SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001819_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein I (SelI)
SpeciesOreochromis niloticus (Tilapia)
Transcript IDSPT00001819
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001724_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00001819_2.0 # Transcript # Selenoprotein I (SelI) # Tilapia (Oreochromis niloticus) # Full length # Forward
TACGAATATGTCACTCAGGAGCAGCTTGCGGGCTTCGACAAATATAAGGTATGATTTATA
GGTTACAATGGCATGCTAGCAGCTAGCCGCTGAGCGGACAGGTTCTGTGCGTTTAGCAGC
TAGTTGTCACGATCTGCAGGGTGCTTCCCCTGAAAAATATGTAAAGGTACTCGGAGTTTA
CGGAACGATACCGGATGTTTCCCATTGTTCCTGTTGAAAATAAAAGCCGTAACGTAGCTT
ATCTCATATTCACCAATGGTACGTTTTTTGTTTTGAAAATTTTGCTCGGAAGTGTCCTTA
TTTTCTGTGTTTTACTTTACATTTGGTGCTTATGCGCTAACAGCTAGCGACTCCTCTCTG
CCTATGTTGTATTTGAATTGAGGCTTCTTTGCTTTGACCCCACAGTTCAGAGACTTTATC
TATTTCCTTTTTTATTGGACTCCAGCTGTTAATTTCTTTTTATTATTTCAGCCACTGTAA
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ATCCAGTAGGATATGAGAAACAAAGACACACATTAAAAACGTCTAAATACAATTAAAAAA
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TTTTGCATTATTTCAGTCAAGTTTCTTCTTCCTTTAAAACCCTAGTGTGGGTATTCAGGC
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GGGAATAAACATGCATATAGACGAGCTTTAAGTGGGATGAACACAAGAGCGTGGAGATGG
CTCAGCTGATCAGTTCACTTCTTTTTTTCTGTCTCTCCACTTCTCACATTCCTTTGTAAC
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AATGCACACAGACTATGATTATAGTGCCTGTTTTCCATGTGTGGTTATAAATAATCACAC
AGGTTATTCTTGTTTATTACATAAACAACCTATTTTGTCATTACATAGTATAATCATCGT
TATCTACAGTGAACACGCTGTCAGTATTGCAGCAGTAGATACAAATTTTCATATTAGGTT
AGATAAATGATTGTGTAGGCTTGAGTGAGAGCACTGTGTAGTAAAATTAAATGTCCTTAG
TTGGCTGTTGTAGTATTAAGTGCTGCACTGTATTCACAATGAACTTGGAAGTGAACACTG
GGGAGCCCAGCTTTTGTAAGAACAGTGTATTTAAAAAAACAAAACAATAGTTAACCCTAA
AAGTGAAGATCCCACCCTTCTTCCATGTATCTAGGAGTGACAGTGCGATCAAAGTCTATC
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GTTGTGAAGGTGAGGAAGACCCATCCAGCTTAATGTGTCCGTTCCAGGCTACATCATTAA
TGAGATTTCCAGCCATGTGCTGTGATACAGTAGCGAGACGACCTGATGCATTACCAGCGC
TCATTTTTCTGCCAGTGTCAGAACACATCAGTCACTGATTGTAATGGTTTGTTTTATACT
TGGGAGGATTTTTTGTTGTTGTTGTTTTTAATGCTGTCATGTAACCAGACAGTCATTTGA
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TTCAATATGCCATTACTATGACGAGAAAACTGTGTGTGAGAGCTGAGTGGCATGATCATG
AATTGTCGTTCTCACAGCCTCTTGTTTTTTTCTCACTCTTTTCTCAACAGTTTCTACCCA
CATGGTTGGCACCAAACCTCATTACATTTACAGGCTTTATGTTCCTTGTGTTGAACTTCC
TCATGTTGGCCTTCTACGACTTTGACTTCAATGCATCTTGTAGGTCATTCACTTTTTCTT
TTTTCTTAAACTGGGGAGGGTTGGTCAGTTTGTTTTCCCTAAAACATACTAGACGTGGGT
TGAATCCATCGCTGTTGTCTAGAGTAGGAAGAGAGATTCAGACATGTGCAAGTTTGTTTA
TGGAAGGCAAAGTCCAGCACTCGACTGCCTATGGTGGCTCACGGTAATCACTAACCCATT
ACATCATTCACACAGGCAACAACACCCAGTGAGCTGTTCCTGTTAACATGCCCAGTCTAC
ATCTCTGTATTGCAAATAAGATACTTTGCTCTAGCACACCTGCTGTCCAACCTAAGTGCT
TACCTTTTGCACACATAAATGAAACACTCATGGAGACAAAAGGCTGTCCTGTACAGTCAG
TATGAGGGCCAGTCAAGATTTTTTTCTGTCAGTACTGAGCTCTTATAGGAAGAGCTAATC
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GATTGGATGACATTGGTCTAATGAGTGGAATCAGTAATATGGAAAATTACTCTAGTCTAG
GTTTTTCATGATCTCCATGTGTCGTGCCATATACTCACAATGTTTGTTTCTCAGCTGCAG
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ATACACTTGGTAAGTTCTGACCTCTGCAACTCCATGTGGCTTGTTTTTATTTTTATTGTA
CATTTTTTTTTCCCTTCTTACTCATGGGAAGTAGAGAAACTCACGGGGAAGTGCAGTGCC
TCTCGAAAGCTTAAAGGCCCCTATTCTGTTTTTGTTTTGGATGTTTACTTTATAGAATGA
GGCACGCAGACACCTGTTTTTCTGTTTTTGCTATAATTGGATTGTTTATATGCGCTCACG
TTACATCTCATAGCATTATATTTTCATTTTTTTAGAAGTATCTAACTGAAATCATAAAAG
TTATCAGATTATTTGTTACTTGAATCAGATAAAGCTGCACTAGTCTGTCTAAAGCTATAC
ATGACATCCTGGATGTATGTGTGTGAAATATAAGGGACCAATCACCATTGCAACAACCTT
ATAAGAGTAAATATATTCCACTCCCAATTCTGATATCTATATATTTTATTTTAAAAAAAA
CTTAAAGGAAAGCATATTTAAAATAAAATTGTCGTCCAATCCAGGCTAGAAAATGTCATT
GGGGAAATGGATTTCAGTACATACTGGCCGCCCACTTAATAGCTATAACATAAGTACAGT
GGTCGCTATAACGCGGTTCACCTTTCGCAGTCTCGCTGAGACACAAAAATGTCGATGAAA
CGTTTCGCACCGTCTAAGGTAACGTGGGTGCCTTTGGTTTTATTCTATAACATTGGACTT
ATTTTTCTACAAAGGTTTGAACTTTTAGAGTGTTTAAACCATAAAGAGGGAAAGTGGGAA
AATGTTCATGCCTGTCGGAGGAACGTGTATAAAGTGTGTAGTGAGGGGTTTTACAGCCAT
AAAACATCTATAATAATTATAAAAAATAAAGTTAGCTACTTTGCGGATTTCACCTATCGC
AGACTGCAGAGTTTGGTTAGAGTTAAATCCTCTCTCCGTTTCTTCTGTTTGTCCTGTCCA
CCATTAGTGAATGACTGATGACCTCAGTAATCACTGCGTGTAACATTAAGTGTGCACGTT
TGGACATGAACGAAGCCTCTTATCTCTGGGCATACTTTCAGTTTTGACTTTCTCATCACA
GTTTATGATAAATATCAGCTCACACAAGTGAATTTCATCTTTTTATAATTGTTTGTTGCT
CTCCCGCTGACATGATCTGTGTTAGTTAGTTAAACTGATCCCTTCTTATCTATCCTTCTG
TCGTACTCTGTGAACCATTAAAATGAAGCGACTGTGGTGTTTCATATGAGGCTGTGCTCC
TGAGTGAACTGAGTGAAGCCCAGTTGTGTTGGTGTAACAGTGAAGTGGGAAGTAGGAATG
TTGCTCCCTTTGACCAGTTATGTAAAGCCTTAGCTGAGCAGAGATGTCACCATATATACA
TATCCCCATAAACACGTACTGTATGTGCTGATCTGTGTTTGTCTGTGCTTTTTATAGATG
GTGTTGATGGCAAACAGGCACGTCGCACCAACTCTTCCACGCCGCTAGGGGAGCTTTTTG
ACCACGGTCTGGACAGCTGGGCCTGTGTCTTCTTTGTGGCCACTGTATACTCTATATTTG
GGCGTGGGGAGAGTGGCGTCGGTGTGGTCACGCTTTATTACATACTGTGGGTGGTGCTGT
TCTCCTTCATACTGTCCCACTGGGAGAAATATAACACTGGCATCTTGTTTCTGCCTTGGG
GATATGATATCAGCCAAGTGGTAAGTTTTTGGCCGTTTGGATGATTGACAGTGTAAGACA
CTACTCTAGACTTCTATACATCTGTCTTGTGTCCTGTCTCCTTGTAGACAATCTCCCTTG
TTTACTTGGTTACTGCTGCAGTGGGTGTGGAAACCTGGTACCAACCAGTCATTTTTCACC
TTCTCTACAGAGACCTCTTCACCTTTATGATCATTGGTGAGCTGTGTTTGATTACTCAGT
TACTGAATATGTTCATTCATTAGCCAAAGCAGCTACTGAAATTAATTTCTGCTGATTTCC
AGCTTGTTCCTTCACTGTGACCTTACCTATGAGCCTCTACAATGTCCTCAAGTAAGCACA
ACTTATATCAGCTTTAGGTCATTCTTTCTTTTTTCTCTTGCGTTTGCTAATTGTCTTCTG
AACTGTTTTCCCGCTGTGCTTTTGTAGGGGTTACAGGAATAACACACTGAAGCACAGCAG
CCTGTATGAAGGTTTACTGCCTTTCCTCTCTCCGTTTCTTCTGTTTGTCCTGTCCACCAT
CTGGGTGATCTACTCTCCATCCAACATCCTGGAGCTGCAGCCCAGGATCTTCTACCTCAT
GGTGGGGACAGCTTTTGCCAACGTCACGGTAAGTGTGTGATTTCTACATTTTTCGGGGGT
GAGCTGCAGTTTAAGCCTCTGTAAAATTTACATTAAAGTTTTAATGTAAAAATTGGCATG
TGTGGTATGTACAGAAACCTCAGAATCTCAGCTAAAAGCTCATACAAACCATTTCTACCA
CCAAAGACAGGAAAAAGCAACAATTAAAAGAGCAGTTACGTAAGTTTGCAAAATGTGCCT
AAACACAAACAACAAAGCCACAAACTCACTCGACTTCATCTAATCAAGGAAACGGCACAT
TTGATCTCACAGATTCTGAAACCGCAAGTTTCGTCACGCTCCGACCACCATTCACCGAAC
CAGCCGCAAAACAAGACCACCAATATACAACAACTTGGAATCAGATTTACCGTGCCGCTT
TTCTATTTTTCTCGCCATTAGCTGTTGTAGCTCGTATCACAGCTGGCTTAATGATGCATT
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ATGGCAACTTATACTGGATGGTTACAATAAAGCCGTTTTAACCATCGTATGTGGAAAAAC
TCGCGATACATCGGGTATATTCGATGTATCGCCCACCCCTACTTGGCACCATATTTTTCT
TTCTAAAATGAGTTGTTAAGGTGGACTGCCACTGTTTCTGTTTAGTTGCTGGTGGACTTC
AACTCAGGACTTTTCAACTTCAGTGTGAGACTTTAAGAGCAACACAACACTTTTTAGACA
CCGATTGTGTTTTTCTGTTAAGTAATGCTGTCTGTTAACCTCACAGACGGGCAAGACTAA
TAGCATTTGCTGCCTAGCTCCCACAATAATGTTATCCTTTTATCAAGTAGCCACAGTTAC
TAGCTGACTGTTGCCTTAAACCATAACTTAACAGATGGCTAATGTGACTGTTAAAACAGT
ATAAAGGCTAACAGTAATGTGTATGCACGCCAGGTTAACATTTATGTTTAATACTTGAGT
GTTGGTGAAACAGCAGCTTTACTGACCTCGGGAAATTCCTCAGAAATAGAAGGGTGTCAG
TCTGTAAGATGCTTCACTGAGTATCTATTTTAGAAAATCAAAAAACAAACAGGTACTGTA
ATGTTTTCAGAAATCAAAACGTGCCATACATATTACTTTTGATGAAGTACATAGTTAAAG
CTTGTTTTTTGTGAATGCCTTTGTCTTTCAGTGTAAGCTGATTGTGTGTCAAATGAGTAA
CACGCGCTGCCAGCCACTGAGCATACTGTTACTGCCCATGACAGCGGTGGTGGTGTTAGC
CATCACCAGGGTCTTCACCAACGAGACGCTTCTGCTTTATTTGTGGACAGCTGCTGTCGT
ATTAGCGCACATACACTACGGCGTGTCAGTGGTAAGAGCACACATGCAAAGAACATGTTT
GATTCCCTGCTGTGCAAAGAGGCTGCAGCTGTTCCAAAGACAAAGATGTGTTTGTTGCTG
TAGCTCTGCCTTCTGGTTTATCCTGATTACCAGGACTGCAGCAGTGCCAGTAACACGCAG
CCTCCTGAGGCTAAGAAGACACTTAAAAAGCCCCCAAAAACAGTGATTGTGTTAATTTAG
ATCAAAACTTACAGACGTTAAAACACAGAAATCGAAAAGATCTTCATTTATGTAGCCATT
TTTATACATAATACATCTTACTGCATGGCCTGTATAGCTGTGATGAATAATGTTTCTGTC
CTATATGATTTAACCTGGAGAGAAAATGTGCACGTTAAAGAGCAATGGCCCAAAACATGA
ACCCTGAGGAGACCAGTGATTTTCTTTTTGTTTCTAAACTTTGCATTCAATACAAAACTG
AACTGAATCAGAATATTTGAAGGCCTTTGGATTTGAATTAACTGCTATTTTTACCTTTTT
CGTTGCTAGGTAAAACAGCTCAGTAACCACTTCAGCATCTTTGCCTTCTCCCTCAAGAAG
CCCAACAGCGACTGACAGGAGGAGGAACGAATCGGCTTGAAAGGAGCAGAGGTTTAAGCT
TCTCTCCTCCTCTGCTTACCGACACTTCACTTTCATCACCGCGGAAACCGCATCCCCTCC
ATCCATGACGACACTGCAAGTGGAAAGGACTAGGGTTTTCTTTTTCCAGTGTCTTCAAAA
ACACACAGTCACTCTGAACATACACGCTCACACGTTCCCTAACCTATCCACCAACCAAAC
TCTGGTGTCAGCGATGTGGTGGGCCCAGGGGCTCTGGCTTCCGTCACTGATGATTGGCCG
ACTCAGTTGAGCCAATGAGGTGCAATTGTTTCCTACGGAAATGTGCTTCAGTCGCGAGGA
CAGGAGCCCAGACGAGCCATGCAAAGATAAACACTCGCATTGTTTGTACTGCTGTCTTTC
GTGAGGGCCCTCATTGTCCCAGCGCAGTGCCCAGACCCCCCCCCCCCCTATATTGTCCAT
CACAAGTCAATGCCTAACCCTTAACCGCACACGTTTCTACTCCAGGCCTCCACCCTCACA
CAGCCTGTCTTCTAAGTTCCGACTCAAAGTGAGGAAAGGCAGAAATTCCCCTCACTCCCG
AGGTCTTCACAAAGATAGACATACAAGCTAATTGACACAGAAAGATGCATTATTCTGTTT
AATGCAGATGAATAAATACTTTGTGGCAGATATTTCATTATAGACACAGCCACAAACACG
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ACCATCAAACTCTGGCCACATGTGGCTCCACAGCTGGATCCAGTGTTTATAGGTTCTGTC
ACTTTTTTTTTTAATGAGATGATTTGCGGTTGGACATCTCTGTGATATATGTTAATAGAT
ATATATATATATATATATATATATATATATAAACGGTATGTGTCAGGGGATTTGGGGCAT
CCTTTTTTTCTAACTTAAATGAAAACATTGTACAAACTTCCCTCTGAAGTTCACTGTCTG
CTCTGTCGTCTTAGAACAGAGTTGATAATAGAGCAAACCCAGGTGACTTTTACTGACTTT
CCACTTTGACCTCTGTCTGAGCACTGGCTTCCCAACTCTACCTACTATCTGAGGTGTCGT
GTCTTCATGCTGATTCGTTCTTTTCTTCTTCTGTTTTTTAAACATTTTTTTTTGTTTGTT
TTTTGGTTGTAGTTTTTTAAAAAAAATTTAACATACATGTCTTTTTGGGGGGGGGTTGAT
TCAACTGTTGCCATGGCAATGGTGTGTGGTAAAGTTGCGTAGCACTTGAATGAAGAGTGG
GTCCAAAAACCGCTAACGGAGCGGGCTCACTCTGAGGGAACAAGTCGTCGCACAG
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