SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001838_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein T (SelT)
SpeciesOreochromis niloticus (Tilapia)
Transcript IDSPT00001838
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001743_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00001838_2.0 # Transcript # Selenoprotein T (SelT) # Tilapia (Oreochromis niloticus) # Full length # Forward
ATGGCGGAGTACAGCCAGACTGGCCTTCTGGCGGCTCTGCTCCTCTTCACGGCGCTCACC
CTCCGGGACATTTATGTTGGAAGGTCGAGCTCGCAGAGTGGGCACCAACCGCCCGACAAC
TCGGCCGTCTTCCCGGACACGGAACCGCGAAAGCCCGCTAAGGCGGCGATCTACAGCGGC
CCCGTACTGCGGTTCCAGTACTGGTGAGTTAACACAGAAGCTAACAGAGGCTAGCAGTGA
GCCTCCGTGAGAATGACCGAGGTGAAGAGAAAATAAAGACAGGGTGGGTGAAAATCTAAA
AACAAACCATCGACGATACGAGTTAAGTTAGCGTGATCTACAGCGCCAGCGCTAACAACT
AGCGGTGAATACTTGTCGTTAACGAGCTTCGGGTAACCCAACTTTGCTCATTTGGTCGGT
TGGAATTTGGAGACTACCCGGATTTTGTTGGCTGATCAAGTTCGAGTTGCTTCGCTTCTG
ACCATCTAATTGGACACCTTAAGGCAGGTGTTCTTGTCTTCAACGTCAGTCTGTCGGGAA
AAGAAAAAAATACACCTGATAATTGATCGGCTAATGTTATTGTGTGTGACAGTGTGTGTA
AGTGTGACAGATTATGATCACCTAACAGATGTGCTTCTTTCAGTATCTCCTGAGGTTACA
GTAAAGTCTTCCAGGATTACTCTCAGGCCATCAGCCAGGTGTACCCGGACATCCGCATCC
AGGGCGAGAACTACCCTCCCACTGCCTTCAACAGGTGAGGTGCTCCGTCTGTAAACTCTG
TCCCCAGCCTCTACAGCTGTGTCTAACCTGCCTCCTCCCGTCAGGTGTGTGGCTCAGCTG
ATCTCGTACCTGAAGCTGCTCTCCATTTTGGTTATCGTCAGTGGTCAGAACCCCTTCTTG
CTTCTCCACCTCCAGACGCCACCTGCCTGGACCTGGAGTCAGAACAACAAGGTACCAGCA
CTTAGCAGATAGCACATGTGCATGGCTCTGTGATTGGCTGTTTGTTAGTGGTTCTTGATT
GGTGCAGCCTGAGCCGCTGTTCAATACTGATAATGTTTAATCACCAACTGATGACACATA
CAGGCAAACTCCACCCACACTGTGGTTTTAGGTGGGACTTACTAATGACAGTAAATCTAC
CATTCCATCAACACGCCGGTCCACTGTTTCCATGTCAGGCTTTGCCTCTCCAAAATGTGA
AATGTACACGCTTGCAGAAGTTGCAGTAATCTGCAGTACCAGCAGAGGGAGTCGTTTTAT
TTCAAGCCAACATGAAAATAATCACAGCAACGTGTTTAAACAGACATTTACATGGAAATA
CATATTAGCCTAGTATAATGGATTTTGCTGATTAAGGACCCTGGAATTAACTTGATATGT
TTTTTGCTCACTACTGACTTGACTTTAAATACATTAGCTCCCCCTGCTGGTAATCCAATT
TTTACATGGGTGTGTAAATGGACACAGTGGACTGGCGTGCCTATTACACATTTTGCCGTG
ACATCAGAGCTACTGGAACATGCCCACCCGCTGTGAAAAAAACATTACTGGAGTCCTTTG
CTCTCCAGTCATCCTTCAAACATCTGGAAGTTTAACTTATCCAAAGAGCCAGATAGTCGC
TGTGCTATCTGATGCACTAATCAGTGCTGGTTATGGATCCAACAGGTGAGCTCAAGTCTC
TTCACTCTGAAGCCCTTTTTCCATTAGTGCCTGCTCAAATCAACTCTGCACGGTTCACCA
CTGTTTACAGGGTTTTGCATCAGGTCACAGTACCTGGTACCAGGTACTTTTTTTGTTTTT
GTGACTGCTCTCCCAGGATTCCAATCGATCCGGGCAGGTACTAAAATGTGACATCGTATG
ACTGCATGCCACTGATTGGCTGGTCAGTAGTATCGCTCGATGTGTCTGAGAGCGCGTCAC
TCACGAAAATCTAAACCACCATTTTTTTATTTTTTTTTTTAAACACTTGGGAACGATGAA
AAGGGCTACAAAGACAACGCTGTGGTTCCCGAGTCTAATGAAAAGGCACAGACTGAGCAG
TAGTTATATCATTGCTTCAACGCCCACCTTTGTTGTAGTGTTGCGGGAAACTCGGGCGTG
TTGCTCTGACCACACACTAGGCAGTAATGGAAAACCAGTCGCTCCGAGTCGTGGCGAGTT
GATCCGAGTGGGTAGTAGTGGAAAAGGAGCTTGACAGGCCAAATCTCACCAATCCCGGTT
TCTCCAGGCTGTCAGTGCAGCTCATTTAAACTGAGGAATGATTTAAATGACCTTGGAAAA
ACACTCATGAATAGACTGATGACTGAGGTTATGGTGTGATCAGAGCGCTAGCTTGTAGAA
TCGTCTGCCTATCCTGCTGCTGTTACCACGGTAATAGGTGCTGTTTACTGATTACCATGG
TAACGGACACTGTGCTTCTGTTGCAGATCTTCTCCTGCCTCATGGCCTTCTTCCTCTGTA
ACATGATGGAGACTCACTTCCTGTCCACTGGAGCCTTTGAGGTCACACTAAATGGTGAGT
TCTGATTGGACCAGACCTTTGTGTTAACATCATGCTTGTGACACAGTTTCAGTACTACAA
CTCAAATTACTGCAGTACTTCACGCTTGTCTGCACTAAAGTCAAAGTATTCAGAGTAATA
AACTGTCAGTCATCAGAAACAGAACAGCACTTCTTACTGTAACCAATTACATCACTGCTG
ACCTCACTTCCTGCTGTAATGCTGCCTGATCTGTACCAGAAACCCAGTTTATTTACTTAT
AAGAAAGTGCTCATACTTCCTGTCACTCTGACAGCAAGCTCTGCGTACATGTCTTAGACA
TGATCTCTGCAGAACGCACTCTTTTCTTTGTGTGAGTTATTAAAGAGAACATGTATGTAT
TCAGTCTAATTTCTATCCTGGAGCTCTGCTCAAACAAACTGTATGTGAAGCTTGATTTAA
AAACAAAAAACATTCACAGTGATAGGGCTGTTCAATATAACGATATATATCAGATGACGA
TATAAAAACATCTATTGTTTCCTATCACGCTATCATTTGTTTCGTGGTGTCGCAAAATAA
ACTGTTTACGGCAATATTTTTTTCATCATTTTGATGGTCACTGTAGTGGCTATATTAATT
TCTTAAAGTTCTCTCTTTCTCTTATATTTAATATAACCACACTATGGACGGACAAGCGCC
TGTTTTTTACGTGCTGTCGTTAGCAACAACGACGGTAAAACCATCGTGTGGCTCCGCTGT
CCGCTTGTTTATTTTCCACATAAACCTTTCACAACAAAGCTCAAGATCCTGTTGAGACGT
TTCAAAATAAACTGAATCACGTGAAAGATGCAGAGTATTTACGGATGAGAAGCAAAAAAG
AGCCGTCAGGTGCTAAAAAATAAACCTTAGACTCAAACGTTAGAACAGACTTTTCCCCGC
AGCACGCTGTGTAATAAATACTCACAAAGAAAACGGAGGCCGTTACAACTATGTCTAAAA
ATGTATCGTTTCATGCATCGGTTAAAACACTCGACTCCAGGTAAAGGACACAAAGCTCGA
AACACTTCATGCAAGTCGAGCTGCCCGACATTCACAGAATTTACAGAAAATGTTAAATTT
GTTTATATCGTGGTCGGAACGATAAATGTCTTATATCGGAATATGAGATTTTGGTAGTCA
AAGGAGTTTGCGAAGAAAAGCGTCTGGACTTCTTTAAGTTGCTTGAAGACGTTTCACCTC
TCATCCGAGAAGCTTCTTCAGTTCTAAGGTCAAATGGTGGGGACTCCCAGATTTAAACCC
AGTGGGAGTATCCCCCCCCCAAAGAGGGACAAAAGGACCCCCTGATGATCCTCTAATCGC
CTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTAATCGCCTGAGGCGATCGGCTCAGGCGATT
AGAGGATCATCAGGATCATCAATATTGCCGTAAACAGCACCTAGTGTCCAGGGCATGGAG
GCGCTACCAGGAGACAGGCCAGTACATCAGGAGACAGGCCAGTACATCAGGAGACAGGCC
AGTACATCAGGAGACATGGAGGAGGCCGTAGGAGGGCAACAACACAGCAGCAGGACCGCT
ACCTCTGCCTTTGTGCAAGGAGGAACAGGAGCAGCACTGCCAGAGCTGTGCAAAATGACC
TCCAGCAGGCCACAAATGTCTGTCATGTCTGCTCAAATGGTTAGAAACAAACTCCATGAG
GGCAGCATGAGGGCCTGACATCCACAGGTGCTTACAGCCCAACACCATGCAGGACGCTTG
GCTTTTGCCTGAGATCACCAAGATTGGCAACTTTGCCACTGGTGCCCTGTGCTCTTCACA
GATGATGGCAGGTTCACACTGAGTACATGTGGCAGACATGACAGTCTCGAGATGCCGTGG
AGAACGTTCTGCTGCCTGCAACATCCTCAAGCATAACCGGTTTGGCAGTGGGTCAGTAAT
GGTGTGGGGATGCATTTTTTGGGGGGGCTGCACAGCCCTCCATGTGCTCGCCAGAGATGG
CCTGACTGCCATTAGGAATGAGATGAGATGAGATCTCATCTCATTAGAAAATCATCAGGT
GTAACAAAGGCAGAGATGTTAGAGGCACGTTCAGTTAAAGGGACCTGCCAGTAACCTTTA
AGAAGATCTAACTTGGTGACGTACTGAGCAGTCCCAACACTGTCCACACAATCCTCAATT
CTTGGGAGAGGATGTGAGTCAGCCACAGTCACAGAGTTCACCTTCCGGAAGTCTGTAATA
AAACGGGGCGAGCCATCTGGCTTAGATTCCACTATACAAGGTGAGCTCCAGGGGCTTTGA
CTGGGCTTCGCTAAGCCATTTTGCAGCAAATAGTCAGCCTCCTGTCTCATGAGCAAGCGT
TTATGGGGGCTGGCTCGATAAGGATGCTGCTTAATAGGTTTAGCTCCCTGAACATCAATA
TATCTTCTCTAGCACTGTAGTGCTAGAGCCCGCCTCAACTACATGCAGATCAGAGTGTGC
CAGACCACTCACACCATTGGCTGCTGCAGGAGCCTTGAACATGACGGAGATGAGATGAGA
TCCGTAGAGCCCTTGTGAGACTATAGGCTGGTGCGGGTGGCCCCGGGTTTCTCCTAATGC
AAGACAATGCTAGACCTCATGTTGCTGGAGTGTGTCAGCAGTTCCTGCAAGACAAAGGTA
TTGATGCTGTGGACTGGCCCGCCTGTTCCACACCCCTGAATCCAACTGAGCACATCTGGG
ACATCTGGGACATCATGTCTTGCTCCATCCAGGAGTTGGCGGATGCTTCAGTCCAGGTCT
GGGAGGAGATGGCTCAGGAGAAAATCGGCCACCTCATCAGGAGCATGCCCAGGCATTGTT
GGAAGGTCATACAGGCACGTGGAGGCCACACACACTACTGAGCCTCATTTTGACGTGTTT
TAAGGACATTACATCAAAGTTGCTTCAGCCTGTAGTGTGATTTTACACGTTTAATTTTGA
GTGTGACTCCAAATCCAGACCTCCATGAGTTGCTATATGTGATTTCCATTGATAATTTTT
GTGTGATTTTTGTTGTCAGCATATTCAACTATGTAAAGAACAAAGTATTAAGAGTATTTC
ATTCATTCAGATATGGGATGTTTATTTTTGTGTTCCCTTTATTTATTTTTTTGAGCAGTG
TATTTTTCCGAAAGACACTTGCACTAGGTGATGCTACACACACACGCTAAAAACTGTGAA
CACTTATTTGTTAAATCAGCTTTACAAATGGAGTTAAATCTGACAGTTTCTTAGAGCAGG
GCTCCATGGTGTGATTTTTTTTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTTTTT
TTCTGAAATCACGCAGAGTTTCATGGTGTCAAAAAAACAAAAAAACCCTCTTATAATATC
TATAAAATGCACTACCTGTCAAACGTTTTCGAACACCACAACTACACCCATACCAGAGAG
TACTGCATGGTGCTGCAGAATGCTGTGGTAGCTGTTCTGGTTCAGGGAGCCTCTCACTCT
GTACCATTCACTGACCCTGGATCCAGCAAACAGCCACACACTGTGGAACCATCCTTTCAC
CTACTCCACGGCCTACAAAGATCCTGAGTGATGAAACGAAGAGTCCAAATGTTGATCCAT
CAGTCAATGATACCTTCTTCCAGTCTTCAGTAGTCCAATGTCGGTGTTTCATGGCTCAGA
CAAGCCTGTTTGTCTTATTCTGACGTCTGGCTTTCTTGCTGCAGCTCGTCCTGTCAAACC
TGCAGGTCAAAGTCTTCTCTTCACAGCTGAAACTGAGACTTGCTTATTACGACCACTATT
AAGCTGCTTGAAGCTGTTGTCCTGTGAGTCACCTATATCACAGCTGTTAACTCTTTGGAT
GCTGAAGGAAACTGGACTCACTGACACCTTGACTTTCTTTGCAGTCTCTCTGTTGGACAG
ACCGACATTTATAAGTGTTATGATGGTCTGTGTCTCTTCCACTTAGGGCTGTGCGATATG
ACCAAAATCTCATATCCCGATATAAGAATTCTATCGTCCCGATAACGATATAAATCACAA
AAATGTAACATTTTCTGTAAATTATGTGAACCTCGGGCAGCTCGACTTGCGTGAAGTGTT
TCCAGCTGCGCGTCATGTAGCTGGAGTCGAGTATTTTAACAGATGCATGAAACTATACAT
TTTTAGACATAAGTGGTAACGGCTGCTGTTTTCTTTGTATTTATTACATGGCGTGCTGCG
GGGAAAAGCCTGTTCTAACGTTTGAGTCTAAGGTTTATTTTTTAGTACCTGGCGGCTCTT
GTTTTGCTTCTCATCCGTAAATAATCTGCTCTTTCACGTGATTGAGTTTATTTTGAAAAG
TCTCAACAGGATCTTGAGCTTTATTGTGAAGGGTTTATGTGGAACATAAACAAGCGGACA
CGCGATGGTGTTACCGTCGTTGTTGCTAACCGCAACGCATAAAAACAAGCGCTTGTCCGT
CTGTAGTGTGGTTATATAAAATGTAAGAGAGAGAGAGAAATTAAGAAATTAATATAGCCA
CTACAGTGACCATCAAAACGATGAAAAAACATTGCCGTAAACAGTTTATTTTGCGACACC
ACGAAACAAACGATAGCGTAAAATGAAACGATAGACGTTTTTATATCGTCATCCGATATA
TATCGTTATATCGAACAGCCCTACTTCCACTGTTATTCTCGCCATGTTTGTATCAACACA
CTGCTTTCTGCAGTACAGTACTGTTCAGCTGTTGCCCATGAGGGTATGGTACCACCGTGT
GCTCCAACACTGCTTCATGCAGACAGAGGGGGAAGTAATCCAGACAAGTTGGAACACCTG
TAGGAATTAGTAGCACCAACTTTCAAGGCTGATCAACCTCCATTCCTGCAGCTTTACATT
GTTAACTCATGTTGTGCTCCCTGGAAAAAGGCCTTTTTGTATAATTCTGATGTGTACATT
AATTTTCATCTTGGGTAACCTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTAACCTATGGCAGTTTACCA
CTTACCTTTGTACCATTTCAACCTATTCACTGGACTTGAAACAGATGAATTTTGATAAAT
AACTGGAAAAACTGGGGTGTGTGTATAAATAATAATATAGTAAACCAAGATATTTTCACA
CTGTAAGCAGTAATTAAACATCAAGTTGTAGTTTGTACAGTAAATATAATAAAACAGCAA
ACACCTTTTATATTTATGTAAAGGACTTTTATTGGGAAAGGAGAGATCTGTTCCTGTGTG
GAATCTTAAGCAAATTAAGATTCCACACAGGAACAGAAGGTTCATGAATGAGCTGAAGTA
TTAGCTCAGAGAGTGATGAAGGCCTGTAAACCAGAATAATCGAGTGTGCGATCAGGTTTT
ACGGTGTCTGTCCAAAAGCGGTGAGCTCAGACCGATACGAGGAGGCACATTGCGTGTTGT
TCAATATAGTTTTATTCCACTTGAAATCTGAAAAACAATGTTACAAAGCCTGGAGGTAAA
TATGGTGTTTGACAGCGCTCCCCAACCCCCGGGCCTTGGACCGGTACCGGTTCGTGAGTC
GTTTGGTACCGGGCAGCGAGAGTTGAGGCTCAGGTGTGAAATGTGTGGTTTTCAGGGTTT
TTATCGGTTTTCAGCGTTATTTTGTTATCGTTTTTACGTGTGTTATGAATAAATCTTCTT
TTTTTCAGTACCTGTACTAGTTTTATTTTGTTGTATTTATCCGCGACACCTTAAAGGTCG
GTCCGTGAAAATATTGTTGGGCATAAACCGGTCCGTGACGCAAAAAAGGTTGGGGACCAC
TGGTGTAGGACACTCTATGCCCCCCTTTAGACTCAGCCCTGTAGGGATCACTGGGACGGA
GAGTGGGCCGGCCGCCGTCAGCCTTCAGCGAGCTCTATAAATTAAACATTATATCAGACT
CAGTTAACAGTTCATCTGCATATTTTGATGTAGCCTTACTTCTGCAGCTTTACTGCAGAT
TTTTCTGTAAAATAAACGGCGATGGGTGGAGCAGCTACAAAGTTTGCTGTTCTCCATTGA
TCAGCTGTTTCCAGGTTTCAATGGTGACTTCAGGAACAGCGCTGCTGTTTCGGAGGCTGT
GCTTTCTTTCTTCTCACCTGAGCTCACCGTGTCGGTAACGCCTCTGCCTCTTTACTCTTC
ACGTTGTATAAACAGACTCCGCCTCCATGTTAAACTGTGCCAGCGTCATCATCGCTGCTG
CCGTTATCAGTGTTTTCGGTTTAACACAGTTGATTATTCACACACTGCTCATAGATACAC
TTCTGTTGTAGTCTGTAGTCAAAGTTTATTGGTCACATATCATGCACTGTGTGACATACG
GCGAAATGCTTATTGCTGTGCAATTCCCGCCCATTAAAAATATTCGAATAAACTCAAGAA
TCAAAATGATGAAGGTGTGCAGATTGATGTATTTATTTTGTTATTAAGTGTGTGTACAGT
GACGTGATACGAGAGACACCAGATCAGAAGTATGTTGTTGTTGTTATTAAAGTGCCGTCC
GTTAAATGAAGAATCGAGGATTTTTTTTTAAATAAGAAAGTTATAATTGGAGTTACTCGA
TGAATCGTTGCCGCCCGCCTCTTTAAAACTGTGGATGACGACGAGCTCAGAACACGAGGG
GAGGTAAGAGGTGCGGCCCGCCTCTGGATGTTGTAGTTTCACCATACGAGTCTGAGTTAC
CTTCTCCTAAACAGGAGGTGAGGGGTCATTTTTGAACTGTACAAACACACCCAGATTTCC
TTGTGGAGATCAGGTAGGGACATTCCTGTGACCTCATTTCCTGGTGTAACGCTTTCTGTC
CTCCCCTCAGATGTGCCCCTGTGGTCGAAGCTTCAGTCTGGTTACGTCCCGAACATCCAG
GAAATGTTTCAGATCCTCGACAACCACATGAAGATGAACCAGGTGGATCACATGACCTTC
ACCTCCACTTAGAGCTGCAGGTGAATGCACATCAAGTTAACTGCGCAAAGTGACGAGACT
CACAGGAAGTTTGTGTGAACTCGGCAGGTGCGATCAGATTATCAGCTTCACCTATCTGTT
AGATTTTCCTCGTACTGATGCATGGAGAAACGCCTGACAGGTACAGACTCACCTGTGACC
CCAAAGACTGAATTTAGTCAATTTAAGAGGAACAAAAATTCGGTCCAGTCATCCTGATGA
GACGGGTGTGACACCGAGACAGGTGAGGCAGAGGCGGGGCCAGAGTTTGATTTACAGACA
AACATTTCTTTAAGTGCTTCAGGGAGTATGTTTTGTGAGAGGGTCTCAGCTGTGCTGTAT
TCAGGTGTGTCTCTCTCTCATTACCTGTTCTGTGTCCAGGTGCTCTGGCTTGCTAGGCGT
TCTCCTGATGGCGTTCATGAAGGGCGGGCCTTAAAACAGATTCTGAAGGGCCCGGCTGGA
TGTTCCTCGCCATGAA
Chart Advanced