SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001994_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein U3 (SelU3)
SpeciesOryzias latipes (Medaka)
Transcript IDSPT00001994
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001900_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00001994_2.0 # Transcript # Selenoprotein U3 (SelU3) # Medaka (Oryzias latipes) # Full length # Forward
ATGGCAAAAGTTGACCTTGCTAAAGTTGGGAAGAATGTGGTGAAAAGTGCTGACAGCGGA
GAGGTGAGTGAACGAATTACTCATGACATGTGACGATCACAAGTTTAAAGGCTACTTTCT
ACGTTTTTACTTCTATTATTCATTTAATTTAGTGGTTAGTTTATAGAATTGTTGCTCTTT
ACCTCTAAGCGTTTGTGTTTCACTAAGTTTTAGCCTACTCAGAGCTAGTTTTGATGAGTG
AATGTGACATAATGAAGGTTTTGTAAGACCTTTACATCATTGCTGTCTAAAATCAGATCA
AATACAATTCACATAGATTTATTTTCAAAAGAGCAACTTTTGTCTTCAGTGTTACTATAT
TCTCACAATTTCTTGATTTTGCTTTAGCCTTGATCATTACCTCTTTTTCCTAAAAACATG
TTTTTCCCTCAGAATGTGGAGCTCCAGTCTCTGTGGCAGGAACAGCCGGTGGTCTTGTTC
TTCCTGCGAAGGTTCGGTTGCCAGGTGTGCCGATGGATGGCGTCCGAAATCAGCAAACTG
GAGCCAGACCTGAGGGCCAGTGGTGTGTCGTTGGTGGGGGTCGGACCAGAAGAAGTTGGA
CTGCAGGAGTTTAAGGAAGGAGGCTTTTTTAAAGGATGTAAGAAGCGTTAAAGTCATTTG
TTTACAGTTTATTTGGTGTTTTCTACTCCAGACATTAGTTAAAAACTAAGTGTTTTCATT
CACGGAGGAACTTTAGTTTAAATCAGCCTCTGCTAATATAAAAACAAGAAAGAAACGGCA
ACCATTTTTTTTCTTCTATTGCAGCAAAGGTATACGTAAACTGTCGACCAGTATTTATGG
TGTAGTGACACACCCAGGGTGTGTCTGTGGATTCTGTTATGCTAACTGGCTTCTCTGTGC
TCGCGTTAATAATTAGTCTCCTTTTTATTTTAGCTATTTACGTCGACGACCAGAAGAGAT
GTTACAAGGATTTGGGTTTTAAACGGTGAGTTCAGTTCCAGGTTTTCTTCCCCTTTAAAG
AAGTGACCCCCAACCCCTAAGGACGGGTGGCACAGGCCGCAGAGAGAGAAAATAACACAG
CCTACGCATACAATCTGATTCTGAAGGAAGTCTTATTTTGGAAAACTACTGGATTCTCTC
CATCACTCATTCTTGACGCCTGTCAAGTCGCTCCAACTCGTGTTGAAAATACATCTTTTT
TAAAGCTGCTGGATTGATCACTAAATTCAACAGCCCAAACTAGCAAAGTTAACAAAAAGC
ACATTTCATTTTGCAAAAAAGAGTCCACAAGGAAGCAGCAGAAAAGCCTTTGATCTGCAT
TTAACAAACTGGGAGTCTTTACTCCTAATGTGGATGGATTGTGACAGTTGTTCCCACGGG
CCACAGTAACAATGCATAGTATTTAGCAACCTGCTGTCTAATGTTATGAGGATGCTGCTA
ATAAAGTTGTTCATACTGTTTATCATTATATTTAAAAAAATACAAGTTTTAGACACTTTT
TAATTGTTTTATATTTCCTTTGGTATTTATCGGTCTCACCTTAAAAGTTGGACCAGGCTG
AAGTTGGCATATGATTTTTTTGGCTTCCACTTTGACAGTCATTCCCATTTTAATGGTTTC
TACACAAAATCAAGCCTACATATAAAGTTTATAGCAGCTGCAGATATTTTACAGAGGATG
AAGATAAACTTCAACCAAAAGTTTAAGGGAAACTGGAGGCCAAAGTACAGCCTCGCACAG
GCCGGTCCGTGAAAATATTGGGACATAAATCCGGTCTGTCGCCTTAAAAAGGTTGGGGAC
CACTGCTATAGAGTAAAATGCAGATTACTTTATTTATTTATTTTTTACTATTTTCTGTAT
CTCATTCAATGTAAAGTCCTTCACAGAGACGTCTTATCTCTGTTTTGAGATTAGATAAAG
AAAACAAAGCAACAAGCATATCAATACAATTTCCCGTTCATTTTATAACAAACCTCCAGT
TTTGTTTTAGCTGTGTAAAATTGACCATTATAGCCTGAGTTTGACTTGTTATGTTTTTGG
TTGAACATTTTTTTGTCAGGTACACAGCCATAAGTGTCGTCCCTGCTGCTTTGGGGAAGA
AAGTCCGGGACATATCCTCAAAGGTATAGGTCTTTTAGTGAATCCATACGATTAGTTTGA
CCATTTTTCTTTATCACAAACATTTTTCTTAACAGTATCTATGGCAAATGAGGTCAACGA
ACTTTCTTTGGCTATTTGTCAAATGTTCTGTTTTCAGGCGAGTGCTGAGGGAATCCAGGG
AAACTTCTCTGGAGATTTGCTCCAAAGTGGAGGCATGCTCATCGTGGCGAAAGGTACAGT
CGGTTCACATCATTTAATGTCCGTTGTAGTTATTTAAAAACAAAGCCAAAGGGTAACTGA
ATTGTTTTATTATTGTGGATTTGAAATGTTCAAGTGCTGTAGCTGGGGAGATGTTAACGC
TGCTTTTAAAAAAATGCATGAAGAAGCTGAAATTACCACCAGAGCTAAAATTACCACTAG
AGGGCAGTATTATATCACTTGTTAGCCATATGAGCCAAATCCTCCAAAACTCCCACAACA
TTTAGAGCTAATAATAATTTTTTTTTACTACTTCCAACTCTTAAGTTGAAATTCAGATTG
ATTATATGATATGTAAGTATTCAAAATAGAATGTGAAATAGCAGTTCAGAAAGTGAATCT
AACATAGAAAGGATTGAGAATTGAGGGATAACAACTTTCCCATTATGTGCTGTTGTGTTG
GGTCATTTTCATTGTCAGGAAAAAAAGCACAGTCCAAATACAAAAGCCAGTGATTCCGAC
TCTCTGTTCGTGTGATGCTCTGCTTTATGTTGCTGTAGGGCGGCGTGCTCTTTTGAAGTT
ACAGGTCACCCTGTCCCGTGTTTCCATCATTTTTAAACTCTTGATTTAAGTAAAGGTCTT
TTCTGTTCAAGCTCAGGTCTATTTCCAATGTTTACACTTTAGTATCAGATGTAGGTTTTA
GACTATGCTTGTGGCCCTCTCATTATACAAGCTATATGATGCAGCATTTGACTACTCTTT
TGGTATATTTGTCAGTGGAAGTATCTTCACTAAACAGTGAGTGAACTCCATATAAACTTA
TAACTTTCACTAGACAAAGTCAGATTTCTAACAATCTTTTTTTGCTGCATGACATTAAAA
ATGTTTTTTTGTTTTTTTTTTAAGGTGGAGAAAAGGTGTTACTGCATTTCATTCAGGATT
CACCTGGAGACTTGGTCCCTCTTGAAGACATCTCCAAGGCTTTGGGCATCACTGCTTCCG
TCAAAGCAGGCCAGAAGCCGGTGGTAAGACATGTCATTTGCAGTTTAGGTTGTAGCCAAG
GTTAAAAAAAGGCAAATGTTTTAACTGCCGGTTTAATTCCTGGTTGTAATATTTATTGTT
TTTGCCATATTTACCTTTTTTGCATCCATCAATGTGCAAAAATGTGTCAAAGTGGGATAA
AATTTATAGGCCATTTTTGGATAAAAGCGCATGCTTGATGATTATAAAAACTGAAAACCT
TGACTCTGTAGTTAAGATGGTAAAATATATAATGAGCAAATAGAATTGATGTTTGCCCGT
TTATTAAATAGCAGAGCTCTGATTTACGTCAGTCGAGGCATGAGTCAGGGTTGTCTCTTT
GAAGAAAATGTATCTCTGATTGGACCATCCTTATAATCTGGGTTTGTGAGAGGCACCAAC
AAGTTCCTAAATGTCATCTGTGCACCCAAAAATACAAAGGAAATCCTATACTTTTGGTAC
TGAACTAAATTAACCTCTGATGTTAAGCATTTTCAAAGTAACTCATTCATTTTTTCAATG
AAAAAGCTGATAATTCAGCTGCAAACCTCAAATCCAGGCCAGAATTGCTGGGACAAAAAC
AAACCAAAAAGGCTGAGATCATCCCCTGCAGTGGGATTTTGCAGTGGGATGGAAGACTGC
TTTATTAGAAGGGTTAAATAACAGAGACAGAACAGTGAAGCTTCTACCACACAGTGAAGA
ATTGTGCCATGCATCACGCATTCCCAGAATCAGCATTCATTGTAGAGTTGGGCTTGTACA
CCTTCAAACAATCGGAAGACATCAAGGGACTCAAAAGGATCCTTGAGATGAGAGTGGTCG
TCCTCAATAACATAAATTCCTGACGGTCCGCCCCTATTATTTCTAAATGATATTCTATGG
TTTTGTGATGTCAATATATAATGAAGCAAAACATTTAGGTTATCGCACAAAATACAGCTT
TTGTTCTGTATTTTTATAGCATCGATTCTGAGACAGACTCCTCAGTTCATTGACTGACGT
AGGATCTGAAAGCCCACGGCTTTATGGGGTTTTTCCTATGACCACAGGGGCTTTCCACAG
TCCCAAAACATTCAACTTTTGCTTCCAAACTGATCAGAATCGTTTAATATCATTGTACAC
AAGAGGCTTGTTACAACGAAGTTACAGGGGCTCTCCAGCTGCTTCAGCAAAATAAAATAA
AGTTACATACATGTTAGAATGAAATAGAAAATATAAGGAACTATGGAAATATACATTGAT
ACAACTTACATACATGTATTGCACGTAACTTTTATTGCACCTTCAGACTGTTAGATATTG
GACATGATTGTTATACAGATGTTACAGTGTTTTTACTTTGAAGTTCACATTTTGTTCAGG
ACGTTGACAGCTCTGGGGAAAAAAAAGGTTTTTAGTCTATTTGGTGTGACCTTTGTGTGT
TCTGTGCCGCCGGCCTGACGGTAGCAGTTGGAACAGGTGGTTGTTGGGATGGTGGAAGTC
CTTGATGATTTGTTTGGCTCTGCTCGTGTAGCGAGAGCTGGCGATGTCCTCTAGGCTGGG
CAGGGGGGAGCCAGTGATTTTCTGGGCAGAGTTGACCACCCTCTGCAGCGCTTTCCTGTC
TGTGGCATACCAGGCTGTGATGCAGGACGTCAGGATGGTCTCTATGGTGGCTCTGTAGAA
GGTCACCAGCAGCTTCTTGTCCAGGTTGTTCCTCCTGAGTATTCTCAGGAAGTGGAGACA
CTGCTGGGCCTTCCCTACTGCCGCAGTGGTGGTCCAGGAGAGTTCCTCTGTGATCAGCAC
ACCCAGGTAGCGGATAGAGCAGACCCTGTCCACGACCCACTTATATACAGTGCTCCACTC
TCCCCTTTCTAAAGTCCTGGATTACTTCTTTAGTCTTTGTGGTGTTCTGATGGAGGTTGT
TTCCTGAACATCACTTCCACAGTCTGCTGACCTCATCCCTGTAGTAAGTCTCATCTTCCC
CTAAAATGAGCCCGACCACAGCGGTGTCGTCAGCAAATTTGATGATGGAGTTGCTCGGGT
AGGTCGAGGTGCAGTCAGATGTGTAGAGCGTGAAGAGGAGTGGGCTCAGTACACATCCTT
GTGGTGATCAAGTGCTAAGGGTTATTGTAGAGGAGAGGTGGGGTCCGAGTCTGACAGACT
GTGGGCGTTCTGACAGAAAGTCTTTAATCCATGTGCACATGGGGGAAGAAAGGCCCAGGT
GTAGCAGTTTCTCTGTCAGGATGTCTGGGACGATGTTGTTGAAGGCTGAGCTGAAATCCA
AAAACAGCGGCCTTACATAGTTCCCTGGGTGGTCTAGGTGACGGAGGGCAGAGTGTAGTG
TGGTGGATATGGGGTCATCTGTAGAGCGGTTTGGTTTATATGCAAACTGGAGCAGGTCTA
GAGTGGGTGGAAGGCTAGCTTTGATGTGTTTTGATACAAGCCTTTCAAAACAGTTCATGA
CTACAGGCGTGAGGACAACTGGCCTGTCGTCGTTGAGACTGTCCGCTACTGGCTTTTTGG
GAACCAGAATTATGGTGGAGGTTTTGAGGCAGGCTGGGTTGCTGCATTGTTCCATTGACT
GGTTGAATATTTTGGTGAAGACCTCTGATAATTGATCGGCGCATGCACTCAGTACCTTGC
CCGGTACTCCGTCGGGGCTTCTTGTCTTCCTTTCCCCTGGTGGCTCATTTGTGTGCTTTC
CACAGAGGCCATTATGTCAGAACCCAAAACCTTTCTAAAGACCATTGAGCAGGTATCCTC
TCAGCAGACCAGGAGCAGCATGCACACAACTATATCTGTCTGTTACTTTTATAAGTATTC
ATTATTTGTGGGTTGTAGGTGTTAATGGAGGGTGATGGTTGGGTTTTTATTGTAATACTG
TACATGTTTTTTGTTTTTAAATGTAAAGTGCTTTGAGTTGCACAGGGCATGAAATGTGCT
TTTCTAATAGATAAGGTTTGATTTGATTGTCTATCACAAATATATATACATAAGTAAGAC
TTGATGCAATATGAAGTTATCTGTAGCTTTGGCATGTTCTAAATGGGTTTTAGAAAAGGG
CGTAAGCTTATTAATGGGATGTACCAACCGGCTGAAAGTAAGCAGGCTTTGGGCAGACTG
TGAAATATGATCAGAACTCGCAGCAGCTGATGAAAAGCATTTTAACAGTCCTCACTCTGA
CCTCCAGGGGATCTTTAAAAACAGAAGAGACAGGCTCATCACTTGGCCTGTAATAAAACA
AAACAAAACCGAGAAACTTTAACACTGTCTGTGCTTTAAAACATTCATATTGACATTTAA
AGAAGAGATTAAACTTTGAAGTAACTGTGAATTTGAGTGCTTCTGGGGTAAAGTACCGTT
AAATTTCTGATTTATTTGATATTTTATCCAGGGAAAGAGCTCTTTGTTTTAATATTTATG
CACAGAGATGGACTTAACTGAAATGCTGTACTGATTAACACAGTACAGGTCAACAAAAAG
AATAAAAATCTTTATATAGGAAATCTAAGAATATCCATTTTTTCTTAAAAAAAATGTTGT
TTTTTTATGATAAAACTTTATAAAGAGGTTTTTTTTATTTAACAAGGAGAGAGAATTGTA
AATCTCTGCTCAGGGAATAAAGCATTTATCTGCCGATGCGACAAAACATCATATCCCTCG
TTTCCCTTTACATTTCTCCTTTATTGCCTTGGGTAAACTCATTGACTTAATGTATTGTAC
ATCTTACATGTTTAGTAATTTAGGTATCGATTGATTAAAACAATAAAGTCAACTTTTTTT
AACCAACCCATTGTAGCGCAAAGTGCACGATTTATAAAAATATCAAATTATATAGAACCG
TTCCAATTTTTTGCAAAAAATAAAACAAAGTATTAAAATTTAAATAAAATTATCTAAAAT
GTTCAACTACATAACCCACAGAAATAATTTGTTTTAAAATATGTACTGTAATAGTTTATA
AAAAAGATAATAGGATTACTGTAGATAAATAAGGTTAACTAATTAAATGTTAAGTTAAAA
AGGGGTTTGTTTTTGTAAATTGCTGTGTTCTCTGCAGCCTTCAAGCCCCCTATATAATAA
TGATTTACTGTTGGTTTTTGATTTAATTCTTTTAACGACTAAAAAACCAGTGATGGATGA
CCACAGGGTCAGCGAGGGGTTGATTTGGTAAAAGCAAACCTGTAAAATTACCCATAAAAC
ATTTATTAATCATCATAAAAATCCTGACGCACACTGGGAACCAATGCAGTGAATATGAGT
CGGCATCCTTGTTCTCTTTAGCACAGAAATGACTGATCCCCTGTGCAAATGCTTGTTTTA
AGAAGATCACAAAGCAGAAGGGTATAATAAATCTCAAGACTAGAAATAAAAGTATACTTT
AGAAACTATATGGTGGAGATACAAGATAGAAAAATGGCCTATAGTCCATAATTTAAGGGT
TTTATGTGTAAGTCATAATTTTGTTTTCTGGTTCTTTTCTTGTTGTTACAGTGCAATGAT
GATGTTTGCACACGATAA
Chart Advanced