAGA
TGAAACCAGGTGAAGTCCAAAAATCAGCAGCTCACCGACATCATTGTTTGTGTGAATTTT
TCACATCCAAATAATAAATAAATGAATAATAAATAATAATATAATTCTTTAGCAGAGCGG
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CTTCTGTAATCTGTATATAACATTAACAAAGAATGACTTCTATTATATATGAAACGGGCT
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CAGGAGATGGTGTTGGCCAAAAATGAGATGACAGGAGAGGATTAATAGGTAAACGTTGTT
AGCACTGATTGGACACTTTTTTCCCTTCAGAACTGTCTTTAATTATTCGTGCCACAGGTT
TAACAAGGTGCTGGAAACATTCCTCAGAGATTTTGCTCCATGTTGACGTTCAAGCATCGC
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GGTCCTAGGGTGCCAAGAAAATATCCTCCACACCCATTACACCACCACCACCAGCTGCCT
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GGGTGTATGACTGTGTGGGAAGATTCCAGCAGATCAGCAGTTTCTGAAATACTCAGGCCA
GCCCATCTGGCACCAACAAACACGTCACATTCAAAGCCTCTTAAATCACCATTCTTCCCA
GTTCTAATGCAGAGTTTGAACTTCACCAGGCCTTCTTCCTAAATTCTGTGAGTTGCTGCC
ATGTGACTGGCTGATTAGACATTTGCTTTAACAAGCACTTGAACAGGTGTACCTAATTAA
GTGGCCCATGAGTGTAGATTGCAGTGTTTGTTTTATTTGTGAGACATGGTGATCTGTGGT
GAATATTACATAAAGTAAAGAGGTTATTTTTGTTGTTTTTCTAATTATTGTTAAAATCCC
ATTGCTCTGTGTTACTATGTTTCACTCGTGTTTCCAGGGTGATACCACTGGGCAAGGAGC
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