SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002320_2.0
Identity
TranscripttRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43)
SpeciesPteropus vampyrus (Megabat)
Transcript IDSPT00002320
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002227_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00002320_2.0 # Transcript # tRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43) # Megabat (Pteropus vampyrus) # Full length # Forward
ATCCCAGCTGGCTACTGCTTTGTAGAATTCGCAGATTTGGCCACAGCCGAGAAGTGTTTG
CATAAAATTAACGGAAAACCCCTTCCAGGAGCCACACCTGTAAGGACACTTAGATAATGA
TGATGTTGCCATTTTTATTCTCATCAACTCATTTATTGAATCCCTACTGTCTGTTTATAT
TATTTCATTTAATCCTATAACAACCCTGAACAGTAGGCATTGTTGTCTTTGACAGACCAG
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CCGCTGCCTCCCTTAATGGAAGACTTGAAACTAGACTTCTTGCCTGTTTGAGAAAGTAGA
AAGGCTGGCAGTAGTGAGGACACATTTCAAGAGAGTTACATTCTGCTCTTCCCACAGTTA
CTTAGCTTACAGCTGCACCAAGCTGGCACACCTGGGCTCATAGAACCATGGAGCTGGCAG
TGCCCTTAGCGGTCATCCGTGCAACCCCCCCATTATATCAGGAGAAAAAGCTGAGGCTTA
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CTGAACCTCTTACCGTATTTCCTCATCTTAAACAGGACCAATTGATTAATAGGATCTGTT
CATAGGAGCGAATTCAAGATTAAATGATGTAATATAAATAAAACATTAGGAAATGCTTTA
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TATTCTTGATCAGAGTTGTAGTTAAAAGCTCAGGCTTTGGGAGTATGACAGACCTAGATT
TGAATCTTACTTCTACTATGACTTTCGGCAAGTTATTAAATCTCTCTGAACTTTGATTCC
CTCTTCCTCAAATTGTTGAACCGTTCGCTGAGATAACCCTGGAAAAATGTTCAGCACAGT
GCCTGGGAAATAAGAAGTGCTCGTTAAATATTAGCTATCATTCATTTATTCTCTCAAGTA
GAATTTGAATTCGGGAGATTAGGAACCTTGTCTGTGTATGACTACTGAGTTCCCATGCCT
AGTGCAATACCTGGCATCCAGGGCATACTCGGTAAATATTTGCTGAATGAATTTTTACAA
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GGAAGCTATTGTTTGGGCAGGAGCCCTTCAGTGACTGTATAGAGAGAATGGTGGTGATCT
GGAAGTGGGGGTTCCAACAGATCTCGGGATCCCCCAGTGCTTGATTCTCACATTGCTGTA
CGGCACGCCTCCCCAGATGGGGCTCTCATCCCTGCCCACATAGTGTGATGAGATTTTTCT
CTCCTTTCTCAGCCCCTTTGCCATTCTTAGACTTTACCTTCATTCCGTTTGTGATCTATA
TAGTTTGTGTTTTTTTCCCTGCAGAGGCTATGGTTTTGTGAAATTCACAGATGAACTGGA
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GCTGAGCGTGGCAATTCCTAAAGCGTGAGTCCTGTGCTTGCGGGGAAGGTAGCCGGCCTG
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TAGGGAGAGAGCTGTGATTAGGGGAGGCAGATACATTCAGACATTGCTGATAGCAGTGCT
AAAAAAGCAGTTTAGCTACACATACTTAATGTCCCTGCTCTTTGCCCAGTAGTGCCACTG
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TTTAGCCTTATTTATATCAATGAAACCTACAGACCTGTGGATGTCCCTTGTTATGGGAAT
GGCTAAGAATTATCGAACCAAACACTCTTTTATGTGCATCACTATTGTACCTGCATGCAA
GGCAGAAGACAACTCCAAGCAGGTTTCTCACTCAGATGTAAGGCAACTTCTTTGCATAGA
ATCTTCCATACTTTGGCCAAAGCAGTGGTTCTCATCGGGGGGCGATTTTATCTCCTAGTG
ACATTGCAACATCTGGAGACAGTTTTGGTTGTCACAATTCAAGGGGAAGGTGCAAATGGC
ATCTAATGAGTAGAGGCCAGAGATGCTCCTTACATCTGACATTGCACAGGACAGCCCCAC
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TTTTAAAGTAGCAAAAGATTTGGAGGTTCTTTGCAGTTTAACTGTTTTTAAAACATAGAA
GATCAGCCTAAGTGTCTTCCTCCCTGAAATGTTATTTGTTCTAAACCACACACACACACA
CAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACTCACTAAGGAAACTATTT
AAAAGAAAGAAATTTCCTCATTATCCTAAAATGACTGATTATAATTTCTGAGTTCATTTC
CAGGCTTCACAGACATTCATGATGTGTAGACATAGACCACACACACACAAACACACACGC
ACACACACACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTTTCTACA
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AGCTGGGTCCCCTCCCCCCGTTTAGTTAGCATATACACTTTTCTATATAATTCCACAATT
ATCATTATAATATTTGTATAGCTTCAGGGTATTCTTTTGATTGTATATTCTGTATAGCAG
TTCCCCTGATGTTGACTATTTGGTTGTTTCTGATGCGTTACCATTTACTCGGTCAACAAT
AACAATTCCTACAACTCAGTAGGCCCTATCCTAGACAAGAGAAGCAAAGACCCTTCTGCA
GGGAGGTTATATTCTATCTAGTTCTTCCTTGGATGATGATGTCGGTATTTGGTGCCTGCC
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GGGAGTGTCTGCCATAGGATTTCATCGAGCCACTCTGTCGAGAGGTGATCAGATGTGTAG
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AAGAGCTCATTCCGACTTTGAGAACCTGTGGTTCCCGTGACAGGGATTTCTGTGGTAGTT
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AATGGAGTCAGTCTCTGCCTCGTGGTGTGTTTGATGTGCACTTATGAGAGACTCTGGCGC
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TGATTTCCTCTCAACTAGAACTGGTGGTCACACCCCCAGGCCTGTTTTATAAGCCTACTC
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TGGGTGTGGCCTTGGGTAAATTGCTTAACCTTTTAGAGACTCAATATTTTCATTTGTATA
GTGGGAGTAATAAATAATAGGTCTAGCATAGGATAATGCAAGACTTAAAATAGGAGACCG
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GGTCAGGATTTCACCATCCTTCTCACCCACCTCTCTGGTCTCTTGACAGACATATGAAGA
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AGCGATTGCTTTGTGACTGGCACTGTGCCTTCAGCTAGATGCTGATGGAATGCAAGGTGA
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GAAGTGTATGTGTCACCCAGTGGTGTGAGTGCAGATCCCAGAGAGCCCAGGGGAAAGCAA
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ACCTCTTTATTATGAATCTAATTCCTTGGGTGGAGGAGTCATCGGTGCCGTCTCTTTCAG
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TTCTACCAGCTTCAAATCACAGGCATTGCAAGCACCATTTTGTACTTCAGGTACATGGTG
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CTTTGCAATACGTTTTGAAATGGGGAAGTGTGAGTCCTTGAACTTTGATTTGGCTGCTCC
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TAACAAAATTGTTTTCCAATCCAAGTATGTGGGATGTCTTTGTTTATTTAGGTCTCTTTA
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ACACGCATTTTGAGATACATCCAAGTTGTGTGCAGCCAAGGTTCATTTTTCAATGCTATG
TGATATTCTTTTAAGAATGAGGATTTTCCAAACCCAAAATTGAAATAAGAACCACACCAG
AAAATCCAGGGCATGTGATGGCTAGATATAGGTGTAGCTTTTAATAGAATTGGAACAGCC
ACCATTATTTGAGTACTAACTATATGTTCCACTACCTACATACATCATCCTATTTTCATC
CTCGCAGGAAATGTGCAAGGCAGTTATAATCAGCCCATGAATGTGGAACTGAGACAGGGA
ACCTGCCCTAGGAAACAGGAAATCTGGAGAGCAGGGCACTGAACCGAAGTCTCTTGTGGC
TTCTGAGTACTTCTCTCCTTGATGCTTCCTAAAGCATCCTTGCTTCTCTTCCAGACCCCA
TGCCGCAACTGGATGTGACTGAGGCCAACAAGGAGTTCATGGAGCAGAGTGAGGAACTAT
ACGATGCACTGATGGACTGTCACTGGCAGCCCTTGGACACAGTGTCTTCAGAGATACCTG
CCATGATG
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