SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001850_2.0
Identity
TranscripttRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43)
SpeciesOreochromis niloticus (Tilapia)
Transcript IDSPT00001850
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001755_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00001850_2.0 # Transcript # tRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43) # Tilapia (Oreochromis niloticus) # Full length # Forward
CTCGACCCATATATGGATGAGAACTTCATCAAACAGGCCTTTAGTGCTATGGGAGAATCT
CCATTTGGGGTCAAGATCATCACTCACAGGATAACAGGGTAGGATATATGCATCAGCCTA
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TGACACACTGTCCATGTTTATATTGTTTTAATTAGTGCCATGTATTACCACATCCAGGCA
GTTTTCAGATTTATTTCCATGTTTGAGAAAGTTGTTCTAATCCCTGATGTCATTCTGCAG
CAGAGCCATGTGGAGGCTGAAGACATAGATGAGGATAATGCAGAAGGTAAGGCTGAGTCA
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TTTGCATTGTTGTTTCTTTTTTCTAGAACCCATTCCCGAGTGTGACGTCGACCTGTGGAA
CAAAGATTTCATGCAGCGCAGTGAGGAGCTCTACGATGCCATGATGAATTGTCACTGGGA
GGCTCTGGACTCTGTTGACTCCCCCATC
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