SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002218_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein T (SelT)
SpeciesPongo abelii (Orangutan)
Transcript IDSPT00002218
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002125_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00002218_2.0 # Transcript # Selenoprotein T (SelT) # Orangutan (Pongo abelii) # Full length # Forward
CTAGTGGCGGCGTCAGCGATGGTCCGGAGCGAGGCCTCGGCCAATCTGGGCGGCGTGCCC
AGCAAGAGATTAAAAATGCAGTACGCCACGGGGCCGCTCCTCAAGTTCCAGATTTGGTGA
GTATGTGCACTGGGCCCCGGCCACCCCGCCGCGCCTCTACTCGTCGCCATTGGCTACGCG
AGGCCCCGGCTTCGCGGCCTAGATGGCTGCATCTTCGCTGGCCTCGTAGAAAGGTGCCGG
CGCCCTTACACAGCCAGCCTTCTCGCGGGCCCTTCTTAGCGCGGTCAGGTCGCCCTCCTT
TTCCAGGTACAACTGCTCACTTGTTTTTTGCCTCCTAGAACAGTGGGAATGGGGAAGGAG
GGCGCGAGAAGGTTAAACGCTGAAAGGCGAAGACGGGGACACCTGTTAGTACGGAGGACC
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CCGCGTCGGCGGAGGAGCGCCAAGCGTTTGTCAGTTCACTTTTTCTGCCCTCTTTTCCGG
GGTAATGCCGGACGGCTTCCCTGCCCTGGCTAGATGAACGTTAATTCGGGTCGTTGGAGA
GGATCCCGGGAGTGACAGACGCCCGTTTTTCTCTTGACCTTGCTGGGGGGGACTGTTGAG
TTTGCAATGGCGTCTGACAGCTGGAGCGGGTTGGAAGGGAGTCTGGGATGCTGGTTCTGT
TTGACTTTCCAACTGTCCAAAGGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TTGGGAGGCTGAGTCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAAGCGGAGGTTGCGGTGAGCCGA
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ACCTGGTAATTGTACCACTTTTGCAAATGTTAGTCAACAAAATAGCAACATAGTGCTGAG
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AGGCTGATCTTGAACTCCTGACCTCAAAGTGACCTACCCACCTTGGCGTCCCAAAGTGCT
AGGATTACAGGTTTGAGCCACTGCCCCGGGCTGAAATTCCCTTTTCGTGTTTTCCTTTTA
TTGATTTTTATAAATTTGTATTGATAGTTACTCTTAGGCATGATGTTTGTCATACATACT
TTACTTTCTCCGTATATGTGATTTAACATGTAATCAGATCTACAGCATTTAATTAGTTGC
AGTTTAAAGAGATTATTGGCTACAACCCTTTACAGTTAATATTTACTTGAACATTTGACA
ACTGAATTTCTGAGAATAGTAGATTAAATGAAATTGAGATTTCAAAACATAAGTAGAATA
TGGCGGGATTTTCAAAGTTTTGTTAGTTTGAGAATCCACTGCTGTAATTTTAGGACAGCC
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TTAAATTTACAACTACTCAGCCTTGGCTTTCATAGTATGACAGCAAGAAAATAAAGACCT
AAGGTTGATTTGGATGTTGATACTCATCAAGATTAGTAGTAAAATGCTGAATTGGAGAAA
TTGTGAGTTACAGAGATCATGTTGGTTACTGTAGACTTGATATTTGCATATTCAACAGAT
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TCATGGACTTCACAGGCAAGAGCAGATGCAGCCATTAATCCATGGACTGACCACACACGT
AAAATTCAATTTGTGTTAGTGCTGTGAAGAAACATTATGTGGTGGTATGAGAGATACCTA
GTTGGGATCAGAGAAGGTTTCCATGAGGAAATGAACTTTGAACTGAGATTCGAAGGATAA
GGTTTATTTGGCGAGAACTTTCCAGGCAATGGGAATAACACGTTCAGTGTACTTATAGTA
GGAAAGACCACAGTTTTGCCAGAGAAGCCTAAGCGTACTGACCTCAGAGACCTAAAAGAA
GGTGCCCTTAAGAGCTTGAGGGTCTGGCAGGCCGTGCTTAACAAAGACCGTTTGGTTTCC
TTGTGGAAAAGACATTCCAGGAGACAAAGAATTGATGGGAAACCATTTAGGGCGGCTTTT
GGAGTTGTCCAGGCAAGAGATGATGGAACTTGGAAAAGTAAGGAGGCGGTAGAAATAGAA
AGAGATGTATTTGAGAGATCTTTATGTGGTAAATTTAACAGCTCTTGATGATGAATTGTA
TGTTTGTGGGGAAAGAGAGGTGGCATGAAGTGAGAGATGTCAAAGATGTCAAAGATGATT
CCTGAGTTCTGTGGTAATGCTACACCATTCACTGGAATGATAATTAAAATAACAAGTTTT
ATGAATGTTTTTGGTGGGAGGGAAGGAATCCTGATTTTTGAAGACTAAGGACATAGTAGC
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ATGCTTATTGGTATCAATGAAATAAACGAGTAGTAAGAAGTTGGTGTAGATAGCAGATTA
GTAGTAGTAGAGTGTTACCATTTAAAAAAATAGCTGCAGCATCTAATTGAACACCTTGCA
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GGTAAACATGACTGAATGATCTTAAAGGTTTTATATCCTTTTACAGAAAATTGAAACATA
ATTTCCTAACAGTTTGCCATTAAGGCAAATGCTGGACAATTGAGTTGAGTATATTATTTA
GAAATACCAAGATAACCCCTAAATTTTGATTAGTACAGTTAACTGGGAAATTGCTCATAT
ACTGGACTAGCAGTTTAGAGGCCCAGATTCTTATTGTATGTGCCTCTTCTCTGAATGACA
CTAGATACAGTATTTAATCTCTCTCTTGTTTATTTGTTTTTTGTTTTTTTTTGAGACAGA
GCCTTGCTGTGTCCTCCAGGCTGGGGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGCAACCTCC
ACCTACCAGGTTCAAGCGATTGTCCTGCCTCAGCCACCTGAATAGCTGGGATTACTTGTG
TGGATCACCGTGCCCAGCTACTTTTTGTATTTTTTGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTG
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TACCTCTGATATCCTGTTATTTTATTTTGTGCTGTTAAGAGGTGTAAAGTAAAAAAGTGA
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ATCTTTAATCCATCTTGAGTTGATTTTGGCATATGGTGAGAGGTAGGGGTCCAGTTTCAT
TCTTTGCATATGATTAGCCAGTTTTCCCAGCACCATTTATTGATTAGGAGGTCCTTTCCC
CATTGTTGGTTGTAGGTGTGTGGCTTTATTTCTGGGTTCTCTGTTCTGTTCCATTGTTCT
ACGTGTCTATTTTTGTACCAGTACCATGTTGTTTTGGTTACTATAGCTTTGTAGTATAGG
ATTGCTTTGGCAGTTTGGGGTCTTTCTTAGTTCTATATGAATTTTAGAATAGTTTTTTCT
AATTCCATGAAAAATGATGTTGGTAAGTTGATAAGAATTGTGTTGAGTCTTTAAGATTCC
TTTGGGCAGTCTGGACATTTTAGTGATGTTGACACTTAGAATCCATGAACATGGAATGTT
TTTCCATTTGTTTGTGTCATCTATGATTTCTTTCAGCAGTGTTTTGTAGTTCTCCTTGTA
GAGTCTTCCATCTCCTTGATTAGATGTATTCCTAGGTATTTTATGTCTTTTGTGGTTATC
ATAAATGGGATTGCATTTTTTATTTGTTTTTTCCACTTGAACGTTACTGTTGTATAGAAA
TGCTGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGGGTCTTGTTCTGTTGCC
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ATCACAGCTTACTGCAGCCTCAACACCTGGGCTCAGTTGATCCTCCAGCCTCATCCCTGG
AGTAGCTAGGACTACAAAGTGCATGCCATCACAACTGGTGCTACTGATTTTCATATGCTG
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CTAGGTATAAAATTATACATCAACAGTAGACTGGTCGCGGTGGCTCACGCCTGTATCTCC
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ACAACATGGTGAAACCTTGTCTGTACTAAAAATAAAAATACAAAAATTAACCGGGCATGG
TGATGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAAGAGAATTGCTTGAACCT
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GTGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGGAAGGAAGGAAGGGAGGGAGG
GAGGGAGGGAAAAGAAAAGAAAAGAAATCATCAACAAAGACAGATAATTTGATTTCCTCT
TTTCCCATTTGGATGACTTTTATTTCTTTCTCTCACGTGATTGTTCTGCCTAGGACTTGT
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GGGAATGCTTTCAACTTTTGCCCATTCAGTATGATATTGGTTATGGGTTTGTCAGAGATG
GCTCTTACTATTTTGAGGTATGTTCCTTTGTTTAAGTTGTTGAGGGTAAAACTTAAGTTT
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TATAAACTTCCAGAATTCTCTGTGCTACTGCTAGTCCTTTTCCTGCTGCCCTGAAACTCT
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CTACATGCCTGGCCAATTTTTGTATTTTTTTGTGGAGAGGAGGTTTCACCATGTTGGCAA
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TGCTTACTTTTGAAGGTAGCTTAACTAATTTTGTCATAGTTTGGCATTATGAAACCTAGC
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TTTGATTTGGTTATCTCAGCACTACAAATTCAGGATGTCACTGTGTTTGGTTTTTCTTCA
AGTTTGCATCTTAGTAGCCAAAAACAGTCTTAACATTTCAATCAGTCTATTAGACTGGGT
TCATGTTTCATTATTTTCAATTTTGCTGGTAGAGAGAAGGAAAGGATAGAATATACATAA
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CCTTGCTCTTTAATTTTTGTTAGTAGTTTGTGCACTGCTTTCTGGGCTTGCTTCTGCATT
ACCTTATAATTGTTCCCCAGGGTTTGCTGTGAATTTGTCTCTCTGAAATTAGATTGTGAA
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GAGAGAGCTGATTTCCTGACTCTGTATTTAATGGTCTTGCCACAGTACTATTGCATCATG
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TGAGGGCCTTCTTGCTGAGTCAGCTCATGCTGGAAGGTCAAAGAGAGGGCAAGCAAAAAC
AGGTGATTGAACTTGCAGCCTCACCTCCCATTAGACCCTGCCTCCCAACAGTGTTGCATT
AGGATTATTTTCATCCTATGCTTTTTGTAGGACATATTCAAACCATAGCACAACATACTT
GTTAAAATTTTAAATCACTGTTAAAGCATGTTTCTTTGTTATACGTGGAAAGCATTGCCT
AGTAATAACTTACTAGTCTTAAGGTAGTTTTCTGAAAAAAAATAAGAGTGGACATAGTAC
AAACATCTTAATACATTTTTTGATTTGTTTCGTGGAGTGTTATGTGATATAAATTGCAGT
TGTACAAAAGCGAATAAAGGAAGATAATTGTAAAATCTGATGCAGCAAAGGTTAAATACT
TTAGGGACATTCTCTTCACTAAATTATGCAGAAGATGGGAACATTTTGGTGTTTTTTTTT
TTGTTTTTTTTTTTTTTTAGAGAAAAAGACCCAGAGATGATTGAGAGGTTCAGGTTAATT
AACATGACGGTGCATTCATCTCATTAGGTTCCCTAAGATTCTCGACACATGGTGTGTTGG
CCACTTGATTGATTCACAGGTTTTTTGGAGAGAGGATCTTTGCAAGATGGCTCTTCTGCT
CTTGAAGACTGGCAGTAGTTACAGGTACAGATAGATATGTTACTGGTTTTGTACAAGATG
CAAAAGATGAATGGTAGTGAAGCCACCCTGGCCACAGGAGAAAGCACATGCAGGAGAAAG
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AAGTACAAAGAAAATAGATATATAAAACTTTTATTCGAGTTAGCTGGCTATTCTGTTGGA
GATTCTTAGGAGCTGCAAATGGAGGCAGGTGGGGGATGACTAGTGAGAGGAGGCTCAAGT
GAGGGACATCCTTCCTATTAGTAATTCTTAGAAGCTACAGATTAGCTTGTCAGATTTAAA
ATGTTAGTCAAAATAAATATACCTGAAGTTTCTTGCTTGGAAAAGCAGGTCAGATGTGAT
TAGAAATGGAGGTGGGTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGGATTTTAGAAGGCAATAGTTAGA
ATTTAGAGCTAGAAAGGATCTTACACATGAAAATACAAAAAGTAGACTTTGTAGGTTTAT
CTAAGATTTTTATTTAGTGACAGAGCTAGAACTAGGATCCAGGGTTTCTCTTTCATGGTT
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ATTTTTATAAGAAATAGATATTATTTATTTAGAATTTATGAGATGTTTCACAGAGGGCTT
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AAAATTGATTCTATAATTCATTGTCATTTGAATAAAGTGGGCCTGTGTCAATATTAATCA
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AGCTAATTTTTGTATTTCTTGTAGAGACGAGGTTTCACCATGTTACTCAGGCTGGTTTCA
AACTCCTGAGCTCAAGCAATACACCTCCTGCCTTGGCCTCCGAAAGTGCTGGGATTACAG
GCGTGAGCCACTGCACCCAGCCAAAGTGAGAAATGGTTTTACACAGGTGAATACTATGAT
GGAATCTACACTCAGGCAGCTGAATTGATTGGAGGAAGGATAGGTGGAAAGCAGCATACC
AATTATTATAATAGTTGAAAGGCAGCTATGGGCATGTGGTGGTAAGCCCAGTTGTAATAG
AAAAAGCAAATAACAGAGCTGAGTTGGAGGACTGTTTTGAGAGAAGCAGGCTGGATATGT
AAGGAATATTATATTCAGAGTGCATTTGTTTCTCTCAGTCTGTGTTCCTTTTTTTCCTCA
TCTCTTTCCAACCTGTGTTTCTTATAACTTGTCTTAAATCTTTTCTCTTATTTAGTAATG
ATGGAAATGCTAAAAAAGAAAAAAAAATTTTTTGCTTTAACAAATTGAGGAAAGGCATGG
TAACTCATGCCTATAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCAAAGAGGGAGGATCACTTGAGGCC
AGGAGTTTGAAACCACCATGGGCAACATAGTGAGATCTCATCTCAACAAAAAATTTAAAA
ATAGCTGGGCATGGTGGCACATGCCTATAGTACCAGTTGTTGAGGAGACTGAGGCAGAAG
GATTGCTTATTTCCTGTTTATCTTGTACTTTTACCTGTTGGTTGTAGAATGATTTCAGGT
GACATTTGAATAAACCCAATAAAGAAGCCAGGACCCTCCATGTCTTAGAAGCCACGTTAG
GTTCATTTTGTGTGTATTTCTACACTGGTAGACACTGTAATGCTCTAAGAGTGCTGCAGC
TGTAAGAGAAATCACTTGGTCTCATATAATATAGTTCCTTAACCTGATAAGCTACTACTT
GTGTAGTGTTGTTTTTGCAACTTAAAAAACAACAACAACAGAAAAAAGCACGCTTTTTAT
CTTCATTCAAAGTGTTTGCAACTGTTTTTGTTTGGTTTGGTTGGGTTTGGTTTGGTTTTT
GACAGTCTCACTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCTGGAGTGTAGGAGTGCAGTGGTGTGGTAT
TGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCATGCCTCAGCCTCCCAAG
TAGCTGGGACTACAGGCACGCGCCACCATGCCCTGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGA
CAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCG
CCTCAGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGCACTGCACTGGCCGATAGTAACTTTTTAAA
ATCCCAGTTCTTCATTTCTAGAGAAGGAACTCTGTTTGGATCTTCTTGTTACAGGTTTGT
ATTTCTGGACCATCAGCTATGACAAGGAATTAGGCCTCGTTGTGTAAATGGGACCCAGTG
CTATGTGTGGATGGCTATTGTGAATCAAACGAGAGAGTGAATTGGAGAGATTGTGAAAAT
AGGAAACCACAAACTAGTATTTATTTTGTAACAGTAAATATCTGAGATCTTGTTCATGTT
GTCTTTTAATGAGGATGCGAGAGATTGGGGTTTATGATGGGCCCAGGTTTGATATAAGTA
GGCATTTGACTCCAATTAGCAGCAAATGTAATAGAGAAGGTGAAAGTGGGATGGTTGGCA
CTATGAATTAGGACACTGAACACATACTGCTCTGTCATCCAGGCTGGAATGCAGTAGTGT
GATCTCAGCTTTCTGTAGCCTTGACTTCTTAGACTCAAATGATCCTCCCACCTCAGCCTC
CCGAGTAGCTGGTACTTCAGATATGTGGTACCATACCTGGCTAATTTTTTCTTTTTGTTT
GTAGAGCTGGTGTCTCACTGTATTGCCTAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGGATCAAGTGAT
CCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGATGTGAGCCATGATGCCCAGCCT
ATGATAGACTTTAAAAAGCACAAAATCAATTTGAAATAGCATGGACAAGAGATTTTGCTG
TATTTTCGAAATTTCCTTTCTGTTCTGCATAGATCATCTAATATGTAAGCAAGATCTTCT
TTTAGAAAAGTACTGTTTCCAAAATATTTTAAATCAAGCAATTGCAACAGTTGATTCCAT
ATAATAAGGTATATCTGTATTACTAGAAAGGGATTTGCAAAGTGATAGCACTTAAACTTA
AGATTTCTTAGCCTGGTGTGGTGGCGGGTGCATGTAGTCCCAGCTACTGGGGAGGCTGAG
GCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTG
CACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAATAAAAAAAGATTTCTT
TTCGGCTAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAAGCCGAGGCGGGT
GGATCATGAGGTCAGGAATTCAAGACCAACCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTAC
TAAAAATACAAAAAAAATTAGCTGGGCACGGTGGCGGGCGCCTGTAATCCCAACTATTCA
GGAGACTGAGGCAAGTGAATTGCTTGAATGCGGGAGGCGGAGTTTGCAGTGAGCCGAGAT
CGCGCCACTGCATGCTAGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTGTCTCAAAAAAAAAGAAAGAT
ATCTTTTCAGGAGTTAGGTTTAATTCCTAAGGACATTTAGTCCGGGGCAGAAGGATAGGC
AGCTGATGCAACATTTTTAATATGTTCATATATTTATTTGGAGGTGTACTGGGAGAGGCA
GTTTTAACTCATTGACCCAAAAAGAGTGGAATAATTTGAAAGAACTGGGTGAGATGGTAG
AGGTGATGGTTACTAGCTCTTTACCATGTATACCTTTAACATTTGTCCACCTTGGTATGT
TACATTTTGGAAGACATCTGTTAGCAGTAGTGATTGCTGCTTCACAACAGAAAAATTATT
TTAGGGAAAGCAATTATATAGGAAAAAGCTTTCCTTGGTTTTCACAAGTCTGGAAGCAAA
TATAAGGAGGAATATGCATAAGTAAACTTGTCTAAAAATATGTTGTGGCTGTCTTATAAA
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TTATTAGCTAAATTCTATTTGGAGTTTCACACAAAGGTCTAAGACTTAACTGAAGATTTA
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TTAGGGTTTCCCGTAAGGGACTTCTTGGGGCTCATAAGCTTGGTCCTCTCAGAAGAATCT
CTGTATCTTCATCATGGAAAAACCCAGGAGGCCAATTATGTAGGTACCCGATGGTGGCAT
TGTGGACAAAGGGAACTTACTTCCTGGACATATGAAGGATAGCTCTTGAATCATCTAATT
GTTAAATTTGGGGTCTAGTGGAAAGGGCCTAGGACCCCAAATCACAAAGACTGTGTTCTG
GTCCCATCCCTGGCACTCAGTGAGGACAGGACCGTATCTGTGTTACTCACCACTAAATAC
TCACTGCCTACTACAGTGCTTACCATGTAATAAATAGGCATTCAGTAAATATTTGAGTGA
GTGAAATAATACATTGGATGCATAACTTCGGAAAAGTCGCGTTATCTCTCTGGGTTTCAT
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