SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002019_2.0
Identity
TranscriptSelenocysteine synthase (SecS)
SpeciesOtolemur garnettii (Bushbaby)
Transcript IDSPT00002019
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001926_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00002019_2.0 # Transcript # Selenocysteine synthase (SecS) # Bushbaby (Otolemur garnettii) # Full length # Forward
ATGAACAGCGACAGCTTCGCGGCGTGCGAGCGGCTGGTGTCGCCGGCTTACGTGCGGCAG
GGCTGTGAGGCCCGTCGCTCGCATGAGCACCTCATACGGCTGCTTCTGGAGAAGGTACCG
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GTCAGTGAACCCAAGGGGTGTTCTTAGCGGGTGTGTGGGGTCGGGTTTTGAGTCCAGTTT
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GATGAAAGTACACTTGAACTCTTTTTACATGAACTTGCGATCATGGATAGCAACAATTTC
TTGGGCAACTGTGGTGTGGGAGAAAGGGAAGGGAGAGTGGCATCTTCGTTAGTTGCTCGT
CGTCATTACAGGTATTTTTTAAAATAGCATGTGAAAACATACCCCCCGCCAATTAAAAAT
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AACAGCACAAGCTGTATATTCTGTTAAGAATGTTTAATTGAATAAACCTATTTGATTGTA
AGAGTTTAAAATATGTTAAGGTTGTTTATAGTTTTCCATATTTCTTTTCTAACATTCCTG
GGTTTTTTAAAGAATGGTTTATAGTTAGAACTTTAAAACACTGTTCATCTGTGTCTCACC
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GTGGCATTACAGCTCACAGCAACCTCCAACTCCTGGGCTCAAGCGAGTCTCCTGCCTCCG
CCTCCCAAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCCGCCACAACGCCCGGCTATTTTTTGGTTGCA
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GTGTAAAAAACTGCCCCCAAACTTAGTAGCTTAAATTATTATTATACTGTTACAATGCAC
TCATAGTTCTGTGGGTTAACTGAGCTCAGCAGGTTGAGTGTTGCCTTGGATCTCTTGTGC
AATTGCAGTAAGACTTTGGCAGAGAATTTAGTCATCTGAAGGTTCAAGTGGGCAGTGCAT
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CCCAGTATGACAGCTGGATTGTAAGAGTGAGCACCCCAACATCAAGCCCTTTAAGATGAC
TGGTAGAAACTAAGACTTCTGTTGACCTCATGGGAAAGTTCCGGAGAATCATTTCTCCTA
GATTCTTCTTGGCCAACCAGGGCACTAGGGCCAGCTCAGATTCAAGAGGAGAGGAATTAG
ACTCAGTCTCTTCATGTGGGCGTGAGGGCATAGGGATAAAAAGAATTGATCATGGCCGCC
TTTGGAGATTAGCTACTACAGCTTAACTGATGAAATTGTTTCAATTTAAACAGGATATTT
TCACATTATTAATACTTTATGAAATATGTCTACAACAGACAAATACTGTTTCTAGTGTTT
TTTGGTTATTACGTTTGTATGTCTGTATGTTGGATTACTTAGAACACTGAATCTATTTGT
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TTCTGCTGTGCAACCAAAAGCTGCGGGCTCTAGCCTTTTGAACAAAATTACCAATTCTTT
GGTCCTGGACATCATAAAGTTGGCTGGTATGTACCATATTCATCATAATATTTTTGGCTG
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GCTAGGGCTACAGCTCTTACTGTATAACAGAAGAAATAGATCATTTCTTTAAGAAAGGTC
CTGGTGTTTCAATGGGATAACTAATTTCTATTTTACTTCTTATTTGTAGGTGTCCATACA
GTGGCCAACTGCTTCGTAGTTCCTATGGCAACTGGTATGAGTCTAACCCTGTGTTTCTTA
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TCCTGCTTTAAATCCATGATCACGGCAGGTAAAAGAAATGTCAAACACAGAGGGTGCCGA
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ATGCTTCGCCTCTGCCATTACAAGAGGTGCTCAGTGTGACTTGTATTGATGTTTTATTAT
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GGGAGGTCTTAATTTTTTTCTGTCTGCATGGATTTTACATTTCTTGATTTTTATGTCTCA
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TTTTTAAAAAAAAAATCTGTGGTAAAATATATAAAATTTACTATAAATACTGCTTTAGAG
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GTGAACTTTGAAGTAAAACAAATATTACTGGAGCATGGGCAGACTTTTCTGTGGACTGAA
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TTAACTAATGAAGCTAGGTCTTTTTTTCTAAAGGAAGGTTCATTGGTTAAAATAACTGTT
TAGAATTCTTGTGTAGAATATTACACCTTCCTGGTGTTCCAGGGTCTTCCTTTATTTTAG
TTAATACTAACGTTTGGATTTCTGATTGGCTTGGGTAGGTTTTGAGCCTGTGGTGATAGA
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GGAACTCGGGCCTGATAACGTTCTGTGTATTCATTCCACTACATCCTGTTTTGCTCCGAG
GGTGCCTGATAGGTAAATGATTTGTGAATATTGTCCTTTAGCTGTTGATTAAGTCTTTTA
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CACCCGGGTAGGGGGAGGCCCTCCGTTTCCTTGCTCCTCTTGTGATTTAATAGAAGTTTA
TTTCCTAAGCTAAAGGTCGGGTTTGCTTGTCTTCACTGTTGTCTCCACTTCTTTGATCTT
ACAGTTTTCATATGTAGAGATTACCATCAGCATTAAAAGATTTTACGTTGAAAATTTTAG
GATTATTTACTTCTGTTTGAAATTTTTTCATTGGAAGAGTAACTCACATGTACACTTAGG
TGTGTGCATAGATCGTCTGCATTTGGGGAATAATGCAAAGATTTAAGGAAATAAAAGTGA
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TTCATTTTAATGTTTTCAACAGAACTGCTAATAATTCGTGAGAACTCTGTTGACTTTTGA
CATTTTCGGTACCATCAAGTTAGACTTTGGTTTTAATTCATGGACTCCATTATTTGGCAG
TAATGAATGCCATGCTGGTTTTTATTACCTTGTAGGCAAATTTTAAGAGATAGTTCTAAA
ACCATGCTCTTGAAAATTTCCCTTGTTACATTCACGAAGCTATTTCAAAATTACATTGCA
TATGCCTTAGTGCTTTATTCATTACCAATCAGATGTTAAATTTGTATTGAAATATTAGAC
ATTTATTTTTTCATTGTTGATGGTTTTGATGTCTGGAAAATTTTTAATGGGATAAAAATA
AGTCACACTTCAATAAACAGCATATGGATTTTGCTTTAGTTGGATTAGTTTTTGTTTTGT
TTCATTTTGAGTAATGTTTTTTGACTATTTACAGCGTGCCTGGTACAGCATTAAGTATTT
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CATTTGCCACTGTTTAGAAGAATTATATAATGAATATTTTTGATAAGAGTGAATTTTAGG
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TTACATCAAACCTAATTCCTTTACAGCCTTAATTTTATGGGTATATCTCTTGTCTTTATT
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TGAAGGAACATCTATTCATTATGCTCTGACTGAAATTTATTACCTTCCTCTGCATAAAGT
TAGACTCTAAAATTGGGAAGTATAAAATGAAAAAAAGTGGATAAGAGTGGATTTAAAACC
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TTTTATTTTATGAGTTGTTTAATGTGAGATTTCTTAACATTTCCAGATATGCTGATTATT
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TTGGAGGGGTCATTATAAATAATTCTCTGGCTTTTTATGTAGGAAAAAATTTAAATATTT
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AGCCCAGTGTGAGTATGTCTTTCGGTTGAATATTTATGTTTGTAGATTAGAAGAACTGGC
TGTGATTTGTGCTAATTACGACATTCCACATATAGTCAACAATGCTTATGGAGTGCAGTC
TTCAAAGTGTATGCACCTCATTCAGCAGGTAAGAGGGTTTAAGAGCTATGTCAAAGAAGT
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ATTATTCTTTCATAGAATGGTAGTAATTGTACTAATGGCTTTGGTAGTCTAGAATCAACG
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TATTGCTCTGCCTGTCAGCTGCTCTTCTCTGACCTTGCTTGCCAAGGCTCAGAAGTACAG
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TGGAGCGTCTTGAGTAGGAGAGAGTGACTTTGTGGGGAATAGACTTCAGGGAGGCAGGAG
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GGGTGACCTTTAATTGCCTTGGTTTGAATCCCAGCTGTGCTATTAATTATATGTCTGATC
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GGCAGGAACAGAACATGTTCCCGTGCTTCCTGTTCTCTGTAAGCTCTTGCTTCCTTTTAG
TGGATTTCCCCGCCCACCCCTTATTTAGCACGGGAATGAGGTCTGTGCATTACTCCTGAG
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AGGTTCTAGAAGAGTCTGGTGCACAGATTCCTCTATTAGTACTTCTCCCAGATTACATTC
ATGGTTCTCTGAGGAATCCTTGGACAGTACATAAATGTTAATAAAAAGGCAACGTTGACG
TTCACATTATTTTTGTGTGCTTCTACTTTGTATTTTTTCAGTTATTTATTCTGTTAATCT
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CTCAGATTAGACCAGCTATCTGCTGCTGCTTTTCTCCCTGAGATATGGATGTGTGAAAAT
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TGATGTTTAAAATTTTCTTTTCTCTTTTATTATCTGAGTGGTAGTAGGAGTAGAGCTGGT
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GCTGGTGGCTGCGGTCCATTAGATTATGGTGGTCACTCTTGAACTCACAGAGGGTGTTTA
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ATCTCTTAGAAATTCAGTTCAATACTCTGGTACTATTACAAAGAAAATACAAATCGGTGA
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AGGTTGAGTTGACAAAAATTTTATCTGCTATGTATAGTGTGATGTTTTGATGTGTGTATA
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TCATTCAGGAAATCAGCAAGATGTATCCAGGTAAATAAATAAGTTGCTCCTTAAAAAAAG
TAACTAACAAACAAAAATCTATTTATATGTAGATTACCATAATAAATCTTAATTTCCAAA
GCTTCTCCGTCCCCCCAGCCTACCTTCCTCAATGTAACTTGTCCATTTTTATTTCAGGAA
GAGCTTCAGCTTCACCTTCTTTAGATGTCCTTATTACTTTATTATCACTTGGATCTAATG
GCTATAAGAAGCTATTAAAAGAAAGAAAGGTAAGCTTTCCCTTTAGGCATAGAATAATAT
TCTTGACTACAATAGCATGCCAAATCATTGGTGTTTTGCTTGTCGGTTTATTACATTGGG
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TGGTTCTCAACCTGTGGCTCACTCCTTTGTAACAATGAAAATACATCGCAGCATGAGGAA
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GGTTTTTTACTATCTCAGTAAAGTTCAATTCATGTATTGCTTAAAGGTAAAGGCTCTTTA
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GTGAAGTGATATTTGTGCTTGAAAACTGGACTTTGTCTCTAATACTGAAAACTAGGTTAA
TTCAGGACAACTCCAAAATTGTAGAGAGAGAGATGGTGTTGGCAGGTCAGATCAAGGTGT
TTTATTCATCTCCTGTTTGGGAGAGCTAGAGGCCCATGTTATGGTTTTTATATCTATGTA
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TAACTGAAGTTTAAAAATATTATATCCTATTTTACCTTCTCCCACTAGTTCAGTCCATGA
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TCAAAGTCATTAGTCATTAGAGAAATGCAGCTTAAAACCACAATGAGATACCACTACACA
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TTAAAAAGGAACAAACTACTGATTTCATTATGCTAAATGAAAGACACCAGACATAAAGAA
TTGCATATTGTGTAGTTTCACTTACATGTCATCCTGGAAAAGGCCGAAAATATAGGGACA
GAAAAAGATGAGTGGCCACTAGAGGCTAGGGAACTTTTGTGAATATCATGAAGTGTTTCA
TATCTTGATAATGGGAATGTTTTCATAACTGTGTATGTTTGTTAAGATTCATAGAAGTAG
ACACTTAAAAGGTGTACACCTGAAATTTTACTGTGTGTGAATTATACTTCTGTAAATCTA
ACAACACATTTTTATACAGTAAGAAGAAAGCTTTTGGTGGGCACAGTGGTTCACACCTGT
AATCCTAGTGCTCTGGGAAGCTGAGGCAGGAGGGAGGAACCCTTGAGTTTAGGAGTTGGA
TACCAGCCTGAGCAAGAGTGAGACCCTGTCTGTTTCTACTAAAAAGAAAAATTAGCTGGA
TATTGTGGCAGTGCCAGGAGTCCCAGTGATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGA
ACCCTGGAGTTCGAATTGCTGTGAGCTAGGCTGATGCTGTGGCACTCTAGCGTGGATAAC
AGAGTGAGACTCTTGTCTCAAGAGAAGGGAAAAAAAAAAGAAGAAGAAAGCTCTAGTATA
AACTCTAAAAGGTAATCGTGGTCATTGATTGTTTTGCCAAGAGAAGAGCTCAGTGCATCT
TTTACGGAAACTTACCCACATGTCAGATGATTACTGTCTGGTGGTTGAGGAAAACCTAGG
ATGTGTTTGTGTGACAGTTGAGTTGTTTCAGATGATAGTGCGTCTTAGCTCTCTTTTAAC
AAGTTGTGTCGTCTTGGAAAAGTTAATTTGAACTTGAAGCTTTTATTTCCCTATTTGTGA
AAGAAACAATTGGTATCTCAGGCCACTTCTATTTCTGAAAGACTTTAGAATATTTCTTAA
AAGAGTTACTTTCTGGGCTTTGAATATTAAAATCATGGGAATTGGCCTGTAATTTGTAAT
CCAGTGCAAGACATATTGGTAGTTTACAAATTGGACATTGTGTAAGTTTGAAATGTTTCT
TTTAAGATGATAATCTCTTTAGTTTCATGGTACCTCATATCCCTTTTTATTGCTGTCAAG
CTATCTTCAACCCCACCCCCATCTGAATAATGACAAGCCCATTTAAAATAGCATGATCTA
GTATGGACCAGTGTTTCTTTGAAATTCAAAGTAGGTGAAGTTGAGTGTGGGATAAGATTC
ATTGAGAAAATGTTTAACTCAATAAATAATTGTATTTATTGAGCATATATTATATGTTAG
GCAAATATATATGTGTGTGTATATACATACATGTATATATCTATGTTTATATAGCATTCA
ATAAAATAGAAAAAGGTATCTATTCTTGTAGATATTCTGTATGGGAAGGACCAGCAATAA
ATAAACAGCCTAATATATAAATTATAAAGTTTGTTTGAAGGTGCTATAAAGAAAAGAAAG
AGTAAGGAGCATTGGGGGTGATGAGGTGGTTGGCAGTGGTGACTGATTTTTGAATATACT
TTAGGAAGGTGTACACATTGGGAAGGTGACATTGGAGGAGTCAGCTTGAAGTGTGAGGGA
GTGTCGACGTATGACGGCAAAGACCGTTTCAGACAGAAAGCCAGGACGAGGACCCGAGGG
CAGATGTTGGCCTTGTGTCTGAGGAGCTCCAAAGGGGCTGTGTGGCTGGAACAAAGTGAA
CAAGCAGAGCTGTGGGAAGTGAGGTGAGGCTGATCATGTAGGGCCTTTGAGGCCATAAGA
AGCTCTTTGTCTACTGCTCTGTGTGAAATATTTATTTTTTTCAAGTATCTTTGATCCACA
CTTGACTGCATCGGGGGAGTCAGAACCTCGAGAGGACTGACTGTACATGAAGGTGGAGGG
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TGGTTAGAAAAGTTTCAGGCAAAGTCGTTCTTAGTTAGTCTTTCCATGCAAGGTTTACGT
TGTCTGCGTACTTACCGTGCATGTGTTAATGCGTTTGCGTAAACATGAAATAATTACACA
TAGTACTGAGCACTGAAAATGGGGTGCCAGGCACTCTCCTAAGCACGTTGGTTTTTTTCT
TCTCTATTCCAGAACAACTTTGTTCTCCTTTGCCTTCTTTGTGTTGTTATTGGAAAACAT
ACTAAATTTGCATTTGTTTAATAGGCCCAATGATAAAATTATATATTTTTTAAAAAATGA
ATTAAGATAGGAAGTAAAAAGATATGCTTTTTTATACTGTTTTTTATAATGATACAATTA
CTTTTACCAACACTCTTTCTTGTTTTATGTGAATTCAAATGAGTATTTGTGATAAGTTGA
TTCCAGGCTAAACAAAGTTTGTTTTTATTTTCTGTAGGGGGAGTCACTAGCACTAAATTT
TCTGGTTTTATTTGTTTGGAATGTGTTTATTTTGCCTTTATTTTTGACAGGTAGCTTGCC
TTGGTATAGAATTCTTAGTTAATGATCTTTATTTTTTTTATTTTTATTTTTTTAAATTTC
AGATTAACATGGGGGTACAAATGTTTAGGTTCCATTGTTTTCATTTTTAAGGTAAAGTTC
AAGTTGTAGTTGAGCCCTTCACCCAGGGGGTGTGCTGAACAGCCTCACATTGCTAAGCAC
TTGTTCCGTATTCATTTAGCCCTCAGAATATCCCCATGGGGTAAGTATTATTGTTATTCT
CATTTTCATAGGAAATGGAAGGACAGAGAAGTATCATATATGAGGTATATTGTAGAACGT
AGATTTAAATCTAGGCAACTAGGTCTCTTATCCTCTGTTTTAACAAGGATAACTAGGTCT
CTCATCCTCTGGACTCTGCTACCTTTTAAAAATACAGGTAAATAATCTAGCCTGGTAGTT
GTGTAGCTGTAGAGTTATAAGTCTAAAGACTCAGGTCCACTAATACCTGAAGAAGGCAAA
AGCAGTGAATAAATTTAACTACTCGAGCCAAAAAAGCTGTTACTATATAGAGCGGGTATG
TTATTTGCTTGTGCAGAATCACTGTCATTGGGGAGCTGCCCGTCCCTGGCTCCGGGTGGT
CCTCATGAGTCTGTCAGTCACAGTGTCCCTTCCACCTGTTTCGTAGGGGTGGGCATGTAA
TTTGGCTGGCAGGTAGGCATGTGGAGATAGAGTCCTTCCAGTAGATTTGATAGATCTTTT
AGAGACAAAGACCTTTCTTTGCAGACAGTAAGCTGAAAGGATATAATCTTAGAACTGTAA
GCTACTGTATTTCTGGCCTTGCAAAGGGAGAATTCTTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNN
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AGATGCTGGATCCAGCCATGCCTGCTTGTAAACCTGGTTGTTAGATGGACTGATAAATTC
TCTTTTCTGAAATGAGATTTCTACCACTGATAACTTTTTCGGAGACAAGGTCTTGCTCTG
TAATCCAGGCTGGAGTGCCATGGATTTGCCTATTTCACAGCAACCTCAGACTCCGGATTT
CAAGCAGTCCTTCTTCTTCAGCCTCCCAAGCCCTGCGTCTAGAGGTACCTGCAAGACACC
TGGCTCATTTTTCTGTTTTTATTAGAGATGGGGTTTTTCTCTTACTCAGGTTAGATAGTC
TTGAACTCCTGAGCTCAAAGGATCCTCTGGCCTGACCCTACCAAAGTGCTAGGATTACAG
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