SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002454_2.0
Identity
TranscriptEukaryotic elongation factor (eEFsec)
SpeciesSorex araneus (Shrew)
Transcript IDSPT00002454
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002361_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00002454_2.0 # Transcript # Eukaryotic elongation factor (eEFsec) # Shrew (Sorex araneus) # Full length # Forward
CACTGCTTCTCCATCCGCGGCCAGGGCACCGTGATGACGGGCACCATCCTCTCGGGCGCC
ATCAGCGTCGGCGACAGCGTGGAGATTCCTGCCCTCAAGGTCAGTCTCCCCCCGGCCCCC
CGGGCCTGCGGCCGGCCCCTGCGGCCTGTCTTCGCTCCTGGCCCCAGAGTCCCCTTGGAC
ACACGCCCCCTCCCCTTCTCGGGGCCTCGGCCCTCCCTTGGCGGCACACGGGTGGCCTTC
GGGGACAGGGCCGTAAGGCTCGGACACACCCTGTTCCCGCCAGCCTCCCGGCCCACCTGG
TGGCCGCTGCCTCCCCGACCCGGGCCTCGCTGGTGTGTCCGGTCAGAGACAGACTCCTGC
GTCCCCAGTCACGTGGGCTTACGGTCTTCCGGAGGGGTCTCGGGCCCCTGGTGACCGTGG
CACACGCCAGGGTAACCCTGGGAAGGGGCACCCGGGCACCCCACCTAGTCACCCCCCCCC
AAGACCCGCTGGTCACTCTGCTCTGGCCCTAGCTGAACTGTGTCCACCCAGGCCTTGGCA
CTTCCTGCCCGGCGGGCCTTTCTTGTGCGGAGGAGACAGTACAGGAGCACGCGGCCCGAC
CTTGGGTTGGGTCCCCGGGCACCCCGTATAGTCCCCTGGGCCCCCGGGGAGTGACCGCTG
AGTCCAGAGCAGGAGTAAGCCTCGAGCACCGCCAGGTGTGGCCTTCTAAATCAACGCATG
AGATGAAACTCTCAAAGCTCATCTCAGCCTCCTGAGCACTGTGGGGGGTGGCCCCCCATA
ATCACAGTCGACTGATTTACTGAGGGCGTCGTCGTAGGATCAGTTTAGAGGGTCGTTCAG
ACACACACAAAGGAATCCGGGGCGCGGGGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNTGGTCCCTTAAGCATAACCGGGGAGTGACCCCGAGCCCAACCAGGCGGTGGTCCCT
AAGCATCACCGGGAGTGACCCCGAGCCCCACCGGGAGTGACCCCGAGCCCAGCCAAGAGG
TGGTCCCTAAGCATCACTGGGAGTGACCCCCGAGCCCACTGTGAATGACCCTGAGCCCAC
CAGGAAGTGACCCCTGAGCCCACCGGGAGTGACCCTGAGCCCAGCCAGGCGGTGGTCCCT
AAGCATCACCGGGAGTGACCCCTGGGTGCAGAGTCGGGAGTGAGCCCTGAGCACCACAGG
GTATGCCCAGTGCCCCTCTGCGCCTGCCCCTGCCCACCCCCGCCAGCTCCCCTGGTGTTC
TTGGCCTGGAAGTCTGCGTCCCCAACCCCATGGGCGCCGCCACTCCGGGGCCACCTGCTG
CTCCTGCTGAGGCCCGAGCCCAGGGCCGTGCCGACACCTGGTTGCCTGGTTTGCCAAGAG
AAAAGCCGGGGTCCCACTCGCCCGCTGCCCCCGACTCGTCTGCACCAAGAGCCGTGTCGG
GGCGACGCCAGCGTCCCTCTCCCCGTCGTCTCTGCCCCCAGCTGGGACGGGCTGTGGCGA
GGGACTCCGTTCTCTCAGCCCACGGCCACGCCGCCCCCCTTCCCGGACCCTCGCCGCCCC
ACCCCTGCAGGACTGTTCTGGGAATCATCAAGGCTCCGCAGCACCGACCCCGGGGTCTAC
CCAGCCCTGCCCGCCGCCCACTGCTCCCGCCTCCCCGGGTGCAGAGCTGGGCCCCCCAAA
GCTGCCCCCGGAGCCGACGAGCGATCGGAGGAAACAGCAGTGGAGAAGCCGGCCCGGAGG
ACCCCGTCTGCAGAGGCTGCTGGGGCCCAGAGGCGGAGCAGTGCNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGATTAACCCGCACGAGACTGTGTAGACGGCCAGC
GCCCTCCCTGCTGTGCTGTGGCTCCTGCTCACGTCTGGTGGTTTCTGGCCGTCCGTGCTC
TGAGAACAGCCCGCACCCCCTCCCCCCGGAACCAGCAGCCCCTCACATGCAGCTCCGGCC
CTGGATGTGTCCGGGATGGCAGGAGGCCCACCTGGAGGAGGAGCGGTGACCTGGAGGACG
CCAGTCTCCCCGAGGCTCCAAGGCGGGGGCCCAGGAATGGGGGTGTTGAGGTCTGCAGGC
CCTGTTACCAAGCCCCGGGTGGGCAGGGCTCAGCCTTCTCCGCTCATGGGCAGTCGCCGC
CCCGCCCCTCCGTCCCCCCTGCACTGTGGCCAGTAGCCAAGCCAGGGCCCTGGGGAAGCC
CCAGTGACCGCCCCCTGCCCCTCTCTCCCGGATTCAGGCCTCTCTGTCTCACCAGGGTTC
CGTCTCCCCCCGCGCAGGTGGTGAAGAAGGTGAAGTCCATGCAGATGTTTCACACGCCGG
TGACCTCGGCCATGCAGGGGGACCGGCTGGGCATCTGCGTCACCCAGTTCGACCCCAAGC
TGCTGGAGCGCGGGCTGGTGTGCGCCCCCGAGACCCTGCACACCATCCACGCGGCCCTCG
TGTCCGTGGAGAAGATCCCCTACTTCCGGGGCCCCCTGCAGACCAAGGCCAAGTTCCACA
TCACGGTGGGCCACGAGACCGTCATGGGCCGGCTGACGTTCTTCGGCCCCGAGCCCGAGC
ACTTTTGACCGGGAGCCACTGCTGGACGCTTCTACTTCTCGCGAGAGTATGTCCTCCAGG
AGCAGACCTGAGCCGGGAGCCGGCCCGAACGAAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGCCACGGGAGCTCCAGTCGCT
GCCGAGGGCAGAGGCCCCGCGTGGGCAGGGACCCCGCCTCCCACTGCTGTCACCCGGGCC
CCGGGCGTGTGGATCCGTGTGTCGGGCACGCGGTTCCCGGTGTGTGCCTGGCAGCCCGGT
GGGGGGTGCTGGGGGTGGGGAGGCCACCCGGGGCTCTGCGCTGACCCTTCTCTCTCCGGC
GGCCGCCGTGCCAGGCGATGGACGACCACAGCGTCATCGGCCGCTCGCTGTTCAAGAAGG
AGACCAACATCCAGCTCTTCGCGGGGCTCCGGGTGCAGCTGTCCTCGGGGGAGCAGGGCG
TCATCGACAGCGCCTTCGGCCAGAGCGGCAAGTTCAAGGTCCACATCCCCGGT
Chart Advanced