SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001825_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein N (SelN)
SpeciesOreochromis niloticus (Tilapia)
Transcript IDSPT00001825
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001730_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00001825_2.0 # Transcript # Selenoprotein N (SelN) # Tilapia (Oreochromis niloticus) # Full length # Forward
ATGGCCGCAGACGTAGATAAAAGAATCCCGGAGGAAGAGAAGAAGATTTCGCCGCAGAAT
GGGAAGCAGAGCCCGGGCTCGAGATCCTGGATCTGCAGGGGGATGTGGACTCTGCTGGTC
GTCTGTGCTGTTCCTCTGTTCGCTTTTGGGATAAAGTACTACCAAGATGCCCAGCTCCTC
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CAGCTTCTCCGGCGGCTTCGAAGATCCCTCCACATCCACTTATATCAGCTTCCTGAAAGA
GGGCTTGGAGAAAGCCAAGGAGTACCTGGCACAGTAATGTGTTTGAGCTTAACCAGACTG
GGCAAATGATCCAAGATTAGGAAAACCTACCAAGCATCTGGTGGCGTTCCTCTTCTGTGT
GTGTTGGCAGCTGGAAACGTTTTTGCCTTCTGTACTCTTTGCTACTATTTATTTGGACGA
CTCTCACGGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTTTATATAGTATTTGTATTGTGACAAGTAG
AAATCCAAAGGCCTTCCACACTGAGCAGGAACAAATACAGTATGTAACACATTTAGACTT
GCTCTTTATCCTTGTAGCTGCTGAATAACATAGCTATAAGATATAGATGGAGGCCTACCA
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ATTTCTTCTTTTATGTGGTGGTGTTGCATGTGCAGTATTTATTGACTGACTGAGCTTCTC
TGCTGCTGAGCGTACCCAGAGACGGAGCTGCTGGTGTTGTTTCCTCCAGCTGTGTTTCTG
CAGTTAGTGAAGGCTTTGCCTGAAAGCTCTCCCCGAGCTGGGTAACGCCTGATGTTCTTG
TTGAGGC
Chart Advanced