SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002148_2.0
Identity
TranscripttRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43)
SpeciesPelodiscus sinensis (Softshell turtle)
Transcript IDSPT00002148
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002055_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00002148_2.0 # Transcript # tRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43) # Softshell turtle (Pelodiscus sinensis) # Full length # Forward
CTGGAGCCATATATGGATGAGAACTTTGTCTCAAGAGCCTTTGCCACCATGGGAGAACTT
GTTCTGAGTGTAAAAATCATCCGAAATAGATTGACAGGGTAATCATTTATCTTTACTGTC
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GCCTTCCCTGACTCCTCGCAAATCGAGGCGTACCAGATGTCAGCAGGACCTACCCTCAGC
ATTCGATTTGGTGGTCTACACTAGACCCGCTAAATTGAACATTAGAAGATTGACCTCCAA
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AACCAGGCAATGAGAAGGAAAAAGCAGGCTACGCATTCCTAACCGCTATGCAATCTTTTA
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ACAGAAGGTCTTATTTAATGGTGATTTTTTTGGTACTTTAGTTTTCTCGTCTCTCTGGAG
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GAAAACAGCCTGATAACAGGTAAGTGTTTAGTATTCAAACATTGTTCTTGTTTGTTTGTG
AGTTCCCTTGCAAAAGAGTATTCAGAGTGCAAATCAATATATTCACTATTGCTGGACCAG
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GCTTAGGTGAGTGATATTTGCATCTTAGGGGTTACATTTTTATTTTTAGACTCTGATCCA
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CTCATGGGGTCAGAAAAGGGGTTCCAGCCATGTAACAACAGTGTGATTAATTCTTGCAGT
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TAAATAACTTGCTCAGGGGCATGCTAAAAGTCTGTGGCAGTCAGAAGGAAAACTTGCTCC
CTTCACTCCATCCTAAACACTTGAGGGCTTTCTATCTTATAAATACATTTTAAATTGTAC
CTATTCCAAACCTAACATTCATTCCTGTGGGAGGACGGGAAAGAAAGGCAAGGTGTCTTT
TATCTCCAGAAAGGTATATTGTGTTTAAGAATTTCAAGAGTCGGAACATTGCCCTAGTCC
TGCAAGCTCTTTAAGCATGAGTAGCCTCATGGACTTCAGTTGCACTACATATGTGTTTAA
ATATTTGCAGCATCAGACTGATTGCAAATAAAGGTCAGTAAATAGGGAACTAGCAAACTT
ATAAATGAGCTATTACCCACAAATGGATAGTAATGGTTTGAAAAGCTAAAGCAATACGAG
TGTTGAGAGTTATTCTGAAAGAATTAATCCACAAATTTAATTTAAAAAATGGTATTGCAA
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ACATGGGGAGCTGGCTTGAAAGCCAGTTTCCTGCATGTACTGGCTCCTGCCTACTCCCCT
CCCCCTCCCGTGCAGCTGCCTCTATATCAGAGGCAGCAGTGCGGTGGGTATGTGCATGTA
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TAACATCTCTAGCCAGTTACATAGGTAAGGCTTTTAAAAATAATATTTATATCCCCATAG
TCCCATTAACTCATGCCACTTAATAATCAGAGCTTTTGGATAGTTTTCTGCTCTTGTTCG
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TCCAGAATACTCACTCTTTGTGGGAGATCTGACCCCAGATGTGGATGACGGCATGTTATA
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TGAGGGAAAAGAAATAATTGTGTCAGTTTTGCTCTGGACTTAACACGCCAGATCACAGCA
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TGGGCTCCCAAATTCTGTAAATACTTTTAAAAATCTTCCCCTGACTCTTTAATGGGTTGG
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AAAACCTTTCCACCATCTCCAACTAGGGCCTGAACATCACACATTGCAGTGGTTTTATAT
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TGAGATTAGCGCCATCTCCACGGCGGGATGTTGATGGCAATCGGGGAGTACTGGCATCAA
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CGTCTAGAGAAGCCCTTGTCCACAGAAAGCCCAGGTGCTCAGCAGGCAGGGGCTGCTCCG
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GGCCTTAATTAATCAATTTGTAGATAAGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCTCACTCCTAA
GTCTGTGATCTTTTTGTCATGTCCAGAGAGGCAGCCCAGTCCACCTCCTGCAAGCTGGCA
CTATTCAGTTGTGTGCTGCTGAATTATCTCTGACTCACTACATCTAGATCCCACTCTTAA
AGCCTCTTCTACGCTAGCAAAATGTTCTAAATGTTTTCTGCTGTTGCCAATTCTGGTTCT
GCTCTACTGGCGTTAGTAACATTGTGTTACTTGTGTTGAAGGGCAGCTGGCTGCATGCCA
CTCTTGTTCAAGTGAGGCTGTCCAGCACAGATATAATTAATATGCCCAGTGTTTCTAATG
CTGGCAGAGCAGTGCAGGTATTCGCCCCAACAAGAAATTTTGTAGAAAAGTTCCCAGTGT
AGATGGCTTTGACTAGGAATCCTGTGTTAATCCATCCTGCAGAAAAGGCAAATTCTGTGC
ATCACAGTGGGGCCGACTTTAGACACAAGTGAAATCTATGGTTGCTTATTAACTTGGCGC
TGACTAAGAAGCTATCCTGGATGGCTTTGATTCCCCCTTCCATTGCTGCCAGATGAGGAG
GAAACCTGGTCTGATTCTTTGTCTCCTCTTCCCTTCATCTCTATAGCTTGAGATAACACA
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GAGCCCCAAAAATCTTCTAATACAAGATGGGTATTATTGTTCTGATGCCTTTGAAAATAC
TGCAGTACCTCAAACACTGCAAATAACAAAGTTGCTGGAATAGGGAATCCAACAACTGCT
AAATCCCTGCTAAAAACACATGGACAGGTTTTCATTTTTGTGTTTCCATTTGCCTGGTAA
AATATTCTCCCAACTCCATATTTTATTAGCTGTAGAGGATTCCTAAATCCGGGTGTTTTT
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TCTTTCTGCAGAGGTTATGGGTTTGTGAAATTCACGGATGAGCTGGAACAGAAAAGAGCC
CTGACAGAGTGCCAAGGAGCTGTGGGATTGGGCTCTAAACCTGTACGCTTGAGTGTGGCC
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ATACTTTATATTTAGCAACTGATGTCTGAACATAATCTCTGTAGATGCATTTGCATAAGC
CTGTCTGATTTGTAAATAGTTTAAAATCTGTTTTTAAAATAAAATGTAAAGATCAATTTA
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GTCACTGTTAGGAAGTTGAGGACTGAAGTTTATATTCTGCACTTCAGAAGATTGTGTCTT
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CATTTACTAGAAACATGAAAAATAAAGGTTAATCTGATTTAAAATGAAGATTCTAATTTC
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TGTTTTAATCTTACACTTCAGTAAGAATTTCTGGTTTGTATCTTTTTTAAATAAGATTTT
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GGAATGGGGACCATCTTTGATCTGTATCTGTACAGTGCTTAACACAGTGGGATCCTGATC
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CCCTTATTTCCATCTTGCTATTCCAGTCTTGAGCCTTGCTGGGGCGCAGACTAATTGTCT
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GTTGTGGGGGGGTTCTTGCTGACTAAACTTACTTTATTTAGATGTTGAATTTTATACAAA
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TTTTCTTTTTTGCTTTTCAGTGGATCAGTCAGCTTCACTTCATACTCTGACTCATGCACT
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ATTAAATCCAAACAAAAGGGGATTTGGGGTTTCTTTTAGAGTGGAATGTTTTTGGGGTTT
TCTTGTTTGTTTTTTTCATTATTGTTTTAACAATCCAAGTATAAACTTAACTCAACTTCA
TAGGTCCAAGTGCTTTATAAATGTTTTCTGCAAATGTAATTTTCTCCTATTCATATCTAC
TTCACAGGGCTGTTGTGATACTTGCTCAATTCATGATGAATTGAACAAAATAAATAGTAC
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CTATGATCATCATAGGCCCAGATACTCCAGGATGTGATAGCAGACAGATGTTTTTACCAA
ATATCCATGAACCAATAAGAAGTATTTTTAGCTTTAATTTTAGTAAACTGTGAGGACTTC
CTAGAAGAACAGGTTGTAGAGGAAAGCATTGGCTTGAGTGATCATGAAACAATTCAGTGT
AATCTAAATAGAAGGTTAAAAAAAAGTAAATCTGCAAGTAGGAGTCTTGATTTCAAAAGG
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GCACCTCAAGCAAGGGGGGAAATTTTAGAGAGGGGTTGCTGATTTAACAGGCATCTCAAA
CAGGTTATTAATCCATTCTTTGGAGGCTTCCTGCTTTCTCTTAATAACCTAAACTTAAAA
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GCTCATGATACCATCTACATGTTTTGTTAGTCTATAAAGTGTTAGCAGACCATTTGTTGT
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GGATCAGCAAGGAAAGCTACCTCTTGGGGTTGGAAAGTATAGATGAAAGGAAAATATAGA
GGAAAAAGTGAGAACTGCCAAAAACCAGTCAGAGCTGGACCTTGTAAAGGAAATTACAAG
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CAGTACTGCGTACCTGGCAGTATTGTCACAAAAAAAGCACTGGAGTCAGTGTTCCCTGTA
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CAAAATATATTTTGCACATGGATGGAAAAAATTAGAGGGAACATTGCGGGGGAGGTTAAA
GGTAATCTAGGTATGGCCTAACACCTAAAAGGAATACTATGGCTCAGTTTTTCATTAGAT
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GCGCCAAAAACTACAGGTTCATTAGCTTGACTGCAGATTTATGCAAGGCTTTAGAACACA
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TTAAAGGCAAGATTATGGTGCATCATGTTGAAAGGTGATCTGTCAAACTGGAGGGAGGTT
ACAGTGCATTCTCTCAGAGCTAGAGAAAGACATACATGTAATTAGTTGATCACAGGGTGA
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TGAGGGAGAGAGCAGGGGCCTTGTACCATTATACAAGGCCCCTGTGAGACCTCTTCTGGA
ATGCTGTGTGCATAAATAAAGTCAGACTGGAACACATGCAGAGAAGGGCTACTTGGCTGA
TCAAAGGGATGGAGAACATACTTTCCAAAAGGATACTTGAGGAGTTGGCTTCTTCAACTA
AACAAAATAAAGGTTGAGGGGAGATGTGGTTGATCTCTCTAAATACAGCAGGGAGGGAGA
AGAGTTATTTAAGTTAAGGGCCAATGTTGGTATAAGAACAAATGGATATGAACTGGTCAT
CAAGTTTAGGCTTAAAATTAGACTGAATTTCTAACCAGGAGAAGAGTGAAATTCTGCAAC
AACCTTCAGAGGACATTAATAGGATGCAAAACACTAACTTGTTTCAAGACTAAGTTTGGT
AAGCTTGTGGGGACGATATAATGAAGTTGCCTGCAGTGGCATGGTGTATGGCTCCTCCAT
GACAGCTGTTGGCAAATACCTTCAGACAGGACACTAGATGGGGAGGGCTTTCAGTTACCA
CAGATAATTCTTTCCCATGTTTCTGTCTGGTGGGTCTCGCCCACATGCTCAGGATCTGAT
CATCAGATCTGGGATCTGGAAGAAATATTCCTGAGGTCAGACTGGCAGAAACCTTACGGG
TTTTTTGCCTTCCTCAGCAGCATGGGGAATGGGTAACTTTCTGGTTTGAACTATAGTAAA
TGGTGGATTCTCTGTAATTATGTCTTTAAATCAAGATATGAGGACTTCCCTAACTCAGCC
AGAGGATATGGGCCTTTTACAAGAGTGGTCGGTGGTCTCTGATGTGCAGGAGATCAGACT
AAATTATCATGGTGGTTCCTTCTGTCTGTGACTGTAAAGCACTTTGAGATGCTCAGGTCA
AAAACTCTTTGCATTTTGTTCCAATAAAATTTGTATTAGTTATTTGTAAACATACTTTGT
ATATGAACCATTTGTGCCTTATTTCTTTCCTCCTTTAGATCCAATGCCTCAGATGGACGT
AAGTGAAGCAAACAAACAGTTTATGGAACAGAGTGAAGAGCTCTATGATGCCTTGATGGA
CTGTCACTGGCAGCCTTTGGACACTGTC
Chart Advanced