SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002546_2.0
Identity
TranscriptThioredoxin reductase (TR)
SpeciesTaeniopygia guttata (Zebra Finch)
Transcript IDSPT00002546
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002453_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00002546_2.0 # Transcript # Thioredoxin reductase (TR) # Zebra Finch (Taeniopygia guttata) # Full length # Forward
GTGCTGCTGGCAATTGGACGAGATCCATGCACAAGAAGAATTGGTTTGGGCAAAGTCGGA
GTGAATATCAATGAAAAGTAAGGACAGATGTCAGTGTACCACTCACTGCTGAGCTTGTGT
CATGTGCTGTTACAATGGTAGTGGTGCAGAGACACCCAAAAGCTTTGAGGGAAAAGTTAT
CCCTTGTACACTTGGATGGGAGACCATGTAGCAGATAACTGCATTTTCTCTCACAGTAAT
GGTAGTTTGCTTTTTTGTTGCTGAAATGTCAATTTCTAATTCCTGGGGGGAAAAAAGTGT
CTGTTTCATTCTTTCTAGATGTACAAGTCTATCTTAACTTCATCCAGTCACAGGGTTTTC
TGGGATCTGTCAGTTGTTCCTTGTACTCTCTTTTTCTCACGTCCTTGCTTTTATCATCTC
TTGGAGCAAAAATCTGTTTGTTCATACAGGCTTTTAGAGCAGTGACTTTTGTTTATATTT
TAATGTAAAAGCTACTATACGTTACTTTGAAAGATAACGTTCAAGGTTTAAGGTTCCTTA
AACTCCCAGGTGTTCTTGATGTGTTTTAGGTTTGGAGGGTTTTATTTTCTTGCCTTGAAG
CAGCCCTTGGGTATAATCTGTGACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNATTAGTGGTTTCAGTGGTTCATGTTTTTGTACTAGCGTTTCCGGTTCCTTTTGTCT
TATGCAGTTCTGGGTTTCAGCCAGGTTATGGTGTTCAAATGGGAGCCATGTGGGTACTCA
TTTTCACCTATGTTTAAACCAGAAGGAAAGGACTCTCCTTGCCTTTAAAGAATTGTTACA
CTGATATGGGTGCTTGCCTCACCTTTATAACCATATGGCATGACCATAAAGGTTTCTCCC
TTTCAGAGCCTGCTGTGTTCATAGCAAGTTCAACTTCAACTTCAACATAGCAAGTTCAGA
TTTAGAGCTTGATTGAGTTGTTTCTTTTACGTTGGCAGGTACTGCAGTAACAGAATTCTG
AATCAGTGTGCATAATGTCATTGAATTAGCCAGGCAAGGTTTAGGAAACTGTAGTAGAAG
CCAGATTTTTTTTTTATTGCTGCAATGCTATGGATATGTCTTAATTTGCATTTTATGCCA
GATAAGTCTGTCAAGGTACAAAAATTGTTATGCTGCCAAAGGAAGCATTCTTATTTAGTG
AATCCAAGAAATTAGTAACTACTTTAAAAAAATGGGAGTGTGGCTTATACTGCCTTTGTA
ACAAATCTGGAGAAGGTGATTGAAATGTAAGGAGGTGTTATGGATAGGTGGGGCTAGAAC
AGTAGTCAGCGTCTTAATTAATCCCCAGTCACAAAGGAAATTAATTAAACTTGAAATATG
TAGAAAATAAAATTGCTAGACATGAAATGGAGCTGACCAGCCTGCTAGTCTGCAGAATTA
CTCATTTGATGTATATGGGAAGAGCAAGGGATGTTTGTTTATTTTGAGTCTAGTGAAGGC
TTTTGCCACTGTCTCCATAACATTGTCACAGACAAAGGGATGAATTGCAGGCTGGGTAAG
TGGCCAGTGGGGTGGGTTGAAAACTGGCTGAACAGACAAGCTTAAAGGGCTGTGACCAGC
ATTCCAGAGACCAGCTGAAGGCCAGTCACTGGTGGTGTGCCACAGGCTTGGACTTGGGTC
CAGTGCTGTTTAACATCTACACTAATGGATCTGGATGCTGAGATCAAGTGCACCCTCAGA
AAGTTTGGAGATGATACAAAACTGGAGAAGTGACAAGCTTTCACTGTGCCCCCAGATGGC
TGTGCTACAGGTTATTTTGGCATCACCTAGGCCACAGCTGATGAAAAATGAGTTTTGAAT
GGTACTGGTGCCCTTGCAGCATCTCCAGCTAAAAAGAGTATGCTTTGTAGAAGTGGTTGA
ACAGGCAAATTTTATCTCCAGTCTGGCCTGTGATTTGGTATGTTTTTAAAATGGGGCACT
GAATTTCCCTTTCCACTTAATCAATGCATACTAATGTTAGTGTGGCTTTAAACTGTCTTT
TTGTTCTTGCTCTAATTAACACCCCTGGAATGAACAAACACAAAACTGTACCTTAATTTA
AGACAAATTAAAAAAAATAAAAGAATTTTCAGAATTGTGAATAAGCAAGCTTTTCTTGCT
GTGTTTCAGACTGCTGAATGCTGGTTTTATTACTGATGTTGTGTGGGTTTTTGTTTTGTT
TTGAATGCCATCCAGTGTGACTATGTGAATGTTCCAACTACTGTATTTACTCCTTTGGAG
TATGGAGCCTGTGGGTACTCTGAAGAGACCGCAGTGGAGAAAATTGGGGAGGAAAACATT
GAGGTA
Chart Advanced