SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002164_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein N (SelN)
SpeciesPetromyzon marinus (Lamprey)
Transcript IDSPT00002164
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002071_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00002164_2.0 # Transcript # Selenoprotein N (SelN) # Lamprey (Petromyzon marinus) # Full length # Forward
CAGGAAATGGCCCTGCGAACACTGGGCAATGACGGGCTATTCCTTTTCACCTCCCTGGAC
ACCAACATGGACATGCAAATCAGCCCCGAGGAGTTCCGGCCTATTGTCGACAAGATCATA
GGTAAACACCAGACCTGCGCATATATCTCAGAATTCTGCGGTCTTTCTTTTTGCGGTGGA
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GAAGGATAGATACACTTTTCGATATTTTATATGCTGTGCTATGGTCTCAGTGACTCGAGT
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GTTCATGTCACCCCTGCAGCTTTTAAAGGCAATACAATTCACTGTAATGTTAAAGATATT
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TGCCCCCCACCTCTCCCTCCACATACATCCTTTTTTATGTTTCGTTTGTTGTCCTTCCCC
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CCCAACGATCTGAACCTCTTTACCGGGTATCTGCCCAACAGCCGCTACTACCCGCCACCG
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GATGACACCTATTCAGAAATTCGAACGCTTTTCTGCAAAAATGTATTGTTGCCGAATCAT
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GCATAGAATAATTTGAATAGTAGAATGATACATAACTCCATTTTCACTTTTCTTACGAAT
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GGTTGGTGAAAGGGGTGATCTGCCCAAGGACCAGTTGAGATATCACCGCCAACATTAGCC
GTGGCCGGGAATAAAACTCAAAAGTCACCGGGATCATAATGAAGTGCGCGCTGTCCATTG
TGCCATCCCTCCATGCCCAGGCGGCGGCTTTGAGAGGCCTTCGTCCAGCTGTAGATTGAT
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CTGTAGACTTCTCTCAGTAAGGAAATGATTGCAGACCAAAACATTTTTCAAAACTAGAAT
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TTTATGTTTGAGTTTTAATGTGATTCCGCTTTTGGTGACAGATTTGTGCCAGACAGGCGC
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GGCAATTGTGCTAATCGGACGTGCGGAAAAGATCCTACTCTTTTCAAAAGTTATTCTTCC
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TGACTTAAAGCTTTCGTAACTGCAGGAATTCATGCTCTTTGGGTCTTTCGGTAAAGTCAC
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TGGCCATTAGTGTAGACAACCTTCTAATGTTCTGAAAATTAATCTTTGTTCTTCGTGTAT
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ACACACAACCCTTGGGTCAAACCTCTACCTTAATCTTGCATTTAATTAAGTATCTGAACT
TTCCCTAAGGGTATACGATAACACTGGCCCCAACATATTTGTTTTTATTTTGCAGTGTTC
TAAAATACTTTAAGCCTAGATCATTTGTCAATGAAAAGCCCATATTGCCACTGGGTAAAA
AAATGCACTCGAAATAATAATTAGCTCATCCAACTGGAGAGGAGGCATGCGTTGACGTCA
TTAGTTTCCTTTCGCCAGCAGAGGATGCAACGTGGCCGAGTTGCCAAACACCGAAGGCTC
CGTCTCAATGAAGACTCTGCCATAAATCCTGTCAAGGAGGGGCTAGGTCAGACCCCCGAT
GTAGCT
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