SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002048_2.0
Identity
TranscripttRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43)
SpeciesOtolemur garnettii (Bushbaby)
Transcript IDSPT00002048
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001955_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00002048_2.0 # Transcript # tRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43) # Bushbaby (Otolemur garnettii) # Full length # Reverse
TACTGTGTCCAGTGGCTGCCAGTGACAGTCCATCAGTGCATCATACAGCTCCTCACTCTG
CTCCATGAACTCCTTGTTGGCCTCAGTCACATCCAGCTGTGGCATGGGATCTGGAGAAAA
AGCAAGGATGAAGGCTATGGGGATAGCTGCAAAGCACTTGATTCTGTTCCCATTATCCTA
AGGCTCTGTTCTAGAGTAAGGTCCCTATTCTTTCTGCCAGTTTCTTCTCTTAGGGGCTGA
TTCCAATGTCCCTGAAAGTAGGATAATGTCTTTAGAAAATACAATAATGGTGGCTGTTAT
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GGTCTAGTCCTCATTTCAAATTTCGTTTGGTAAGTCTGATCAAAGTTACCGAGTCCAAAG
CACCAGCTCAAAATCTGACAAAAGCTGGCTCAGGGCCTGTAGCTTAGTAGCTAGGACACT
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AGTCACAGCTTCTTGGGAGGCGGAGGCAAGAGAATCGCTTAAGCCCAAGAGTTTGAGATT
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AAAAAAAAAAGAAATCAATGTCTGTGGGAGGCCTAGGCGGGTAGCTTGCCTGACCTCACA
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TTGTAGGCACCTATAGTCCCAGTTCCTTGGGAGACTGAAGCAAGAGAATCACTGAAGTCC
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TAATCCCAGCTGCCAAGGCACTCTACTGAGGGTAACTGAATAAGACTCTGTCTCAAGGGT
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TGACACCTGGGCACTCTACTGAGGGTGATGAAGTGACTCTGTCTTAAATAAATAAATAAA
TTTTACTTTCTGTAAACTTAAACTTAGTATCTATTCAGAAACATTTGAAAAATTTACTTT
TGTTTTCCATAGTTTCTTAAAACCTTTTGAGAAAATCCTTTCAGAACTAATATCTTTTTT
TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGCCTCAAGCTGTCCCCCTGGGTAGAGGGCT
GTGGCATCATAGCTCACAGCAACCTCCAACTCCTGGGCTCAAGCGAGTCTCCTGCCTCTG
CCTCCGCCTCCCAAGTAGCTGGGACCACAGGCGCCTGCCACAACGCCTGGCTATTTTTTG
GTTGCAGCCATCATTGTTGTTTGGCGGGCCGGGCTGGCTTCGAACCTGCCACCTTAGGTG
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TTGAAACCATATTTGACCTTTTAGCAATTCCTTCTATTGTACTTTTCCTTTTCTTCTGTT
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TGAGCTTTAGGCAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCAAAGGCACCCACCACAACAGCTGGCT
ACTTTTTGTTGCAGTTGTCATTATTTAGCAGGCTGGGGCTGGGTTTGAACCTGCCAGCCT
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TTTTTTTTTTTAAGACAGAGCCTCAAGCTGGGCTCAAGTGATTCTCTTGCCACTGTCTCC
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CACTGTTGTTTGTCATTGTTTATTTAGCAGGCTGGGGCTGGATTCGAACCTGCCAGCTTG
GTGTATGTGGCTGGCACCTTAGCCACTTGAGCCACAGGGGCCAAACCTACAATAAATATA
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GGCCGGGTGCAGTGGCTTACACCAAAAATCCTAGGACTCTGGGAGGCAGAGCCTCAGCTC
ATGAGTTCGAGACCAGACTGAGCAAAAGCAATACCCCGTCTCTACTAAAAATAGAAAAAC
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TTATTATCACATTGCAGGATTAGGGGTTACGTTCAATTTCATAATAGTTTATTTTCCAAA
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TCCCCTGTAGCTGCTTGTTCTGGGCTCCATCTGCACTAACAACGCTGAGTCTGCTCTCCC
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AAAACAGTGCCAGCCATAAGACAGTCACATGATAGTGGCTGACGGAGGAATGAATAAACA
AACTTTCTTACCTTCTAATGCATCATCCCCAACTTCTTCATATGTCTGCCAAGAGACCAG
AGAGGTGAGTGAGTAGCATGGTGAAACCATGGTCCACGCCCATAATGGCTTATTTTTAAC
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TCTTACCAATCCCATCCAGGAGAATGACCCATTTCTAGTGGAGAAACATAACCCAAGAGG
GCAGACTTGCCAAACCACTGTTACCTGCATGGTGCTCTGAGTATAGCCATACTGAGGGTA
ACTGTAGCTGTAGCTGCCTGTGTTCTGGTCATAACCCCACTGGGCATAGTAGTTCTGGTA
TTGCTGGTAATACTGGTTGTAGCTGTAACTATACATCTGACTATACTCCACTGGCTTTAC
ACGGCTCCTTAAATAAACAAAAATAAACAAATATAAAAATATTTCCACAACACTGCCTTT
GTAACCAGAGACTATTCTAAGTGGTTTATGCAGATTAACTCATTAATCCTCACAGCATCC
CTATGTAGTAAGTATACCATTATTCTTATTTTACAGATGAGTAAACTGAGGTACAGAGAG
AGGTTAAGTAATTTGTCCAAAACTGTACAGCTATTTTAGTAAGAGATTCAAATTCAGGCA
GTCTGGCTCCACAGTCCATGCTTTTAAGAGAAGAGGTTTTAATGGTTAGGTTTGTCTCCC
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CAGCCTTCACACTACTGACATAGTAGCAGGAACTCTGCTATGAACTCTAGGATCATCCTT
GGCTGCTACCCACTAAATGCCATTAGCACATCCTTAGTTGCTATAACCACAAATGTCTCC
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TAAAGGATGAAAGGTTTTATTCACAGAAAAGCTGTCTTTTTTTTTTTTTTGGAGACAGTC
TCACTTTGTCACCCTTGGTAGAGTGCTATGGCATCATAGCTCACAGCAACCTCAAACTCC
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AAGAATGGTTTTTACCTGACATGACAGCTGTATTAGTGATGTATATAAATTTTTTTTTTT
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TCAGACTCTTGGGCTCAAGCAATTCTCTTGTTTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAG
TTCAACACAATGTCTGGCTATTTTTTAGAGATGGTCTCTCTCTGGCTCAGGCTGGTCTCA
AACCTGTGAGTTCAGGCAATCCACACTCCTTGGCCTCCCAGAGTGCTAGGATTATAGGTG
TGAGTCACCATACCCGGCCCAGATGTATGTAATATTCTATAGGATGTTTACAACATTCTT
ACCCATTCCCATAGCAAGAGACATTCACAGGCACTTTGTAGGTTTCATTAATATACATAA
GGCTAAAATTATTAGTAATTGTTTTTTTGTGTGTTATTCTTATTAATTCTGTGGGTAAGT
TTCCAATGGTGGCACTACTGGGCAAAGGATATCAGGTATGTATAGCCAAAAGCTTTTCCA
GTGAGGCCACCAGCAACATCTACATGTATCTGGCCCCTGCAATCATAACTGTATGCTTCT
AGAGGGGTGGAGCTATGCCAGTTATGCTCTAACACCTAGCACACAGTCATGACAGAAGCA
GGATTTAAAGCCCCATCTGTCAGTAGCCATTTGATTACTTGTGGCTTGACCTGAATATCC
CCCACAATCTTCCACCCCGCATGGGGATGTCCTGATTCTCAGCAAACATATGAAGAGTGT
CCAGGTAGTGGGGTAGAGATGGGAGTCCAAAGCCCCTCTACCTTCCTGCAGGACTCACGC
TTTAGGGATTGCCACACTGAGCCGCACGGGTTTAGACCCCAGTCCTACTGCTCCCTGGCA
CTCCGTCAGTGCTCGCTTCTGTTCCAATTCATCTGTGAATTTCACAAAACCATAACCCCT
GCAGGAAAAAAAAAAAAACAAAACCCAACCCGTTATTTAGATTATTAATGTGATGAATGT
GTCTTAAGAACAGAGGAGGCATGGAGAAGTGGGAAGGGCAAGAAGGTGGGCAGGAATACA
GAGAGGAGGAGGGGTGGAGAAAAGCAAGAGAGTCAACAGTCCCATTAATGAGGGGAGCAG
AGCAGTGTCAGGATTCAAGCACATGACAATCCTGAGATCCACAGGAATTCCCATGTTCAG
TTCCCCATTCTCCTTGACACCATCACCCCTGGGGATCCTGCCCAAGTAGGAGATTCTTTC
CTAATCTACTGAAAACAGTAGCAATGGTAGTGACAGCTGAAGAAACTAATTCAGCAAATA
TTTACAGAGTCTGCTCTGATGCTCTCCTGAGTTCATATTCTAGTTGGGGGGAAAATGAAT
GACAGCTAAAGTTAACAAGCACTTATTTCCTAGGCACTGTGCTGAGGCACTTATTTCCCA
AGGTTATCTCATTAAATTGTTTCAACAATTCCATGAAGGTAGTATCCACACTTTACTGAA
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TGAGCCGTTAAGGTTTTTCCATTTTTTAAGTGAAAACTTCTACCTATAATGAAAGGCTCA
GTAACAGTAATAAAACAGCAAACACCTTTAAACAATTTCCTATGTGATTTGCTTGTATTA
TATCCTTTAATTCTTACATCAACCTTATGAGCAGATACTATTAATCAGCCCCCTTTTACA
GATAAGCTCACAGGGTGAGAGACCCTCAGTAAGTTGTACACTGCATTACCCCTACCAACA
CTGGAGCTGGGATTCATACTCCAGAGCCTGTGCTCTTAACTGCCATGTTATCCACCTTTG
TAAGACATCTCCACCTGGGAGAAAAGAGTGTGGCCATCATTAACAGGTAAGGCCTTACTT
AGACACACCAGTCTGGTCCAAAACCACCTTGCCTCCTCGACAGGAGGGGTAGACTTTCAC
GAAGAATTCATACAGCATACCATCATCCACATCTGGGGTCAGGTCCCCAACAAAGAGGGA
GTACTCAGGGCTGAGAGGAGAGAACAAGAGATTCAGAGACAAAGACCAAAACCTCTGCTC
TGAAAAGCTTTTCTTCGTATCCCAGGTAAAAATCTCCTATGAATTTCTTAGGGAACAATA
CTCCCGATGGGTCTAGTCTCATTTTGTCGTCCTTAGTAGAGTACTATGGAGTCATAGCTT
GCAGCAACTTCCCAGTATCCGGGACTATAGGCACCTGCCACAATGCCGGCTCTTTTTTAG
AGACAGGGTCTTGCTCTGGCTCAGGCTGGTATCGAACCTATGAGCACAAGCAATCCAACC
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GCTAGTTGGGAGGCTGAGGCAAAAGAATTGCTAAAGTCCAAGAGTTTGAGGTTGCTGTGA
GCTGTAAAGTCATGGCACTCTGCCCAGGGTGACAGCTTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAG
AATAGAAAAAAATAGGCTGTGTACGGTAGCTCACGCCTGTAATCCTACCACTCTGGGAGG
CCAAGGTAGGTGGATTGTTTAAGCTCAGGAGTTCAAGACCACCTGGAGGAAGAGTGAGAC
CCTGGCTCTAAAAAACATAGCCCGGCCTTGTGACAAATGCCTTAGTCCCACCTACTCCAG
AATCTAAGGCAAGAGTTTGAGGTTGCTGTGAGCTATGACACCACAGCACTCTACCCAGGG
CAACAGAGTGAGACTCAGTCTCAAAAAATAAGAATGTAAAATTGTAGCTTTGAGGTAGTT
GAAATCAGGCCAGTTTGTCAACCTCTAGTCTAGAAAATCAATTCTGCTCAAAAAATAAAT
CAACACTATTTTAAGTGTAATACATATTCCTCGTAAAAAAATCAGAATACACAGCTCGGT
GCCTGTGGCTCAAGTGGCTAAAGCACCAGCCACATACACCTGAGGTGGCAGGTTCAAATC
CAAACAACAATGATGGCTGCAACCAATGATGGCCCACCAAACAATGATGGCTGCAACCAA
AAAAAAAAAAAAAAGCTGGGCGTTGTGGTGGGTGCCTGTGGTCCCAGCTGCTTGGGAGGC
GGAGGCAGGAGACTTTCTTGAGCCCAGGAGTTGGAGGTTGCTGTGAGCTGTGATGCCACG
GCACCCTACCCAGGGGGACAGCTTGAGGCTCTGTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCA
GCATACATGCTCAGTGCCTATAGCACAGTGGTTATGGCAGCAGCCACATGTACCAACGCT
GCAACTTGTTAATAGATACATGAAGACTTGTTAATAAATTCACAGCATTCCAATTAATGA
ACATATTATAATTTAACCACTTTACTATTATTAGGTTATTTGGGTTTTCCCCAACTTAGC
CCATTATATGTAATACTTTGGCTAGGCACCTGTAGCTCAGTGGCTAAGGTGCTGGCCACA
TATACTGGGGCTGACAGATTCAAACCCAACAACAACTACAACCAAAAAAATAGCTGGGTG
TTGTGGCAGGTGCTTATAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAAGAGAATTACTTAAG
CCCAAAAGTTTGAAGTTGCTGTGAGCTGTGACGCCCTAGCACTCTACTGAGGGCGACAAA
GTGAGACTGTGTCTCAGAACAACAACAAAAAAAGAACTTAAAAAAAAAAATAGAAAAGGC
TTTAAAGTTTTCAAACAGCAACCTCAATTGATAACCAATTTATGTTGCTACAATATTAAT
TCAGAATAGAACCTTCACACTGTGGGGAGTAAAACTGGAAGGCTAGGGGAGGGACCACCC
ATAGAAAAGGCCTGGCCTTGACAGGAGGCACACTATGAAGGTCCTTCTGCAGGACTTCAG
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TTTTTGGCCAAGGCCAGGTTTGAACCTGCCACCTCCGACATATGGGACTGGCGCCCTACT
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CGCATTCGGTAGAGTGCTGTGGCATCACAGCTCACAGCAACCTCCAGCTCTTAGGCTTAG
GTGATTCTCTTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTTCCACAACACCA
GGCTATTTTTTTGTTGCAGTTTTCACTGTTGTTTAGCTGGCGTGGGCCAGGTTCGAACCC
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CCTTTGTTTTTTTAAAGATTGTTGCCAGAATGCAGTGGCATCATTCATCACAGTTCATGG
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TTCCAGCCTCCTAAAGTGATAGAATTACTGGGGAGTCACCCCACTTGGCCCTATTTCTCC
TTTTTTTGGCAGTGACAAGTATGGTGACACACTGTGTCTCTGGCTAGACATTACTTAGTG
CTTACCTGTTATCTGGTTGTTTCCCATAAGTAGCATAGTTCAGTTTAAAACGTTTTGCCT
GGAAAATTTACAAACAGACAAACTAAAACAGAGAAAGGTGTTTCAAGAGTCAAACAATAT
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TTTCTCTCCTGTATAAAATGAGGGGGTTGCACGGATGACCTCTAAGGGCACTGCCAGCTC
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CAATCAGGCAAGAAGTCTAGAGTTTCAAGTCTTCTGTTATGTGAGGCAGTGACACAGAGT
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GTCAAAGGTAACAATGCCCACAGTACAGGGTTGTTATAGGATTAAGTAAAATGACATCAG
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TGGGATTACAGGTGTGAGCCAACTTGCCTGGTAGTGAAACCATTTTTCTAATTAAGCCCA
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TGGGCCAATCCCAGACTTATTTAGTAAATATTCATTTATGTGTGCTGCATCATGTATGAT
GTATGCTTGCAAAAATTATTTTATGCAATCTGAGCAAGCTTTTTTAAAAAAATAATTTTT
TTTTATTGTTGGGGGATGATCAAGCTTTTAGATCTAAAATCCAGCTTATAGGAAATATTA
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GTGAAAGAACTAGGATTACCTCCCACAAACAGCAATGGTGACAGGAAAGAAAGAGATGGG
CTTTTGTACCTTAAAAGACACTTTGAAGAACTAAATGCAGTGCAGGATATAAGATTGGAT
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CGTTGTTGTTTTGGCGGGCCCAGGCTGGATTCAAACCCGCCACCTTAGGTGTATGTGGCT
GACGCCTTAGCCACTTGAGCCATAGGCGCCGAGCCTTGTTTGAAAGTTTTAATAACATAA
AAGACTTTTTGCTAACCTATCACAGGCCAAGGTGATACAACTGAAGAAGATGGTTTCTTT
CTTTCTTTCTTTTTTGAGACAGAGTCTTACTATGTTGCCCTCGGCAGTGTATAGCATCAC
AGCTCACAGCAACCTCAACTCTTGGGCTTAAGCAATTCTCTTGCCTCAGCTTTCCAAGTA
GCTGGAACTATAGGCACCTGCCACAATGCCCAGCTATTTTTTGGTTGTAGTCGTTGTTTG
GACGGCTCAGGATGGATTTGAACCCATCAGTTCTGGTGTATGTGAGCTACAGGTGCCAAG
CCAGAAAATGGTTGAACTGCTTGAACTTCTGAGGTCACGCAATCTTGACTACAGGTGCCA
AGCCAGAAAATGGTTTCTTTTTTTGTTTTCTTTGAGATAGAGTCTCATTTTGTTGCCCTG
GGTAAAGTGCCATAGCATCACAGATGACAGCAACCTCTAATTCCTGGGACTTAAGTGATT
CGCTTGCCTCAGTCTCCCAAGTAGCTGGGGCTACCAGCGTCTGCCACAATGTCTAGCTAT
TTTTCAAGACGAAGTATCGCTCTGGCTCAGGTAATCCTTCCACCTCGGCCTCTCAAGTGC
TGGGATTCAAAGGCATGAGCCACCACATCTGGCCTTAAAGAAAATGGTTTCTGCCCTCAA
GAAACTTAATGATCTAATACAGGCATACTCAAACTATGGCCTGTGGGCCACATGCAACGC
CTAGGACATTTATCCGGCCCGCCGGGTGTTTTGCCACTGCTGCTCGTACTGCTTAGCAGC
TGACTCGTCCCAGGGCCCACAGTCCGGCCCTCCAATGGTCTGAGGGACAGTAAACTGGCC
CCCTGTTTAAAAAGTTTGAGGACCCCTGATCTAATAGGACAGACAATGTAAACAAATGTA
CTATACCTAACTGGAGGTATCTGTGAGATTCCCAACATTCTACTTTTTTTTTTTTTTTTG
TTTTTGAGACAGAGCCTCAAGCTGTCCCCCTGGGTAGAGTGCTGTGGCATCACAGCTTAC
AGCAACTCCAACTCCTAGGCTCAAGCGAGTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGA
CTACAGGTGCCCACCACAACACCTGGCTATTTTTTGGTTACAGCTGTCACTGCTGTTTGG
CGGGCCCGGGCTGGATTCGAACCCACCACCTTAGGTGTATGAGGCTGGCGCCTTAGCTAG
TTGAGCCACAGACACTGAGCCCCAACACTTTACTTCTGAAAGCATCTCACTAGGAGACGT
AAGTAGGAAGACGTGACTATACCTTTTGGTAACTTTTCCTATTATAAGCTCTATCCTGAA
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TTTTGGGCAATGCTCCTTTAGATATTTAGTTCAAGTAACACACAGCCATGAAGGAATGAG
AGGGCAGAGTATCTGAGCCTGGAGATCACAGAACACTATCTATGAGCTTCATAAATGTTT
GCTGATATTAAGAATGATGGGCCAAATCTTTGACTTGTCTTGTGTGCCCTAGTATTTTAA
GGTCCACAGATGTAAAGACTATCACCGGGAAGAGCTGATGATTAGTAAGTACTATGGGCC
AGGCACTGTGTTACACACTTCATACATACCATCTCAAGTCATTGTCACAAAAATTATGAG
GTGGCTAAAGGCAACCTCAAACTCTTGGGCTCAAGTGATTCTCTTGCCTCAGATTCCCAA
GTAGCTGGGACTACAGGCACCCACCATAATGCCCAGTTATTTTTAGAGATGAGGTCTTGC
TCTGGCTCAAGGTGATCTCGAACCTGTGAGCTCAGGCAATCCACCTACCTCAGCCTCCCA
GAGTGCTAGGATTATAGACCTAAGCCACCACACCCAGCCCCACCAATGTTTTATTATGAA
AAGTTCCCAATCCAAAAATTTAAAGAGGCTTGGTGCCTGTAGCTCAGTGGCTAGGGCGCT
GGTCACATACACCAGGGCTGGTGAGTTCGAACCGGGCCCAGGCCTGCTAAACAACAACAA
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TTGCCTAGGCCCAGGAATTTGAGGTGCCTGTGAGGTATGATGAGACAACCGCACTCTACC
CTGGGCAGTAAGCTGCAGATATGCAGATAAGGCAGCAGTTTTCAACCTAGGGGTTGAGAC
CCCTTTGTAACAATGAAAATACATCCTGCATATCAGATATTTACATTATAATTCATAACA
GTAGCAAAATTACAGAAGTTTGAAGAACTTAATTACTGAATTCTTCTTAATTATGAAGAA
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TATCAGGCCAGTTCCTCAAGTACTTTAGTGTATCATTTACAACAATTTTTTTAGAGACAG
GGTCTGGTTCTGTTACCTAAGCTAGAATGCAGTGCACAATCATAGCTCACTGTAACCTTG
AATTCCTGGGCTCAATAGATCATTCTGCCTAGCTTTCCAATTAGCTGGGATTATAGGTAC
ATACTACCATGCCTGGCTAAATTTTTGTAGAGATAGGATCGTGCTGTTACTCAGGGTAAA
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GTCTTGATTCTTTATTTACATTTATTTTACAATATTATTATTATTATTTTACAGACAGAG
TCTCACTTTGTCATGCTCAGTAGAGTGCTATGGTGTCACAGTTCACAGGAACCTCCAGCT
CTTGGGCTTAGGCAATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGATGCCTG
CCATAACACCTGGCTATTTTTTTGTTGCAGTTTGGCTGGAGCCAAGTTCGAACCTGCCAC
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