SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002157_2.0
Identity
TranscriptSelenophosphate synthetase (SPS)
SpeciesPetromyzon marinus (Lamprey)
Transcript IDSPT00002157
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002064_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00002157_2.0 # Transcript # Selenophosphate synthetase (SPS) # Lamprey (Petromyzon marinus) # Full length # Reverse
CCGTCCCCTGTGGCAGGATTCCGCCCCTCCCTCGGGCTTCAGAGAACCCTCTTGCGCCTT
TTGAGGGAAGAGCATCAAATTCAGGGGGCGGATGCGAAACCGGCTAACGGACAATCGGCA
GCGAGTGGTGACGAGCTTGTAAAAATGTTAAAACACCTAAAAGAAAATAGGTTTTCACAT
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GCGCACAGGTTGGGCAGGGGGCAGGCACCAGCGCGCCGTGGCCTTGGTGGCCCCTATTGT
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GTGCGCGGCGTGCACCGGGCTACAACGCCAGGCGCGCTGCGGGCTAGCGTGGGATGCGTC
GAGTGCACCCAGCGTGCGATGGCGTGCACAGTCGATCGTGAGTGCATGCGGAGCAAGACG
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CCGCGCTTGTGCCACGAAGACACGAAAAACCATCTCCGTGGAGCCCAGGAGGGCCGAGCG
TGCGTGTGATGCTTGTGCGTCAGTTGGCGGTGCCTGTGTGCGGTGATGTGCCCCACCCCA
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GGGCCGTGCGGCCACCCTTCTCCACGATGCCGATGATCCACGCCTGGTGACCCTCGCCGT
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TGAAGCTCTTTTTGATAGATGTCCAAGGTTGGTGAAGAGGGGCCCACAATCAGTTCAGAT
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CGCACGCCGCGGCTGATGGAAAGATTTCTACCAGAGGAAACGCTAGAAAACCTGATAGAG
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GTCAGAAGTAGTTTCAATTGTAACTTGTTCGTGGGTTCAACTACCGTGCTGGGAGATCGA
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CCGCAGGCCTTGCTGATGGCGGCCATCTTGGCGATGACGGGGAGGTTGTGGATGACAAAG
GACACCTCATTGCGCTGCTGCTTGGCCAGGTTCTGCGCGTGACCGAGGATGCCGAAGCCT
GTGATGTCCGTTGCCGCATGTGCGTTGAACGTGTGCATCAGTCCAGCGGCTGTGGGAGTT
GGAGATGGCATCAGCGTATTATTAATTTCTGATTACGCTTGTTTAGCCAGGAAAGCCTCA
ATAAGTACCACACACTACACAACCCACACCCACATTTCACAGGAAGCGAGCAATGTTGCT
ATGTGTAATGCCAGTTGAGTAATGTGCACGTAATAATGCAGCAATATGATGTTACATCCT
ATGTTTTTTGAGCAATGTGAAAAAAGGTGAGAACCAGAATACACAGAAAGGCATCCAAGT
CGGGAATTGAACCTAGACCCTCCTTGTTAGCACAGATGGCTACGTACGGTGCCAAAGAAG
TTCAACAAACATGTTATCGGGCACATGCGTTACCATGGCACCATGATTTTTACCAACATT
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ACAATGATCGGTGTGTGATACACAATCCCAGCTTAAAAGTGCAATAACATAATTCTTTAT
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ACCAATTCTAACCAAAACAAAATGTATTTCAAATTTTACCAGGTAAGGCCCACTGAGCTT
TATAGCTATTTTTCAGAATTGACCTGGCTTCAAATGATAAATAAATGAAGTAGCTAATCA
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ATACAGGTGTCAGGGTCGAGATTGAACCGACGACCTCCTGCATGCCAGGCGAGGAAGCTA
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AACCCATGTTTAACACTTAAAAAGATCCCAGCATTAATTTCACAAACGAATTTGCTGTAC
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AAGTTTGTGACATAAAAATCACAACTATGGCCCTGCTTGTGCACATAATACAAATGTTAA
ATAATAACAAGTGCAGATTATTTATGCATCACAGCAGGCACACCCATAAATCTTGTCATA
GGCAGATGCAGCATTTTTCCTACTGACCTGTGCGGTTGAGGCGTGCCATGTTGAACATAG
CCTCCTGGTAAGCCAACTCCACATCCTCTTGTGTAACCACCAGCTTGATTTTATTCCACT
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TAGAAATATACCCATCTGCCTTTGTCTCCCCAGTGCTGATGCTTATCAGTGCACCAGATA
TTAATGTACGATTAGAGAACATATACAGGTTAAATACACAGCGCGGATTGGGTAGGAAAT
GTCCCTAGAAGGGATGGTGGCCAGTGGGCGAGACTAACAAAGTGACAGCAAAGGGAAGAA
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TTATACCAACTCACAGGCGTGAATCTCCACTTATTTGAGATTCAAGCCTGTTTTGGCCAT
TCCCCCTCCCAACCGAGATGATTGTCTACATTTAAGCCAGGAAACTCCCCATTATGATTG
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GCCTTCGCAAGGAATAACTACAAAGTTGATGAAGCGAAACAGAAAACGGCCGTGCCCGAG
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ACAAACAACTAATAACGAACACGCACGCAAGGGCTGGTGGCTCACATGATGAACTCGTTG
GGTTGACACACGGTGGTGGCGACGCCCCCGATGACGATCCAGGGGTTGACCACTGTCTGC
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AATATTTCACATTACCTTTGCATTTTATCCGCCTATTGCAAATAACTGCTTGCAAGTAGA
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TATTATATACACCGTACGTACTGTACAGCGAAAACAATGGATGCTCCATTGCCCTATAAA
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GAGTGCGCGTGAACCGCTCATATATAGAGTATACGTGTACCCCCCCAAATGTATGCATCT
AGGTATGGCTACATAAGATATTTAGGATCAATGGGTTTTTTTTTTACCTGGTGACCCCTT
TTATTTTTTTAAAAGGATTTACTGTATACACACCCAGCAGTTCACGAAGGCACCATTTAA
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GGGGAGGTCTAGGCCGCCCTTCCGAGTACAGTAGCACCGCACAATGACAATACAAAACGG
CCACCACGCACGTGGTCTCCCACCACTCGACAACGAACACACGCGGTCCATTACAGTATT
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GGAAAGCGCCAGCCACGTGGTTGACGGTTCTTGGCGCGATAATCTGGCGACGATTGTGCC
TTGCGATGGTAGTCGCCTGGTAGTACTGTAATATATTCTAGCGAAAAACACCGTATAGTG
ATGGAACATGTTGGCGATTGTCGCGACTGGTGGTGGTTTTTGGTAATACGTATTTACATG
TACAGCCCTCTTAATTCGTCAACCGCTGGATGGCCTCCCACGCCGTGCGCTTGTGGAATT
TATTTGTCCATACTTCACCCCCGATTAATGCGGGTTAGTGCACGCGGTGACCATGGACGT
GACCACACAATAAGTGCAATTGATTTATTTTTCTTCAATGCCCACATTTTAGGCTCGCTG
CCCTTAATACCTGTTATAAACACGGTGATCACCCATATTAAATTAAACATTTTCAAAGGT
ATACCAGGTAAGGCACATCCAAGCATTATCCAAATTCAAACCTGCTTCGCAAGAGTGGTG
TGCATGTGCTGTACGCCGGTTTGTGCGGGTCTGTAATACATACTGTACGTCACCCGGAAC
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GTGCACAGACAT
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