SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002341_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein K (SelK)
SpeciesRattus norvegicus (Rat)
Transcript IDSPT00002341
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002248_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00002341_2.0 # Transcript # Selenoprotein K (SelK) # Rat (Rattus norvegicus) # Full length # Forward
ATGGTTTACATCTCGAATGGTGAGTGAGAGCCTTACCCTGGGCCGCTTCTGTCCTCTGTC
GCCGGGTCCGGAGCTTCGGGCGGCCTCCCCCACGTCAATGGCCTGAAGGAGTGGGAAGCG
AAGGCGGTGGGACCTGAGGCGCGTCCCAGAAGGAGCTGCTGGGTGGCCCGGGTGGCAATC
GCAGGTCCCTGAAGCCTCCCGGTACAGCGAATTCCCGTTGTGGATTTGTGTTAGTGGTCC
CGGGTGCGGGTATCCTTACCCGGTAATGACAGATGCCAAGCCGGTGCACAACGCGCTTTT
GTTTGGGCCACTATAACAGCGTTCTTTGCTTAGCATCGCTTTCGTCTTTGTAACTGTTCT
ATTCAGATGGTGTTTCTATCCCTGTCTTTCGGATCAGACTGAGACGCAGATAGATCGACT
GGCACGCTTAAGATCACAAAGGCAGTGTGTAACTTCGGTTAGATTGAACTCAGATTGGCT
CCAGTGTCACCTACCATGCTGCCTCCCCAAATGCGTTCAATAACGATGGTGATGATGGTG
AGACAGAACTAGCACGAATATGAAAAAAAAAATTTGGAGATAGGGTCTCATTTTGTAGTT
CTGTCTGTCCTGTGACTCACTGTGTACATTAAGCTGGCTACTAACTCCCAGAGATCCTCC
TGCCTCTGTCTTCGGAGTACGGGGATTAAAAGTGAGCACCACCACACCAGGCAATACAAA
AGTTCCGACAGATTTTTCTCCCTTAAGAGTGCAGCTAGTCCTAAGCCCAAGGCTTTACCC
CAACTGAAAAGAACTTGGTTAGCAAGTCTCCAGTTACTGGGAACGAAAAAAAAATACTGC
GGGAGAAGGTCATATCAGTGCCAGAACCATCTGCCCACCTGCGTGACTGCGGTGAAAACC
CTTGGTGCATTTCTACAAGTCTGTCTTGGGTCCCTGGAAGGAGGCGTGGTTGTATCTGAT
TCACCCGTGTATTTCCAGAGAGTAAGGCAGTTAGAAGTCTTTTAGATGATGAACTTTGAA
TTTCTTGGCTTCAGAATGTCACCTCCTGATTACAAGGCTTTGGGATAGGTGGTTTGATGG
GCATTAAAAGAAGCATCAGCATTTCATCTTAAGTTTCAAGGGCTTGCAGATTTTATTGTT
TTTGCATTTTAATTTTATTTTATTATTTTATTATCTGTGCATTATTAAATAATAATATAG
AGTATAGATGCTGCATACTGTGTCGTGTGAGGACTTTTTTCAAAACAAAAATTTGTAGTT
GACAGATGCAACTTTATTCAAGCACCTTTTCACCCTCTGGGGACATGGGATGGTATCACG
CTCTGCCTTTGCAGAGTGCAAAGGGTCCTGGAGAATGGTGGGTATGCATTTAGTTCTTTA
GACTCGAGAAGGGATAATTGATGGCTTTGTGAACAGCTTGCTTCACTTAGCATAGCTTAG
TGCTTTGTCATACAATGGCCTATCAAAATTTCTTCTCTTTAAAAAGATTGGCCGGTGTTC
CGTGGTATACATTTAGAGCCCCTCCCACCCTCGGCTCCCATCCACCTGTCAAAGGACATT
TCAGTTTTCTGTTATGAATCATGCCACTATGAACATAGAGACCCATCTATTCACGCATTT
TTGAGGAAGACCAAGATGTTTGGCGAGCTGCCCGCATCGCCTCTGCTGTTCTCTTTTGAG
GTAACCCTGGCTGGCCTGGAACTTGAGATCTGCCTACCTCTGCCTCCCGGGTGTTGCAAT
CAGGGGTGCACATCAACACATGTGGCAGTATCTATCTTCTTATAAGTGTTTAAAGAATTT
TTTTTCCACCTGCAAAGTCTCTTGCCTGTTTAAAATAAAAGTTATTTAGATAAACAGACC
TTTAAAATCAATTATTTTGATAAAAATCCTTATACAAAGAACCTATATGGTTCACTTATT
GAAACATACTTAGAAATGGTTTGATTTCTTTTCTAAGATTTTGTAGTAATTTACAGAGGC
AAAAGGTAGTTTGTTATAAATAAATAAATCTTTTTTAAAAAGTGGGGGGGGGTGGGGGTG
GGGGTGGGGATGGCGGCTGGAGAGATGGCTCAGTGGTTAAGAGCACTGGCTGCTCTTCCA
GAGGTCCTGAGTTCAAATCTCAACAACCAGGTGGCTCACAACCATCTGTAAGGGGATCCG
ATGCCCTCTTCTGGCGTGTCTGAAGACAGCGACAGTGTACTCATATACATAAAATAAATC
TTTAAAAAATGTTTTTAAAAAAGTAGTTTGTTGGTTGCCAGGGGTTACAGGGAAGAAGTA
GCAGGAAGTCTAAAGAGAATGGATAGGATGTCAGCTGGGGAAGACAGAGAAGCTTTGGGT
AGGCAGTGGAGATGTGGAGTGCTCACACAACTCTGCACTCAAAAATGATGCACGTTCTGC
TGCGTCCATCTTGCCACTAAAGTGTTCAGTGTGCATTTCACCAGTGAGAAGGAGATGGAA
AAGAGTTGCCTAGAATGAGTTCGCCTCCAAGCATTACATACGGAAAGTAGGCATTCAACG
AAGGAGTGAACTGGAGATCTCAGAGTTTGACGTCACTCTCCGTGGACTTTGATGTCGGCT
GGTTTTGAAATATCGAACGACTTCAAACTGAGCTGACTGGTTGTCGCTCCAGTGATGAAA
TGCAACGCCAAGTTGTGGACTTGGCATTTACTCAATTTCTTCTTTTTAATTCTGTAGGTC
AGGTGTTAGACAGCCGGAATCAGTCCCCCTGGAGATTGTCTTTCATAACAGATTTCTTCT
GGGGAATAGCAGAATTTGTGGTTTTTTTGTAAGTATGAAAGTTAATCGCATTTATACTTA
AGCTGGTGGAATTACATGATATTATGTCGGTTGGTTATCTTGGAGAATTTCATATGTGTG
TGCAACGTATCTTGATCATACTCATCCCTCTCTCCCCACTTCCCCCCATGTTGCTCACTA
CCCCTCCTAACTTCATATCCTGGCCTCTCTTTTTTTTATGATCCACTAAGTGTAATTACT
ACTGGCCATTCGGGTGTAGGGCCATCCCCCAGAACATTGTCTCCCTACCACACCCCTAAA
GAAAACTGCCTCTCCCTCCCAGCAGCAATCATCAGCTGTCAGTAGCTCATATTTAGGAGG
AGGGGCTTGTGCGGCCCCTCTAGATCCACACTCTGTGGTTTACTGTGTGGCCCCTCTACA
TCCACACTCTGTGGTTTACTGTGCGGCCCCTCTAGATCCACACTCTGTGGTTTACTGTGC
AGCCCCTCTAGATCCACACTCTGTGGTTTACTGTGCGGCCCCTCTACATCCACACTCTGT
GGTTTACTAGCTAGAGGCACCCAAAGCTTCAAAGAATTGATGAGTGTCGCATGTTTAAGA
GACAGTAAGGTCCCAGTTCTCCCTGACTTCTGGTTCCTACAATCTTTTCTCCCCTTTTCT
ATGCTGTTCCTGAGCTTTTGGGAGGGAGTGTGTGACAGAGATGTGCCCGCTGATGGCATA
GGCCCTGACCCTGCACTCTGACCAGCTCCGAGTCTCTGTGAGCATCGGCAGGGCCCACTG
CACATAGAAGCTGAAGCTCCTTCCAGTTGTGATTGTTTAAATAGCTTAACGAAGGAAAAT
TAAGAGTTTTTATGATTATAAATATGGTATTAAATTAGTAAGCTTGACTGTGCCTGACCT
GTTATGGTAGCCATGTCAACTTCTAGCCAACCTATCCATTCTCGTGTCAAAATACTCTCT
GGGTTTTGGCTTTTGCGACCAAGTGTTGCTGTATAGCCTTACACAGCTGATTTAGTGTCA
CAGAGAGTCTAAGTTGGCCTAGAATTCACTCTAGTCACCCTGCCTTAGCCTCCTACACGT
TGAAAGTATAAGAATGTACCACCACTCCTGGCTCTGAACTCTTAATGAAGGGTTAGAAGT
CAGTAATAGAAAAAAATGTAGACTTTTCCGTCATTTGAGCAGTTCTTTATTAAATGAGTG
GTGATGGTGGTGTCTGACTTTCACACGCTGCGTTACCTAAACTACCAGTCAGTCACTAGC
AGGTCTTATCCCGAGTTGAGTAAATATTTGAATTTCTCGTGTTTAGAAAGTTATGAGTAG
ACGGGGAAGACTCCTCCTTTCATTGAGTGTTGGGCTGGCTAGTTTTATGTCAACTTGACA
CGTGTTAGAGTCATCCGAAATGGGGAACCTCAATTGAGAAAATGCCACCATAAGATCAGG
CTAGAGGCAGACCTGTAGGGCATTTTCTTAATTACTGGTTAACGTGGGAGGTCCTAGTCC
ATTGTGGGTGGGGACACCTCTGGGTTCTACAAGAAAACAAGCTGAGCAAGCTATGGGGAG
AAAGCCAGTAAGCAGCACCCTCCATTGGCCTCGGCATCGGCCCCTGCCTCCAGGTTCTAT
TTGAGTTCTTGTCCTGACATCCATCAGTGATGGGCCATGATTGTGGAACTGTAAGCCAAT
AAACCCTTTCCTCGACAGCTTGCTTTTTGGTCATGGTGTTCATCACAGCAGTAGTAACCC
GAAACCAAGGCAGGCATGATGTTAGTAATACCAGTTTTCATAGTCCGTATAATTTAGTAT
ATTCAGTACATTAGATTCAGTATATCAGTCTTCATATTGCAAGGGAGGGTAAAATGAGTG
TCATTGTGGAAAGTGGACATTAGAGGAAGTTACCTGAGGAGGGCACAAGCCCCTAACTTA
AAAGTTACCAGTGCGAAGTTTAACTACTTTTACGAATTTTACCTAATCTCTCTTGTTTGC
TGTTTTGCCTTAGTTAAGACCTCCATCTAAGAAGTTAGAGAACTTGGCTAAGAATAGCGG
CATACACTGTTAATCCCAGCATTCAGAGTTCACAGTCAGGTGGGGGTCAAGGCCAGCGGG
GCGTCACACATAGTAAGACCTAGTCTTAGGGGAAAAAAAGAAAAAGAAAGAAAATTGCAT
TTTCTGACATTGAGAAGCTCCGTACCTCTGACTATAATACCCTCCTCTATTCCCTCTGAA
AGGATGTCAGGTAGGCTGTAGGCAAAGGAATTGCAGGTCTGGTGAATGTAAGATACGTTA
AAACCAGAATAAGTTAGTGTGTGGGGGGTGATGGCTGTATGATACTGTAAAAATAGATTT
TGTTGAAACCTAACAGGAAGAATGAAACCAAGGAGGACTCTGGTTTCATGCTGTCTACAG
GAGTCACTATCAGAGGAGAAATATGGGGACAGGTGGCTTTGGTATAGAATGTGGCACACC
CTGTTTTGGACACATGCTTATGCTAAATTTGTCCAGCTGGCATCAGGAAGTGTAGACTTA
AGCTAATAAGTTGGGTTAGTCACCCTCTTGCAGACATAGCGAGAACCATAGTGAGAAATA
TGCTTAATAATGGCGTCAGAAGTGAGACCTCTTGTTTTCCGCCCCTTGTTTCAGTTTCAA
AACTCTGCTTCAGCAAGATGTGAAGAAAAGAAGAGGCTACGGGGGCTCCTCTGATTCCAG
ATATGATGACGGAAGAGGGTAAGGAGAGAGAGCCTTTCCTACTGACGTGTCTCCTTTGTG
TCTTCATTGTGCTGTTTTAGATAGAGTTAGACTTGTAGAAATTCAAAGAAAATCTCATTT
CACAAAATTCACAAGTTGCTATAAAGTAAAAGCCTAATTGCTTCTCCCAATAAACAGTCA
AACTAGAACTTTAACATTTTTAAATTTAAAATTTTAATTTTAAAATATACCGTGGGAAAG
CTAAATTAGAGGCTGAACACTAATGGGCAGCATTCAAATCCAGAGACTTCAGTGTAGTCT
GGGCTTCCAGCAGCCATGGCCGGTTCCGGTGAGAAGAGGCACCTGGCTGAGCTTAGGTTT
GAAGGAGGAGCTGCAGGTCTCACAGCGTGTGTTTGAATGTGTGGTCCCACTTAGAGTTTG
AGCCCTCTGCTGCTGTGACGCAGCTGACCACGAGCTACTTGGGCAGGGAAAGTTTTGTTA
CAGTCCATACCTAGAGCAGTTGAAGCACGCACTGAAGCAGAGACCCTGGAGAATGGCTGC
TTCCGTCTTGCTTCGCCTGGCTTGCTCAGCCACCGTTTTAATACAGCCTGAGGAGTGGCA
CCACCTACAGTGGGCTATAGCAGTCAGCTATCAAAGTCCACCATAAGCGTGCCCTGTGGG
CCGCTCTGACGATGGAGGTCTCAGTTGATATCCCACCTCACCAACTGCTAGGTCTCAAAC
CTGAAACAATGGCTAACTGAGGTACTCATTAACAATCAAAGCAGACACTGGCACGGTTCT
CCCTGCAGCCTTCAGTCCCATACTTGTTACAGGGCCTGGCTAGCATACCTCCCACCCCCT
GAGTGTCATGTGCTCCAGCCATTCTGGTTACTTAGCCTTCTGCTCTACCCTTTACCTTCT
TGGTCCAGGCTGCCCCTCTTGGTCAGTGGCTTCTCACTCCACTCCCCTGTCCTCACACGA
CCCAGCTCGGTCTGGACACTCCCAGATGCCTCTGCTTCTAACTATGGTCTCCCTTTCGTC
TGCAATAAACCGGCTCCACCTGCTTCCTTCCTTTTCACTTGCTAACCTGCATGGTAGTTG
CCGGCTTAAGACAACTTAGGGTTGTGTGCGTTGTTTTGTTTTTTTGAGATAGGGTTTGCT
TTGCCGTACTGTTGGCTTGGTCCTGGTTACATATCCTAGGCTGACCTTAAACCTCTGATA
ATCTTTCTTCCTTGGTCTCCCAAGTGCTGAGATAACCGTTGTAGGCTACCATGCTCATTT
TCCTGTGTTTATTGAACAAGCTGTAGTTGAAGGCTTAATAAAGGAACCAATTGGCCAGAC
ATGTAGTGCACACCTTCAAAACCAGCTCTGAGGATGTCTGAGAAGCAGACAGAATCTCAG
TTCAAGGCCTGGATTGTATAAAAATTCAGGCTAGGCAAGGCTACATAGCAAGACACTCTC
AAAAAAGAGAGGAGCAGTTGAAGCTGGTGATAACTTCTCCTTTGATTAGGCCACCAGGAA
ACCCTCCACGAAGAATGGGTCGGATCAGTCACCTTCGTGGCCCCAGCCCTCCTCCAATGG
CCGGTGGATGAGGAAGGTAAGTTAAAATCTGAAATTATTTTGCCTCCTTAGGAATATTTT
GTTTAGAAAAGCATTTTTTGGTGAGGGGCTTTTCAAGACTGAATTTTTCTGTTCATCCCT
AAATCAGATTGGCCTCTAAGAGCTTTGCCTGCCTGTGCCTCCCGAGTACCGGGATAAAAG
TGTCTTCTGCTTCCACTGACTGTTTGGTTTTTTGTTTGTTTGTGTTTATATGTATATGAG
TGTTTTGTTTACATATACATAATTGTACTGTGTATGTTGGGGCTAGAGGGGCGCAGGGAG
GAGACCAGTACAGGACACTGACTCTCCTGCAAGTGGCATTTTTTTACGATTTTTTTTTTA
CTTATGTATATGTGTGTGTGTATGTATCTGCTTGTAAGTATGGGTGCCCACGGAGGTCAG
AGAAAGTCAAATCCTCCTGGAACTGTATTGCCAGCAGTTGTGAGCCACCCAAGATGGATG
CTTAGAATCTAACTCCTGTCCTCCGTAAGAGTAGGAAATGTTCTTAGCCATCTCTTTAGA
AGTTGCATATTTTACTATTTAGAAAGATATGTCTTAATTCTTGGAGGTTTATTGACTTTA
TTATTAAAATATCAGTTGAAAAAAGATTTGTTTTCTGTTTATCTGCCGTCCTTTCCTCCA
GACCTCCGTGGCTTCATGGCCAGCTCTCTTCACTGTCTCTACCCCTCAGGAAGTTTATGC
TGATATATGTACACATGCCAGAGAAGGGGGGAGGGGCAGGGGGAAGTGAGGGAGGAGGAG
GGGTAGGGAAGGGAGAGGGAGAAATTCAATTTAACTAGAAGGAGCTAATTAATTGTTTTA
ACCTCTTTTAGGTAAACGTCTGCTCTGAGAAGCAGACAACTAGACATACACGCCTAGAAG
GGAACCATCAAGAGGTGAGGAGCGGCTCATGAGGAGAAGATGGTGTATGTCCAAACAAGG
ACTGCTCTGTGTCCTCACAGAAGAATGAGGTCATGCTGGGAACTCCCTCTGCAGGATCTG
GCCTGACTGATGTGCAGTTCTATAAATGT
Chart Advanced