SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001988_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein T (SelT)
SpeciesOryzias latipes (Medaka)
Transcript IDSPT00001988
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001894_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00001988_2.0 # Transcript # Selenoprotein T (SelT) # Medaka (Oryzias latipes) # Full length # Forward
AAGAGGATGAAGATGCAGTTTGCGACGGGGCCTCTACTCAAGTTTCAATTTTGGTAAGTA
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CAGCTGTACTGGGGAAAAAAAGTTTATTTTCTTTTGATCTGAGCTCTCACTGGTCACACC
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AAGCATCGCTGCGCATGTGCTGCGGTTTCCAGGGGTTGCGCACAAATAAACGATGCGTAG
AATTAAAACGGCAGGTTCCGCTGTGTGCGTGGCTGCAGCTCTTCTCCTGATATCCTGTTT
GCTCCAA
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