SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002544_2.0
Identity
TranscriptThioredoxin reductase (TR)
SpeciesTaeniopygia guttata (Zebra Finch)
Transcript IDSPT00002544
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002451_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00002544_2.0 # Transcript # Thioredoxin reductase (TR) # Zebra Finch (Taeniopygia guttata) # Full length # Forward
CAGAAAACAATGGAAGTGAACGGGCTTACGCCGGTGCCGGATTCCTATGACTATGATCTC
ATTGTCATTGGTGGAGGCTCAGGAGGTCTGGCAGCTGCCAAGGTATGAGGGGGAAAATAC
ACACTTATACTTTCCTTGTAAGTAGGTGAGTGACATCCCCAGTGTCTTGGATTTGGTATC
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TGGTTATAGGATTATAATTTTTTTAGGCTGCAATCCAGTAATTGGAAGCATGTAGAGGCA
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ATATAATATATAATTTTATATAAAATATAAAAGCTGTCAATAATTCAGTAAGTCTTAATT
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CTCAGACTAAAAGATGAACCTTCCTCTTCTGTTTCTGACAGTCAAACACAACTGGATGAC
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CAAAACTCCATGTGGTGTGTTTCCCTTTTAATAAGTAGTAATGAAATAAAAGATGACAAA
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AGAGCTATGCTACAGCCTTTAATTGCACAATCACATTTTATTCCATCACCCTGAAAAAGG
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TGAGTAAGTGTGATGCCTCCATGCGTCCTGATTCTGTGGAGAAGCCGGGGTTTTATAGCC
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TGTTGTCTGTGTGTATCTGGCGCTGTGTATAATGCTTTAGCAAAAGGATAAATCTTCAAA
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GTATAATTGACAGGTATAATTTAATCTTAATATGAAAATTTCGTGAAATTATGAAATTAA
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GTAGGGTTTTAGCAGGTTTTCTCATCTCTTTGAGACATTGCGTTTGAAGTTATGCCTGTT
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TGTTTTTCTCTAAATATTGAACATGAAGTACGAACAAGGGTGTTGTTGAAAAGTACTTTT
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GTCTCTTGTTATGTACTGCTGAGGGTTTTCTATCACAGTGGCTTCCCATGGGTGGAGGGA
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ATGAGTTGCAGGATTTTTTCCCAGTGGGATATTTGCAATAAATGATAAGTAATGATTTAT
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GGAGTAAAACAGCCAGGTGACATGTCATCTCAAGAGCTGTTCTTGACACATCTTCACAAA
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GGCCTTGATGCTGAAAAGGGGGGAAAAAATGTGACTAGAGTGTTTGGAACCACACAGAAT
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TCTGTCAGTTGTTCCTTGTACTCTCTTTTTCCCATCTCCTTGCTTTTATCATCTCTTGGA
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TAAAAGCTACTATACATTATTTTGAAAGATAAGGTTCAAGGTTTAAGGTTCCTTAAACTC
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ACAGGAACTGCCACTAGTCTCTCAAGTAACTATGTGACTATTTCTGTGTCAGTCTGATTA
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GTAGGAAATATTAATAATTAAAAGCTTCCATTAGCTCAGTGCACTTACAGCTAAAAAGCT
TGCTGGCTGTCCCTTAGGGTGTGTAACAGCTTAACCTGTCTCTGAGTAGAACCCTGAAGG
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TTCTCTCCCTCATACTCCACATACAAGTCTTTCTCTTAAAGCTAAGGAGCCTACAATGTT
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CTATTGGAGATATCCTGCAGGGCAAGCTGGAGCTCACACCAGTGGCGATCCAGGCAGGAA
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ATGGTCCCTAAATACAGTGGAGTATGAGTTTGTGATGTTCTTAATTTTCAGTGTTACTTT
CACAATTTTTTTTTTCACTTCTCACTTGTATGTTTTCAAGATAACATGAAGTCCTTATTG
TAGTTGAATGTAGTGGACACAATGGGAGATCAGATGTACCAGTAACTCAGCACATGTTAA
TACCTTAGTAGCTGAATTAGTGGTTTCAGTGTTCATGTTTTGTACTATTGCAGTTCTGGG
TTTCAGCCAGGTTATGGTTGTTCAAATGGGAGCCATGTGGGTACTCATTTTCACCTTATG
TTTAAACCAGAAGGAAAGGACTCTCCTTGCCTTTAAAGAATTGTTACACTGATATGGGTG
CTTGCCTCACCTTTATAACCATATGGCATGACCATAAAGGTTTCTCCCTTTCAGAGCCTG
CTGTGTTCATAGCAAGTTCAACTTCAACTTCAACATAACAAGTTCAGATTTAGAGCTTGA
TTGAGTTGTTTCTTTTACGTTGGCAGGTACTGCAGTAACAGAATTCTGAATCAGTGTGCA
TAATGTCATTGAATTAGCCAGGCAAGGTTTAGGAAACTGTAGTAGAAGCCAGGATTTTTT
ATTGCTGCAATGCTATGGATATGTCTTAATTTGAATTTTATGCCAGATAAGTCTGTCAAG
GTACAAAACCAAAGGAAGCATTCTTATTTAGTGAATCCAAGAAATGAGTAACTACTTTAA
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TAAGGAGGTATTATGGATAGGTGGGGCAAGAACAATAGTCAGCATCTTAATTAATCCTCA
GTCACAAAGGAAATTAATTAAAGTTGAAATATGTAGAAAATAAAATTGCTAGACATTAAA
TGGAGCTGACCAGCCTGCTAGTCTGTAGAATTACTCATTTGATGTATATGGGAAGAGCAA
GGGATGTTTGTTTATTTTGAGTCTAGTGAAGGCTTTTGCCACTGTCTCCATAACATTGTC
ACGGACAAAGGGATGAATTGCAGGCTGGGTAAGTGGCCAGTGGGGTGGGTTGAAAACTGG
CTGAACAGACAAGCTTAAAGGGCTGTGACCAGCATTCCAGAGACCAGCTGAAGGCCAGTC
ACTGGTGGTGTGCCACAGGCTTGGACTTGGGTCCAGTGCTGTTTAACATCTACACTAATG
GATCTGGATGCTGAGATCAAGTGCACCCTCAGAAAGTTTGGAGATGATACAAAACTGGGA
GAAGCTTTCACTGTGCCCCCAGATGGCTGTGCTACAGGTTATTTTGGCATCACCTAGGCC
ACAGCTGATGAAAAATGAGTTTTGAATGGCAGTGGTGCCCTTGCAGCATCTCCAGCTAAA
AAGAAGAAGTGGTTGAACAGGCAAATTTTATCTCCAGTCTGGCCTGTGATTTGGTATGTT
TTTAAAATGGGGCACTGAATTTCCCTTTCCACTTAATCAATGCATACTAATGTTAGTGTG
GCTTTAAACTGTCTTTTTGTTCTTGCTCTAATTAACACCTCTGGAATGAACAAACACAAA
ACTGTACCTTAATTTAAGACAAATTAAAAAAAAATAAAAGAATTTTCAGAATTGTGAATA
AGCAAGCTTTTCTTGCTGTGTTTCAGACTGCTGAATGCTGGTTTTATTACTGATGTTGTG
TGGGTTTTTGTTTTGTTTTGAATGCCATCCAGTGTGACTATGTGAATGTTCCAACTACTG
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TTGGGGAGGAAAACATTGAGGTAAATGCCTTAATTTCATCTGGGTTTTACTTTTCCAATT
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TATTTCTCAGTTCCAATAGCTCTAATTGCAGATATGTTCTATTTTTGGCAAAGAGGGGCT
TAAAGGTGGAATGTTTGGTAAAAAAAATAGTAAAAGGGTTTCTTTGTGTCTGAAAATACT
TCAGGATAATTTTAAACTGGATATATACTGGAAGCAATACACTGGTTTTAATGACAAAGT
GGAGCTTTTGAACCTACATTATGGCAAATTCCTTATCATAGTAATTTTTACTTTATAAAG
CCAGATGTTACACTCATTTTTCCTGTTTACTTTGACTGTACAAAGAGGTATGTGCTTAAT
TTCACTCATGTGAGTAATCCCTTTTCATTCCTTGGGATTGCTGGTCAGGAGTGAAATTAG
ACAAAGATAAGCACTTAGTGCCTGAGGCTGTTCTTCCAAAATGCTGTACTGACCACACTA
CAGAAAGCATAAGGGGAGGAAATCTCACAATAAACTGAACATTTATGTCCTACAAATATC
ACCTGAGGAGCATTATTTACAGAAATAAGCAGGTAAGTGGTAGTGCATGAAGCTGAGAAC
TTGTCCCCCTCTTAGCTGACATTTTCTGATTTTGACTGTGGAGGAAAATAAGCAAATACA
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TTTCCTGCCCACAAAGTTTGTATATACTCAGTCAAATTTTTGTTATTGAGGGAAATTCTT
GATGTTATATGTGAAACACTGGGCCCTTTATTTTGGAAAATAATGTGCTTTTGAATTTCA
AAGCATTTTATATTTTAATATGTGCACCCAGAAGAATTTGTGTTCTGGCTAAGTCCTCAT
TTGGTGTATTCTGACCTCTTTACTGTATCACCTTATTGGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGC
AAGCTTCAGTAAGACTATTGAGTCACTTGTTATTTTGTAATTTAATAAAAGCATGGTGAA
CTGTGTTTTGGAAGTATAATATTCTTATGGCTTCTCTTTTTTTAATTATTGGATGACACC
AGTACTTGGTTTATAGAGACTTCTGTCTTTGGCATTCATTAAGGGAAAAGAGTATCATAA
TGATTTCAGATGTTCTAAATGCTGTGTACATAGCTCATTATTTAGGATAATCTGGCAGCT
TTTGGAAGATCGTGTTCTCTTCTTGGAAATTTTACAACTCTTTTTTAACCTGTGTTTTAT
TTCCAGGTGTACCATAGTCATTTCTGGCCACTGGAGTGGACTGTGCCATCCAGAGATAAC
AACAAATGCTATGCAAAGATAATTTGCAATATTCAAGATAACGTAAGTACATCTTTCCTT
CCTGGGTAAACAATATCTAAATGTTTATCATAAAACTGTTGATGATACAACAGCTATAAA
TAGGTTGTTTTTAACAAATTAAAATAAATTTAAATTTACCTACCTTTTGAAGTATAATAA
ATATTTATAGTGATGCATATTTCTGTGTATACAAAACCAACTCCCAGTAAAATACAAAAT
TCTGCTATTGTTATTTGTATATGGTACTTCTTCCATAGATGTAAAATAAGAAGTAGAGAT
CTTTAAGACTGTTCATTAACTTTGAGAAGTGAGCAAATCAATACATGTAAAAATGGTTAG
TAGTTTTATTGGTTTATTCTCTCCTCCCCAGACTTGGACATTCTCTTCTGGGAGACTCTT
CTCTCTGAAATGGAGGTCTCTCAGAAGCCATTACAACTTGTAACCTCTCCAAATTCACAT
GTATTCAGAGAACTCTTGAGCTTGTTCTAACAGGATAATGTATCTTGCCTGCACAAATCC
CATTTAGGGTGATAATGCCTGGATTATCCTTGGACTAGGATCAAATGGAAATCATTTCCT
GGCCATGGAAATGTACAGTTCCTGCTGAAGCATAAGCAAAATTAGTAGTTTGTTAGAAAA
ATTGGTGTGCCCATCTCAGAATGATCATCACCTGTTCAATAAAATGTAGTTGATTTTAAA
AATATAACTTATTATGAAGAGTAATATTCCAATAAAATGTATTCCTGTTAAAATGGTGGC
ATAGCTATCTGTCCTATGAGAAAAAAACAAAACTTACTTAACCTATATTAATTTTTCTTA
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TAAACCTGTCCATCTCCTCTTTCTGGTGGAGATTGCAGTAGTGTGGAAGGCATTTTAGAA
CCTCTGGCTGTGCTCTAATCCAGAGTCACTTAAGAAAATGCAAAGGTGTAATGGTGATTT
CAAGTGTTTCATTAATTTATTTTCACTTCTTGTCCTAAAAATTTGAAATGTGTTTAAACA
TCTAAGGATAGTGTTGAAAGTTACCCTCGAAAAAAAGTAGTTCAGCATCTATTTAAAGCT
CTCATTGCTTTGGTTTCATTGCTGTGGTTTTATTTTGACACATGTCAATATTTTTGAAGG
AAAATAAGGAAAATTCCATTTTACTTATTACCCAATTATAGCTTTTCTTATTTAAATAAA
CCCTGTGGTAAATCTCAGTCCTCAGACTTATTGAAAGAATAATAATCTTTCAGTAGTATT
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