SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002029_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein O (SelO)
SpeciesOtolemur garnettii (Bushbaby)
Transcript IDSPT00002029
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001936_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00002029_2.0 # Transcript # Selenoprotein O (SelO) # Bushbaby (Otolemur garnettii) # Full length # Forward
GATATTTTGGACCTCGATTTATCTGTCTCAAAAACAGATGATTTTATCCAGCTTGTCAGT
GGCAAAAAGTTAGTGTTTGGATCCGTTCCATTGGCCCACCGATATGGTGGCCACCAGGTA
AGAGTAGCAACAGTGTCACTTTCCTTATGCAAATATCATTTGGTTCTGTCCTATTAAATT
ATTTTGCATTAATTTGTCTAATATTAGTGTTTTGGGCCTGCAAAAAGATGGTCCTAGAAG
AATATGTCATCGTAAGATGTTTATGTATTAGCTGTGATAAAGGCAGAGGCTTAAGTTCCC
TTGGTGGAATTAGGAAGATTGGTGCAGTATAAGCATACAATTTCCACGAAGCATTGCTAG
GGAAGTCACTCAGTTTTGACAAGAATTTTAGGCAAAACTAGCATAGCATAATATAGCACA
GAGCATAGAACGTCAATATAAGAGTACCAGAGGGTGGCACCTATGGCTCAGCGAGTAGGG
CGCCGGCCCCCCATACTGAGGGTGGAGGGTTCAAACCCGGCCCCAACCAAACTGCAACAA
CAACAATAGCTTGGTGTTATGGCAGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCA
AGAGAATCACCTAAGCCCAAGAGCTGGAGGTTGCTGTGAGCTGTGACGCCACGGCACTCC
ACCGAGGGTGACAAAGCAAGACTTGTTAAAAAGTACCAGAAAGACAAATAGATTATATTT
AATAATTTGCCTAGGGTAGCCATGGAACAAAGTTGTAGAACTATTAGAAAGGCGGAACCA
AGATTTATGGGGGGGGGTGTGTGTGTGTTTTATATAGTGCAGTGAACAGGAAGCGATTAA
GGTACATTCTAGAAATAAGATGTTGGGACAAGTTGAGTAACTATAGTCTGACTAATTAAA
GGGGGGAAATAGGAACATAAAATCAATTGTTGAAATTTCTGTGACTTTCCTATAAACTAG
GTAAAATTAATTTAACACTCTGGTTTTCCGAGAGAATGTTTTGGTAATGCTGGTTCACTC
AGGAATTTTAGGACAATTAGTATGGCATAACAGAGTTGGTGTAAGGATTAAATTAGGAAA
TTATATAGCACGTGCCTGGGGCCTGTAGTTCTAGCTTCTAGGGAGACTGAGGCAGTGGGA
TCACTCGAGCACAGGATTTGGAGTTTGCAGTGAGCTATGATGGTGCCGTTGCTCCTTAGC
CAAATCTCTGAGCAAGATTCTGGCTCCAAAGCAAACAAAAAAAGCTATATGAAGGTGATT
AACAATTTTTCTTTCTTCTTTTTCTTCTTTAGTTTGGGGTATGGGCAGATCAACTTGGGG
ATGGAAGAGCCCACCTTCTTGGAATTTACGTGAACAGGTACCACATGTTTGCCTGCATAA
TAGCTTTTTTCCTTAATATTAATGTGAATCTTCTAATACGTAGGCTTTTTTTTGAAGGCA
GGGTGAAAAGTGGGAGCTCCAGTTAAAAGGCTCAGGAAAGACCCCATACTCACGGTACAG
TTTGGTAGCTTTTTTAATCATCTGGATAAGATCGACGTTACCTTAATGACAAATGAAAAT
CTTTTAAATTTTATTTTGTACAGAAATGGTGATGGTAGAGCCGTACTTCGTTCCTCTGTG
AGAGAATTTCTGTGCAGTGAGGCTATGCACTATCTTGGAATTCCAACTAGCCGAGCTGCA
AGGTAAATTCCTCTTTCTTGAAGGCTAACTTTCAGGGCTGCATCCTGCTATCTCCAGAAA
CATGTCAGGAAATCAAGCAGATGAATCTCACATAGCAAGTAACTATGTCTTCCAGTTGCT
TATTGTTTCGGCTACTTCTTGATAGCAGTTAAAATGTAACTTTGCTCGATTCTCTTATGT
TTCAGTCTGGTTGTGAGTGATGATGAAGTCTGGCGAGATCAGTTTTACAATGGAACGATC
ACAAAAGAACGAGGTAATGGCCATTCTTAGAATGTGCGCATAAAATTGGATCAAGTTCTT
AGTTCAGTTTTGGACTTAGATGTTAGACATTTGCAATCTTAATATAACCCCCTGGTTCTT
CACGATGTCATTTCAACACTAGATCATAATCATAGAAAACCCTTTGCCACACCCCTGTAT
CACTAATTCATCCATTTCAAACAGCAAACATCTGGGAAGTGAACAAAAAGATATTTGTGA
ACAGCTGGCAGAATGTTCCGAAGCCAATACAGTGCATACACTTTCTTCTCAAGAAAGCAC
TGCAGACTTTTCCTCAAGTCTTGTTTACTTCCAGTAAGCTCAAGTTAACTTTCCTGTTTA
GCCTTTAGTAGTGCAGAAATAAAATATCAGAAAGAGGAGGAGAAAGGGATCCTTGGAGCA
ACAGAAACAGAGTGAGAGAGACTTGACTCTGAACCTCTAGGAAGAGGAAGAGAACTGACA
TCAATAATAAACATAGTTAAGAGCTTAAAAAGTTGAGGTTGAGAACCTTTGACAGGCCTT
TGTGGTAGTGAGTCCTGTGGACATCACTGGATGTCACTGGAAGGGTTTGGGCTGCTATGA
CGTAATACCTTAAACTGGGTATTTATGAACAACATGAGTCTGTTGCTTATAATTTTGGAG
GCTGGGAAGTCCAAGACCAAAGTGCCAGCAGATTCAGCGTCTGCTTCACAGATGGTGCCT
TCTCGCTGCATCCTCCCATGGCAGAAGGTGAAGACATAAGGGGCCTGGGGCCTCCTTCAT
AAGGACGCTGATCCCATGCACAAGGGTGGAGCCCCCATGACCTAATTACCTCCCAAAGAG
GTAACCTTCTGTTGCCATTACCTTAGTAATTAGGTTTCAACATGGGAATTTGGGGGGAAT
ACAAACTTTCAGACCATAGCATAAGTTCTTATTAAAAAAAAAAATGTCCCTCAGAAGTAT
TTATGCTTAAAGGAGTTAAGATTATCCTTATGACATTTCTCTGTCCCCCCTCTAATTTCA
CCAGGATAAATAATGCTATTGCACACAGGCCTGTAGGTTTTCTTGCTTATGGTGATTTGA
TCTGAGATTCTAGTCACAGACTGTGGCAAGACTGATGCAATACTACTAACTTTTGTGGCT
GTGAGTTATTATCTGAATTCTTCGCCACAATCTTAATTGATCCCATGGTTTAAATAATCC
CAAGTATTTCTTCTATTTGGCCATTAATTAATAGGATTTCCATATCCACTCATATGTTCA
CATATTTCAATTGTGCTGTTACATTTGCATAGGGTCCACGGTGGTCCAGTGAGAAGAGTT
AGAGGCTTGGCACCTGTGGCTCAAGTGGCTAAGGCGCCAGCCACATACACCAGAGCTGGC
AGGTTCGAATCCAGCCTTGGCCTGCCAAACAACAATGACCACTACAACCAAAAAATAGCC
AGGCGTTGTGGTGGGCGCCTGTAGTCCCAGTGACTTGGGAGGCTGAGGCAAGAGAATTGC
TTAAGCCCAGGAGTTAGAGGTTGCTGTGAGCTGTGATGTTATGGCACTCTACCCAGGGTG
ACAGCTTGAGGCTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAGAGAAGAGAGCTAGACAGGAAAAAAGAA
TATGTGAAACCTAGAATTGGCTCTGCAGGAACTAGCTCGGTGGCCTGGGCAAGTCACTGA
AACATTCTGTGTCTCAGTTTCTTCATCTCACACAAGGAGGTTAGAGCTACCTCTGTGTCT
CCCAGTGCTAACATTTGGTGGTTCAATAGCTATTCCTTAACATTTAGAATAACTGAGTTT
TTATGTATTCTTTCTAAGTGACTACATTTTATTGCTCAAAGAACTCATGAATATAAATAT
CCAGATTATTATGAATACGTCTTGACTGTATGGATAATGAGAATACTATTAGTAATTGGT
CCTTTCTTCTGCCCACTACTGGTTTAAGGGGGCCTGAGAGTAAGAGGTATGTCATAGTAG
TCCCTGGTCTTAAGAAATTCACGGTCTTTGGAGAGAAGAGACTTAAATACAGGGAACAAA
TGAATAATAAGTCATCAGAGGTCAGTGAAAGGGGGACGGATGGATCAGTGATCTTGAGCG
TAGTCAGGTAGGATTTCAGTAAGGGGACAAGAGGGAGTGGGGTATGGGGACACAGAGAGA
ATAGCACTAACAAAGTGAGCATGGCGGTCCCTTCTGGACAGCACCCACAGGGCAAGGACT
TGTAAGACCTTGACCTTATTTTGACATCTAAACACGTGTAGGTGTAGCATTCCTCATGAA
TTCTGTTTGCTAATTACTATAAAGGCTTATCAAAATTCATTAAGTCCCCTTTGCAGGATG
ACGTTAACAGGGAAAAGGTCACAGCTAATGAGACAGTGGAGAGTCTGAAGCTTGAAGCCT
GTGGACGACCTATCAGCCTTAGCTAGACTGGAGCCTTGCTATCCTAACCTTGCTTTCCTA
ACATTCTGATTCAGGCTTTAATGGGCTAGAGAAATACCCCTCGTCCTTTATGGAGTGTAA
ATTAGTTGCTTTTCTGCTAAATCCAGTGCGTATGTTCTTTTTTATTAAAACAATATCCGT
TTTAAGACATTTTGCTATATTCACATAGCTTGTGCTAAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTAA
GGTGCAATAGTGCTGCGTGTCGCAAAATCATGGTTTAGAATCGGATCATTAGAAATTTTG
GCGCATTATGGTGAACTGGATCTACTGAGGTTAGAACATTACATTGTTTTTCTTTAGCTG
TGAACATAAATTTCCCCCCAGCTTTACTGAAGAGTAATTGGCATATAAGAATTGTACATA
TTTATATAATGGGATGTTCTGATGTACAGTGTGGAATGATTACCCTAATCAAGCTCGTTG
CCATATCCATCCCCTCACGTTTTGTTTTTTTGGTGAGAATAGTTACGATCTCTTAGGAAA
TTTCAAGTATAATAATACAGTGGTGCTAACTATAGTCTATTCATTGGGTCTTCAGAACTT
AGGCATCTTTTAACTGAAACTTTGTGCCCTTTGAGCAACATCTGCCTAACCGCTGGTAAC
CACTGTTCTTTCTATTTCTATGAGTTCAACTTTTTAGATTCCACATGAAAGGGAGAACAT
CCAGTATCTATCTTTCTGTTTCTGGCTTATTGCGTTTAGCATAATGGTCTCAAGGTTCAT
GCATCCTGGTGCAAATAGCAGGGTTTCCTTCTTAAGGCTAAATAAGAAGATTGCATTTTA
TCTCAGCAAATTAGATATAGGAGAAAAAACAAGGACAAAAATCACATTAAAAAATGATAC
AAGCTAGTTGGGAGGCTGGGTACATTGACTCACGCCTGTGATCCTAGCACTCTGGGAGGC
TGAGGTGGGTGGATTGCTTAAGCTCAGGAGTTCAAGATCAGCCTAAGCCAGAGCAAGACC
CTGTCTGTAAACAAGCCGGGCTCTGTGGTGGGCTGTGATCGCACCACTGTACTCCAGCCC
GGGTGACAGTAAGAATGCGTCTTTTAACAATTAGGAAAAAAAAAAAAGCAAAAGTAATAA
ATTCTTCTCTTGGAGTCACGCATTGCAGCTTCTGTCATTCTCTGAGGTCTTAGTGTCTGC
TGGTTTCTGTGCTCATAAAATTCTTTCTCCCTTAAGTAGGCTTAGCAAGATGTTTGTTCA
AACACTAAAGTTCTTTGAGAGGAATTCTGTTTCCATTTGTTAAGATAATACAGTTAAGAA
AATTAGAAAAATATATATATTTTTTAGAGACAGTCTCACTTTTTTACCCTCAATAGGGTG
CTGTCGCATCACAGCTCACAGCAACCTCCAGCTCCTGGGCTTAAGGTGATTCTCTTATCT
CAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACCTGCCAAGGCGCCCACCTATTTTTTGTTG
CCGTTTGGCCGGGGTCAGGTACAAACCCACCACCCTTGGTATATGGGACCGGCGTCTCAC
CCACTGAGCCAGAGGCACCACCCTGAAAAATTAGTAATAGTTTTTAAAGATTCTCTTAGA
TAAACAATAATCATTTGGAATCTGGATCCTATATTGGTAGTTATTGGTATAGTAAATCCA
GATTTGGTCCATGAAGAATAAAAGGAGAAAAAAATGAAAGAAATGAATAAAGAGTAGAGT
AGGTGTCAGACTTGTCACCACTATTCTCTGGGTCTTTCACTGAGGTCACGGTCAGCTTGG
CTGGTGGAGAGAGCGGTCTACTTTTAGTGGGCACTGTTTCTAACTACCCGTTTGCTTTTT
GGGTCTCTTCTGCCTGGATGCACTACGCCACTAAAATTGTTTCCTCTGCTCCCCAAATTC
CTTCTTCCTCAAGGAGGCTTAGCAAGATGTTTATTCCAACACAAAAGTTCTTCCTTTGAG
AGGAATTCTGTTTCCCTATGTTAAGATAATACAGTTTGTAAAAATCATTAGAAATATTTT
TCAGTGAGCTTAGAAGCTTCTTGAAAGTTCTATTTCACTTACTTCTCTGGCATTTGATTT
CAAGTCCACCACTTCATCCTTGATGACCAGCCTCCACTGGCTAATAGGATGTTACTGTCA
TGTACTATGTATATTTCGTGTATATGCACATATATACACACACAAGTACACACACGTATA
TGAGACCTAGATATAGATAGTATTCGAACTGTGTTGTTTTGACTGGCTTTAAGTCATTTC
CAAATCATAACAAAACCTAGATTATTTTTCTCCAGATTCCATCTTATTGAATGCAGTCAA
CACTAGCGGTTAGTCAACTAACTAGAAAAGTTGGTTAAAATAGGCAAAAAAAATATGACA
GAGGCGTACTTTAAATGTGTTAGCTTTAGACAGATGTTGACCAATTTTTTGTCATTTCCT
TTGTGAAGCCTTAAATGATCCTCCACAAATAATCGTTCCCTGCTCTATTGCTATACTTTT
TCTGTATTTCTGACATTGCATTTATTATGTGGTAATGTCATGATTCTCCTGTAATACACT
ATACGCTCTGTGAGGTCTGAATCTGGTCACTCATTCTCCCAGAACTTGCCCAGGGCTTGG
CAAACACCGTAGGTACCATAGATACTCCGTAGATGTTTATGGAACTAATCTGAATTTATA
ACATACTAAGGTAGAATCTAGTGTGATCTTAGAAAATTTTTCATTTTTGATCGGTAGTGT
AGAAATATTTTTCTGTGGCTTTTTGGGGAATAAAATCTTATTCTGAAAGTCGTTTTGAGC
CTGATCTAACAAATTCCTCAATGTTGAAGGTGGATTTGGTGCTTGGATATTAGTCCTATA
TTCTGAGGAACACTCATCCCATCTCCTTTTTATCTCCAGGACATTATTAGACTTTGTCAT
ACAGGAGCATTTTCCCTCAGTAGATGTCAGAGAACCGGATAGATACGTGGTAAGTTTTGA
AAGAGTAAGGGTAATTCTCTCATTGGCCCATCAATACTAGAGATTACAATTTAGAACTTC
AAACACAGAGTGCAGGTGAGATGAACCACTTCATAAAAGACAGTTGTTTTGTTTGAAAGA
TACTAGACAAAAGAACAGGTGTTCCTGTGTCCTAACTCTGCATGTTATTTTTTTGAGCAG
CTTTTGTAACTTGGTCACATACGTTCTCTAACCACACATTTGGTGAGCAGATATTTGTAT
AGTAGTAGTTCTAAAATAAACCCAGTACATACGAGTGATGTAAAATTGTGATTTTTCTAT
TCTTGGGGAAGTTTTTAAATCTTTATATTGTTTTTTTTTTTTAAACAGTCACGGACAAGA
GAATTCATAGTTTTTTTGTGTGATACTTTTCAATGTTTAATAACTCCTATTTCTGAAATT
TAACTCCCTTGTGCTAAATTCTATTCCTTTTACTTTTCTTATTGGACGTGGAGAAGCTTG
ATTATAATACTATGTAATGTGTATTATCTCTGAATTTTAGCTTCCTCATTCTTGCATATA
TATATATTGAGACAGAGTCTTATTAGGTTGCCCTTGGTAGAGTGCTGTGGCGTCATAGCT
CACAGCAACCTCAAACTCTTGCCTCAGCCTCCCACATGGTAGGGACTATAGGCACCTGCC
ACAACGCCCGGCTATTTTTGTTGTTGGTGGAGTTGTCATCGTTTAGCAGGCCTGGGCTGG
GTTTGAACCCACTAGCCCGGGTGTGGCCAGTGCCCTACCCATGGAGCTACAGGTGCTGAG
CCTTTCTTGTATATTCTAATGTTCAATCCTTCAGTCATCTTTTGACCCACCTTTGAATTC
TTCCCATATTCACCTTGTGACTTACCAAAGGATCCTAAAAGAGTATACCTTACCAAAAGT
CTAAAAAAAGTTTCTAAATTCTATTTTAGGATTTTTTTTCTATTGTGGTATCTGAAACTG
CACAACTTGTTGCCTTATGGATGTCTGTTGGTTTTGCTCATGGTAAGTTAAATGTTATTT
CGATCTTCTGATGAGAGTTTGTTGAAGTAGATGACTTCTTTCTTGGCTATTTAAAAATAT
TCCCACTGATGAGTTGTTTTTTTTTTAATATAGTCACTCCCCCTTATCTGCAGTTTCACA
GTTTTAGTTAACTTCTGCTAACCTGTGGTCCAAAAACATTAAGTGGAAAATTCTAGACAT
AAGCAATTCATAAGTTTTGAATGGTGCTCCATTTTGAGTGCATGATGGAACCTTGCTCCA
TCCAGCTTGGAACATGACTCATCCCTTTGTCTAGCATATCGGGTTGTCAATTCTTCCTGC
CCCTTGGTCATTTAGTGGCCCTCCAGGTTATCAGATCAACTATGGTAGCATCACACCTTG
TTTTACTTCACATTGGCCCCAAAGTGCAAGAGTAATGATGCTGGCATGTCTTTAGAATTG
TTCTCTTTTATTATTAGTTATTGTTTCTTTGTAAGTTAAGCTTTATCATAGGTGTGTATG
TATAGGGAAACACATTGCAGATATGGGGCTCTGTACTATTTGTGGTTTCAGACATCTACT
GGGGGTCTTGGAATGGACCCCACTGAGAAGAGGTGACCAAACTTGTTTTTGTTATGCAAA
TTTGTTTTTAGCAACAGAAATAGATTTTTTTCCCATGTTTGAAATGGCAGGGAACGGAAT
GGTAATCACAGAACAGGAAGATGTTATCTGTAAAGCTTTTTGACCTTAGGCTTACATGTA
TGAGTATTAGGCTTATATTTCTTTAAAGCTACTAAAATTTCTTTTAATTATACAAGTGTC
AAATGCTCATTGTAAATAACTTAAAATATATATAAATGGGTGGAAACTCCATTCTCCAAA
GTAATTGCTGTTAACCGTTTCATACCTCTTCTTTTTTTGGTTTTGAGATACAATCTCACT
TTGTTGCCCTCAGTAGAGTGCTGTAACGTCATAGCTCACAGCAACCTCAAACTCTTAGGC
TTAAGCGATTCTCTTGCCTCAACCTCCTGAATAACTGGGACTATATGTGCCCACCACAAT
GCCCGACTATTTTTAGAGAAGTGGTCTTGCTCTTGCTCAGACTGGTCTCGAACCCGTGAG
CTCAGGCAATCCACCCTCCTTGGCATCCCAGAGTGCTGGGATTATAGGCCTGAGCCAGCA
CGCCTGGCCCGTTTCATATCAATTCTTCTAGACTTTTTTTACTAGTATCCTGCCGCTCAT
GACTGTCATGGTGGTACATACTCACAATTTGTCTTTTCCTCTTTTTAAAACCTTTGAAAG
AACCTTATTTCTTTATTAATCTCAATTTTCATTCCAAGTAATACATATTTTTTAATGAAT
GCTAGAAATTAAGGATAAACAAAAGAGGGGTTTTATTCCTATGGTAGGTGAAATCTTCGT
GGGAGGATTATAAAATAGAAGGCTAAATTTAATTTTAAAACATAGGTTTCATGTATATGA
AGCTACCTGATATCACCAACTAAACTTTCAATTTATAATCTAATTTTGTTTCATCTCTAA
AACAAATAGCATTTCCATGACTTTCTATTCTGGATAATTTTATAGAGTTCAAAGGAATCT
GCCTTTTTATTATGTTTTTGGAATTTGTTGTTTTAGGTGTTTGTAATACCGATAACTTCA
GTTTGTTATCCATTACAATTGACTATGGTCCATTTGGTTTTATGGAAGCCTATAATCCA
Chart Advanced