SelenoDB
Release 2.0
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Transcript Report for SPT00002129_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein O (SelO)
SpeciesPelodiscus sinensis (Softshell turtle)
Transcript IDSPT00002129
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002036_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00002129_2.0 # Transcript # Selenoprotein O (SelO) # Softshell turtle (Pelodiscus sinensis) # Full length # Reverse
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GAAAAAACAAATTAAGATTTTTGTTTGGTTCAAGATTCGGTTTTTAAAACGTGGACCCAT
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GATCCAGCCCATGGGCCATATTTTGCCTATCCCTGCTATAATGTCTTATTCAGAGTTACA
GCTTCCATTCTTAAGATCTTCATGTAGCTGAGGTTCTTCTGTAGATATGACAGCACAAAT
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GCTATTACCCAGGATCGGTAAAAATGGTGTCCCGAGCCTCTGTTTATCTGCAAATGGGTG
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TGTCCAGGATGGTACATGGTCCTGCTGTGGGGGCAGGGGACTGGACTTGATGACCTCCCA
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GCTAGAATTTGAAAGGTGTGCCAGTTGAACTGTAGCAGTGCTTTGACTGGAGGCGGAGAG
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GTGCTACATAGTCCTATTTTTTGTTACAGTCAATCCTGTGTGAAATCAGCTCACACCTCA
CTTCATGTGCCTCTGCTTTGTGTGTGTCACATTAGCAATACTGAGGAAAAAAAACATGCG
GATGAAAACCAGTCTAATCTAGAAACCGTAAACAAAATGTCTCACGGGACACACACAAAA
TCCCAATGGGCTACAGGTTGCCTACCATCTATGTAAATTCTGAGTGTGCAGTCTAGGTAA
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CAGTTACTGTACTCAGTTTAGTACAGTACTGCATTAAAAAGTTTTGCTTTCATGCTACTG
TGATTTATTCATTACTTCTCCTGCTCCACTATACAAAGTCTGTCTAGAGTATCCCAAAAG
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ACCAGTGAACTTGTCCATAAAGATGGAAACTGGATGGTTCTGAGGATTTGTATCAGTTTG
CAGATCATCTAATATATATTTTTATTGTATTTAGCAGACAATGTAAGGGACTGAAAAATA
CCGTTTACCTCTTAACTTGTCAGCAGTCATAATTACAAAATCACCAACTCTGACACTTAT
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CCCTAGATTCCACTTGCAGATCTCCGGCTGTTTGTTATAAGCATAGCGCCCTGTTTTATC
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TACCTAAAAAACAAAAGACTTCAACTCTAATTATGACTTAGACATTTCTATATGTTTCAA
GGGTGATGTTAACCTAAACAGTGTGATTTTGCAAACCACTACTGCATTACACTGTAGGAC
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AGTTATCTCCCCAGAAGCAAACAGCAATTTATTCCAAGTTTTAGCAACAACATTCTAGCA
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CAGTTAGGAATTTTTTCCTAATGTCCAATCTAAACCTCCCCTGCTGCACTTTAAGCCCAT
TACTCCTTGTCCTGTCCACAGAAACCAAGAGGAACAAATTTTCTCCTTCCCCCTTGTGAC
ACCCTTTTAGATATTTGAAAACCGCTATCATGTCCCCCCTTAATCTTCTTTTTTCCAAAC
TAAAGCCCAGTTCATGAAGCCTGGCTTCATAGGTCATGTTCTCTATAAACCTTTAATCAT
TCTTGTCACTCTTCTCTGTACCCTTTCCAATTTCTCCACATCTTTCTTGAAATGTGGCGC
CCAGAACTGGACACAGTACTCCAGCTGAGGCCTAACTTAGTGCAGAGTAGAGCGGCAGAA
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TTTTTGCAACAGCATCACACTGTTGACTTATATTCAACTTGTGGTCCACTACGACCCCTA
GATCCCTTTCCGCCATGCTCCTTCCTAGACAGTCGCTTCCCATCTTGTATGTATGGAACT
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GGAGGGAGGGGTAGTGGGATCTCTGTGCACTGCTCCCACACCCCAGCACAATTCTTGCAG
GTCCTATTGGCCAGAAACCAGATAATTGGAGCTGCAGCAGCAGTGCTTCCAGGCAAGCGC
AGCATGCAGATCCTCTGTCCCCCTCCCTACAAGTCTGTTCTATGAAAACTAAGTTACTTT
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CCTTCTAAAGCAGTTTAAGGTATCAAAAGTAATTTTATAACAGAATAGCCATTTTACACT
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TAGCAAGTGCCCCCCTTATTGACTAGTTGAGTTGTCAATGGAAATTCCATCAACTACTCG
ATTAGCTGATTAATCAAAATTTAACTAGTTAGGAGAAACAAAGAAGGGTTTAGAATGCCA
AAATTTTGGAAACCTTAACTTTCTACATTCCCTTCTCCACTATTTGTCAGGTCCCTTGTT
ACATGCATGCATTACAGGGCTTTCAAGCAAAATACTTTATATTGTTTCCATGGTGCTCAG
GACAGTGAAAAGCCATATGCCACAAGATACTCCAAGCTGCTAAATGTGCATAGAACTGAT
TAGGAATACGCTATAAACAAGTACAACTGGCCACATATTGCACTATGGCTTCATGCCAAA
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AATTTTAAGCAGTCGTGTGTGTATTTTTAAAGGTATCTAGCCTACAGTATATAAGGCAAA
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CTATCCAAACCTTTTGCCTCAATTGCACCAGAATTAAAGAGGAGGTACTTAACAGGTGTG
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AGGAAAAGCCCCCTCTGCCGGGAGCCAACCACAGTTTTAGCTTCGAGATTGTTTTAAAAA
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GCTCCGGCCACCCCGCGAGGGGATCTAAGCCAGATGGCAAGGCTGCCCTGCTCTGCGACA
TGGCCTGCCACCCCTGGAGCATGCCTGCTCACGAAGCAGCCACCCGCCACGCAGCTGGTG
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TGCGCGCATTTCAATATGCAGTTTCATCGGGAGAGTTCCCTCCAAAAACAAGAAACAGTT
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GGATTTCTGGATAGAAAGTGCTGATCACATAATTAAGCATTTGTATTCGAATATCATTTC
GGTTAACACTGGGACCTTTGCGTCCTGTGTATTCATCTGTAGGTTTAAAAATCTCAAAGG
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CAACCCTCCTCCCCGATCCCACCCGCACATCACTTCCCCCATTGGTCTCAACCTCCTCCT
CCCACAACCCTCTCCCTCTCTCTTCCTTCCCTTCCCTCCCCCCCCAGACAGCAGGCACTG
GGGTGAGGGAGGCAGATTGGGAGCATGGCTGCATGTAGATGCTGAATATCAGCTGATCTT
TCCTGTGGGTCCACCAGGTATGGAGCACCCACAGGGGCAGTAAGCACTTATCCTAGCAAG
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ATGAACGTATTTTATGTATACTGCTTATACAACAAATGAAAGACATCTTGCAAAAAAGTT
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GGCCTACATTGCATCTCTAATACAGTCATATACATCAAGATCTAGATTCTGACAATTTTA
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GCATCCCATCGACACAGAATTCCACTAGTCTAGCACAGAACAGCTAAAATCTTACAATGA
GAATCATAGATGGTTTTGTTAGAAACACAATGGCTGCGTCTAGACTGGTAAGTTTTTCCG
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CCAATCATCTATTTTGTTGGTTTTACAGGTTCTTAAGTTTTTGTCCAATGTTATTGTATG
TTATTCTAATGTAACGACTTTTTAAACGAGTAGATATTCTTAGGTAGTACTAATGTCTAT
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AATTTTCCCCTTAAAAATGGTTATTAAGCATTTACAGGATTTCCTTATCTCACACCATGG
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AAACCTGGGATTCTCTGGTCTGGCAACATCTGTGGTTTGGAATGATCTTGGATGGTCCAG
GATCAGAGAGTATCAGCATGTTGCACAGGAGATGGGGGACTGGGAACCAGTGCACTGCTC
AGCTGGACTGTGGGGGAAGGGGGCGGGAGCTGGCACCTGGCTCATCCAGGCTGCTCTCTT
GTGCTGTCAGAGGAGAGCCAGGAGCTGGTACACGGCTCAGTTGGGCTGTGAGGGGGGACC
GGAAGTCAGTGTGCAGCTCTGCTGAGATGTGTGGGGGGGTGGCACAGTGGGGGACCAGCA
GCAAAGGGCCTGAAATGACCTCCCCTGATCTGGAAAAATCCCTCATCTGGGACCAATCAG
GTCTTGAGGGTGCCAGATCAGGGAGGTCCAACCTGTACTTGAAAAGAAAAAATACACCTT
AAACAATAATGGTCCTGTAGCACCTTAGAAACTAACCAAAATATATAAATAGTACCATGA
GCTTTTGTGGCAAACCCACTTCTTCAGATAACAATTTGCAAACTGGCCCATGGCCCAGAT
ATCTACAGTTTCTGAAGCTAATAGAAAAGCATGTAAATCACGGGTGGGCAAACTTTTTGA
CCTGAGAGCTGCATCTCCATATGGAAATTGTATGGCAGGCCATGAATATTCACAAAATTG
GGATTTGGGATGCAGGAAGGAGAGTTCCAGCTGGAGTATGAACTCTGGATTGGGGCCAGA
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GAAGACTAAGGCTCTGGCTGGGGGTGAAGGCTCTGTGGTGGGCCTGCAGATGAGGTGTTT
AGGATGCATCAGGGGCTACGTCTAGACTGGCATGATTTTCCGGAAATGCTTTTAATAGAA
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CAAAAGCACTTTTTGTGGAAAAGCTTCTGTGGCCAATTTAGACACGCTTTTCCGCAAAAA
AGCCCCGATCGCCATTTTTGCGATCGGGGCTTTTTTGCTGAAAACAACTCTCTGCTGTCT
ACACTGGCCCTTTAGCGCAAAAGTTTTTTGGAAAAAGACTTTTGCCCGAACGGGAGCAGC
ATAGTATTTCCGCAAAAGCACTGACAATCTTACGTGAGATCGTCAGTGCTTTTGCGGAAA
TTCAAGCGGCCAGTGTAGACAGCTGGCAAGTTTTTCTGCAAAAGCAGATGATTTTGCGGA
AAAACTTGCCAGTCTAGACACAGCCAGGGTGTTCTGGGCTGGGATTAAAGGGCAGGAGGG
GGAGCAGGGGTGTGGCAGGAGACTGGGGTGCAGGAGAGCTCTAGAATACAGGTTCCAGGT
AGTGCTTACATCAAGCAGCTCCTGAAAGCAAAGCAGTAGCATATTCTCCACCCAGTTCCT
GTGGGGAGATACTGCTAGGTGACTCTGCGCACTGCTCTGTCCGCAGACAATAGGTCCACT
GCCCCCAGTTTCTGTTCAGTGGAAGTAGCAAAGCTGTCACTTGGGGTAAGAGCTGCGTGC
CAAGCCCCCTGATTACCCCTGCTTCCAGGAGCTGCAAAGAGCCATAGCGCACACGGAGCA
GGACAAGCCTCTCACCCTTCTTGCTGGCTGGAGTGCAAGAGTGGCATAAGCTCCCAACCC
CACTCTGTGATAGGAACACAAGGGCTGGAGTAAAAGATCTGATGGACCAGATGTGGCTCA
CGGGCTGCAGTTTGCCCAACTCTGACCTAAACTGTGATTCCTTCTGCTAGCTGTAGCTTA
CTCTAGGGTTTCAAATTTCATAGTTTGGGTTTTTTGGAACCAGCTGAACTTAAATACACC
CTTTATTCTGCATGAAGTCTCATGTCTTTCATGAAGTGGTTCTCAACTAATAGTTTGAAA
GCTACTTGTGGCCCAATCAACAAATAGCTGCATCAGCCTATGTAACATCCTCAGGATCAT
ACGTGCACTATAGATATTGTTTAGACACGGCCCACACAGGGATATTCAATTTCATTTAAT
GAACTCATCAACTAGTCAATTAGCCAATAAGCCTGGGAGCTACAGTGGAGTTTCTCCCAG
ACCCAGGAGCTAACCCCACTGCAGTTCTGCCTTTTAAATGTGTTAAGAAACTACTGGCTT
TTAAATACATTTAAAAGGCTGCTGCACAGCTGAGAGGACCCAGCACAAACTGGGACAGCT
GATTCCCAGCTCGCACCAGGTCCCCCCACTGCACTTCTGATTTTTAAATGTATTAAGAAC
TGCTGGCTCTTAAGTTTAAAAAGCAGAGGCATAGCATTTGGGACTGGGTGTGAGCTGGCA
ATCAACTAATTACTGGCTCACGCCCAGTCTTGTCTACCCCCTGCCCTGCGCAGAGATGGT
GCTGGAAGGAATTGGCTTTTAAGCTGGCTCCCCCCAGAACCGGCTTCTGTTCTCCCCTTG
CTGCCTCCGACAGAGGCTGGGGGGGGGGACGGGAGAATTGTGTAGTCAAGAGACTAGTCG
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CATAACACAGAGTTGCATATGTGGCCCATGACTGTAAATTGAAAATCACTGTTTTAATGT
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AACAAGACTTAACTGCACATTGTCTGGAAAGTACAGAACAATAGGAGCTAAAAATCAGTG
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GAGCAGAGGTGCAGAATACAAATTAAAAAAATTGGTGTGTTATATCTAGCACTTCCACCA
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