SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002020_2.0
Identity
Transcript15 kDa selenoprotein (Sel15)
SpeciesOtolemur garnettii (Bushbaby)
Transcript IDSPT00002020
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001927_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00002020_2.0 # Transcript # 15 kDa selenoprotein (Sel15) # Bushbaby (Otolemur garnettii) # Full length # Forward
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TGTTTTAGCTGGCCCAGGCAGGGTTCGAACCCGCCAGCCTCGGTGTATGTGGCCGGCGCC
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CTCTTCAAGTGTCCACACTCATCCTCTAATAGCCTAGACCAACTTCTTTTCATAGGCGTC
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GGTGTCATTTTTAACTTTTTCCTTTCCTTACATATCTCACATCCAGGCAGTTAATAAATC
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TGTTTATAGGGCAGCCACATACACCAACGGTGGCAGGTTCAAGGCCGGCTCAGACCAGCT
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TTTGCTTGCCTAGAATTACCACAACAGCTTTCTTAACTGGTATCCCCATTTTCTTCCTTT
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GTATGAGACTTATGGGGGAGAGGGGAAGTTAAAATAAAATACACATGCTTGGACTCTGCC
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TACTCTTGATTTTAGTTTCTTTAGTTCCTTCTTGTTCAGAGAGAGTGCAAAGCTTAACCC
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TTAGGCTGTATTACACCGATCCACACGGTCTTAACCAATCACAGCTGTGTTTGTGTGCAT
GTACACATGTGCGTATGCATGTATATGTCTATGCCTGTCCTTCCACTCCTCCTGCCCCTG
TGCTAATTAGAATGAAACCAAAGGGAATGCAGGGACCATTTTTCTTTCATATTTGTTTTA
ATTGTGCCTCATATGTATTGGTTCATTTAAATCCCTCTGAGGTATAAATGGCCTCCTCCA
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CAGTCCTCTTGTCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTATAGGCACCTGCCACAACTCTGG
GCTAATTTTTCTACTTTTAATAGAGACCTGTCTCACTCTTGGTCAGGCTGATCTCAAACT
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TGCTTACATCCTACTAAACAACATAGCCTTCACCTCTTTTACCCAATTACAGGATTAAGA
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AGCTCCCTTCCCTCCTTCATCCTAGGCTATAGTTGTGTTTCATTTACCATATGCTTGTGT
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GTGACCGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGACAAGAGAACCACTATGCCC
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GGACGGGTCACACAATTGTAATTGTCATAATTTTTCTTATTCTTGGAAGTACATATAATA
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GGCAGATCAGGATTAAAAATCTTAATGCTCCCACCTATTTGCTGTGTGATCTTAGACAAA
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TTTGGCATTAAAAATATGTTAGGCATAATTTAGAACTCTTCTGTATTAATTAACAGTAGG
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TTTTTAGGTGTGCTTTCATAGTGGTAGGTGGGAACAATACCGACATACATTAAATACGAC
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TTGAATCATGACGTCTTAAGAGTTCAAAATACATGTTTTGCCTATTCATGCCACCTATGA
GTAGGTGCTTGGTAAATGAAAGAATAAAACCAAATAGTGCATGTTACACATTTGAGATTC
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TTTAGTGATGTGAAATAATTGTGTATTTTGTTTCTATGTTCTGTGGTTCAGCAATTCATA
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TGTCACAGCGCCTGCCTAGATTCAGGGCAAGGGGACATAGACCCCACTTCTCAGTGGAGG
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CCTTTTCAAGAAATCAGTCCCTGAAGCCACAGATAAAGATGCAGTTGTCCACGAAAAGTA
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TGAAAGAGAAAGGGAGTGGGTGACAAGCCTCTGGAAGGAGCAGCGAAGGCAGAACAATTT
GGAATGCCTTTGCATTTGGGGGGTTTTGGCAAATTTCGTGGAGTAGTAGAATCAGAAACC
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TTATGATGTGTTCTTGCCTTCTCCCACACCATCCCTTTTTTCTTATCCCTTCCCCTGCTG
GATGAGAGTGCAAACAGATTCCACAATGACTGTTAGTCCATAGACCCATATGAACAGGGC
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AGGCTTAACTTTACATTTTTTGGTTGTAGCTATCATTATTATTTAGCAGGCCTAGGCCAA
GTTTCCAACCCGCCAGCCCCGGTGTATGTGGCCAGCGCCCCAACCACTGAGCTACGAGCG
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TCCTTCCCCGTTTTGCTTTAATTTCTCTCCCAATAAAGTATGCTCTTTGAAGTCTAGGAC
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CCATGTTGGCGCTTATCCATTGGTAACACTCTTTGGTTATAATTATCTAACTACAAATAT
AGATCTCTCATTTCCACATTTTATTTATAAGGACCCCCAAATCTGTCTAAAAAGAGATAT
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CTTGACGGTGTGCCCCTCTTTCTTCAGCTAATACATATTCTTTTTCTTTCGGTTTCTTGT
TTCTTTTGTCTTCTGCCTTGAAAATATTTTGATTTAATTGGTTTTAGCACTTTTATTCTT
TTACACCTACCTTATTTCTGAACTACTATTTTGAAGGTCAAAGTTAGTTACCAAACCAGA
GCACCTTCTGGAGAAAAGAATTGCTTAGGTGAATTATTTATCTACCTGAACCAATAAACA
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CTGGTGTTCTTAGACAAAGTATAATAATTATTCTGAGTCTGTTTTCTCATCTATAAATTG
GGGATAATAGTTTATATCAAATAGGGTGGTGATGATGATTAAATGAGTTAATATCCATAC
TCTGCTTAATTGAGCCTAACATATAACAAGTACTAGGTAAATATTTGCTGCTGGTAGTGA
TGACTAGTAGTAGTAGGAGTATCTGGTTTGCTGATTTAAAAAAAGCAAGAAAGAAACAAA
ATTTGGAGAAATCAGAGAATAGCATAATGATCACTACTGACAAACAATAAAAAGTAAATA
AATAAGAAATAAAACATGAACTGTTAGATTTGCCAACAATAACAATTTGGAACAATATTT
TCTGTTATTCTACTCAAACTTCTGGATCAGGTAAATCAAAAGGAACTTTTTTTGCAGTTT
TTGGCCGGGGCTGGGTTTGAACCTGCCACCTCAAGCATATGGGGCTAGGGCCCTACTCCT
TTGAGCCACAGGTGCCACCCAAAAGGAACTATCTTAAGATAACACAATCAGTAGCATAAA
AAGCATATTTACAACTACTTATTTGTGTGAATAAAATACAAAAATAGTATCGAAAATATA
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GTCACCCTCAGTGGAGTGCCATGGCACATCCTAGATTTCAGATATTTGAGTCCTGTCAGT
AGACAAATTTTAATAAGGAAAATACTATAAATTTTAACTTTATAAATAATTGGGTGTTTT
GTTTGTTTGAGATAGAGTCTCACTTTTGTCACCCTCAGTGGAGTGCCATGGCACATCCAG
ATCACAGCAACCTCAAATTCTTGGGCTCAAGTGATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCAAGTTG
CTAGGACTACAGGCATCTATTTTTTTGAGACAGAGTTTCACTCTTGCTCAGTCTGGTTTC
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CATAGCTCACAGCAACCTCAAACTCTTGGGCTTAAGAGATTCTCTTGCCTGAGCCTCCTA
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TATTATTAGTTAGCTGGCGTGGGCCAGGCTTGAACTTGCCAACCTTGGTGCATATGGCTG
GCACCATAACGACTGCGCTATGGGGTCTGTGCCTGTTTTCAAATTTTTTAATTAATTGGT
TGGCATTTTGTGGTACAGAGACATGCTTTCCATGAATAGATTATGGTGGGATATAGTCTC
TGAATCCTTGAAACAACCAAGTGGGGCCTGAGATAAGCAGCTTCCTCCTTTTATCCCAGT
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GCATCCTTAAGTGCGTTCACATTGTTGTACAGCCATCTTTTTCCAGAATTTTTTTTCATC
TTTTCAAACTGAAGCTCTATACCCGTGAAACTGTATTCCCTGTTCCTCCCTGTTTGAGGC
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TGATTAATGATGTTGAGCATCTGTCTCTTCATTAGCTTTTTGGTAACAGGGCTTATATTT
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ACCTATTATATAGAATTAAGTTAACCTATTCTTAAATTTTATTTCTGGGCTCGGCGCCTG
TGGCTCAAGTGGCTAAGGCGCCAGCCACGTACACCTAAGGTGGCGGGTTCGAATCCCCAG
CCCGGACCCGCCAAACAACAATGACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TGTGACCTCTCAAAAACTTAAGAACTGCTGATCTTGCCCAGAATCACAAAAATTTTAGAA
GTTACTATCTTTTTAGGCCAGATTCAGGTGATTTTTAAATTTCTGCTTTGTGCTTTTCTG
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ATTGCAATAAAATATTTGCATTGAGCTTTTTATAATGAGCTTTTATCATAAAGAGAACAT
GCAGGTGCTATAGCTAGAAAGGTGCTGTTTACCATTGAATCCATTTCAACTGAATTTCAT
TAAAGGAAAATATTTGCATTTGGGTTCTTTATAATGAGATTTTACTGGTTTGCCTATAAT
ATCTTTACATAGTACTTTCTATAATAATTACTTTTAAAAGGTATTGAGCTTCTGTTTAAA
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