SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001814_2.0
Identity
TranscriptSelenocysteine synthase (SecS)
SpeciesOreochromis niloticus (Tilapia)
Transcript IDSPT00001814
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001719_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00001814_2.0 # Transcript # Selenocysteine synthase (SecS) # Tilapia (Oreochromis niloticus) # Full length # Reverse
GCCCTCTTTCTTCAGAGTTTTCAGGCATTTGTCGAGCCTTTTGATGCAGACCGTCACATC
TTCTCGAGTGATACCCACAGCGGAGGCAGCGTTGAGGTAAGGACAGGGGTACGAGTCCGA
GTGGGACATAAACCCACGAAACGTGTGTCCGCTTACGGTCTGCTCCTTGCCCAGTGGTAT
CACCCTGGAAACACGAGTGAAACATAGTAACACAGAGCAATGGGATTTTAACAATAATTA
GAAAAACAACAAAAATAACCTCTTTACTTTATGTAATATTCACCACAGATCACCATGTCT
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TAGAAATTGTCATAAACAACATGAGCCATCCTGCTTTGTTCAGGCAGCTGGTGGTGGTGG
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GTAAACATCTGAGACCAAACGCAAAGCTAGAAAGACTTATGCCGTCTCAGAAAAGCAGCG
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GGGTGTGAAGCAACCTCTCCCCGTGTGCAGAAGCCAGACTCTTCAGCTGCTCAGCCAGGA
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GTTTGAAAGCATCAAGAGGGAAAATATTTTCCCTGTCAAGAGTCAAACACAAACAGCATT
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TTGTGACGAGTCAAAGGCCGCCCCGACTGAAACAAAAGCACGCGCATCACCCGTTTCTTC
TTTTCATTATGCAGACATTATCTAAACCGGTGGTACACACGAGGCAGTAAATGAACCTAA
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AAGCTCTGATGGTGTGTCGGGTCAGGCAAGAGGCCACAGGAATCTCCTAGGTATACATTT
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AAAAACCTTCAACTTTAAAGTGTTACTCCTTTTCGAGTTTCTGTGCTCCGAGTGTGAGGA
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ATGCTGCAGTGCTGATCATCTAAAGAGGAGGATGCTGCATTGTGAGCAACTCTGCTTTAA
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TGTACTCCTTCCTTCACAGAGCTCACTACACACTCAAGTCCACAGTCTCCATCATCAGTG
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TCTCATCATACATGTTGGAAACATCCAGCAGACATAACAGCCACGTTTAACTAAGTGAGG
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GTGAGGCTGATGCTCTCCCTGGAAGAGAAGGCAGAAGCGTTTAAAAAACAAACCTGCTGT
CAAACTGAAGTAGAAGCATTGTTATTAACGTTTAACAACGATCCAATTTGACTTATACAG
ATGAGGATAAAATTATTATCCCCCTGACAGGATTTAAACATAACATTTCTAAACACACTA
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GTTTTTGACATTTATATGCTTCAAATATGCTGATTAAGCATCAAGAGTCTCAGAGCAGTG
TGTCGAGGACTGTAGAAGGGCGATGGAGCTCAGGACACAGACGTCCAGGCAGGGAAGCTG
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GAAGACTACGCATACTGGAAGTGCGGCTTTGGTCAGATGAGATTAAACTACAGCTGTTTG
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TGTTTGCCGGGGTTACTGAGAGTTCATCAGTCTGATTGCTGGCGGGATGAACCTAAAGTG
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GGTATAACTCCAGCTCAGATTTGGCCTGACAGAAAAGAAAATGTGTAACAGTATACCCAC
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TGAATTCAGTTACCATGGGGACATCATGTGTGCTGCTTCCATTTACCATCTATTCAGGCA
GCTCCCTCACCTAAACCACACGGGCCACTGAGATTCTGACTCATGCAAACTGTCTGCTGA
CGTGAGCTAAAAAACTCCAAGATATCTGTGTGAGATAACAGTCCCAACGAAATACACTCC
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TAACATTTAGAGCGGGAACAATGAGGTTGTCTTTGCAGTCTCAGGTCAAGAAGAAAAAGT
AGGAAAGTGGGAAATTTGTGCTGAATAGGTTTGAAGTTAAACAAACAACAACAAGGACCT
GTTTCTTCATACTACATCAGTTATCCCATTTTGTATCGTTCAAACATTTTCATGCTTTAT
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GTTATTGTTTCATACCAGTGAGCGTTAACACTCACCTGGGTACATCTTGCTTATCTCCTG
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GTCCAGGCTCTGTACAAAGGCGTCGATTCTTCCCACACGGGCGCCCTGATGACAGACAAT
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GAGGTGCATGCATTTGGACGACTGCACGCCATATGCATTGTTAACTATGTGGGGAATATC
ATGCTTGCTGCAGAGACATGACAGCTCCTCAAGCCTGCAAGACCCCAAAACAAACAATAT
TAGAAATGGTGCATACCTTATTCCCACACTGTGAGCCAAAACAAGCAACATACATTATGT
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AACATAATAAAACCTGAGGGCATGAATGAAAGCTTACAAGACCTGTCAGGGACCCGTGGG
GCGAAGCAAGAAGTCGTTGAATGAACACACAGGATATTTTCAGCTCCAAGCTCTTCAATC
TTGCGTTCAACTGCTTCCAAATCTGTCCGCAGCTCATCACCCTCGAGCACATTCTCCACG
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GGGTCTCCTGTGACGAAGGGTCAGGAAGCAGAGAGTCAAACTCATCCCTGTAGCCATGGG
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TGAATGTCACAACACGAGCCGTTAAACGACTTCCTAAACTCCGTGACGAGCTCAAAGCTG
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TTTCAAGTGACAGCTCAAACTCCGACGTTTTTATACTGTATGTAAATTGGAAGAAAACTT
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AAGATGAAAGTTTTAACTTCAATCACATCTTGATTGTCTTATTTAAAAGCCACTGTGGTG
GTGTACGTAGGCAACATTTCAAAAGCTGCACCCAAGCACAACCTGAACAGGACTATTCTA
GTGAGAAAAACATAAATGAACCAGAGATGAAAGGTCGACGATTCTTTATCACTGTACAAA
TTCCAAGGAGGTTCTTGCTGCTGAAGGAGCTTCAGATAGACACACATTACAAGAGTTTGC
TTAGTTTTTCCCAACCTGTGCTCAGTACATACAAAGGTACAACTGTTAGCTGTTTTTACT
TTGAATTTGTCTCCAAGTGTGACAGAGATTGGCCCAGTGTATTCACAAAGTTTTTCTTCC
AACTACTCTAAATCAGAATCACTTTAAGCACATTCCTGCACTACAAAATATTTGTTGTAG
AGAAAAAACAACAACAACAAAAGATCTGCTTGCTTTTTATCTGCCTCACAATCCATCAGT
CGGGGTTTAATAGTGAATCGCTAATAACGGATAAGGCCTGGCAGGCAAACTTGAACCTGT
AATGTCGTCTTGCCACAAGGCTGGACGCCACCCGGCCTTCTCTCTCTCCTACTCCACAGT
TACCCAGGAAGTTGTTGCTGTCCATCACAGCTAGCTCGTTGAGGAAGAGCTCAACAGTGC
TCTCGCTCCATCCTTCCTCAGGACACTTTCCCTGCAACACACAACATGAGAGAGGAAGTG
TCTTCACTGCAGTGGTATAAGGAAACAAAAGAAAGCCTTGAGCGTACTTGTTCCAGTAAC
TGTCTGATGAGTTGCTCATGGCCACGGCGAGCCTGCGATCCCTGCCGGATGTAGGAAGGT
GACACAATCTTCTCGCTCAGGTTGAAGTTGTCGCTGTTCAT
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