SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001915_2.0
Identity
TranscriptSelenocysteine synthase (SecS)
SpeciesOryctolagus cuniculus (Rabbit)
Transcript IDSPT00001915
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001821_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00001915_2.0 # Transcript # Selenocysteine synthase (SecS) # Rabbit (Oryctolagus cuniculus) # Full length # Forward
ATGAACCGCGAGAGCTTCGCGGCGAGCGAGCGGCTGGTGTCGCCGGCTTACGTGCGGCAG
GGCTGTGAGGCCCGGCGCTCGCACGAGCACCGCATACGGCTGCTTCTGGAGAAGGTACCG
AGGGGTCGGTCCGCTCCCCAGCGCCGCGCCTCCTGCGGGGGTGCTGGGTCCGGCTCCGCT
GCCGGCTGCCTCGACTTGGCCCTGGCGTCCGTCGCGGCGTGGCCAAAGCCAGCGGAAGGC
AGAGCCTGTTCCTAGAGGGTGTGTGTGGGGTCGGGGTTTGGAGCCACGCTTTTTCTGCCC
TGGGCTTGCAGAAGTGAGAGAGTCCGGGTAGCTCACTTTGTTTGCGGCGAGGGCAAAGGT
CGCCCTGCCTCCTTTCGCCACCCCGGGGACTCGTGGCACACCTGGTGTTTGCCAGCCACG
GTGTGCCGGCTCCAGCCAGGGCGCCTGCACCCGACCCCCGCGGGGCTCGCCCCGGCCCGC
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CGGGTTCTGGCTGTGACCGGCTCAGGCTGTACGCTCTGTTGAGGGTGTGACACCTGACCA
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CGTTGTGGCGTAGCAGGCAGAACTGGTGGGCACCGGTTCGTGTCCCGACTGCTCCATTTC
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CCCCTCCATCCATGTGGGAGACCTGGATGAAGCTTCTGGCTCCTGGCTTTGGCCTGGCTT
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TCTCAAGTAACCACCGAACCTGCTCTGCCTCAGTGACTGTCCCTCCTGAGTAGCTTTTGA
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TGTAGGTGTCCATTCGGTGGCCAACTGCTTTGTAGTTCCTATGGCAACGGGTATGAGTCT
AACCCTGTGCTTCTTAACCTTACGACATAAAAGACCAAAGGCAAAGTATATCATATGGCC
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AACATTTAGTGTATACATTGCTTTATATAACATTTAATTTGTGGATACTTAATTATTTAT
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TGGACTAAGTGATTCTTTCTGTCATCAATGTCTGTGTTATTATTTCTGTAGGTATCTCTT
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CCCACGTGGGTGGTAGATTTGCAGGCACCGGGATGTGGGTGTCCGAAGTGGCATCTTAAC
TGCTAGGCCATATGCCCACTCCTAGAATTTTTTTTTTTTTTTTTAAGATTTATTTATTTA
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GGAACTTGGGCCTGATTGCGTTCTGTGTGTTCACTCTACTACATCCTGTTTTGCGCCAAG
GGTTCCCGACAGGTAAATGATTCCCAAACATTAACCTCCTTTAGGTGTGTGTACAAGAAT
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TATTATATTTAGGATTATATTACTTTCCTTTGAAATTTTTTAGTAAGATTAACTCAGGTC
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TCATTTTAACATTTTGAGCAAAAGTGCTAGTAATTTGTCAGAAGTATATTGACTAGACGT
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TTAACTTTTATAATCTTACAGGCAGATCTTAAGAGATGATCTTAAAACCATGCTCTTGAA
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TTAGAGCACATGTGTGAAAGTGCCTTTTATTAAGAAAAGATGGGTATGTTTCAGAAGGTC
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GCGCCGGCACCCCGGGTTCTAGTCCCAGTTGGGGCGCTGGATTCTGTCCTGGTTGCTCCT
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TGATTCTAAATTTTGTTTTTAGAGATTTACTTATTTATTTGAAAGGCAGAGTTAGAGAGG
CAGCAGGTGGGATGTAGGGGAGAGAGAGAGGATGAGAGAACGATAGAGAGCGCACGTTTT
CTATCCACTGGTTCACTCCAAATGGCCACAATGGTCACGGCTGGGCCAGGCTGAAGCCAG
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CCCCACAAGGTTTGATGGGTTTGGGCCTCTGCTGCTTCTCTGATTTCATTTCTCCCCCAT
CTCCCCCTTGTGCCGCACGTGTGTACGTTTCCAGGCTTTTGCTCCCCTGGTCCCTCTGCT
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GCTGGGAGTGGGCCAGGCTGATGCCGGGAGCCTGGAACTCGATTTGGTTCTCCCACATGG
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GGAAGCTGATTAATTAATCCTAATAATTAAAGGTGTACTTAGGACTGCTCCCATTCTGCA
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CTAATGTGCCTGGAAAGTGGCAGAGGATGGGCAAAGTCCTTGGCCACCTGTGTTGGAGAC
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AATAAAACTTAAAAAGAATGGCTTAATGCTGGGCATACTGAATATTCTATATTCACATAG
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TAGGACAGAATGGTAGGGACATAGCTGAATCACAAAACATGACTATAGAACTAAGTATTT
TAGAGTCAGAATGGATTGTGAAGCTTCAGAAGTAGTTGGAAGCAGCAACTTTGCTTACTA
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CAAGTAGGACAGGCGCGGTATGGGGTGTCACGTTAAATGGAGTGAACCAAGAAGTCACCT
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CCAGAAGGTGACAGCAAGTGCCAAGAGTATGAGAAAGCACCATGTTTGCACTGTGTGAGA
AACAGAAAGGAAGCCGTGTGGCTGGGCCACAGTGAATGGAACAGTGGTCTTGGGGTCTTG
AACTGTTGTAAGGATTTGGCTTTTAATTCTTGGTGTGGTTGTCAGCCATTGAAGGGTTTG
GAGTAATGGGGTGACAGGTGTCATGTGGGGACTAGAATGTGGGATGACAAGCTATTGGAG
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TGGTTCTCATACCGGCTGCCCCACTTCCAATCCAGCTCCCTGCTAATGCTCCTGGGAAAG
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CCTGGCTCCTGGCTTCAGCTGGCTCAGCCCTGGCTGTTGGGGCATTTGGGGAGTGAACCA
GTGGGTGGAAGACATTCTCTCTCTTTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCTCCCACCCCTTGC
CTCTCCCTCTCCTTCCCCCTCCTCTCCCCCTCCCTCTCTGTAACTCTGACTTTCAAATGA
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ATACTGGTGGGCTTGAGCCACGTGTAGCTGTGAAGCTGGTAAGAAATGAAATGGGGTCAG
ATCATTTTTGAGCATGTTGGTGAGGGTAGCTGCAGGGTGTAAGGAAAGTGGATATTCAGG
AACTCTTTAAGCTGGGAAGAATGCAAGTACCACAGGAAGAAATATTTTTTGGTCTTTTAA
AGCATGGGAATTTTCTTTTCTTTTTTAAGATTTATTTTTTTATTTTGCCAGCGCCGTGGG
CTTCACTAGGCTAATCCCTCGCCCTTGCGGGGCCCTGCACACCCGGGTCCTAGGCCCGGG
CCGAGGCACCGAAATCCTGTCCCAGATTGCCCCTCTTCCAGTGCCNNNNNNNNNNNNNNN
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CATGGCCACAATGGCCAGAGCTGTGCTGATCTGAAGCCAGGAGCCAGGAGCCAGGAGCTT
CTTCTGGGTCTCCCATACAGGTGTAGGGGTCCAAGCAGTTGGGCCATCAGTACCATCTTC
TAGTGCTTTCTTAGACCATAGCAGAGAGCTGGATCGGAAGTGGAGCAGCCGGGACTTGAA
CCAGCGCCCATATGGATGCCGGCACTGCAGGCTGTGGCTTTACCCACTACACTACAGCTC
TGGCCCAAGCATGGCATTTTCATCTAGGTTACTTAGGTTCTTGTCCTTGCTGTGTCATTG
ATTGGGCACTCTTCAGTGGCGCACCGTATCTGTGTTGATTTGAACCCTGGTTGATCTCTG
GCAGGGCACTTCCATGCCACGACGCCTTGATTTTCTGAGCTGTAAAGTAGGTAGTATAGC
AGCATCTGCCTCGTGTAGGTACCATGAGGGCTGAGTGGGTTGTGACCCCAGTGAGCTTGA
AGCAGTGCCTGACCCATGGTAAGCAGGGAGGTGAATTCTGACAGTAATTACCATATGACA
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GGTGCTCAGATAGTTGCTCTGTGAATAAGTGAGTGAAGGAACGGACTGGTGAGTGAGCCC
TTCCTTCAGTAGAACGTGAAGTGTCTGCTCTCCTTCAGCCGTTCCGTCCCTCTGTCCGCC
CCTCCTTGTTGAGTGGCTGCTGACCGGAGCGGGGAGAGAGGTCCCTGTGCCGTTCCTGAG
ACTGGATCCGGCGTGCTTGCTTTCTTGCCGGAGCGCACTGCCTTCTGCCTTCAGCGTTGT
GATGAGCGTTCTGCCAAGGCTGGGCGCCGGTGCTTGTCTTCCTATGACTGCTCTCGCTTA
GGTTCAGCTTTCTCCCAGGAGCTGGGGGTGCCACATAAGTGTCCACAAAAACCGCCTCTG
AGTGTTCCTGTTTATTTTTACATGCTATTACTACACGTGCTTTTCAGTTATGTTTTCTGT
TGGTCTTAAATACTTCTTTCCATTTGCCTGTGGTAGGGTGGGGTCCTCTCTTGTCCTGAC
TTCTCAGGAAGTGGAATGGTGGCAGGGCAAGGTGCAGACTTGCACAGTCGTGTGATAGCC
CCTAGAGCAGTCTGCGGCCCTCGCCTGCCTGTGCTGCCTTGTGGCTGCCTGCATCTGCTC
TCTCAGAGTAGGCCAGCTCACTGCTCCTATTCCCCTGAGATCTGGGTCTGGTGAGACGGT
GAGAGTGAAGGGCAAATGTGGTTATAATATTAATAGGAATGTAGATTGTGAATACAGATT
GAAGAATCTGTGGCTGCAGATAAAGAAAAAAGCCACCTTAGTTGACATTTAGATAGTATC
TCTTTTTAGGAGGGCAAAATCGAAGCGCATTGGACAGAAGGTCATAGACTGTGTTGGATG
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ACTTGAATTACTAGAAACATTGCTTTTGGAACTGCCACAAGTATACAAGTAAAGTTTCTA
TCAGTTGATGTTAAAAATAAAATACTGCTCTTCTCCTTCGTTTTCCGAGTGATACTGTCT
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GTGGCATCAGATTATGGTGGCCACTCTTGAACTCACAGAGGCTGTTTGAAACTGCTTAGT
AATTGTGGCATCACTGTGGGCATTGATGACGGATGAGAGGCATGGGAGGAATCCATTCTC
TCTTACACAGTTTTAGGGTGGCAAGCTCCATTTTGATAAAATCCCCCCGGACAGATACTG
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CGTAGACTGCACAGTGCTGCTCCAGACGTCATGAGGATGACTTAAACACTTGGTTTAATA
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TAAAATTTCTATGCATTGTTTCAACTTTAAAATTTAAGAAGTGTTAGCAAATAAAAGAAT
TCTGTAAATTTGGAGGGTATAATGTGATGTTTTGATACATTTGTATGTTGTGAAATGTTT
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GGTGCTCGGGTTGGTAGAATAGACGCTTTTGTACAGAGCTTGGACAAAAATTTTATGGTT
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ATGTATCCAGGTAAATAAATGAGTTGTTCTTCAGAAAAAGTAGCATAACAAACAGAAATC
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CATTACTTTACTATCGCTTGGATCGAGTGGCTATAAGAAGTTGTTAAAGGAAAGGAAGGT
GAGCACTGGTGATTTTGCCTTCTGGTTATCACATTTGGACTGTGGATACCTAATATGAGA
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TGAGCCTGGGAAAGCAGGGGAAGATGGCCCAAGTTGTTGGACCCTGCACCTGGCTCCTGG
CTTCAGATTGGCCCAGCTCCAGCCATTGTGGCCATTTGGGGAGTGAACCAGTAGATGGAA
GGTCTGTCTCTGTTCTGTATCTCTCTCTGTCTCTCTAACTCTGCCTTTCAAATAATAAAT
AATTAAAATTTAAAAAGCCTGAAGACTTCTTTGTATGTGAGTATCAGTCACAGGAGGAGG
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