SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002507_2.0
Identity
TranscripttRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43)
SpeciesSus scrofa (Pig)
Transcript IDSPT00002507
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002414_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00002507_2.0 # Transcript # tRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43) # Pig (Sus scrofa) # Full length # Forward
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TTTGCCACCATGGGAGAGACTGTGATGAGCGTCAAAATTATCCGAAATCGCCTCACTGGG
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TGGGGGTTGGATCCCTCCCCTTGCTCAGTGGGTTAATGATCCCGTGTTGCTGTGCTGTGG
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GGGAAAAAACAAAACAGTGATTTCCTAATACCACACAATAGTGTACATTTAAATTTTTAT
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TGAGCTGTGGTGTAGGTTGCAGACTCAGCTTGGATCCCCAGTTGCTGTGGCTCTGGCGTA
GGCCAGTGGCTACAGCTCCGATTAGACCCCTAGCCTGGGAACTTCCATATATATCGTGGG
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GAGCCAGGATGCAAATTGAAGATTGGTTGCCTTTAAAATCCATGCCCTTGCACTCTGCAC
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TTAGCTTTCAGCCGCACCAAGCTGGCACACCTGGGCTCATAGAACCATGGAGCTGGCAGT
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GTGTATTCTGATTTTATAGAAGGAATATATGTCATACATGAAATAAAGTAATAATGGGTG
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GTATCCACAAGGATGCGGGTTCAATCCCTGGCCTCGCTTAGTGGGTAAAGGATCCAGCGT
TGCCATGGGCTGTGGTGTAGGTCTTCAGCTCCAATTAGACCCTTAGCCTAGGAACTTCAT
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AAAAGCTTCATTTTTGATCTGAGTAGTAGTTAGGAGCTTGAGCTTTAAATTTGAAAATTT
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GAATTTCCATATGCCATGGGCACAGCCAAAAAACAAAAACAAAAACAAAAAAACCAACTC
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GGTGGGGTGGGGTGGGGGTGGGTGGAGGGCCTCTGGAGAGACCCCTCCCCTGACATGCCT
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GGAATAGAAGGGAAAAATTACACCCTATTTTAGCCTTATTTATAGCAGTGAAACCTATGA
ATGTCCCTTGCTTTGGGAATGGCTAAGAATTAATGATACAAACACATTAGAATATTATGT
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ACTGTCATACCTGTCATGTTGGGCAGAAGACTCTTCTACCTTACAATTCCAAGAAGGTTT
TTTACTCAGAACAGTTTTTCTCTCCTTAGAATCTTCCATCCTTTGGTCCAAGCAGTGCTT
TTCAACTAGGGGACATTGTTGATACCCAGAGACAAATATGGTTGTAAACTTGGGGGAGAG
GTGCTACTGGCATTTACTTAGAGTACAGGCCAGAGTTGCCACTAAACATCGTACAGTTCA
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GCTGTGGCTCTGGCGTAGGCTGGTGGCTATGGCTCCGATTAGACCCCTAGCCTGGGAACC
TCCATCTGCCGTGGAGGCGGCCCTAGAAAAGACAAAAAAAAAAAAGAAAAAAGAAAAGTA
GAAGAATATTGAAGTTCCCTTGTGGTGCATTGTCACTGCAGAGGTTCAGGTCACAGCTGT
GGCTTGAGTTTGATCCCTGGCCCAAGAACTTGCAGATGTGGCAAAAAAAAAAAAAAGTAG
AAGAGTGGCTGCACTCTTAGGGCAGAGCTTCCAAATGTCTGTGGGTGTTTGAAGGGGGGG
ATTTGTTTTGTTTTATTGTATTTTTTGGTCGTGTCCAAAGCATGTGGAAGTTCCCAGGCC
AGGGATCAAACCCATGCCATGGAAGTGACCTGAGCCAATAGCAATGACAACACCAGATCC
TTAATCACTGATCCACCAGGAAACTCTAAAATGGCTGTGTTTTTTATTTTTTATTTTTTT
ATTTTTTTTTGTCTTTTTGCTATTTCTTGGGCCGCTCCTGCGGCATATGGAGGTTCCCAG
GCCAGGGGTTGAATCGGAGCTGTAGCCGCCAGCCTACGCCAGAGCCACAGCAACGATGGA
TCCGAGCCGCGTCTGCAACCTACACCACAGCTCATGGCAACACCGGATTGTTAACCCACT
GAGCAAGGGCAGGGACCAAACCGCAACCTCATGGTTCCTAGTCGGATTCATTAACCACTG
CACCACGACGGGAACTCCTAAAATGGCTGTGTTTTTTAAAGCAGCTCAAGATTTATGATT
TAACCATGTTTAATACACAGAAGATCAGCCTAAGTGATTCCCCTCTTCCAAATGTGATTT
GTTCTAAACTCACATATACAAAAACATTTAAAAGAAAGAAATTTCAGGAGTTCCCTGGTG
GCCTAGCAATTAAGGACTTGGTATTGTCACTGCTGTGGCTCAAGATTGAACCCTGGCCTG
GAACTTCTACATGCTGTGGGTGTAGCCAAAATAGAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAATTT
TCTCATTATCCTGAAATGACTGATTATAGGGATTCCCTTAGGGCGCAGGGGTTGAAGGAA
TCCAGTGTGGTCTCTGTAGCAGCTGAGGTCCCTGTTGTGGCATAAGTATGATCCCTGGCC
TGAGAGCTTCCATATGCTATGGATGCAGCCAAAATAAAACAAAAAAATAAAATGACTGAT
TATAATTTCTTAGCTCCTTTCCAGGCTTCTCCATTAGCCTCTTCGAAATACAGATGTAGA
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TCTCTTTAGGGCCACACCTTCAGCATATGGAAGTTCCCAGGCTAGGGGTTTAATTGGAGC
TGTAGCTGTCGGCCTACACCACAGCCACAGCAACGCCAGGTCCTTAACCCATTGAGTGAG
GCCAGGGATTGAACCCAGTCCTTGTAGGTACTAGTCGGGTTCATTACCACTGAGCCACAA
TGGGAACTCTATAATATTTTTTTAAGAGCTGTACACACTCTCTTTGCCATATAGTTGGGC
AGTCATCATTATAATATTTTTTAACAGCTGCAGGATATTCTTTTGATTGTATAGTCTATC
CAGCAGTTCCCTGATGGTGACTGTTTTGGTTGGTTGTGCTGTGTCACCCTATTTATTCCA
TCTGATAACTGCATCCCTCCCACTCTGCAGGCCCTGCCCTAGACCTTGAAGTTGTAGCTG
TAAACAAGAGAGAGTCCTTCTGTAGGGAGGTTATGTTCTAGTCTCTATTCCTTCATTGAA
AGTTGTTAGGGAGTTCCCATTATGGCGCAGTGGTTAACAAATCCAACTAGGAACCATGAG
GTTTCGGGTTCGATCCCTGGCCTTGCTCAGTGGGTTAACGATCCGGCGTTGCTGTGAGCT
GTGGTATAGGTCGCAGATGCGGCTCGGATCCATCGTTGCTGTGGCTCTGGCGTAGACTGG
TGGCTACAGCTCTGATTCGACCCCTGGCCTGGGAACCTCCATATGCCGCGGGAGTGGCCC
AAGAAATAACAAAAAGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTGTTAGTACTTGATGT
CAGTGCCCTCAAGCCCTGGGAACTAAGGGAGATAAGCGTTCCCTTAGTTTGGAGAAACAG
GAGAGAAATTTGCAGACCCAAGCCAGAGAAACTGTGCCTTTAAAGACCTGAGTATGTCAG
GAGGGTGACAGGCTCCTTTGAAACCTGGAGGGGAGCCATGGAGGTGGAAGTTAGCAGTTT
GCAGCCTGGCACCAGGGATGAGGAAGGAATTTCTGCCATCTGACTCTGTCGAGCACACCG
TTGGGAGGCGACGCAAAGGCAGTTAAATGAGCGTGTCTACTGCTCTGGCCAAGCCCCCCT
CACCAAGCAGACATTGAATGCTCGAGGAACTTGGAAGGGGTCATTCAGGCTCTGCCTTTG
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CTGGCTTCACTGTGGAGATGGATGCACCAATCCTGAGGACCCCCACACGTCCCACACTGT
GTGATAGGAGGAGTCTGTCTGCTCATATGTTTTTATGTGTTTGAAAGCAATGGATCCTTT
GCAGGCTTGATACTCTTATCTTTGGTTGGCAGCAGCTAGGGGAGCTGTGCTATCAGAGAA
GGAAGCTTTCCTCTCTGGGCCTCAGCCCTGATTGGCGAATCAGGATGTAGGAGACCAACA
AAGAGTCTTGAGTCTGTCAGGGCAGGTGTGGTGGTGAGAGCGTGAGCCTTGGAGTTAAAA
TTGGCTCCAGTCCTATGTGTAGTCTTGGGTAAATCACTCAGCTTTACAGAGGCTCTGTTC
TTATCTGTGTTACGGGAATAATAAATAATATTTCTATCATAGGGCTTTGCAAGACTTAAA
ATAGACTATATATGAAAAATAATGGACACAAATCCAAGATACCTACACCTTAAGGGGTAA
CTATGACCACAGTTGCAGGCTACTAAAATGCTTAATTTTTTTGTGGGAAAAAGGTGGTTA
GATATTTTGTAGTTTGGGAGTTCCCATCGTGGCACAATGGAAATGAATCCGACTAGGAAC
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TGAGCTGTAGTGTAGGTCACAGACGCAGCTCGGATCTGGCGTTGCTGTGGCTCTTGCATA
GGCTGGTGGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCTCCAATTAGACCCCTAGCCTGAGAACCTC
CATATGCTGTGGGTACGGCCCTAAAAGGACAAAAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAGATATTT
TGTAGTTTGGAATGCTTTCTGTATCATCCTAAGTCCAGATTTTTCAGGCCACGTTCACCT
GGGCCTTCGTGGCTGGCAGAAATGCAGCCCCCAGCCCCTAAGATCTTGAGTAGGGGAAAG
GCAGTACTGACACGGTTTGATAAGAGAGACAGACCTAACTGTTGAAAGCTCCTCTCTTTA
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