SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001830_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein P (SelP)
SpeciesOreochromis niloticus (Tilapia)
Transcript IDSPT00001830
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001735_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00001830_2.0 # Transcript # Selenoprotein P (SelP) # Tilapia (Oreochromis niloticus) # Full length # Forward
CTGTGGCTGTTCGCAGCATTGCCAGGCCTGTTGTGGGCCTCACACAGCACTCTGATTGTG
GAGGGGGACAATGATGCCTCCAGGATCTGCAAACCTGCCCCCCAGTGGGACATTAAGGGA
TATGCACCCATGCAAGACCTGTTGGGAAACGTGGCTGTGGTGGCGCTGCTGAAGGCTACC
TGACAATTCTGCCTCAAGCAGGCATCCAAGTAAGAAAGTTGTAATAGTTGAAACTCCTAT
TTTTAAGTTTTATTTTGAAGAGTAAACTCATTAACCAGTTGTATGTATTTTTTTATTGGC
TTCTTAATAATACAATTTTACTTTATAGTGTTGTTATTTTCTGAAACCTTTTTTCTGAAA
CACTATTTCCCAATAGTCCTCAAATTTGTATTTTAGTTTTAAAAAAGTCATTTTAAATAG
ACTACTAGATAGCATGCTGTTAAAGGAAAAACAGAAAAGAAATCCACACCGTCTTTATAC
AGACCTTAAATCTCTCATATGTTTACTGAAATTGCTGGGAAACAACATTACAGTATACTA
ATATTAACAATATAAGAAAAATTATGTATCATTAGACCATATAATCTGAGCTGATTTTTT
TGTCTTATTTTGAAGAGTAAAAATAAGCAAAATGTAAAACAAACATGATCTATGTACAAA
AGGTGTTCTTGTGGAGAGACAGTTGCTCAGAATTCCTCTTATGAGCCTCTAAACATGATT
TTGCTGCACATTCAGTGCAGTAAAGATTTATCATCCTTTTATTGCAGTTTTTTCTCTTAA
AACTGGAAGACAGACAAGCCCTCCTTGTTGCTTGAGTCGAGGCTTTGGCGTCCTGTGATT
CTAGAAAGACCTTTTCCAACTGTCCAGATTAACAGCGATGTGAGATTATACCCAGCTCTC
TATCTTCTCTTCCATCTGTTCATCCGTAGAATTGGAGGCCTGCGTGATAGGCTGAATCGC
AGCAACATGACTGAGGTGTCTTTCATAATAGTAAATGAGCGTGACGCTCATTCCAGAGCA
ATGTATTGGGAGCTGAAGAGAAGTGCTCCCACCGGGGTCCCCGTGTTTCAGCAGCAACCT
TTTCAAAATGATGTGTGGGAGGCTCTGGACGGAGACAAAGATGACTTCCTGGTTTATGAC
AGGTGAGATGAACCTGCCCTTCATGACATTTACCTCATATTTTTGATTTTATTTAGGGCA
AAACACTTTAAATGTTTGAACTTTGCTTTAAATCATGCATGGGAACGGTTACATAGATAG
CAGGGTGTGACTTAAAACAGGGTAATGTAGATAATGGTATGATGTGGACATCAAGGAGTG
GAGGAGAGAACATGTATAAAACCCCATGCAGACGGAACAAGTTGTTCTTCCTTTAGTTCC
ACACACGTGTCATATTTGTATGCATCATGTGGACATTATGAATTTGCGTTTCAATTCTCC
CTCTCTTTCTGCTTCATTTTCTCCAGGTGTGGTCTCCTCACCTTTCATATAGTGATGCCT
TACAGTTTCCTGCATCACCCTTTCGTAGAGGCTGCAATCAGAGCTACTTATCAGAAAAAT
ATCTGTAACTGCACTGTGAGTGATCAGTGGAAAAATGTGTGCGAAATGAATGAAGTCCAA
TGTTATAGTTCACAGAACTAATCAACAGACCTGGGCGTACCCCGTCATTTATCCTATGAC
ATCTGGGATGGATGGATGCATGGAAGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGCATGGA
TGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGAATGCATGGATGGATGGATGGATGAAAGGA
TGAATGGATGGATGGATGGATGGATGACTGCATGGATGGATGGATGGTTGGATGAATGCA
TGGATGGATGGATGGATGAAAGGATGAATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGAC
TGCATGGATGGATGGATGGATGGATGAATGCATGGATGGATGGATGGATGAAAGGATGAA
TGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGACTGCATGGATGGATGGATGGTTGGATGAA
TGGATGAATGAATGGAAGGATAGATAGATGGATCAATGAATGGATGGATGAATGAATGGA
TGGATGGTTAAATGGATGGATGGATAAACTACTCAATATTTTTTTATGTTCTGTAATGTT
TCCTTTTCATAGTGAGGGACTGGTAAGGAATTGTTGGCTAGCTTCACATTAACTTGACTG
GGATTTATTGGTAGATTGGCCTCTTGTAGTTGAGTTGTCTTGAGTTGGCCCTCAGTTTGG
GTTCTCATCAGCCACAGGAATAAATGTTGGGAATAAAACTGGTTTGATCGAGAAAAAAAA
CAAAAAACAGAAAAAAGTAGTAATTATGTTTTAAGAACAGCAGTGCATTTAACAGAAATG
AGGCTGACTAAAAACAAGGTAGAGATTATTAATCAGAAACATTAGCTAATGTTAATGGTA
ACTAATAGCAAGTTGATCAAATTTTACTACATCAGTGTTGTGCCTTTACTTTAATGTGCT
GCCCCCAAGTGGCCGAAATAAATGTGACAATTGTGAGTGTGATGCAGCTTTACCTCACGA
ATAATGAATATGGTGTGTGTGACTGTGTATTCCTCTTTTCCAGCAAAATTTTACTTCATC
TGTCGGTGGTAACAACATCACAAACAATGGCACAGCTCAGCTTGTTGACGAAGGTTCAGA
AGTGCCAGACACAGCTTCTGGAAGGACTCACCACCACCACCACCACCACCATCATCATGA
TGACCCCCCCTCTCATCATCACCACCACGATCAACATTCCAGTCACCAGAATCAGTCGCT
ACATCAGCAGGATCAGGGTGATTCTACTTCTCATCACCACCACCATTCCCCCCATCAGCA
GCACCAACATGATCATTAATCTGGCAGCAGCACTGATAACTAACATTTGTAATTTGCTTT
AGTGTAGTTTGATTAGAATCTGAATGTTTTTTGTGCATTTTTATTTTATTGTATTGTCTA
ATTATAAGCAGTGATTATACTGTGGTTTGTCTCCTGGCATTTCCACACTCCACATCTCTG
TGTGGATAAAGTAACCAATCTCCACCATCTCCTCATATTAATGAAGTCCGCGGTGTAAAA
GCTGCTTGCAGAAAACTGTGGATGGATGTGTTTGGCGAGATGGGA
Chart Advanced