SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002531_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein O (SelO)
SpeciesTaeniopygia guttata (Zebra Finch)
Transcript IDSPT00002531
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002438_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00002531_2.0 # Transcript # Selenoprotein O (SelO) # Zebra Finch (Taeniopygia guttata) # Full length # Forward
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AATGCAGAACTTTAAATCTGTCTGAATATCAGCAGGAAATAATTTGGCAGGTTAGAGCCT
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TGTGCACGAAATTCTACTGAGCACACAGTGTGCTTCAGCTCTCTGCTGGCAGATTGGTTA
AATGCCTGGCTCTCTTAACTGTTGTACAAGCTCTGCAGACTGTTTGCAAGACTTAATTTG
GAAAAACCCCAGCTGACAGCCATATTCTTCCCGATGGGGAGCTGTTGCACTGAGGCTGGT
GGGATGCACTTAACAGAGGTCTTGTCAAGTCTTGTCAGAAGTGGGAGGAAAAACCGTATG
GCTTATCCCAGAACACCCAGCAGGTTGGTTTGCTCTATTAATTTTAAGTACTGTGTTCCC
AATGGGGTGCTACAGTTTATGACTGTACTGCCAGATACAGAACACTTCATACAGTACCAT
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TATCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCCATCC
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TGCTGCTGCCTTTTCTCCAGTAATGGCACTTACCAACTGCCAGGACCATTGGAGAACTAC
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TGCACGTCCATACTAACTAAATGTCAATGCCTCCGTGGATTTTTTTATCCACAATAGAAG
TGCTGGTATTCTGTAGGAATTTGGCAGAGAGCCTGCTAAGAGTTATGCAGTAAAAAGGAA
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AAAAACAAAACCCATCCTAATTCTACTTCTATCAGTACAGCTCCAATAAAAGCAGATTGA
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CTGTTCAGTGTCTCACCGCCCTCTGAGTAAAAAACTTCTTCCTAATACCTGATCTAAACC
TGCCCTCTTTCTGTTTACAGCCATTCCTCCTTGTCCTATTGCTAGAGGCCCTGGTAAAGG
GTACCTCTCCAGCTCTCTTGTAGACTCCTTTGGGGACTGGAAGGTGCTGTAAGGTTTCCC
CTTATTCCCCACGAACAGCCCCACCTCTCAGTCATAGGAGAGGTGCTCCAGCTCTCTGGT
CATTTCTGGACCCATTCCAAAGGTCCGTGTTTCTCCTGAGTAGAATATTTTCCAGTTATC
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TTGAATAAGGAATCTTCTGTGCCTATTAAGGGGATAAGATCTCTTTCAGAAGATGGCACC
AAGCTGGATTGTCAGTGTAATCCCCGTTGTTTTGAAGAGAAAACTTCCTACTTGTTAACC
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TGATAGAACGGAAAATACAAGGAAATTACATATTTTATTTAAACAAATTAATGCAAGTTA
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GAAAATTTATAGGATGTATAGAATTTTAAGGCAAATGAAAGGAAGAGATTGGTTTTAAAA
ATCCAAGTACCAGTAGCAGTGATTGCTAAGGACTACAGAGCTGTCCCTGAAGTTTCTGAC
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GTCTGAGGGTCATTTCCAATCGCCTTATCCCCAAGGAAACAATGTTAATTGTAGAGTGTA
AATTGCGAAGAATTTAAAGAAGCTTTGAATTGGAGGAGAAAAATATTTATAGTTCAATAC
ATGAAATTATAAAATATTTTAAAGCAAGCAAACCTCAATATGGATAAATAATTTTTAGCT
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CTTAGAGGAACGGTGCCCTTGTTTGTGGATTGAAGTTTGTCTCCCCTTATTCCCCACGAA
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AGGTCCTGTCTCCACCACCCTGAGATAAAAAATGCCCACCCAACTTAAATTTTAGAATCA
TAAGAATTATAATTTTGGATTAGGAAAAACTTTTTACTAGACCTATCCCAATTCCCCCCC
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CCAGATATTAAACAAATTAATGCAGTTTCAAATATTTAAAGCAAGTTGTACTGATCTCTC
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GAAAGGAAGAGATTGGTTTTAAAAATCCAAGTACCAGTAGCAGTGATTGCTAAGGACTAC
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CTCTTTGCCTGTGTCATTTGTAAATACAAAGCTATGCCACCAAAACAATCTTTCCTCTTA
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GTGGAGAGACCAGTTTTACAATGGAAATATTAAGAAAGAAAGAGGTAATAAACATATTTT
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CATCTTGGTTGAAGAAATGAAGCCCTCTGAACAGGTCTTCTATGATTGTAGCATACATAT
TGAAAGAATATGATTTTGATTTTCATTTCCCATTACAAAAATGCTATTGAAAACTAGGGA
AGTTTTACATTGTTTTGACATCAATACCAGGATGGGTAGAATGCAACTGTGGCCATGTCA
TTGTGACATCATCTACACCTGCTCTGAAAAAGAGAGATGGCACAGAATGGTGAAAAATCT
GTTTGTGCTCTTTCTTTGAGGCTGGCATTTCTGGAATGATTCTAATATTAATGCACTAAC
AGAATTTTGCCTGTGGTTGCTGGCATAGCAAATCAAACTTTATCATTATGTAGTGTAGTA
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AAAAATACCATATTAACTGTGCCTATACAACTCTGTGTCTATAGAAACAACACATGGTGG
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TGTATATTTAAGGTGCAATAGTGCTACGACTTGCCAAATCGTGGTTTCGTATAGGATCCT
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GGCCTAGATCTTACAAAATGAGGAGAATTTTATACCTAAGTAGTTCTGGTAACTAAGCAC
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CTCAGTTTTCTGTGACAGGTCCTGCAAATTGTAATGCATGTATCCCATTTCCCTAAGCCT
GTCTTGTAGGAATGTGGATAACTGTTTTAGGAATGGCCAGTTACTGTAGAAGTAACCCTA
CTCCATAAGAATTCAGCTATAACATTTTCTTTGTGAGAATTCTGATGTAGAGTGGTTATT
CCTTGTAATCTTATACTGTTTTTTTGGAAATGCAAACTCTTTTTTTTCCATAAAACATGG
CTATTGCTGCATGCAATTGCTACCATGTCCTAGTATGCTCTGGAGATTTAATGTGGGGAT
AATTTTAACTCTTTGTGGCAGTCTCCAGTCATATTTATGACTACAACCCTAGGTTTTATC
TCTAAGCATTTTGGAAGATCTTACTCTAATATTCATTGGAATAAATTTATGAGTTTTTTA
ATAACTATTTGTGGCAAGCTGTAGATCAGCATTTTTCTGTTTGAAAACAAGAATTTTTAA
TTATCAGTTCCAAAGTACCAGTTTAAAGAATTCTGTTTCTGCTGTTACAGAAAATTGCTA
GACTTTATCATCCAGGAACATTTTCCATCAATAGCTATCAATGATTCAAATAGATACCTG
GTAAGTCTTTCTTGAGAGTAATTTTTATTTTCCAGAAGTATGTGAACAAAAATTACAGGA
AGGTCTTCACAATTTCAAGTTTTACAATATTTAAAAATTTGAAGTAAGATTCCAGGTTTC
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AGTATACTGCCTAGTATGTATAGTGCCTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTGTTGGTTTTTTTT
TTTTAATTTTACTTCTTAATTTCTTTAAGGGCATCTGTGTATACTTATTTAACAACAGTC
TTTGCTGGATAAGGTTACTATGCATTCACATAATTTAGAATGGGAATGACAATGCTGACA
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ATGGGCTCGGGGCAGAGAGATGGGTGTGTTTTCCAAAGTCTGATTCCTGAGAGCTCTTTA
AATTCAGTGGACCTGTTTCACAGCAAATTGCCTGGAGCCTGGGGTTCAGGTGGAATTTTA
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TTGTCCATAACAATAGATTATGGTCCATTTGGATTTATGGACTCCTATGACCCAAGTGAG
TGTAGCATCTGGTTGTTTTTTTTTTTTACTTAAAATAATATTTTTCTATTAAATTATATA
GTTTCCATTGCATGAAAACTCCTTTCATTATTAGCAGAAAAACCCTAAGCATGTGTACTG
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TGCATGAAAGCTCCAGTTTTATAGTCATAGCAGCTAATTATATGTTGGAAGAGAAGAAAT
CAAACCTACACAGTCACGGTAACTTTTCTTTGAAAATCTTAACTCAGTCTGGGGTTGATA
GATAGAGGTTCAGTATGTACATAAATGTGTATTCTTAGACTATTGTTTATAGTTTGCAAC
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GGGCTTTTTTGCTCTTAGATTTTTCTTTATAGGGTGGGTTGACCCCAGCTGGCAATTAAG
GATCCAGAAGCCATTTGTTCACTCTTCCCTGCTGTGGGCTGAGGGGCATAATTGGAAAAG
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AAAATGGCAGCGGTGACCAGCAAGTGATGCAAAGATAATCACTCACCATATGTCACCACC
AGACTGATGCCGAGTCAGTCCCTAACCAAGAACTGCCTTGGAAAAACTACCCCCACCCCA
GATTTTATTGCTGATCATGATGTTGTAGGTGTGGAATATCCCAGCTGAGCTCAGCTGTCT
CAGCTGCATCCCCTCCTAGCCCACCCCAGCCTCATTTTCTGGGGTTACAGAATGAGAATT
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GCACAGTTTTGGTCACAAGGCCAACACACGGTGCCAGACAGGCTGCTGTGAAGAGAGCTG
AGTCTGTCCCAGCCAGGCAGTGCACGCTAGAGCCAGATGAGAGGTGTTAGAGAAGAAATT
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ATTTGCTGTCAGTGTCCTCTGAGGGCCGGGGTGATGTTGTGTGCATGGATCAGCTTATCT
GGGTTTGATCTGAGTGAGGGGTTCCCACTGATCCCCTCAGAGACTGCTGCTGTAGATAGG
CATACATTTTACTTCTGTATACTTGTAACTTGCTGGACAGGTATTTGGTATCTCCCAGAT
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TGTTTACTATATGTGTGACTTTCCCATAAATACATAAACCCTGATTCTAGTTGGACATTT
GTTTGCTTAATCTATGTGCTAAATAGTAGCACTAGATGTAGTAAAAATACTGGGTTTAAG
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TTGCCTGTAGTTTTCTGTTCTAAGATTGCCTAGCTTGTTTTGTAAGGCACTTATTTAGGA
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GACATTCCGAGAGCTGAGTGAAATTACTGCAGACCAGTTAAAGGAGCTCCATATTCCTGA
GGTATAAATACAAGCACCCAATCCTATGAATACTTAATATAAAAAGAGTAAATCAAGTTG
GACATAACTCTGATATAGTAGAGGCTATCTTAAGCTATGATTCATCTGGGAAATATGTTC
TTGTGTCATTATTAAGGGACAGAGGGACTAATACATCTGTTTCAGGCTACCACCCCTTCT
TAAGCTTGTATCTGGTAATGATGGATATATTAATGAAAAATGCTAATGAAAGGTGCCTTC
ATGAAAAATGCTGAAGTCAGATTTTCAGCCTTTGGTACAGGTCCAATAGGAGTAGTCATA
AATACTCATACACAACTAGGAATGTGATTTTTGTCACATTTAACATGGGTCTGCTACAAA
GAATTTTCTTCCCCTTCATCTCCCCATTGTTTTGTTTAAGAATAACTTTTGTCCAACAAG
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TATGGGCTTACCAGGTGACCTAAACCTCTGCTGTCAGGCATATTTGCTTATTTTGGTATC
TAATGATAAGTGAGATTCCATCTCAACATAAACTCCTGCTTGAACTCTTTGCCCAGAGTG
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TACATTTTGCTATTGTGTCCTGCTCAGCCTGCTGTCTCATCCTGTGTTGCTGCTGACTTA
GCCTAAACTTACTCTTCAGGACCAAGTATAACCATATATAAAACACATGAAAGTATTTCA
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TGGACTGAGATGCTAGGCAAGTCATAATTGAATAAAACAGCAAAAGGGAAATTCTGAAAA
GGAAGCTTGTAATCTGGTTCTGAAAAGGAACCTAATCTGGAAAAAAAATCGCCTTTTTGT
GAGAGCCAAAATTATTTTTTTCCTTTTATTCTTGAGTATAGTGTCTTTTCCATGGGATGA
ATATTGTTCATTTTGCCTGGGAAACTTCATTGCCTTCCCCAAACACCTGATTTATGTCTG
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GATGACAATGTAAAGCACAGAATGAAAATGAGGAGTTGATGGTTCTTTTTCCATGTATAA
TTAAGTGGTTTTGAGCAAATTTTCTGGTTTTCCTTGTTTTCTTCTGTTAAGCAAGAGGTC
ATTTTTTATGACCTTTTCTATGAACTTGAAGCCAATAAGTGTTTAAAAGTTTAGATGGTC
TAGAGGTGAGCAACAAAAAAACCCAGGAGTTGTGGCCTTGGAATTTATTGTTTGCACAGG
AGGGTGATAAGAGGATGGGTGTATTTGTAAGAGAAGGTATTCTTGTCATAGAACCCAAGG
GATTTTTCCATTTATGTCAACTCCATCTTCCCATCTTTGAAGGTGTTGGCTGAGGAACCA
GCAACTGTGGTGTAGTTGTGATCCTGCTGCTACACTAAGGGTCATTTCCAGCCTTCACTT
GGTAGCAACCTGATCTTTTTTTTCCCCACATAATGCAATTATTGAGCCCACAAATTCTGA
GTTCCAAAACTGATGTGGAAAAACAAGTACAATTTTATGCTGGTAAAAAGTTTTCAATGT
TTTAAAGAATTTCAATTTTAAAGTAATTTCACTTCTGTTTATTTACACACCAATACTTTT
ATTGATTTGTACATAATTTAAGATTTTTTCAGCTGCATACCAAAATTGACTTAAAAATGC
CAGAATCCTTTGGGAACAATGCAGGAGTCCTTAAATTTAGTATTAACTGAAAACATGCTG
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ACCAAATATAGTTTTCATATCTTTTTTACTCTTATTCCTCAAAGAAAAAAAAAAAACCAC
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TTGCTTTAATTTCCCTTGCCTTTTATCTATGTCCATTTCCTCCTAATCTGTTCTTTCTCT
GTTCATTTTTTTGTCTGTGAGCATTGGCTGCTTTCAGCTGAGGAATATGAAGCAGCTGTT
AGCTCGGTGTATTCAGCCAGGGAAGCCTGGTTTGTGTTTGCTGTCCGCTGTCCATCACTG
GAGGCAGTAACCCCAAACTCTGATTTCTTGCTGTCAGCATTTTCCAAGTTCTGTCTCCTC
TCCTGCTGTCTCTATTCTCCTCAGTTTTCTGCTGTCCCTGTAGACTTTAGCTTCCCTTTC
CTTCACCTTTTCTTTATTTATATATTTTGCTTATTGTACCATTTTTGATTAAAAAAACCT
ATCTGAATATATTTGATCCATGTACAAGTCTCAGTAGAGAGTGAAACCTGTAATTATGTA
GCTTAAAAATCATATAGGTCAGACAATAAGCCAAGGAAAAACAGGGGTGAAGTGCTAGAG
GTGTTTAGGTAAAATTTTTGAAAACAGAGACGGATTCATGTGGCTGTATCATGCTAGCAA
AAATAAATAATTTGAATACAGAGGAAAAGATACCAGCAGAATGTTTACGGAGAAAATTCT
TTGGAGGGTTATCATACATTTGCCTTTTAAATTTTTTATTGTTCATTGTTTTGGTTTCAT
CTGGGATAGAGTTAATTTTCTTCCTAGTAGCTGGTACAGTGCCATGTCTTGGATTTAGGT
TGTGAATAATGCTGAAAAGACACTGAAGGTTTAGTTGTTGCTGAGCAGGGCTTACACTAT
GTCAAGGACTTTTCACCTTCTTGTGGTGCCCTGCCAGCAAGAAGGCTGGAGGTAGACAAG
AAGATGGGAGGTGACAGAGCCAGGACAGCTGACCCAAAGTGGCCAAAGGGATATCCCAGA
GCACTTGGTGCCATGCTCAGCAAATAAACTAGGGGAGAGCTCGGGGGGGATAATACCCTG
CTTGGGAACTGCCTGGGCATAGTTCAGTGAGCAATTGGGGTTTTATTTCTCTCTCCTTTT
GATATTTTCCTATTCACTGCTATTATTATTGTTATTATTAAATTATTTCAATTATTAAAC
TGATCCTAACCCATGAGTTTTCTTACTTTTAACCTTACTTTAAACCCCAGTTAAGGAGGA
GCATGAGCAAGTGCTTATGTGAGGCTTAGTTGCCAGCTGGGGATAAAACACAATATTTGT
TGCTTACTTTGGTTTTTGCTTAACAGGAAAATAATTCTGATTATCTGTCAATAAATGTTT
CTTTCTCTTTAGGAATTCTGGGCTCTCCAGGATCTGGGTAAACACAAATTATTTTCAGAA
TGGGTTACTATGTACCTCCTTAGATTAAACAGGTAAATCTGATTGCAGTTTAAAGTGTGC
ATTTGCCAGAACCAGGAAACTTTAGTCTGCAGTGATTTTGCATAGTCTTTAATGGGTCTA
ATAAACTGGCCCAACCATGGTTTCCTATGCCTTTTTTGTTTTCTTGGTTCTTCATTGTGC
TGGATTCAGCAATAATTGCTGTTGTAGTTCTGTTTTGACACTCAGGTACACAAAAATGAC
ATGGTAGGAGTAATTTCTGTTCTTCGTCTTTCATTGAGCATCTGATTCATTTTCTTTGGT
TAACAGTTTTTCTTAAAATACCAATCCTACAGATTCAGTCCAAGAATCACAAACAGGCTT
TGCAAGTATATAGGAATGAATAGTGTTTGATTACTGGTTTTATTTATTTATTTATTTATT
TGTTTGTTTGTTTATTATTATATAATAACATTGCTTTATGGTGTCCGGGGATGGAAGCTG
AACAGCTGCAAATTCACAGACTGTGTTTGGAAGCCATTGTGTTGCATAGATAGGAATTCA
CAGGATTCTTTTGTGTTAAATCAATAAAAAATCTAACATTTTTTTCTTAGTTATATATGG
TATGCATGGCTAATAGTACTGAAAATAAATACATATCAGATACTTGGAAATTTTATTCAG
TAAATAAAATTCTTAAGGGAAAAAACCAATGCAAGGCACAAAACCTACAAGAAAATGTGC
AGTTTTTTCCAAGTCTAATAATTTGTAGAGATTCACACCAGCTTCTGCCAAACACAAAAG
CAGAGCACTTAATGATTTTAATGGAAGTCAAATAAGATATTTCTAAAAATAAATCAGCTT
AATCCTCACTAGCTAAAGTGCTTTCTGTTTTTCTTCTTTTTGTTTGTTTTTCATGTGTAG
TTACAACGGTGACTCAGATGCCAAAAGAAGAATAAGAATGGCAAGTGAGTAAAACAATCC
AAAGGAATCATATGCTTGCAGATGGCAAATATCTATTTACATACCTTCCTCTAGTGTTAG
ATATTTTTCTTTTTGGGTAGAACTAAAATACAGTATTTTTCTGAAGAGGAGAAGCTCTCA
TTATGCTGCTGCAAATCTTGTCACACTACATTCATTCAGTCTGTCTCTGCCCTTTGTACA
TTCTACAAAGAATTAATATTTCTGATAGAGACACACTTTTTCTTTCTGTCATCCAGAGGA
AAAACTTGTGAAAGGATTATCTGGTCATAGAAAGCAAAGGAAGGTGCTTTGATTCTCCAA
GTTTTTCTAAATACAAAATTGCAAAGGTACTGCTGTTAGGTATCACAGCAGAAACAATGG
ATATGAAATTCCAATAATTGTTCAGCACGAGATATTTTTGCTCTGCAGTAAGCTGTGGTA
AATTTGTGAAATTTGCTTATAAGAAAAAATGAGCAACTGAAAATCAATGACCAAAAGGGA
ATAAAGATCTAATCAAACTCTGCACATGAGGCTTCACTGTTACACTGCCTTACAGGGTGC
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CTTCTAAAGCTCCAATCGATTTGCTAGGAAAATGGCAGGAGCTGGCACTGACTTTCAGTA
ATGAGGTAGTAAAACTACAGAGGGCACAGTTTATGGTTCCAGGTTTGCATCCCCATTTTT
TAACAAAGGCTCTATCCTTTTTAAAGAACACTTCTTAAAATTCTATATGCATTTTAGAAA
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CATCTGTGAGTTTCTGAGGCACTTGGCTCAATTATTGTTTTTAAGTTTCAAGCTCCTGTT
TCCCTCAGCTAAAATTGAATGCTGAAAACTGTCTAAACACAGTTCTTATGCTTCTGTATC
TTTTAAATCTGCTTTTAGAGAAAATCTTGACATCCTGGGGTTTTATTCCAAATCAGAAAA
TATCCTAATTTCTCAATGGTTTTCTGCAAACCATCATTATTTTTTTCTTGATGCACCTCA
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ACTTGTGCTAGTGGTCTTAATTTTGGTAGCAGTCAAAGCTTGATCTGCAAAGGTTCACGG
TTCAGTTCGTTTTCTTCCATATAATCAACCATCACTCTCTAATTATACTGCAGAGCTGCA
AAAATTTATAATAGGCTACTGATGTTAGTTTGTTCTTGTTTTATTTAAAATCAACAACCT
TTGTTGGACCTTTGCTAGCTGCTCCATATTACAGGATGACTGAATTTTCTTACAGAGATT
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