SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002496_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein U2 (SelU2)
SpeciesSus scrofa (Pig)
Transcript IDSPT00002496
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002403_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00002496_2.0 # Transcript # Selenoprotein U2 (SelU2) # Pig (Sus scrofa) # Full length # Forward
TCGCCATTCGTGGCTCCGGTCACGCGGCAAGTCAGCGGTCGCGCCGCTCCAGCCTCAATT
CCAAGCGGCCCCGAGAGTGGGCAGCCCCTGGCCGCCACCGTGGCCGAGATGCCCGTGCTG
GACGCCTCCGGGAGGCGGGTGCTGTTCGGCTCGCTGTTCCGAGAGCGACGGGCTGTCGTG
GTCTTTGTGCGGGTGAGCGCGGGCGGCGAGACAACCCGGAGCTGGGACCTCGCCCGCAGG
CTGGGACGGAGGTTGCTTCCACGGCCCCAGCTAGGGGAAGTCCATCGGGTCCCTCAAAGG
GTCCGGGGCCCGAGAGGGGAGACTGCTGGGCCTGGCCCTTCCCGTGATCATCCACTAGAG
GCTTCTGGAATGCGAACTGCTCCTCTTGCTTCCTTGAACGGGAATAGAAAAGCAGCCCGC
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ACCTGCATGGGTGTTGCGTGAAGTAGTGTCACGCACAATAAAGTACTTGGTCCTTTGTGG
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TTCTCACGAAATCTATGTTGATCCTGAGAGAGAAATTTATAAAAGATTGGGAATGAAAAG
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AAGGCTGTTGGTGAAATACTAAGTAAACGAAAAACACAAATTGCAGAAGTGTTTTTAGTA
TGATTTCATTTTTGTGAAAATAAAAACCATTTTCATAAAGATCCATAGCATATAAGTGTG
TGTATGATGAAAAATGTTTTAAAAGATATTGCAGCGGGAGTTCCCACTGTGGCTAAGTGG
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TTAAGGATCTAGCATTACCATGGGCTGTGGTACAGGTCGGCTCAGATCCCACATTGCCCA
GGCTGTGGCATAGCTGCAGCTCTCGTTCAACCCCTAGCCTGGGAACTTCCATATGCCAGT
GGTACAGCCCTAAAAACAGCAAAATAAAAGTAAAATAAAAATAAAAGATATTGCAGTGTT
TACCCCAAGGTGTGGGAATGAGAGAGTGGCTTTTGTATTTTTTGCAATGAAATTACTTTT
TTAATTAAAAGTAAAATAATATTGCTTAAGTTGATATATCTTCATACCTTAACACCATGG
CTTTGAATATTGTACTTTTTTTTTTTTTCTTTTTAGGGCCACACTCAAGGCATATGGAAG
TTCCCAGGCTAGGGGTATAATCAGAGCAACAGCTGCCGGCCTACACCACAGCCACAGCAA
CGCCACATCCGAGGCACGTCTGCAACCTACACCACAGCTCACGCCAACGCCCGATCCTTA
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TCCACTGCACCATGGTGGGAACTCCAATACTCTTTTTTAATTGATGAAATCTTACTTTTC
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CATTGTATTTAAGAATAGCTTGTACATTATTATATATGTATACTCCATTATTGCACTTAA
GGTGGTCAGTAGTGTACTTAGTTGAAAAGTTTGTGTTTTATTCATCTATATATGGTCCAC
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TTTATATGTATTTTAGGTAGAAGGAACTTGGCTTCTGAAATATCAAATAAGAGAACTCAC
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ATCCATGAGGATGTGGGTTTGATCCCTGGCCTTGCTCAGTGGGTCGAGGATGTAGCGTTG
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GCATGGGCCAGCAGCTGTAGCTCCAGCTTGACCCCTAGGCTGGGAACCTCTGTATGCCGC
AGGTGCAACCCTAAAAAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAGAAAAGAAAAAGAAATCA
AATAATTTAGTCTCAATAAATGTTGAGAGTGACACCCATGGCACCCATGGTGTCAGATAG
TCCTAGAAGGACTGTTAAAAGACACAGCCCAGGAGTTCCCTGGTGGCTCAGCGGGTTAAG
GACCTGATGTTGTCCCTGCTGCAGTTCAGGTCACTGCCGTGGCATGGGTTCCATCCCTGG
CCTAGGAACTTCCACATGCCACAGGCATGAGCTGCCCTCCTACCCTCCTACCCCAGTCTG
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TTGGAGAAGTACAGATTGCTATGTCTGGCTGGAGTCCAGGAGCCAGTTGGGGGATTGGTG
TGAGCCAAGAGGCAGGTTGTGGCCAATTCATGCCGAGTCTGGGAACATGCCAGGGAGTTT
GGATTTGTTTTGAAGGTAATTGGGAAGTCATACAGGTAGTGGAGTGGAGAAGCGATACAG
TCATGTGGCCAGCGTGGAGCAGTCATTGGAACCTGCCAAACCAGAGCCACCGATATTCTT
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TTTCAGGTGGTTTTGTTTGTTTGTTTTTGCTTTTTAGGGCTGCACCCGTGGCATAGGGGA
GTTCCCAGACTAGGGGTCAAATCGGAGTTAGAGCTGCCGGCCTTCACCGCAGCCACAGCA
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AACCCCCTGAGCAAGGCCAGGGATTGAATCCGCATCCTCACGGATACTAGTTGGGTTCAC
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TTTATTTATTTATTTATTTTGTCTTTTTAGAGCTGCACCCTCAGCATATGGAGGTTCTCA
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TCCAAGCCTCATCTGCAACCTACACTACAGCTCATGGCAACACCGGATCCTTAACCCAGA
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CTACGACAGGAACTCCAACTTTATTAAACCTAATGATGAGCTAGCATAAATACAGAGTTT
TCTCTTTTTCCCCCTTTCTTTATTCTTTTATTTTATTTATTTTTTTATTTTTTGGTCTTT
TGTCTTTTTAGGGCCGCACCAGTGGCATATGGAGGTTCTCAGGCTAGGGGTCAAATCGGA
GATACAGCTGCTGGCCTACACCAGAGCCACAGCAATGCCAGATCCGAGCTGCGTCTGCAA
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GAACCCACAACCTCAAGGTTCCTGGTCGGATTTGTTTCCACTGCGCCATGACGGGAACTC
CTCCCCTTTCTTTTTGGTATAGGAAATTGCAACAGTATAGATTGTGAACCTCTGTCTTTG
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CAAACAGAAAATATTAGGTTCTTACAAAATAATTTTTGAAAATTCCTACCTGAAAAAGTG
TGAATCTCAGAATCAGTCCTAGAATAATTCTACTTTAAAATTAGGACACTAGGAGTTCCC
GTCGTGGCGCAGTGGTTAACGAATCCGACTAGGAACCATGAGGTTGCGGGTTCGATCCCT
GCCCTTGCTCAGTGGGTTAAGGATCCGGCGTTGCCGTGAGCTGTGGTGTAGGTTGCAGAC
GTGGCTCAGATCCCAAGTTGCTGTGGCTCTGGCGTAGGCTGGTGGCTACAGCTCCGATTC
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ATAATTTAAAATTAAAGGATCAGTTTATGAGGACAAAAAATAAGAAAAAAAGCTACTAGG
AATTCCCTGGTGGCCTAGCTGGTTAAGGATCTGGTGTTGTCACTGCTTTGGCTTGAGCTG
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TTTTGTCTTTTAGGCCCACACCCATGGCATATGGAAGTTCCCAGGCTAAGGGTGGAGTTG
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GACCTATACCACATCTCATTGCAATGCCGGCTCGTTAACCCACTAAGCGAGGCCAGGGAT
CAAGCCCAAGTCCTTATGGATACTAGCTGAGTTAGCTACCACTGAGCCACGACAGAAGCT
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ATTTCAGGTTGTGGATCTTCTTCAATTGACTTTCTAAAATTTCAGAAATATTATTATAAT
TATTATTATTTGCTTTTTAGGTCCGCGCCCGTGACATGGAAATTCCCAGGCTAGGGGTCA
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CATGTCTCTAATGAACCTGGTATTTGTTTCTTGGTAAGATAAATGTTTATCTTAATATAA
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CTCTGGCATAGGCCGGTGGCTACAGCTCCGATTCGACCCCCAGCCTGGGAACCTCCATAT
GCTGCAGGAGCAGCCCAAGAAATGGCAAAAAGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACAG
TGGAGTCCAAAATTAAAGGAAAAAAAAAAAATGAAAGACATAAAAGAAGTTCCTGTTGTG
GCTCAGAGGGTTAAGAACCTGACATAGTGTCCATGATGATGTGGGTTCCAACCCTGGCCT
TGCTCAGTGGGTTAAAGGCATAGGTTGCAGCTGCATCTTGGATCCAGCATCGCTGTAGCT
GTGGCATAGGCTGGCAGCTGCAGCTCCAATTCAACCCCTAGCCCTAGCCCTGGCCCAGGA
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GGAAACTGGTATTTGACCAGCACATAACAGCCTGTGCCACAGTGTCTCTTGAAAAGAAAT
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GGGTCTGTTATCACTTCTTCCTTTAAAGCAGTAGTTCTCAACCAGGGACAGTTTTTGCCC
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GAAGGAAGAAGAAAAGTCAAAAGTAAGGAGTTCCCGTCGTGGTGCAGCAGAAATGAGTCT
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GTGAGCTGTGGTGTAGGTCGCAGATGCAGCTCGGATCTGGTGTTGCTGTGACTGTGGTGT
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GCGTCCCTAAAAAGACAAAAGACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAAGATGACCCATAAGA
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CTGTGCTGTCATAGGGGACATCATTTGTTTTCAAATGCTTCTGTGTATCTTTGATGTCTG
TTTACTGGATGTCATGTGGCCATCATTCCATGCCTGAGTGATTCCATGTATTTGGGATAA
GGAAAGTCAGCAGGGGTTTGGTGACTTGTATATGGCTATAACACTCTAAAAATTTTAGTG
GAGGTAAACATTAAAAAAAGAGAGAAAGGGAGTTCCAGTTGTGGCGCAGTGGTTAACGAA
TCCGACTAGGAACCATGAGGTTGCGGGTTCGGTCCCTGGCCTCTCTCAGTGGGTTAAGGA
TCCGGCGCTGCCACGATCTGTGGTGTAGTTTGCAAACTTGGCTTGGATCCTGCTTTGCTG
TAGCTCTAGTGTAGGCCAGCGGCTACAGCTCTGATTAGACCCCTAGCCTGGGAACGTCCA
TATGCCAAGGAAGCGGCCCTAGAAAAATGGCCAAAATACCAAAAAAAAAATAAATAAATA
AAAAATTAAGAATAAATAAATAAAATAAGAGAGAAAGCCATCAAGCATTCTTTTTTTTTT
TTTTTGTCTTTTTTTTTTTTTTGTCATTAGAAGGATCAACCTAGTTATTTATAGCTAACA
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TGGTACTTCATCTTTAAAACTGTCCACATGAGTAAGCATAGCTTCTATGAGATGTAAATT
TAACATTTACTTTAATAAATTCCAAATGTCTTAAAAGAAGTCTTTATAAGGAGGATTTTT
TTTTTTTCTGTCTTTTTGCCTTTTCTAGGGCTGCACCTGTGGCACATGGAGGTTCCCAGG
CTAGGGGTCTAATCTGAGCCGTAGATGCCGGCCTACACCACAACCACAGCAAAGCGGGAT
CCGAGCCTCGTCTGCAACCTACACCACAGCTCATGGCAATGCTGGATCTTTAATCCACTG
AGTGAGGCCAGGGATCAAACCTGCAACCTCATTGTTCCTAGTCGGATTCGTTAACCACTG
TGCCACAACGGGAACTCCTATAAGGAGGATTTTGATCAAGCATTATGACTTTTTGGCTTT
TTGCAGCTGGAACACTATGGCTAGCTAAAATCTAAAATCTGTCATTTTATGTAATCTCCC
TTTCCCTCCCTCTCACAAATTTACACGAGTTAGACTGGCCAAAAAAGAAGCCTTGCTTTA
TGAGAATGAGTCCTATAAATTAGCCCAGAATGACATTAAGCCATGTTTCTGAATGAATTT
CCATTCTCAGACTTGTAAGGTATTATTTTTTGAGTCTCTCATCTCCAAATTTTGGCATCA
TTTGAGCACACATTCAGTTGTATAAGAATGCAAAGCACACAGCATCATTTAGGTGCCAAG
TTGGGAACAGACTTAATAAGGAGAATATTTTGATACTACCTATTGGAGAAATTGTAGCTC
CTGTAAGGAGAGAGCTGGGTTTACATATTTATACAAATCTATTATCACAGTTAAACAAGT
ATTTCATTTTGCCTTATTTGCTAATAAGCCAGTTTATGATATTCAATCTAAAGCGATTAC
TGTAGACAGCAGATAAATACAATGCAGAAAACATGCTTCTTACAATGTTTACTTAATGTA
ATGTTTGAAGTTAAAATTCTGGCCTTGGAGTTCCCGTCATGGCTCAGTGGTTAACGAATC
CGACTGGGAACCATGAGGTTGCAGGTTCGATCCCTGGCCTTGCTCAGTGAGTTGAGGATC
TGGCGTTGCCGTGAGCTATGGTGTAGGTTGCAGACGCGGCTCGGATCCCGAGTTGCTGTG
GCCCTGGCGTAGGCCGACAGCTGCAACTCCAACTGGACCCCTGGCCTGGGAACCTCCGTG
TGCTGCGGGAGCGGCCCTAGAAAAGGTAAAAAACAAGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAATT
CTGGCCTTGAGTCCAAGAATCAAAGTAAACAGAACGTAAGACCATAAATGACGACTGTTT
TATTTGAGCACATAAAAGGATTGTGAACATCTAAACGTATGTAACTTAATGCTATTATTT
TTCAGCTTCTTTTGGTCTATGGTTCTAATGCAGTCAGCCTATTAAATCAGTGTTTGGGAG
TGAATTTTTTTAAGGTAGTGATTTATTCCATTATCGCACTTAAGATCCAGATGGTGATTT
TCCAGCTCGATATCTACATTAGTTCCATATTCTGCCTGTCTGTTTGACAACATATTTTAT
TGAATTACATTTAATAAAACCTAATAGAAGCTTATAATTTAAGGATCTTTCCCCTTGGAT
CTCATAAAACATTAAGTAGCACTCTGATTTAATGATAATTTTTGTCATGCTTTATTACCT
TAATTAAAAATTATTATATCATTATATAGAGGATATTATGTACTCCAGGTAATTGGTTTT
CCCCTTTGGACTAATTAAAAGTTGAAATGCTTCCTTGATTCTAGCAAGCACTAAATCTAA
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CCATTTTATACATCGTGATAGGAATAGGTTGGATCACAAACCCATCAACTCTGTTTTACA
GCTCGTAGGCGTTCAGCATGTGGACTTTTCAAGCCGACCTTCAGTTATCCACGTGTGA
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