SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001848_2.0
Identity
TranscriptEukaryotic elongation factor (eEFsec)
SpeciesOreochromis niloticus (Tilapia)
Transcript IDSPT00001848
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001753_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00001848_2.0 # Transcript # Eukaryotic elongation factor (eEFsec) # Tilapia (Oreochromis niloticus) # Full length # Reverse
TCAAGACTGAACCATCTTTTTATGTGGATCAAAGACATATCGCTTGAAATGCAAGTGAAT
GCTAACAGGCTGAAAATCTGTTCTGGGCTCCTCTTCATTTGCAGTTCCACCTTTGCTCAC
ACTCTTCCCTTTCTTCTTAGAGGTGGAGGAAAAAAGCTGCTTGGTTTCTGGTCGAAGACC
CTCTGAAGAAAGACATCAACATCAAGGTCAACTCAAACTGAATTAAAAAACTGTATTTAT
GGAAACACAGAAAACTTTAAGATTGTTACCGTATACTGTCCGACAGTATGAACAGTAGTT
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TCGCATCTATCTGTTAGCTTCTCAGTCATCACTTTCCTCTCATATTGGCCTTATTCTAAT
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GGCATTTTCCCTGCACAGCAAAATTAAATTTTACAGGTACTAAAAAAACTTAAGGCATCT
CTCAAAGCATGAGGATTTTTACTTAAAAAAATATTTGTCAGATGTGGTTCAAAATTAATA
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CTGACAGTTTTGTGTCAGTATATTTAGAAAAGTAGGGACAATCAGTAATACTCCAGTCAC
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TTACTCCTGTTATAAACTTATAACATTTAAAAAATAAAATGTTTCCTATCATGAATTTGT
TGGAATCTACATCTTCAACTTTTCATGTTTTTTTTTTCCTACAGGAGGTTAAATAAGGCA
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CTTAACTGTATTTTTCAGCTTCTAAACATTGCTCTTTAATATTTTGTGGTGTACCATGGG
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TACTGGCAATTTTTATCTGAATGATTTACTTTAACTAATTAACAAACTGGCTCATTTAAA
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AGAGGCTACTAACATCAGGAAGAGCACAGGTGAGGCTATCCAATATATTTTTACACACAT
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CTGAAAGAGACCCGGTGCCCCGCTCAAGCTCACAGACTTTGGCTTTGCCAAGGAGACCAC
CTCACTGAATCTGTTTGAGTTTACTGTGTAAAGTATGTAAAGCCATTAAAAAAGTATTCT
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ACCTATCATGACTTCTCTGTCTTATACCCCTGAATGTCTTATGTTATGTTCCTGCCTGAA
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TGTAGGTGAGGCTCTCTTTCTAGATATTTTTGTTTTCTCTTCCCTCCTGGTGTGGAGTCG
TGGGTTTTGAGCAACAGAAGGTAAAATAAACACTGATCAGGCTTCCCCCGGAACACGTGC
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TGTGAGCACTGATGAAGGGGGAGAGACTGTTATGTGCAGCAGGAAACATCAGGGTAGTCG
TTTCACTAAATCCTTACCTTGTATGCGAATCTTGAACTTCCCGCTCTGCCCAAACCCACC
CTCAATGACACCAGTTTCTCCTGTGGACAAGGTGACCTTTAACCCCACAAAGAGCTGGAG
GTTGGTCTCCTTCTTGAACAGGCTGCGGCCAATCACAGTGTAATCATCGGTTACCTGGGC
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TATTGCTCATCTTGTGTGATTTCATTCTGCCGTCACGAAGAGCTGATCTGTCCCACACCC
TCTTCAATTGCACCGTTCAGCTGCATTCATCGAGTCCCGCGGCCTGGCTGTCTCGCACTC
TCTTTTTCATGGTTGTGCACTTAATGGCATATTTGTTTTTATTTCTCGATTATCATCCAT
CACTAAGTCAATATAACCCGCTGCTAATCTGATAACGTGAGGGCACCGCTCTGTCTCCAA
CTCGCCCCCATCACCAGCTCGCCCTCATCACCAGCTCTTCCTTTCTCTTCTGCTTAACCC
TCATTCATTCTTGAACATTTGACCCTGATGTATCGCAAGCGTGACTGATGAGCTGATAAA
AAAAAAAATACAGTTGCTGTATATGTCGTTTGACAGACCGTCTGAACTGTGACTGTTCGA
GTTCGTCATATCTCAACAATGCCACTAATGTGTTTTTACCAAAAGGACATTCTTTAAGTT
TGAAGCATAACTGCTGCATTCTGGGAGACACACGAGCGACAACGTTAACGTCACACGACC
ACCATCTGACCTCGTGCACATGCTGTTCTGCTCCTGAGTTAGCGAGTGGAGCTGTCAACA
GCCTGAGGTGCTAAAGCAGGAAACTAATTCACACACTTGACCCCTGACCTGAATCTGCCT
TTCTATGAGGGAAACATGCAGAGAAGCTGAACTGTAACACACAGAATGACAACAGCTACT
ATCAAAATCACAGTTAGTGTGAACAAAAATGTAAATATAACTTGTTAAGTGTCTGAAAAA
CTGACAAATCCAAGTTAAGTCAGATGTTTGATGAAAACCACAGAGAGAGCGGCTCGGGAT
TCAGGACACAATGAAACAGCAATCACACAAATATGAAAATAAAGGTGGCGAGAGTATGTG
ACAGAGAGGAAGAGAATGAGAGCAAAAGGCACTCAGGCAGACAGAAGGGAAAGCTAGACT
AATTCACAGTGGATGTGGATATTCGTGTGCCACTCAGGTGTGTCCAAACAGCGCCAGCCT
CTGACAGCTAGACAGGACTAGTGGCGTCAGGCGGCCACCCACGCACACCTCTGTCACAGC
ACATGCTAAGGCATGCATACCCATCCCATGCCTCAAATATTGCTCACCAGAGCTGCATAT
GCATGCTTGTTTGTGTGTACGTGTCTGTTTATGAATATACAATAGGGGCTCTGTCTGAGA
GACACGCTCCAGTGCCGCCAGCAATGAGAAACATCCAAAGATTCAGAGCAAGCAAAAGGA
GCGCAAGGTGACAGAGAGGGCAGAGATGCAAGGAGAGGACTCCAAAGGCTGAAAGGTCAC
AACACTGATCATTTTAAATGAGAGACAAACTGCTGAGCGTGCACTCACCCTCTCCACCTG
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TTTATCTTCAAACCCCTGCAGCAGACGGCCCTGGAAAGCCAGCCGGCATGCATTGGCGTG
GATGTCTGTATCTAGCTTTGACCCAATTACTAGACAGAGAGAAGGGCACGTGACTGGCCG
TTCAAACTCCAGTAGAGCCCACTGCTCTGGGTCAGGCCCCGAACTCCCCTCTTCCTGACC
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GCAGGGCTCTGATGGAGGCGGTTTAGAGTCTGGAGGGGGCTCTGAGGCACCCGCAGGTGG
CAGCCCAAAGAAGGTCACCTTTGCCATGACTGTCTCGTGACCCACTGTGATGTGGAACTT
GGCACGGGTGGACAGAGAGCCCTTGAAGTAGCCTATCTTCCTTACAGAGATGACAGCTGC
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AAACATCTGCACCGACTTTATCTTCTTGGTCACCTGATGTCAGAGAGCATAGAGAAATAA
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AACAGACTGAGATGTAACAGATACAAAGCTAAACAACTGCAAAACTGAGAAGGAGAAAGT
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GACACCAAATAGATGCCAAGCTTTGTTTTGTTACACAAAATACACATTTCCAAAAACAGG
TGAACACATGGATGATTTAAAGGTGTCCAGATGAGTATATGTATATGTCACACCACACTT
TCGATCCCTAGCTTGACACTCTATTGTGAATTTTATGGTTGTGTTTGTTGCCTATCACAC
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TATGCTGCCTCCAAGAGGTGACCATGATGACTGCACGCAAGGCCACTGAGACATGCTCAT
AGTTTGCATCTGGTCTAAATTACCCAACTCCTGTGCTCCCAATCCACCCCCAGTCCCCCC
ATCCTTCCCTCGCACTAAACTGACACATCCTCTGATCCTAGCCGGCAAGCCGTCCCTTTT
TCTGCCCACAGCCAACTCAACTTCTGAACTTCCGAAACTCTGCGGTTCCTTCGAATGCTT
TTCCACTGCTCGGGAATGTTTCTTGCTTGTACATATCAGAAATTCCAAATTCGTACCCAT
TTTTTTGGAACACACCTTTAGCGCTGGGATTTCTACAGTGTCATTAATGGCCAGCGACCC
CTGCAGGATGGTCCCAGTCATGACTGTTCCTTGACCACGGATAGAGAAACAATGATCCAC
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ATCTTCTCTTCACTAATCCTGTTTTTGAAGCTCGGCCTCTTATGTTGACAGAGTTGATCC
GACTCAGCAGTTTTTCACACTCCAGGAAAATGTACATAAACTCTCCAGAGTACCATCCTT
AGGTTACGTTTTATTCAGCTTTATTGAATACTTGACTGAGTTTGACCAGTAAAATCAACC
AATTGTTTATCTCTCTGCAGCTGATCGAAATCAGCGAGCAGCAAAGAAACTCCATGTTCC
AGATGTGCCTGAAGTAATGTTTCCATTACAGTTTGACCACCAGAGAGCACAGAGCTTCTT
TTCCAACTGTCAAATGTCGCTCTTATTGCATACGTTTGTCACGTTTGTCTCCTCGAAACA
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TGGCAGTAGGTCAATCTTATTCAGGACAACAACCATGCGAGGGCAGGTGAGCTCTCCTAT
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CAGGTCGATGATTTGGGCACCTAGAGGAGGCAGATGTCACAGAGGTCAAAGAAAAGTAGT
GAGCTGAAGGGGAACAATGCAGTGCTTTGTGTTAAAGGCATTTCAGCTTTCCTGCTCTAT
AAAAAGATGCAAATGCTTAGAGGCTATGAAGCCGACAACAGCAATGCAAACAGGAATGGA
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GGCAAGGAGAGAATAAAAGGCTAGAGGGTTGAAACTGGAGCCGCGGCTCACTTGGTTGTC
TTTCCTTTCCCTCTTTCTTTTCCTGATTTTGGCAATCTCTCTTTCCTGTGCTCCCCTCTT
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GCCACCTAAATGGCTCTTGCATTTTTTTTCTTTTACAGTGCTGGTCACACAACACAGATG
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TGATTGATACAAACATAGTAGTCTGATAATGTACACCCTTACACCAAACACTATCAGTGT
TTGCGCTACTGAGGGTATCCCAGACATTTTTTAATGTTTTTATGGGCATACTGTTAAACT
TGTTTTGTACAAACTTGTTCATTCGTGACTGATCAGCACTAAATCTTATGATGTTCCAAC
ACTTAGTTTTTCCAATTTTCATTTGATAGTTACATATAAACTTGGGTGATGTTGTGAGTG
CCTGTAATCTACTCTGTTTCAGTCATAGTCAGTCAAATATGTGTAGTAGAATTTGTGAAT
TCTGAATATTTTTCCTGCATAAATGTCTTTTCTGTTCATCTGGACGTAGCGTTTTCAGTG
GGAGAAACGTTTCATCACTCATTCAAGTGAATTCTTCAGTCTCAGCTGACTGCAGGTTTC
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GCTGGGAGGTCAGTTCCTTGATCAATAATATGCAAATTCTCATGACAACAACCACTGATC
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GGAATGGCTACAATTACAGCATTGTAAGATGGCAGAGATGTACCCTTAGGCCCCCTCCTC
GATTCAGAGATGGTCTTTCCCTTTTCACGTAAAGGGCCTCCTTGACTCGCTCAAACCAGC
GTTCCTCCCTGTCCAGGATGTGTACATCCTCATCATTGAAAGAGTGTCCACTGGCCTGTA
GGTGTGAATTTACTGCGGAGTCCTGGCCTGATGAGGTGGCTTTTCTGTGTTGTGCCATCT
GCTTAGCCAGAGGTTGTTTGGTTTCCCTGATGAATAAATCCTGGCAATCCTCCTGGCACT
TAACAGTTTACACTATATTGCTCTGTTTGTGTCGGGGGACCGATCCTTGGGGTGGACCAA
GGTGCAGCCACCGAGACGCGGTGTTTTAAAAAAAAAAAATCCGTCACTTGGATGAGTGAC
GAAACGTTTCTCCCACTGAAAACGCTACGTCCAGATGAACAGAATCAACTTTTGGGCATT
TACTTACCTGGATGATTGAGCATGCATCAAGATGCCCTAAGGAAATTATGTGAAACTGAG
GTTTATGATGGTATTTTATGTCTGTGGTCTCACATCCAAACTTTTTGTACCCAGATTCCT
GCAAGTTATTTTATTGCCGAAGAAGACAGCATCAGCATGCAGTCACATACACACACAAAG
TAGATTTAACTGACTGCATATTTACATTTTCTGTAAATATCGCGATAAAATAGTTGTCAT
TTCTTTTGATCATTCTGTATTTAAAATGGGAAATCGTGACCCTCCTACATCAGAGCTCAC
CTCCAATGATAGTCCGAATGAGAGAAGCGTGCCCCGGACAATCCACCAGGGTAAACTGGA
GGCTGTCATATGGCTGCTTTCCCACGCTGTCCCGCAGGTGATCGGGAAGATCCACAGTGA
AGGAGGAGAAGCCGAGGTCCAGAGTGATGCCTCTCTCGCGGGACTGCGGGTTCTTGTCGA
AGGCGGCTGTGGACGCAGTGCTGCTCAGCGCCCTGGCAAGCGACGTCTTCCCGCTGTCGA
CATGTCCGAGCACGCCGACGTTGAAATTTAACGTTTT
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