SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001843_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein U3 (SelU3)
SpeciesOreochromis niloticus (Tilapia)
Transcript IDSPT00001843
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001748_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00001843_2.0 # Transcript # Selenoprotein U3 (SelU3) # Tilapia (Oreochromis niloticus) # Full length # Forward
CAGAAAGTAGAGCTCCAGTCTCTGTGGCATGACCAGCCGGTGGTCCTCTTCTTCCTGCGC
AGGTTTGGCTGTCAGGTATGTCGGTGGACGGCAGCAGAGATCAGCAAACTGGAGCCAGAC
CTGAGGGCCAACGGGGTAGCGCTAGTGGGAATCGGACCAGAAGAATTTGGGCTCCAGGAG
TTCAAGCAAGGAGGCTTTTTAAAAGGACGTAAGCATCCTTAATCATTTAGTGCAGTGCAT
ATTAATTTATCTTTTGGTAAGTTCTTATAAAAGCTGTCGAAAAATGAGGTTACACCAGAC
TATATTTGGTTTATTAGAATATCAAAGAAAAGATGGTCTTCTGTAACTGACTAGAACTTC
CCTGTTGAGAGCATTCAAAATTGTCAGCAGCCACTCCTGCTGTGTGATTGTGAATAATCA
TTAATCAGCTTCCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTAGCCCTTTATGTGGATGA
ACAAAAGAAATGTTACAAGGATCTGGGCTTCAAACGGTGAGTGCAATAAATGTAGAGAGC
TCATGTCAGTACACCAAGAAGGTTCTGGGTCAAGGGTGTCAAACACAAGGCACAAAGACT
CCAATATGGCCCACTGAACATCTTTGGAAAAAACACTGAGGACATACATTTTTAACTGTA
TTTTCATAAGTTTTGTATGTTTTCCTACTGATAAAGACGCCCAGAAGAGACAACACCAAA
GTAAATATGTAATACTTAATTTTTTTTAATTTATTTATTTTTAATAGAAACTTGTGATTT
TTATAGTGGGTTCACAGTAAAAAAGAAAAGAAACAAGAATCAACAAAATGTTTCCATTTT
ATAACTAAAGGACAGTCTGTGCAATGAGCTAACAGAATTTTCTTCTGTAATATTACACAT
TTATTTCTTTAAATTCAAGCCCAAAGCAGCATTTTTTAAAATCATGTAGAAAAACAAAGA
TGTAATGTTTAAATTACACTTCTTGCATGCAGATCTCAGGAATTAAATGTATAGTTAAAT
CTCTTTACACTAACGGAGAGAAGAGTTTCACCCATTCTGGCCCACTTAGGATTAAAGTGG
CAACCCTGTTCTGTGTTTTAACCTGCTGGGGCCTTTATGTGTGGGGTTTACATGCTATTC
CTTGTTTTGCATGGGTTTTACTACAATCAGTGTTAAATTAACTAGTTGTTGTAAATTAGC
CAAGCACCCTGGCAGGTGAATGTCAGCATGAGCTGTTGTCTTCGTATTTGTTACCCAGGG
TGTACAGTGCTTCTTGCCCTATGACAGCTGGGGTAGTTTTCAGCACTCCCTCTTGCAAAC
CTAAAATGGATAAGGTCCTAAGACCAATGCTTTGACCAAGATGTGATTTGCTTTAAATTG
TCAAACTTACTGAAAAGGAATAACTTAAACAGTGTTGATCTTTACTCAATTAATTCATTT
TAGTAAACAAATTTCATCAACCCAATCATTTTAAAACATCATCTTGGGATGTCATAACAG
GAATAAAAAAAAACATTTATCAAATCAAATCAAATGCACGAATATTTAATGATCCGTAAT
GGAAAAGCTGTATTCTCTTCCCATTCAGATACAACGCTGTAAGTGTGGTTCCTGCAGCAT
TGGGGAAAAAAGTACGAGATGTAGCAGCAAAGGTAGACATATTTGTCACTTGCTAAAATG
AATTAAAAACAAAAGAGCAGTGGTACACGGTGACTTTTTCAAGCTGATTATTTTTGCTTT
TTTCAGGCCAGCGCTGAAGGAATCCAGGGAAACTTCTCAGGAGATCTGCTCCAGAGTGGA
GGCATGCTCATTGTGGCCAAAGGTAAACTGGGTGGACACCAGTGGGGTGGAGGGGTGCAA
GGGTCCATTTTAAGATTATGTAAAAGTAAGTGGAAAGGCACTGATTGTTTAAACCTTTAC
CAAATAAAGATGACATATGACCACCTCCCCTGTACCCCTAATGACAAGTTTTGTTACCTC
AGTCTATATCAATAAAGACGTGGTTTGACAACTATTAGCACAGGTTCCAGGTTTTAAGGG
TATCTATAGTAAGCTGTATAGGCAGAGATCACCCTTGCTAACTTCTGATGAAAACCCAGG
TATTTTGTTCTGGAAGCAGGCCTGAAGTATGACAGAAATGGCTCAGCTCAGTTCAGTTCA
GTTCAGAGGTTACCCCTAGTAGGCGTTCAGGAGATAAGGAGTTAAAACATATGATAAATT
AGAGGATTTTCCTCATAATTCGCCTTGTGGCATGGCACGGAGTACAGAAAAGGTGTTCTG
TCATTTTAAGTTGCATTTTTGTGGTGCGTCCTCTAGAGGGCAGTGCAGCATCACATTATG
GCGATGCAATCAGGAGCAGCATTTACTTCTAAATCCAGTTTTCCACAGGTCTGCTGACTA
TTCTTATTTACATGAAGTATAGGATTATTTTTCAATTGTTGGAATATATTAAGGTTAAAT
TCTTATCCATATTTAAACATATAAAAGCGAATATACTCACCAAATAAAAACGACACAGTC
CTAAATACATTACATATATACATTATAGCACAACATTAGGAAAACTAAGACTATATTAAA
AGGGTTTTTTGACAGTATTCAATTAATTTTACAATACAAATAAAATGCTTGGTCACTCTA
ATTCTCCCTCTTAGTGTGCCAAAGTCTTTTTACGGTGCGGCAGAACAGCTTGTCTTTATG
GAAAAAGGCATCTGGTGGAGTAGGTAGTGGGTCACTTTGTCTAGTGTGTCTCCCAGTGTT
AAAGCCTTGGCTCCACCAAAAGTCCTTCAACACCTACACAGTAAAACATTTGAAGTTTTA
TTTCTATAATATTATTTTAACATTTTTCTGTGTTTGGAAGTAGTTTAGTTGTTTATCAAA
CAGAAGCTTTGTGTTAAACCAAACTGCACTATACACACATGTTTGAAATACTGTTCTGTG
TGTGCCATAGCATTTTTTGTTTTCATGTATTTTGCTTTTAATAAAGGATCCCTAGTGAGG
CAACCAAAGCAAAATTACATTATTATATTGTAATAAACAGGGCCAGCAAGTTGTTTATAT
GATGAAGGTATCTAAGTGATTTATTTTTGCACTCCAAAGGTGGAGAAAAGGTCCTACTAC
ACTTTATCCAAGATTCACCGGGAGACTACCTGCCTTTGGAGGAGATTACCAAGGCTCTGG
GTATCTCAGCCACAGTAAAAGCAGGACAGAGGCCAGTGGTAAGGCATACCATACATGTCC
ATGTTATAATTGATGCTATGAACTGAGCTGTAAAGCAAAGGGTTAAATGGGATAGAGCCA
ACTGGTGTCATTGTGTGTGTGAAAACACTGGACGGATCTAATCATCAGTTTCTTTCAACA
GTCCGTTTTACGTCAGTAGAGACAAATGCATCAGAGTATCCTCTTCACAGACAATTTCAC
ACTTATTACAGCATCTTCATGGTCTGTCAGTGTCTGTGTCAAAGGCCCCGAAACCTTTTA
AACTTGACTGAAGATGATGTCCGTACTTGAAAACACAGCAGTTATTTTACAGATCCATAT
AATAGCGGTGCTGTAGTGCAAGCTGAAAAGCACAAGTGCTCTGCAGATTTAAATTATCAC
TATATTATGGAGGAATTCATATTTTTTTTTTAGCAAGTCCTTGATCNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTGTGTGTGTG
TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTGTAGATTA
TTCATACAGCACAGCAGAAATGGGACATGTCTAGTAAGAGGACATGGGAATGACTGGCAG
TACTGGCTGCGGTGACCATTTCTGTTGAGGTCATTGTTACCTCATGTGGTTTCCACCCTA
GTCATTTTGCCCTGTTTACATCCTTTTTCTTTTTTTTAAACCCTCTGGTAGAGGCGACTC
AGAATTTTCTTACCTAATGTGCACAGTGGGATTTTAAGAAGCTGGAAGGTCAGTGTTGTC
ATGACAGTGTCATAAATTGGTTACCACTGAGAGACAAATAATAAACAGCCTGTGGCAGGC
AAACATGTTGTGAATGAAAAACAGAAACTACAGATAATTAATATTAAAACTGTAACAGAT
TTAAAGTGTAAAACTGAGAAAAGTACCTTATTAGAGCACTGTTGCCTTTTCAAAAATGGT
TATACTGAGGATTTGTTTTCTACAAAATGTCCTGACTCAACCTTATTGTGTAACGAGCTC
ATAATCATTGCTTCTCTTCCACCATGCAACCGGCAATAGGCTCACTAGAGGCTCGCTGTA
GCATCCATGTGATTCTCCTCATTGATGACGACCACTGTGATGAAGCGCTGCTTAGATTTC
AGATACTTCAAATTTGAAGTTGAGCACTTACTTGGGAATTATGCTTCAGCAGTAACTTCA
AACCCTTCTGGAACCCTACATCGTAAATTACAGCGTAACCTGACTTGGATTTTCCTAGAA
ATGTAACAAGAGGACAGGGCCAGTGACTCCAGTCAGCAGTAAATCTACAACAGTGACTGT
TGCAAAGAGAGGGGATCAAAATTCCTCCATAATCATGAACCTTTTAAATCATGGGATGTA
TTTTTTTTGGAGGGGGGGCTATGTAGTATTAAGTAGTCTGCTTGCATAGGGATTTTTTTT
TTTTTAACAATAACATAAATTCCTGTTTGCTTACTGCACTACCATCATTATGTTTATATG
CAAAGTCTCAGCACTTAACAAATTTTTAGTGACAGATTGTGCCTGCTTTTTAACTGTTTG
CTTACTGCAAACAGGAATTTAGTATCTATTGCAAAACCACTAGTTTATGTTAACATACAA
GACCCAACAACACTATTTACTCTTAAATCTTTTGAGAGATTCTTTCTGGCTGGGAGCATC
GCAAGAATATTGAAACAGGACTGTAATATAAAGCTACAGCCAGGCTAAAATTAGCTTAAT
ACAACACAAAGAATGGAAATGGCTTGCTGTATCCAAACTTAAAAAAAGGTTTTGCACGTC
TTATTCTGAGGTGATATTTATTATGTTCCCACAGAGCCAGGCTAGTCACTTGTTAGATAA
GCTAACCAGCTGCTGATTGTGGTCTTGTGTATATAATAAAAACATCCACAGGAGTAACAC
TATGGGGTATGTAATATGTTCTGTTTGTCTGTTTGTTAGCAGTCTAGCAGATAACAATAA
TGAGTTGATTTCATTTTGGTGAAAATGGGGTCAAGGTCAGGCCAAAATCAGTAAAAACTT
TATATTACTCACATTTGTTTTGTTTTGTTTTTGGATCGTCTTTCAACTTCACAACAATAT
ACTTGGGTGACAAGAGTACCTAGGTTGGCTAAGCATTTGACCTTGACTTTCACAGTTAGC
ACCCAAGGTCAAGGATGACCTCTAAAAAAGTTTCAAGAAGCCATATCGAGTAATATATAT
GACGCCATAACAGGCTGACATCAGCATGTCGTAATAAAAACATCATAAAACATCAAAGCT
TCAGTATTGCTTCACTCCTCAGGGTGAGCTGCGCTGGCTTTGTGTTCTTGATAAGAAAGA
GAATAATCTCAGGATTAAGTGTTCATATTATTACACTTACAATTTTTTTTTTTTTGCAAA
ATCAGAGCATTTGTTGTGTTTAATGAAAATGGTAACACCTATTTCACCTATTCAGGCTAC
AAAAAATCTGTCTTTTTAACATCAGTTAAGCGCAGCAGTTTATATGTTATCAGTTTGTAA
ATGCAGGCATTGCACAGATCTCAGACAGAAAGTGCAGTGTTTTATTTTTCTTTGCTTCTC
TCTTCACAAACTAAAAAAAAGAAAAGCCCCATACCTGTCAGTTTTTATCAGTCATTGACA
ACAATAAATCTGAACTTTAGTGAAGTAAAGGTCAGATCAGCAAACTGTTGTTTATCTCCT
CTACAACCATTTTCATTCAACTTAGATTCCCCCACCCGGTCATCCACAGCCTGATCCCTG
TAGCTCTGAGAACCTTAGATATACTTTGAGAAACTCTGCGTCAGAGAATGAGCCGCATTG
ATTGCTGTGTTGGTATAAGATTTAAAATTTCAGTTTGATTTATAAGATTTCAAAAATAAA
ATGTGGCCTAGTTTTTTGTTAGTGTATTCACAAAACAAACTGCTCACAGATTTGTGGGCC
TAACACTTTCAGTTCTGCAGGGTTTGTCCTGTGATCGTCAGGGCTTTCGACATGCCCATC
ACATCCAGCACATGCTCTTCAACCACTTTGCCTCTGAGCGCTATTGCTCGCTTCCCACAG
AATCCACTGTGTCGAAACTATTGCACCATGTCCCCATGATCTCTGACGACCAAACGATGT
CATCTCTGCAACCCACAACAGAATAGACCTTGTTATCTCCGAGGGGTCAAAATGTGTCAG
GAACGAGTAAAAGTCACAAGCTGAATGTCTGGTTTGGAAAGGCCCGGGCAATGTTTTGTT
AACAGAGAGAGGTCACAGGCTGGTCCCGATAAAACCACTAAGACCACTCATGGGTTTAGA
AGTAATGTCTCTCCTCAAACCTTTGTTTACTTTGGAGGTTCTTCTATCTGTGCCCAAGTT
TGGGAACTCTCAAACTAGATTTCCCACAAGAATGACTCGTGTTCTAACTTGAGCAATCAC
TCTGAGGGACCGCAAACAAGACGCAGTGTTTAGACAAACAAGGCTTCCTATTGATGGAGC
TTTATCCACAAAAGGTGATCGGTGAGCAGCATCTTTATTTATGAGCTGCTGCTTCTCCTA
AATACATGGCTGAGGCTCATTATTTATTGTTCTCATTGTTTAATGCAACTTTGTCATCTT
TTGCAGTGCAACGATGACGTTTGTACACGA
Chart Advanced