SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001848_2.0
Identity
TranscriptEukaryotic elongation factor (eEFsec)
SpeciesOreochromis niloticus (Tilapia)
Transcript IDSPT00001848
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001753_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00001848_2.0 # Transcript # Eukaryotic elongation factor (eEFsec) # Tilapia (Oreochromis niloticus) # Full length # Forward
AAAACGTTAAATTTCAACGTCGGCGTGCTCGGACATGTCGACAGCGGGAAGACGTCGCTT
GCCAGGGCGCTGAGCAGCACTGCGTCCACAGCCGCCTTCGACAAGAACCCGCAGTCCCGC
GAGAGAGGCATCACTCTGGACCTCGGCTTCTCCTCCTTCACTGTGGATCTTCCCGATCAC
CTGCGGGACAGCGTGGGAAAGCAGCCATATGACAGCCTCCAGTTTACCCTGGTGGATTGT
CCGGGGCACGCTTCTCTCATTCGGACTATCATTGGAGGTGAGCTCTGATGTAGGAGGGTC
ACGATTTCCCATTTTAAATACAGAATGATCAAAAGAAATGACAACTATTTTATCGCGATA
TTTACAGAAAATGTAAATATGCAGTCAGTTAAATCTACTTTGTGTGTGTATGTGACTGCA
TGCTGATGCTGTCTTCTTCGGCAATAAAATAACTTGCAGGAATCTGGGTACAAAAAGTTT
GGATGTGAGACCACAGACATAAAATACCATCATAAACCTCAGTTTCACATAATTTCCTTA
GGGCATCTTGATGCATGCTCAATCATCCAGGTAAGTAAATGCCCAAAAGTTGATTCTGTT
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ACCTCATCAGGCCAGGACTCCGCAGTAAATTCACACCTACAGGCCAGTGGACACTCTTTC
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GAACAGAAAAGACATTTATGCAGGAAAAATATTCAGAATTCACAAATTCTACTACACATA
TTTGACTGACTATGACTGAAACAGAGTAGATTACAGGCACTCACAACATCACCCAAGTTT
ATATGTAACTATCAAATGAAAATTGGAAAAACTAAGTGTTGGAACATCATAAGATTTAGT
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GAGCTTCAATTTTATTGTCCAGCAGAGGGCGCCCTCTCTTTGCCAGCATGTCTCAGTGGG
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CAGTTTCAACCCTCTAGCCTTTTATTCTCTCCTTGCCTCTGTGCACCCCCTCCCTTTATT
TCTCCTCTTTTTCTCCTGTTATTTTTGGGTGTCCGTGTCCATTCCTGTTTGCATTGCTGT
TGTCGGCTTCATAGCCTCTAAGCATTTGCATCTTTTTATAGAGCAGGAAAGCTGAAATGC
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ACATCTGCCTCCTCTAGGTGCCCAAATCATCGACCTGATGATGCTGGTGGTGGATGTGGT
GAAAGGGGTGCAGACTCAGACTGCAGAGTGTCTGCTGATAGGAGAGCTCACCTGCCCTCG
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TGAGAAAATGACCAAGAGACTCCACAAAACACTGGAAAACACCAGGTCTGCAATTATATC
TAAAATAATAATTGGGTTACACAGCTGCATAATGTAGAGCCACACATCAGTGGGGTTACG
GGGATCCCAAGCACTTGCAGTAATCACAGGACTAACCCTCATGTCAGCTCCCTCATTTAT
TACGCTTCATATCTCTCCCTCTGTGTCCAGAGTTAGTCTGCTCCGCCTGCTTATATTTCA
GTGATGCTTTAAAAAAAAAGCAAAAACTAAAACATTGAAGCATGACTTGATTCCACCTTG
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GAGGTCCGGAGGCTCCTGACACAGAGGAGCCACAGGGAGTGCCACAGTTAATAGAGGTAA
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TTAGTATGATTACTTAATTGATGTGCTTAAAAATGAGTTAGTCACAGCAAGTATTTCTTT
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ATTATTTAGAATGTGTCTGCTGAGTTTGGCGATTTGTGTTCACAGGTTTTTGTTTTGTGC
TGATTCATTCATTCAGTCAAGTGAGTGAAAAAGTAAAGCTTCCTATGTCTCATTAAGCGC
AGTATATCATGAACTGTTGGGTTGAGTATCACATACTTGTGGGCCACATTAAGTGTCACC
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TGAAACCATTATTGTTAGTATTTTTTATTTTCCTCATTGTTTCGAGGAGACAAACGTGAC
AAACGTATGCAATAAGAGCGACATTTGACAGTTGGAAAAGAAGCTCTGTGCTCTCTGGTG
GTCAAACTGTAATGGAAACATTACTTCAGGCACATCTGGAACATGGAGTTTCTTTGCTGC
TCGCTGATTTCGATCAGCTGCAGAGAGATAAACAATTGGTTGATTTTACTGGTCAAACTC
AGTCAAGTATTCAATAAAGCTGAATAAAACGTAACCTAAGGATGGTACTCTGGAGAGTTT
ATGTACATTTTCCTGGAGTGTGAAAAACTGCTGAGTCGGATCAACTCTGTCAACATAAGA
GGCCGAGCTTCAAAAACAGGATTAGTGAAGAGAAGATATGGATCTCATTAATGCTTGTAC
GTGTCCGAAACCATAGACGTGACCTTGAGATATTTTTTCAAATCGATTGTGGTCTCTTTT
TTGTATTTTATATTGAATATGTGCTTTCTCCTTCTAGCTTTTAAAGAAACAGACATACCT
ACCCAAGAGAGACCCTGGAGGTGACCTCCTAATGGCTGTGGATCATTGTTTCTCTATCCG
TGGTCAAGGAACAGTCATGACTGGGACCATCCTGCAGGGGTCGCTGGCCATTAATGACAC
TGTAGAAATCCCAGCGCTAAAGGTGTGTTCCAAAAAAATGGGTACGAATTTGGAATTTCT
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TTTCGGAAGTTCAGAAGTTGAGTTGGCTGTGGGCAGAAAAAGGGACGGCTTGCCGGCTAG
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AGCACAGGAGTTGGGTAATTTAGACCAGATGCAAACTATGAGCATGTCTCAGTGGCCTTG
CGTGCAGTCATCATGGTCACCTCTTGGAGGCAGCATATAGCTAAATTGATAGCCACTTGT
TAAGGAGCCTTGATCCAGCTTACGGGTGATTTTGTCTGTGTGATAGGCAACAAACACAAC
CATAAAATTCACAATAGAGTGTCAAGCTAGGGATCGAAAGTGTGGTGTGACATATACATA
TACTCATCTGGACACCTTTAAATCATCCATGTGTTCACCTGTTTTTGGAAATGTGTATTT
TGTGTAACAAAACAAAGCTTGGCATCTATTTGGTGTCTTATTTATCTTTGTATATATTCA
AATATGATTTTCACTCTTCAAGTCCTTTTCTCAGAAATTAGTCATGTATAATATTTTACA
CTGTAGTGGGACCTTTTTAAATAGCCAACAAGTTTAATTATTTGTCTTTGCATTTATCAA
AGCTAATATGCTGACAAATAGTGCACTTTAAACTGTAACTTATACAAGCTTTTTGTTTAC
ATGTGTGCATGTTTTATTGATAAAATGCCGCTAAAGGGCGTTTTCGTGTATTTTAAATAT
CAGAGTACAGGAGATAATGATAACTATTATAACTGATGTTTCGTTTCTTTTTAATCTCTA
CATGTATTCTGGGTTTGTTTTTCAAATTTTACCTCTAAAATTAAAATATCGATAAAAATA
AAAATGTTAAAGGAAACATAAAACATTATTCTCTTTCAAAAGGAAGCTATAGGAAGTTAA
ATTCTGAGCTGTAAACTTTACTATAGAGCCTTAGTATACTTTCTCCTTCTCAGTTTTGCA
GTTGTTTAGCTTTGTATCTGTTACATCTCAGTCTGTTATTAAGTTTACATGAGGAAACTT
TATTGTTTGTATTTAAATGTGTTTTGAGCTGTGTTATTTATTTCTCTATGCTCTCTGACA
TCAGGTGACCAAGAAGATAAAGTCGGTGCAGATGTTTCGGAAGCCCGTGTCTGGGGCCAT
GCAGGGGGATCGGGTGGGTGTGTGCGTAACCCAGTTTGACCCTAAACTGTTGGAGCGTGG
TGTGGTGTGCACCCCAGAATCCTTGCGCACGCTCTTTGCAGCTGTCATCTCTGTAAGGAA
GATAGGCTACTTCAAGGGCTCTCTGTCCACCCGTGCCAAGTTCCACATCACAGTGGGTCA
CGAGACAGTCATGGCAAAGGTGACCTTCTTTGGGCTGCCACCTGCGGGTGCCTCAGAGCC
CCCTCCAGACTCTAAACCGCCTCCATCAGAGCCCTGCTCACTGGAAACCCCGTTCACCTT
TGACAGGGAGTACTTCTACCAGGATGAATATGTAACTGGTCAGGAAGAGGGGAGTTCGGG
GCCTGACCCAGAGCAGTGGGCTCTACTGGAGTTTGAACGGCCAGTCACGTGCCCTTCTCT
CTGTCTAGTAATTGGGTCAAAGCTAGATACAGACATCCACGCCAATGCATGCCGGCTGGC
TTTCCAGGGCCGTCTGCTGCAGGGGTTTGAAGATAAAAACTACGCTGAGACCGATCTACC
TCGTCTGCGCATTTACAAAACCAAGCACAAGGAGGGACAGGTGGAGAGGGTGAGTGCACG
CTCAGCAGTTTGTCTCTCATTTAAAATGATCAGTGTTGTGACCTTTCAGCCTTTGGAGTC
CTCTCCTTGCATCTCTGCCCTCTCTGTCACCTTGCGCTCCTTTTGCTTGCTCTGAATCTT
TGGATGTTTCTCATTGCTGGCGGCACTGGAGCGTGTCTCTCAGACAGAGCCCCTATTGTA
TATTCATAAACAGACACGTACACACAAACAAGCATGCATATGCAGCTCTGGTGAGCAATA
TTTGAGGCATGGGATGGGTATGCATGCCTTAGCATGTGCTGTGACAGAGGTGTGCGTGGG
TGGCCGCCTGACGCCACTAGTCCTGTCTAGCTGTCAGAGGCTGGCGCTGTTTGGACACAC
CTGAGTGGCACACGAATATCCACATCCACTGTGAATTAGTCTAGCTTTCCCTTCTGTCTG
CCTGAGTGCCTTTTGCTCTCATTCTCTTCCTCTCTGTCACATACTCTCGCCACCTTTATT
TTCATATTTGTGTGATTGCTGTTTCATTGTGTCCTGAATCCCGAGCCGCTCTCTCTGTGG
TTTTCATCAAACATCTGACTTAACTTGGATTTGTCAGTTTTTCAGACACTTAACAAGTTA
TATTTACATTTTTGTTCACACTAACTGTGATTTTGATAGTAGCTGTTGTCATTCTGTGTG
TTACAGTTCAGCTTCTCTGCATGTTTCCCTCATAGAAAGGCAGATTCAGGTCAGGGGTCA
AGTGTGTGAATTAGTTTCCTGCTTTAGCACCTCAGGCTGTTGACAGCTCCACTCGCTAAC
TCAGGAGCAGAACAGCATGTGCACGAGGTCAGATGGTGGTCGTGTGACGTTAACGTTGTC
GCTCGTGTGTCTCCCAGAATGCAGCAGTTATGCTTCAAACTTAAAGAATGTCCTTTTGGT
AAAAACACATTAGTGGCATTGTTGAGATATGACGAACTCGAACAGTCACAGTTCAGACGG
TCTGTCAAACGACATATACAGCAACTGTATTTTTTTTTTTATCAGCTCATCAGTCACGCT
TGCGATACATCAGGGTCAAATGTTCAAGAATGAATGAGGGTTAAGCAGAAGAGAAAGGAA
GAGCTGGTGATGAGGGCGAGCTGGTGATGGGGGCGAGTTGGAGACAGAGCGGTGCCCTCA
CGTTATCAGATTAGCAGCGGGTTATATTGACTTAGTGATGGATGATAATCGAGAAATAAA
AACAAATATGCCATTAAGTGCACAACCATGAAAAAGAGAGTGCGAGACAGCCAGGCCGCG
GGACTCGATGAATGCAGCTGAACGGTGCAATTGAAGAGGGTGTGGGACAGATCAGCTCTT
CGTGACGGCAGAATGAAATCACACAAGATGAGCAATAAATGAATTATTAGATCATACCCT
GCCTTGCACACTGTTTGCATAATTGTTGCTCTCTCGTGCCCAGGTAACCGATGATTACAC
TGTGATTGGCCGCAGCCTGTTCAAGAAGGAGACCAACCTCCAGCTCTTTGTGGGGTTAAA
GGTCACCTTGTCCACAGGAGAAACTGGTGTCATTGAGGGTGGGTTTGGGCAGAGCGGGAA
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CCTTGAATTTTTGGGACTCACCGGACAGTTTTCAGGATGTGGTAAAAGTGGTAGGCCTGA
CATCCCGAGCCACATTCCCAGGATTCCTCCGGGGATTGCACGTGTTCCGGGGGAAGCCTG
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GAAAACAAAAATATCTAGAAAGAGAGCCTCACCTACATCCTTTTTGCTGCCTTACTCCTG
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CATACTTTACACAGTAAACTCAAACAGATTCAGTGAGGTGGTCTCCTTGGCAAAGCCAAA
GTCTGTGAGCTTGAGCGGGGCACCGGGTCTCTTTCAGGAATACAGTAAGTTCTCTGGCTG
CTGGGAGTATTCAGGAATCCAACAAAAAGATATGATTACAACATTAGTAACTAAGTCACC
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ATAGCATGTAGCTTGACATCTCTGTGGGTGATGTTGAATGTGTGTAAAAATATATTGGAT
AGCCTCACCTGTGCTCTTCCTGATGTTAGTAGCCTCTGAAGTGGTGAGACTGTCTGGTCA
CCACCACCACCGCCACCATCCATGCTAAAAATTCAATTTTAAATGAGCCAGTTTGTTAAT
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GACCAGCCAGAGTCTATGAAAGGCACAGAAGGTAGGTTGCTATGGTTGCTTTTACGCTCT
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TTTATGCTTCAGAAACTTAACATCAGCATGCGGCATGTACACACATGTATGTAAAGTGAT
GAATCCTGGTTTTCAGTATTTTTTATGCAATGAGGAGTTTCAGCATCGCAGTTCTACTAA
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CAAATATTTTTTTAAGTAAAAATCCTCATGCTTTGAGAGATGCCTTAAGTTTTTTTAGTA
CCTGTAAAATTTAATTTTGCTGTGCAGGGAAAATGCCAAGACATTGGCAGCATTTGTGGG
CAGAAAACAAAATAGCAATCCTCATGTGTCACTTGAACTCAAGTGATAGGGTGTGGGAGG
GCGTGTTTTGTGGTGGCGAACGGGACATTTTCAGCTGATCAAAGATAACAAGAAGAAATT
TCTGGCTGCGCTGCAACCATAACAACCCTCACGCTGGCATAACGATAACAAGAAGAATGC
TGGCGCCGCTGTACGTGAGGTCAGACAGCCAGCGTGTAAAACAGTGAACCGAGACTATTT
CTTACCTTCCGTGTGCAAGACAGCAAGCAAACAAGCATTCAGTTTGTTTCCTCGAAAAGA
CATACAGACAGACGACAAGATATGATAGAGAAGGACTTGCATTGCATGCCTAACTGGCAT
CGAACAATAAACTGAGCATTTGTATGGGTTAGTATGGATTAGAATAAGGCCAATATGAGA
GGAAAGTGATGACTGAGAAGCTAACAGATAGATGCGACACAACGTGGAACTGTGTAGATT
ATAACTAGGAGCAACTGTGACCTGGTTTTCTACGTACTGTCGTTAGTTACATCAGGAGCA
CGGAGGCATCAGTTGATCTCGAGGTCAGCACATTGTTACAGCATCAACTGCACACATAAC
CGAAAAGATCCATATCATGTATCACATATGCCATCACAACTACTGTTCATACTGTCGGAC
AGTATACGGTAACAATCTTAAAGTTTTCTGTGTTTCCATAAATACAGTTTTTTAATTCAG
TTTGAGTTGACCTTGATGTTGATGTCTTTCTTCAGAGGGTCTTCGACCAGAAACCAAGCA
GCTTTTTTCCTCCACCTCTAAGAAGAAAGGGAAGAGTGTGAGCAAAGGTGGAACTGCAAA
TGAAGAGGAGCCCAGAACAGATTTTCAGCCTGTTAGCATTCACTTGCATTTCAAGCGATA
TGTCTTTGATCCACATAAAAAGATGGTTCAGTCTTGA
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