SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002248_2.0
Identity
TranscriptSelenocysteine synthase (SecS)
SpeciesProcavia capensis (Hyrax)
Transcript IDSPT00002248
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002155_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00002248_2.0 # Transcript # Selenocysteine synthase (SecS) # Hyrax (Procavia capensis) # Full length # Forward
AGATTAGAAGAACTGGCTGTGATCTGTGCTAATTATGGCATTCCTCATATAGTCAACAAT
GCATATGGAGTACAGTCTTCAAAATGTATGCACCTCATTCAGCAGGTAAGAGAGTTTTAA
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ACTACTTAGAAGTGTGAATGTACGTTGAAGATACATGGAGGGTAGATGTAGTTTTTGTTG
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CAGATAAAAATCTACAAATGAAACCTAGAAATTTTACTGTTCATTAACAGTGGTGTGGTA
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ATTATCTTATTCTTTAACCTTCTGAAACAAGGGTAGGAATATTAGTTTAAGAGGGCCAAG
GAATCTTTGTGTGTCTTAGAAAAGGTACCTACAACAAGTTGTGTTTCCATATCCACAGTT
GGTGCTGACTTTTGCCTCCTCAGATTTTTCTCTGTTCTCCTTTTACTGACAAAAGAAAAG
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GAATTTTCCTCTTAATCTTGACCTGACAGAAAATGGAGTTAGTCATCCGCTTGCTGTAGA
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TCCTACCTCGTCCTGGTCTAGAAACTCTGCCAACACCATTTACACAGCCCAGTGGCATGC
CATCCTGCACTGACAAGGGAATGGAGTGGACTTGAGGTGCCCTGGCCAGGAAGCAAGCCT
GGGTCTCCTGCACAGAGGGCAAGAATTCTCCTGAACTGCGTGCTCCACCAGCCCTTGGCT
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GCATATTCAGCCACAGATTTCTTTGGGCAGCTTTTTATTTTATCACTTTTAAAGGGCTTA
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TGCCACTTACATATGTACATGAACTTTTGTGGTAGTAAAATGTATTTTCTAACAGTGGGC
GTAGTTCAGAGTGGGATCAAAAATACAATTTTTAGTTTGGGGTTGCTGTATTCTTTTAGT
CGAGTTTGGTTCAGTTTGTATATTTAAAAACCCTCATAAGCCCTTGGTTGTTGAATCAAT
TCTGACTCCTGGTGTTCCAGAAGAACAGAACAGACTTCTCCGTAGGGTTTCCAAGGAGTG
TCTGGTGAATTCAAACAGCTGAATTTTGTTTAGCAGCTGTAGCTCTTAACCACTGCACCA
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GCTGGTTTTCTAAGGAACTTACATATTAAAAGCGTAACACACTTTTGTTGGTAATGACAG
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TGATGCTGGGTCTCAGCATGTGACAAGAGGCCATTCAGGGAATAATCTGGGAAAAAAATT
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TATGTATGTTGTTATGTACTGTTGGGTTGGTTCCAACTCAGCAATCTTATGCCCAAAGAA
TGAAACATTGCCTGGTCCTGCACCATGCCCACAGTCATTTTTATGCTGATGCCCACTGTT
GCAGCTATGGTGTCAGTCCATCTTTGAGGGTCTTCCTCTTTTTCGCTGATGCTGCACTCT
ACCAAGTGTGATGTCCTTCTCTAGGGACTGATCCCTCCTCACAGTGTGTCCAGAGTATGT
GAGGTGCAGTCTCACCATCATTGCTTCCAAGGTGCACTCTGGTTGTACTTCTTCCAGAAC
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GTGACATGATCTGATTTTTGCTTTTGAAAGACCACTCTGGCCTGTATGTAGAACAGATTG
TAGGTGGCAAGTGAGTAGGCACAGAAATACTAGAATCTGTTGCTGTTGCCCATGAAGGAG
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