SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002537_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein R (SelR)
SpeciesTaeniopygia guttata (Zebra Finch)
Transcript IDSPT00002537
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002444_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00002537_2.0 # Transcript # Selenoprotein R  (SelR) # Zebra Finch (Taeniopygia guttata) # Full length # Forward
CTATATCTAATTGAAGACACAGACCCCCTCACTAAACAAGCTGAAGCAGCTGCTGCTACA
GACTGGAAAAAAAAATTGACTCCGGAACAATTCTACGTAACACGAGAAAAAGGAACTGAA
CCGGTGAGCACAAGTGCTAATGCTGTCTGAGGGTGAGCCAGCTCCTCTGCCTGCTGGGCA
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GGGATACTTTCCTGTCAGATAAACTGTTTGTGTGCCGGGAGTAGAGGCCCGTCTAGAGGA
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TTGGTCAGAACAATCCCTTGATGCCCAAGTGCTGTGTGTAAATCTTCCAGGATGCCTGTG
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GGGTCCCTCACACTGCAGCTGAGACCTTCTCTTCACCCCCACTCCCTCCTTGTTCCCTAA
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GTGCTTTAATGAAATCTCAAACCTTCATCAAACCATAAACCTACAGCTGAGATTCATACA
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TGGAAAAAGTAGATCATTGGCTGTGAGGATGTGTCATAGGCGAAAATGGTTTGAGCAAGG
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GGGAAAAGGAAAAGTATGTCTGGACTACCTGTGGTGATGTAATATAAGCAACAGCCCACG
TAAAAGATCCCCGTCTTCTGGGGACTGGGTGTAGGGCAGGTGTGGTGGCAGAAACAGGGC
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CAGGTGTTTGATTTTTTCCAGTTTTATGGAGAGGAGGGAAAGGAGACGTTTTTCATGCTA
CTGGTGTTGATGTAAATTAAGACCTTTTAATGAAAGAAAGTTAAGGCCTTGATCAACAGA
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CTGGTGGTTTGTGCAGGTAAACAGGGACTCTTTAGCTGGAAAGAAACACCTGGAGCTAAG
GTTTGATGTACAGAGTTGCAACTGCATTTGTCAGTTGCTGAATTTATATGTAAACTACGG
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TGATTGTGGGTTTTCAAAGAGGATCTTTGTATTATGTGTGAATAACAAAAGGATTCCTGT
GTCAAAAAGTAAAGAGTTTTGGTGAAAAATAAACAGAGGTCCTGAGGGACAGATGTATGT
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TGGCTGGTAGGGACAGTGCTTGTGTGGTTTTGTGGCAGGTAAAGCAGGGAACCTTCTTTA
GCTGGAAAGAAACAGGCCTGGAGCCCTAAGGATCTTGATGTACAGAGTCTGCAAACTGCA
TTTGCTTCAGACCAGGCTGCTCCTGTGTCTGATTTTTCTCCAGTTTTATGGAGAGGAGGG
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TTACTCAGTGACAGCCCTGTACAGATGAATATAAAAATGCTGATTCATGCGCTACTCTTT
GGGTTGGATTTTTTCAAGGTTTTTGTCCAGTTTGGTTGCCTTATCTTTCTAAAAGGCACT
GCAATTAAGATTTTAGGATTTTCCTTCACTGTGTGAACAACCCACCAAAATATACGTGAT
ATATATGACATACTTAGTTTTAAATTCTTCTGTAACTAACGTTTCGATCCCCTTGATCAA
GAGCTGCTAGTGGTGCTGATGTCTCCATCCACCACTAGATGCCAGTAAGAGCATTGGGTT
TGCGAAACTGGGGAAAAACCATGAGAAATAGTGAGGAAATGGTTGTGGTGAGTCTCCAGA
CCACTTATCTGAGAAATATGTGAACCTATCTTCACTTCTTGTTCTAACTCACGCAAGCTC
CCTCTTTGATAAGAGAAGGTTCATATTGCTGTCAAAGCTTGCACAATTTTAAAAAAGAGG
GATTATCTCATTTCTGTACCAAATCCCTAAAATATATTTTGATCATATTTGCCAACACAC
TCTAAGTTTTAATATGCAGCTAAACAGTGTTGATCACCCTGGATGTTAACAGGAGGCACC
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AGATCTTTGTGCTGTGAGGATTTGTCATTGGTTGATTGATGGTTTGAGCAAGGCTCTGTT
TGATTTTCCAAACCAGCTTGATGGCTGACTGCAAGACAAAGCCTCTATCATCATCAGGCA
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CTCTTCTCTGGGATTGCTGGATTGAGCCATGCTTCAAACTGCAACTCTGTAGGTATAATT
CAGCTAAACACTATAGCATAATATTGGTATAGCATAGTTGTCAGGGAAAAAAAAACCACT
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CCTGTTGTGAGCTGATTGAGAATTCCCTTTGGAAAAGTTTCCAGCACAGTTCGATGCCAA
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CTGGTTTCCACTATAGCTCAGAGAAGAAGTACAATTCTGGGACTGGATGGCCATCTTTTT
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GATGATACACAAAGACACAAATCTTAGCAGATAAGTTTTCTTTGTGCCCATGAGAATCTA
CCTAAACACAACAGTGAGAATTACAGTATCACTGGAGCCATTCTTTCTCAGCCTGAGGTG
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TTGTACAGAAAATTTACACAAGGTGTGACAAGAGATGGTAGAAGAGACTCTTAGATAGGG
TCCATGCATTTGGCCCATCATAGTGACAGTTCTTCCTCATTCAGCCTTGCTAAATATTTG
CTGTAGATGTCCTTAAAATATTCAGAGAGTGAGACACCAGCCCTTAAACCATTATTAGCC
ATTACTATTTGCCCTGCAGGGTGGTAGCTGTGCTCTGCATCTCCACAGATATTTTCTGCG
GATTCTCTTGTTTCACAGAAGCTACCCTTCTATTTTTTTTTTTAGCTATTTTGACTCCCT
CAGTCTTTTCTTTTCTAGACTAGAAAGGTGCAGTTCCTTCAACTTCCTTTTTGTTCAGTG
ATTTTTAGTGTGCTCACCATCCTGTTGCTCTGCTTTGCATCCTTCCCAGTTGACCCTTTT
CCTTCTTGTAGTAGAGTGCAAGGTGGACTTAGCACTGCAGCTGGGCCCAGCCTGCAGCAG
GGGTTAGAGGCTGTTCAGGTGTGTTAGAAATGGTGTTCCTGTCCTTACACCTTTACCTTT
CCACAGACCATATTACACAGACACATTTTGCTTTTGGAACCTACTGTAAGACCCAGGTTC
TTTTTCTAAAGAACTGCCACTCTTAACCATTTCTTTCCAACTCAAATCTGTTTTTCACTT
CTGTTAAGGTATAAAAGTGTGCAATTGAATTTAATGAATTGCATCTTGGATTTGGGACTT
TTTTATGTCTCTGTGTGTCTGTTTTTGTAAGGTGTTAAGATTGTTAATGCTGTCCTTCAA
TGTGCTTGCAGCAGTTTAGGTACATCTGCAAATGTAACAAGAGTTTGCTGCAGTCCATTA
TCTTGGAGGAGTTCACATTTACAGCCGTATGCAGCAAGCACCTCCAAGAACCCCGGCTGA
AGACCTTCCAATTTTATAATGTCACTGATAGCTATACTGTGTCTAATATTTTCACCTCAG
TAATTTGAGAGGGGAATCCTCAGTTGATCTGTGAGAATGACCTTCAGTGACTTCTTAACT
TGAAGTTTTCATTATATATTGAGAAGTTTAGATTGTCTCATTTATTTCCTATACTTTCTG
GCAATAATATTTTTTCTCTTCTGGGATGTGCTTGTTTGGGGGCAGATACTTGCCCACTGA
CAAAATGTGATTCCTTGTCATCCCCAGGACTCTCCCACTCACCCAACTTAACAGTGATTT
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AATTCCAATGATAATAATGCAATGACAATGTGTTCTGGTCACCAGTGATGTTCTCTAGGG
CTCAGCGCTGCCACCAGCTCTGTTCAATCTTTCTCAGTGATCCACGTGAGGGGATCCAGG
GCACCCTCAGTCAGTCTGCAGACACAGCGGGCTGGGTGGGAGCGCTGAGCTGCTGAAGGC
TCTGCAGGGGGATCTGGACAGGCTGCACGGATGGGGAGAGGCCAGAGCTCTGAGCTTCAG
CAAGGCCAAGTGCCTGGGCTTGCTCCTGCCCCTGGGTCACAACAGCCCCTGCAGCTACAG
GCTGGGGCAGAGTGGCACCAAAGATGCCTGGAGGAAAAGGTCCCGGGGGTGCTGGTCAAC
AGCAGCTGAACAGGAGCCAGAGAGTGCCCAGGTGGCCCAGAGACCAATGGCATCCTGGCC
TGGATCAGCAACAGTGTGGCAGCAGCACCAGGGCAGTGACCATAACCCTCTACAATGGAC
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CTGAGGTGCTGGAGAGAGTCCAGAGAAGGGCAATGGAGCTGGGGAAGGGTCTGGAGCACA
AGTCTGATGAGGAGCAGCTGAGGGAACTGAGGATGTTTAGCCTGGAGAAGAGGAGGCTCA
GGAGTGAGCTTATCACTCTACAGCTGCCTGAAAGGAGGGTGCAGCCAGGTGGGGTTGGGC
TGTTCTTCCAGGCAGCTGGAGACAGGACAAGTGGACATGGCCTCAGACTGTACTAGGGAG
GTTCAGGCTGGACATCAGTAGGAAATTCGTCATGAAAAGGGCTGTTAAACATTGGAATGG
ACTGCCAAGGGAGGTGGTGGAGTCACCATCCTTGAAGGTGTTCAAGAAACCACTGGACAT
GGCAATTAGTGCCATAGTGGTGATCAAAGATGGACCCTATGAATGAGAGTCTTTCCCAGC
CTAAAGGATTCTGTCATTTTGTAGCAACACTATAATAAAATGGTAATAATTTCTGTTGCA
GTGTGACGCCCATCTAGGCCACGTGTTTGATGATGGACCCACACCTTCTGGCCAGAGGTT
CTGTATCAACAGTGTTTCATTAAACTTCAAACCAGGC
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