SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002177_2.0
Identity
TranscripttRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43)
SpeciesPetromyzon marinus (Lamprey)
Transcript IDSPT00002177
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002084_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00002177_2.0 # Transcript # tRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43) # Lamprey (Petromyzon marinus) # Full length # Forward
AGGTCGGACTTCTCGCTCTACATTGGTGACCTGACGCACGACGTCGACGACTTCCAGCTC
TACGACTTCTTTGTGCGGCGCTACCCTTCATGCCGCGCCGGCAAAGTGGTGGTGGACGAC
CTTGGGCACTCGCGGTGAGTGCAGTCGGTGGTTACGCGAGTCGTCGCTTTTCCAGGCCAA
CCCTCGCGGTCAAAGCTTTGTCTATTGGGGTGGCGCTCATCCATAGCGCAGTTGTTTTTG
CTTTGATATCTATTTGCTTCATTGCTGTACTTTTATATTCTATAAGCTTTTTTCATCTTG
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TGAGCACAATGGACTTGTAATGCAAAGGACGCCGGTTTGATTAAATTTCCTGGCGTCTCT
TTTTTTTTAACACAGTTGCTTAGCACAGGTCCAAGGCCCAAAACGTCTAGCAGTCAGCAA
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TTTTTTTTTTAACACAGTTGCTTAGCACAGGTCCAAGGCCCAAAACGTCTAGCAGTCAGC
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TTGAGCAAACTTAAACAAGCTTATGGAAAGAGACAATGGGAAATAATTCTAAAGTGGAGC
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TAAAATGTCTGTACCGACCGCCACAAGCAATCGCTAAGAGGTCAAGAGGCAGACTTTGAG
TGTGTCTGAACCTGTGACATTCACCTGCGTGCAGGGGATTTGGGTTCGTGAGGTTCCGAG
ACGAGCGGGAGCAAAAGGCCGCCCTGGTGGAGATGCAGAGCGCCGTGGGGCTGGGCGGGA
GGCCTCTGCGCATCAACCTCGCCAACCCCAAGCGG
Chart Advanced