SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002494_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein T (SelT)
SpeciesSus scrofa (Pig)
Transcript IDSPT00002494
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002401_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00002494_2.0 # Transcript # Selenoprotein T (SelT) # Pig (Sus scrofa) # Full length # Forward
CTGGTGGCGGCGTCGGCGGTGGTCCGGAGCGATGCCTCGGCCAACATGGGAGGCGTGCCT
GGCAAGAGATTAAAGATGCAGTACGCCACGGGGCCGCTGCTCAAATTCCAGATATGGTGA
GTATATGTGCCGGGCCCCAGCCGCGCCGGTGTTCCTCTGCCCGGCGCCTTTCACTACTCG
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TTCACTTTACTATAACTTAATTACTGATCCTGCTCCCTCCTGCCAAGTGGTACCTTCATT
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TTCAGGTCTTCTGTTCGACTCTTTAAAAGTTTTTTTTTTTTGTCTTTTTGTCCTTTTTAG
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GTTAATGATTTTTAGGCCTTGTATAACTAAAAAATCTAGGCATAATTCTAAGCCACCTAA
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TATTTTTTTACTTTTGTGAATTGGTTCAATTAACTTTCCTTAGTTATTATAATTTCTTAA
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TGGCATATGGAAGTTTCCAGGCTAGGGGTTGAATTAGAACTATAGCTGCTGGCCTACACC
ACAGCCACAACCACAGCAACTCGGAATCTGAGCCATGTCTGCGACCTACACCACAGCTCA
CAGCAAAGCTGGATCCCCAACCCACTGAGCGAGGCCGGAGATCAAACCCACATCCTCATG
GATACTAGTTGGATGTGTTTTTGCTGCACCACAACGGGAGTTCCAAGAACTCTTACATTT
TTATAGAAGGTCAATGTTATAAAATTCTGTACTGTTAAAATAACGGTATTTTTAAAGGCC
AAGGCTATATAATTTTATAAACTTTTGATTGCTTTAAAAGATCTTGAACATTTTTGTTTT
AAAGCTACATGGTAAACTTTACTATCTCTTTCACAGTATAATTAGCAACTTTTAGATTTG
GTGTTTAGAAAACATTCGTACACATAAACTTGAGAAATTGAAGCTTCTGATGAAATTCTG
TCTTTTTTACTTGAATTTTTATTTTTTTATTATAGTTGATTTACAATGTTGTGTCTTTCT
TTTCTTTTGATAGACATATAGCATCTTTCCTGTCAGTCTTCAAGCTAGTATTAATAGGCT
TAATAATCGTTGGCAAAGATCCTTTTGCTTTTTTCGGCATGCAAGCTCCTAGTATCTGGC
AATGGGGCCAAGAAAATAAGGTATGTAACTTAATAGCTTTGATAGCTCTAGGTTTTTAGG
CTGTCAATGAAGTATTTTAATGGATTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTAGATGCTTTTAGCTC
TATTATTTCAATTTAAACCACTATTTTTGTTTTGTTTTTTAGAGCCATACCCATGGCATA
TGGGAGTTCCCAGGCTAGGAGTTGAATTGGAACTATAGCTGCTGGCCTGTGCCACAGCCG
CAGTAGTGCCAGATCTGAGCCAGATCTGCGACCTATACCACAACTCATGGCAATGCCAGA
TCCCTGACCCACCGCGTGAGGCCAGGGATCCAACCCGCATCCTCATGGATCCTCATGGAT
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TTTTTTTAATCTCTGGGCAAAGTGTTTAACCTCCTTTGGCCTTAGTCTTTATATCTATAT
ATTAAAAATGATTGGGTCTTGCCTTTTTATTGTTTGAAGAATAGGGAGGTGTTACTTTAG
TAGAACCTAGGCACAATAGAATTTCATACCTGATTTTGATTATATAACTTGGGCCAAATC
ATCCAGCAAAACATAATATGTACGTAATGTAGGCCCTTTGTAACAACTAATGTAGGTATT
AATGGGTTTATTCATATTAAAAATAGGATTTTCACCTATTTATTCTTGTCAAAACTCTGT
TTTTCTTGGAGTTCCCTTAAAAAAAAGTGGATTAGCATCTGGCTTTGTCACTGCAGCAGC
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GTTCATGAGGAATCTGAAGCATATTGCCTGAAACAGTCATAAATATACATAAGAATCTGG
TGCTATTTCTTTTTTTTTCTTTTTAGGGTCTTGCTGCAGCATACATTCTTTTTAGATCAT
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GGAACTAATTTTTATTTCTCTTTTGAGTGAGCTTGCTTAGGTTTCCTTCTAAGAAGTATT
CTTTTTTGGAATCCTCTATCTGATCTTGCCCTTTAGCTCTAGGCTGAGACTACTTTTAGC
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GTTATTAATGAAACATTGATTTGGATAGGAATAAGAATTGGGAATTAACTACTTATTGAT
AATATTTTGTGCCATGTTTGTTAATTCTGTTGATTCTAAATTATCTATGGCACATTTTAC
TTCAGTAGACATGTAACATTGTTGATCTACTGTCAACAATGGAAGAAGTTACTTGAAAAT
TGTAGCTTTCATGATACTTCCTTGTGTATTGTTCTCATGAAATTAGACTTTGTACGTAAA
TGCTAGGAAAACTATGAAGTCAAAGCCCACCTAGCTCGAGTGGAGCTGGTGGCAAGCTCC
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