SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002520_2.0
Identity
TranscriptSECIS binding protein 2 (SBP2)
SpeciesTaeniopygia guttata (Zebra Finch)
Transcript IDSPT00002520
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002427_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00002520_2.0 # Transcript # SECIS binding protein 2 (SBP2) # Zebra Finch (Taeniopygia guttata) # Full length # Reverse
TTGGTCTTCCAAATTCAGTATTGCCATGTCAGCAGTTGCACTCTTTTCCAATTCCAGTGC
ATATGGGTTATATTCTTCTTCAAGTTTTCTCTTCCAGACTTTAACTAGGGAACATTGGGA
GGGAAAAAAAACAAAAACAAAGAAAAAACAACAACCAATATGTTACCATTTAATACTTGA
GGAAAAACTTAAAATGAAAAGTCAACCCTAATTTTTTACTTCAATTTCAAAATAAGTGCT
GAGATCAGCTGACACACAGGCATGCTGGCATTTACACTATGCAACATCAGATGACACACA
AAAGAATAACTTAAGAGTGATGGGGTCCACTGAGCTCCTTGTGTCCAAACTCTACTTAAC
CCTGAAGGTGCTTCCAACTTTAAAAAAAGCAGTAAGTGTTCAAAACTTTCTATGTATAAT
ACATTGCACTGTCTGTTGACTTAAGAACAGAGCTGGAGGAAAATGTTTCTACAAACGAGT
ACTTGTGGTCAGGAACATGCATCTCAAATAGGCTTCTATCTACCATAGTCATAGAGTATG
GACATCCACAATCAATCTTAAAAGGATTTTTATTTAAATAGAAATATAGAAATATAAAAA
TAGAAATATAATTAGGAGCTCTATTAAGCCTCCTCGAGCAAAGTAATGAGTACTGCCTGC
CATTTGTGGATTTCAGGGAGGAACTTCTTTAATACTTTCTCAGTAAAAACTGACTTTGGA
TTTATAAAAGACCCCAAGAATTTGCCCCCACTTTCCCTCCTTACTAACGACTACAGCAGA
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AATCCAAGTCAGCAAATACTTACTGTAATTTGGTACATCCTCATCTGAGTCCTTGGAAGA
TGTTTTACAAGTTTCTAACAAGCCATTTTTTTCAGTTTCAGGAGTTAAGATGCTGGGTTG
GGTTTCTCGTTGTCCTGCTTTAGCTTCTTCCTCTAAAGCTGCTATCATATCTTTGTAGGC
CTTCCTTGCCTCTGTTGTCAGCTGTACCATTCTATGAAAATGGTCCTATGGCAATATAAA
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CCTTATTCAGAATATGTAGGTTCATGTATAAAAGCTGAGCAGCTTTGTATGTATGAAGGC
ATGAAAGACACAGCATTTATAAAAACAGCAGTTCTCTTGAAAAAAATCATCAGGGGAGGA
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CTCTTGCAAGTAAAAAGTGAAGCCTTTTGAATAAAAACACATGAAGTGACTTATTTCAGC
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CGCAGCGGCCCAGGGCCTTGCGATTGAGGGCAAAAACAAACGGGATGTTCTGCTCACAGG
CACAGTCAATGATGTTGTGTAGGGTCTCGTCCAGCCCACCTGCAGCACACAACACAATCA
GGCTGACTGGAGCTAAAGAATCATACTGTTAACAAATGGCAAAAAATACCCCAAGATTAT
GAGTGCATTCCGAAACTATACCTTATAGGAAAAAAACAGACCACAAGTAGTGTTGAATAT
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ATCTCAGGTAACTTCTCCCACCCCAGACAGTCTTGACTCAGCTCACAGTTCAGCTGCACA
GCAGTAAAGAATCAGAGCAAGGAAGGCAACTTCATATGGCTGGATTTCAAAGGATACTCA
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CGTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTAAAGAGACTTTTTTTTATTAAGAACTTATT
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TTACTGGGTCTTTCTGATACAAACGATCTTGGAAACGAACCAGTTCTTTTAAGAGATCTG
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AAATAGTTAGACTCACTAAAATTACAAATATGTAACATTTAAATATGTAATACATTAAAT
ATACATTTAAGATTCTATTCTATGTCTTTGTATTTTTTTCTGTTTCCACTCCAAACACAC
TTGTCATATACACAAAACCAAAAATTTACTTATTTTTAGTGTCTGAAAATTTGAGAGGAA
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CTAGGTATGTGCATATATTTATGGATATTTATTTTGACATATATAAATTAAAGTACAGCA
CCAAAGTACAAAAATCTAACTTATTTCGGTAAATTCAAGGCTATGTGTACCAAAGATGGA
AAACTGGATCACATTCCTCCTCTCTACATTCATGTCTGTCATCCTTTTCTACTTATCTGA
CTATGGATTTGTGATGTTCGTAAGGAAAGGGTACAAAACTATGTAATTCACCCTCCCAGG
GCACTCTGGGGAAGATAAGAGTTAAAAATTATTTCACCCCACCCACTTTTACATAAAGAA
TTTTCCAGTGAAGACAGATATGAAAAAGCAAAACTAGAGATGTATCAACTGCATTGTAAA
CAAAAAGAATTGCCAGTGGCAAATTCACATAAGATAAAGAGATCACAACATCTATCCTCA
ATCTTAGAGATACAATTATTTCCGAATTTTATTTAGGTTACAAAAATTTTTACTTACTAT
TTCCTACCAGTTTCACTAAGTCTTGAAGACAGATCTACTGGAACACTAAAAAAACCTGAC
TTAAAGAAAATAATCTAAGCTTTGCTGAATGCTCTACATCCTGCAAACTGAGTTGTCCTT
CACATATTCAACCTAAACTGTGCTCTCAGTAAAACACTGTTACATAGACACAAATTAATC
AATTTCTATTGCAATTAAAAATTAAGAATTAACATAGCAGGAATGCTTGTATCACTATTA
ACCATTACTATGACATGAACTGCAGAAAAACCACCAGTGGTGGATTTGCTTCATGGGAGG
GGATCTAAAAGTTAAGACACTGCTTTCCTCAAGAAACCGTTTCAAGCTTTCGTGAATGGA
TCTCTGACCTCTTCACATGACTGTTTTAACTATTGTGACTTCACATGACTATAATGACTA
TTTCTTTCTTCTAAAGAAACATGTACACACATAATCTTAAACATTTAGCTGAAACTGTAC
ACAATACTCCTAAGTATTGCCTTTATTTTTTTGCCAGCTACAACATAAAATGTCATCTAG
TTTCTTTACATTTTTGCCTTTTGGTCTGGCAGTAGAAAATCGAACTACAATTAAAAATAC
TATTTAAGAAATAAAGTAGCACAGGTAACAGTTGAGCTGTTGCCTCATTATTTAATATAA
AGTACTTATATTTTAACAGCAGCTCTTTTCTTTCCTTAGCCTCTAGAGAATTTCGTTGGT
TTTTTTTTTTTCTTCAAGGAACATGCCTTTTCAAGTGAGAATCACAAAACACACTAAGTT
TATAATTTCTTTGTGTGTCAGCTTACAGAAAGACTGAAAGAAAAAAATTTAGAGCCTTCA
GTCTAAATTCCAGTTAGTTTTGCAGAGAATGCAACTGCATTACTTTGTTTGAAAAATGCC
ACTTTGGTGGTACTGTGCAAAACGAGCCATCAATACAATCATTACTTACTCTCTAAAATT
CCTGCTGTGGATTTTTGGAAGAGTGGCAGTTAGCTGCTTTGTAGTCACAGAACCTTCTTT
AGATTCCTTGTTCCCCGTGTGCTCTGGAAACCCTTCAGCAACTTGTGTTACTGGAACAGC
TATTGTGTAAATCAAGATACTTTCACTGAAAAGACAGCCCAAATGCCTTGTGAAGAGATT
AATCTGTCAAGCATGTATGGAAGAGTCTCTGCCTTAGGATTAGAACAGTCTATGGTAGTA
GGGAAACAGGTATAACTTTTTTCCTTAATTTCATAGGGTTTTTTTTCTCATTTCAAACCT
CATTAATTGCCAAAGGTAGGCGGGCACTCTCCTTACAAGATACCAGAAAACCAACAGGCA
CAGAAGTGTGGAACAGTAATCAGAATCCTTATTACTGACTTCCAGTTTTGGCCCACTTTA
CAGTCAAGATAAGCCTGAGGTCAATCTCAGAAAACTTGGAGGTTGCAGCCTTCATTTGGC
AGTATTTAGTACCTGTTTTTAAAGTACTAAATGTGCTCAAATTTCCAGCTACATACTGTA
TTACAGGTTCCCTCAAAAGATACCTGCTTGACTATCCTGTAGAAGTGTTGCATTCTCAGT
AACATTTCCTTCTGTCTGACAAATGTTATCTTCATCTTTCGGTGCTGCTTTCTGTTCTAA
CAGGTGCTGCTGTTTTCTTTGTTCTCTTTCTTTCAGAATAATCTAAAATATGTATCAAAA
CCAAACCAACTTGATGTCATGCAGATAACAAAGCATACCACATATTTACACAAAAAACAT
TTATAAAGAGGTTCAGCACTAGTATCTGAAGTTTACAACCTTTTCTTTCTATTTGCACAC
AAAAACAAGGAAAGATAATTCCTAAATTTACATAGGAAAAGACTTTTACCTTGATTAGCA
GTATATAGGCAGAAAAAAAAAATTACTAGGGATAAACTACAAGGAGAGAACTAAAGTTAA
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TGGAAGAACACAGAAACATTAAATATCACCTCTGTTTGATCCATTCTCCCCAGTCCACCA
AATAAGGTCAACTTTGCCACACCAAATAATATTTCTTTGCATGTTTTCCTGTATCAATGA
TGTGTGGACACTTCTGTAGTGGCACTTCATAATCTATCAATTAATTCAAGGGAGAAAGTG
TATTTTTTGGAATTTATATATGCCATTTAGCAAGACTACCCTTTTCTACCCCTCCCCTCT
TTGAAACCAAGCAAAGCTAAAACTGCATTCAGGCAAGTGGACACTGAGATGCAGATGTCT
GTATGAGAGGGCTTAACAGACTCCTAGAGTAATATATTATCCTATAGTTTTACTATTTAA
GATTAAAAAAAAAGGACCTTTTTGAGAGGTGTTGGTCTCTTTGCTTTAGGTACTTCTCTC
TGTTTCCCTTTCTTTACCAAAGGAGCGCTGGAATCCAAGGGATTGTGAGGCATCTTTCCT
TGGTTTAAACGGTGACTTCTCGTGGCAGTAGCAGGGTCTTTAGATAGCAGCGGAACAGCA
CCACCAACTGAGATTTAAGAAGAAATTTGCATCAGACAACTAAAATGAATACCTGAATTA
GAATCCAATTTCAAGTTTAAGACTGGTATACACATATTAAAATTGTGTTGCTATTAAGAA
TATTTACAGGCAATCCTGTATCATCAAACTGTTATTTTGAAAAGATACTCCTTACAAAAG
ACTGCTGTGTCCCCTACTTCTGTTATACCCCTGGAATCACAATCTCTGTCTCAAAAGCAG
AATTTGACCAAACACTGCAGTCCAAGCTACCTTCAACATCTTGCCATACCATCTTGGTAA
ACCTCCAAGAATTTCTGTGTTTCATGATGGGACACTTCCTCCTCCATTGATTCCATACTG
GGTTAAGATAAATACTGAGTAGCAGTAGTACAGATTTTAGATTTACTTGCTGTAAATAAA
CTTAAGCATTTATGCCTACCTTTTGTTACACCTTAAGGAACCTAGATGAAATTCACTTGC
AAATGGGTCATGAGTAATGCAAAGCTACAGCTAAGTCTCTTTTGCTTAACCTGCAAAGCT
CGCTGAAGATGTCCATTTTACTTGCATTTTTTCAGAGGGTTTAGAGCACAGAAGCTTTAA
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ACTCTTCCTCACTATCAGTAAGAACTGCTGTATCCTGTAGAGCACTTTGTCAGACTTAGT
TACCTGCAATATAAAGCAGTTCACATTAGCAAGTCAATGGAGAGGATGACTAAGTAAGTA
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ACAAAAATATTCTGGCAGCTTGTCTTAAGCCATCTTCATTTACTGCTTCCACAGTATTTA
TATGCAGATCCTCCCTCATCACATGCAGTACTCTTACCATGAACAGTTTACACCATAGAG
CTGCTAAACTGATGTTTCTTTTTCGGCTCTGTGTATCAAAGGCAAACTGAGAACACTGCC
AAAAATGTGCAGCATAGGTGGCTACAGAAATGGAAGCTGGATTTGCAGCAATAAATAATC
ATACATCCCACAGACACATATCTCCTTAATGTGTACATGATCATTTCAAGTTCACAGTTT
TCATGTTCCTAAACTTGATGACTTTACCAGTATTACCTATCATGTGAAGTAGTAACTGGA
ATAAAAACAACTGTCTGTGGACATACTCCTTTCCATTCCTGTTCACTGTCCTCTTCTTGG
TAGCAGAGGTCAGAATGATGCTACTTTGCAAACTGAAGCTGTACTTTGGTACACACCAAA
TCAATGGTGTACTAAACATTAAAACAGTACAAAGCTAAAGTAACATCAGCCTTATGCTCC
CAGGATACAAACATGACACATCTATTTCTCTTCTGCAGTAGATTCAGGCACAGGAAGCTT
AGTATTAGAAAATGGCTATTTTGACCCATACCTTTGTGGCCCACCATCTACTCATCAATC
CACACACTGTATAGTTTTATAGAAACAAAACTGGTTATTAGCATCTCTGCAGCATTAAGT
CTGATTGACCCAAATGAAAATAAAAGGAGATCAACTGAAAAAAAGAAAGTATTTTAAAAA
AGCATCTCATAAGTTCTGTCAGCTTAGTGAAGGAAAATCTCACCAATGCTAAGCATTTGA
GCTTTATATTTAAAATCTCAGCTATCACATTACGTATTGTGAGATGAAATCTCTTGTGAT
TAGATCTCTTTCTGAAATAATTACTAAAAAAACCTTTGCTGAAATAAGAAAAATTTTACT
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GATTAAATTTTGACCTATAATGAGAAAGACAACGGCTATTTTCTCCTGCTTCCATCATGA
AGAACTGAAAGATCCTCTGCATTAACAAAACCTAGCATTTTGTTAACATCAATTATTTCA
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GGAGATTTAAGAAAGCCTTTGTTACTGTGTAGCTCCTTCCTGCCTGTTTAGATCAGAACA
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CAACATTTCAATCGTGCCTCATATTTATGTAAGGCATTCTTTCACAAAGCTGTGTTTCTT
TCCGTAAGTCTTCCATCAAACAATTCAGACTGCCATGCTTTTTAAATTTCTTTTTAAAGA
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GGAAATTTCATAGTAACCAATACCTGAAAATACCACAGGTTTAGGAGACTGTTTTGACTT
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AATTTGACTCTTCTTACCACTGCTCCTGGATGTTTCCTGAAAAAGTTCAGTACCAGTTAG
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GCTACTGCAACAAAGCATAAAGTATAAAGTCTTCAATAAAGGAAGGCCTTTATGTCAGGG
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TCCTCATAAGCACTCATCTTTTTCTCTGCTTTGAAGAGAAGGCAAAAGCCATGATCCATA
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GAATTTAAAGATAGAAGGTGACAAGGAGGAAGACAAAATATATAGAACGAGGACACATGG
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AGCAGGGCCAGAGGAGGGCCACAGAAATGACCAAAAGACTGGATTACCTCTCTTATGATA
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CGTGGCCTTCTAGAAGGGTGACCATTCATTGGCTGCCATACCACTTAATCACATTCATGG
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TCTTCGTAATAAATCTTTTTTAAGCAACTGCTGTGCCTTTTGCTACTCACTCCTCCTTGT
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TTTGACAGAACAATCACATTTTCAATCCTTGCCATTTATGCTTAGGATTCATCCACATAC
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AAACCAAACAACTTGGATTCATAATTGATACTTGAGTCACATAATGTCGCAAGATTACTT
ACTTCAGACTGCTTTCTGACTGCAGAAGTAAAGGCTGGTTTCTGAGGTCCTACCCTGTTT
CTCTTATCAGAAGCAGCTGCCAGATGAGGAAACTCCTCAACATCCTAAACAAATAACCCA
GATGTTGATTTCATAAGAATAATCAAGTCTGTATTTTCAAAACTTTTCCCACACTCCAAC
AATTTTCTCCCCGCTTATCAAACATTTATCATAATTTGTTCCACTGTACAAAAATTCAGA
AGGCAAGGGTAGTGCAACCAGCTATGACAAGTACAACAATGGTTAAATCTTCCATGCAGC
AGCTGATTCAGGGCTGAAACAGCTTGTAACAGAAATGCTTCCAAAAGCAGCTTGTTATGG
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TTTAAAAGCCTTGCAAACAACTTCCCCCTTCTTCCAGTACAGTCTCCAGCTGTGCAATTC
TGTCCTTAACATGTGAGTGGTGAAGAACAGAACAGGCAGTATGTACTGTAGTACAGAAAT
AAACAAATAATTACTCAAATGATCATGGCTTACACACAAGAGGAAGTTTTATTAGCAGAG
GATCCGTTGTGCAGAATCTGGATTATCAAGAGCTGACAGGCTGAAGTTTGGCCTATACTC
ACCACCCTATACCCACTGCCTCCATCATAATGATCTCAATCCATCAGCTAGGTTTTTGCT
TCTCCTCCCACTTTCTGAGAGGCCTTTTTAGCTGTGATACAGTACCACTGAACACACCAA
GACCTGTTCCAGACTGAAAGGCTTTATTTAAACACCCCAAGCTCTAGCACAGGGAGTGAC
ACACTTCAACCAATGAACTTTTGAAGAAGCTTGCAAGTAAGCCAAAAAGCAACTGAAAGG
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TGCTTCTGAAATGCATATAGATTTCTGACATATGCAACATCCTGTAGCAAACTAAATAAT
TAAAATGTAGCACTCAGTGAGAGGTTACACCTCCCTGTATTTGTTCTTACCATCTGTAAG
AACATCAAACACTAGGAGAAAGGTCAACTTCGTTTTTACTTTCTTGCAACTGCTATATTG
CCATTTAGCCATCTCTTGTATATACTGAGAAGTCCTAATTTTGTTCAGTCTTGCCTCCCA
CAGAAATTGCTTCACACCTTTGATTATTTTTGGAGCCTTCTGTCCATCTTTTTTAGTTCA
AATATGTGTATTTTTTTAAGGAATGGGAGGAATATAAGAAAACAAAATCCACACTGTATT
TAGATCAGATATGCCCTGAAATTCTGTATTGTCATAATCAATTTCCCTTTTTATTTTCCT
AGCACCGTTTACATGTCTGACCAATACTAGTAGCACTGACCTGATTATCAACAGCACCTT
CAATATTAACTCAAGGAAGATATCGAGGTCAGGACCTGCCAGTGTGTATGAAATGACAGG
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ATATAAAACTAGAGAGCAATCCAATATATGGCTCTGTTGAGCTGCTGCACATAAACAGAA
CCTTCTTAAACCTCCTGGGTGCCCAGAAGCTCCAAGTGTGTCATCTCTGCATGGTTTATT
ATTTCAAGAGCATCATACAAGCATCTCACCCATTTTTCAAACTGCTGAGGACACAAGAAT
TCCCAGCAAACCAGGAGGATCAGAAAGCTTTCCTCCACTGCCACAACAGATGCTGCATCC
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CTTTCAATTTAGAATGCCCATTCATAGCATACAGTGTTTATGGTAGCATATAGCAAAAAT
GGGGATATTCTCCTGAAGAAAGAACTAGCACAGCTTTGGTTTTACCCATTTCCTTTAACA
AAGAGGTCTGTTAATACTCATTTCTTGTGCCATTCCTAGACAAGCAACCACACAGTAAAA
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AGGAAGGCTTCTTTATGCTGTCATTTCAGAGTATTATTACACCAAATCAAACACGTAAAC
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TAGGAAATATTAAGCCAAATAAGGCAAGAGTTCCATGTTTCATGTCTTATTCTGAGGGTC
AGAAATTTGAAAAAGAAATTCAGCCTCAAAGCTGAAAGTTCTTATTCCTAGTCTAGCACT
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ATAAAGAAACACAAACACAGGGAGAGGCATTAGTTGAGAGCAGAGAATTCTCAAGTACTT
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Chart Advanced