SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002552_2.0
Identity
TranscripttRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43)
SpeciesTaeniopygia guttata (Zebra Finch)
Transcript IDSPT00002552
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002459_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00002552_2.0 # Transcript # tRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43) # Zebra Finch (Taeniopygia guttata) # Full length # Forward
ATTCCAGCAGGCTATTGCTTTGTAGAATTTGCAGATCTAGCTACTGCAGAGAAATGTTTG
CACAAAATCAATGGAAAACCACTTCCTGGTGCTACACCGGTAAGTAAATGGGATCAGCCA
GTTGAGAACCAAAACTTGGAAGGGACAGATAGTGTAGAATGTGTATTTTAATAATTACAG
ATAAATTGAATACTTAGCAAGCTGGGATTCTTCTTTGCTTTAGAACTCAAGTTATGACTA
TAAAACCGTTAATGTTCTTGCTCTGAAAACTGTTGAGAAAAACCACTGATTTCTTTGTGA
CTGTCTAGATAAAATTCAGGTGTAGAAGTGTTGTGGGATGTTTTTTATATCTGACCATTG
CTGCTGTTACCAAAGTTGGACTAATCAGAAATCTGAGAAGAGCAAGGAAGAAATTTGACT
GAGTATAGTGTATGTCTGCCACAATTCTTCCATCTCTGTCCTTTTGTGTAATCATGGAGT
CACAGAGTGGTTTGGGTTGGAAGGGAGCTTAAAGCTTATCGTATTTCATCCCCTACCACA
GGCAGGGACACCTTCCACTAGACCAAATTGCTCCAAGCCCCATCCAGCCAGGCTTTGAAC
ACTTTCAGGGATGAGGCAACCTGAGACTTTAGCTGTGTTTGTTGTTACATGTGTACAGGA
TGAACTTGCAAGTTCACACTGTCTTTTGAGTAACACTGGCAAGAGAAACATGACTATTAA
TCTTGCATTGTTCTTGGCCCTTAGCAAAGAGAAGTTACTCAAACCTCTTTACAGTGGAGA
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GTTCAGATTGAGCTGTTTAGTCAGCGTTCCTGAGTGGGTGACATGCCCTGTTAAAAGGAG
TTGATGAGAGGCCTGGAGATACCTGTTTCACGTGTTTTCTCATGATTAAGGCAAGCTGAT
CATCCCGGATGCCTTGTATAATCACTGGAGAGACAAAGAGAGCAGCTCTTGCAAGGAGTA
AGATAACAATGGAAGTTTGGTTTTGGGAATACCCATCTTACTTCACAGTTTTGTTCAAAA
CAGTGTGGAGGGATGATTTGCATAACACACGGAGAGAATTACAGATGTCAGGCAGAGATC
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GGTATTCCCAGTTCCCATCTGAGTGAAAATACTCTCAGGTGTCTTGTTAATTTTAAAGCC
AGAATATTGCAGTGAAGAGTGAGATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTTAAGTGCTT
CAAAGGGGAATCTAAATTTTGTGTTAGCTTGTAAATGATCCACAGAAGGTTGTGTAGTAC
TGTGCTCCAAAGAATGCAAGCATGCAAGGAACAGGACTATAGCCTAGAGATAAGACTGTG
CTCTATTTCCCAATAATTACTTACCTGTTTTTGAGGGAATTAAATCCATCATACAAGGTC
CAGGAACACACTGGGCTCTTCACTATACTGAACAAGTACCCTGATCTCTAGGGCATTTCT
GATTGTGATCCGAAATCCTGATTTTATGATCTGAAGTCTTGATCCTGAGATTAGCCCAGA
GCTGATTCAAAGATCTTGGTCTTCTTAGATCTTGGTCTAAACTTAAATGTAAGCTGGGTA
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CTCCAGTGTCCTTTCAGTAGTAGTAGTTCTTTCAGAACCCTTTAATTTTGAATCTTACTA
AATGTCCAGAGCCAAGTATTTAGCCACACTTCCAGACTCAGGCTGATTCCATTTTCTGGT
ATGTTTGATTCTGGTCTGCTAGTGTTTGTGTTAAATCACAAAAGTCCAGTAGTGGTACTG
TTGTTTCATTTTAAGACCTTAAAATGGGAAGAAAATTAACATTTGTTATTACATTTTGAT
TTTCATTATTATATCTGTACTGATGCTAAATAAAAATGTGCTTGTTACCTTAACTGATTG
GCTTGAAGGCATTGAAAATGAGTCATTAAGTTGCATTATATCAGCTTGTTGTATTTTTCC
CTAATTGCTTGAATTCACATGATGACATTTGAATGTATGGATTCGTTTTTGCCTTGTTTC
AGGCGAAGCGATTTAAATTGAATTATGCAACATATGGAAAACAGCCTGATAACAGGTAAG
TGCTCAATATTTAAATATTAATTTTGCCTGCTTAATGTCTCTCTATTAATTGCCTTGCAA
AAATTATTCAAAATATATAAACCCAAAGTTCATCACTGCCAGTCTTTAGTAGAAGGAAGA
GAACTTAGTCTGCCAGTTTTGTGCTTTGCCCTGTGTGTGGCACAACAGATTTATCCAGTG
TCCTTTGAGGTACTTAAGCTTTGTAGCATCAAAGTATCTAATTCATATATTATAATTTAA
GATCTATGTATTATAATTTGAGATCTATGTATTGGAAATAACATCTCTATAAATGAGATA
TTTTTTCTTGTCGTTTTAGAAATCAGAGATATCCTGAGTAATAAGCATTGAAATAATCTT
TAAAGAAAAAGCAGTATTCAGTTGGTTGGTTGTCCTGCTTGGATTAACTTGAAAAAGCAG
TGTCAATCAAAATTTTAGTTAAGCAGCTTAACTGGTGGCACTTCAACATCTCCATTACAT
GGTCTTTTAATATCACTCTTCTCTGAGTTCAAATATTTAAGCTAAATGGTAACTGTCACT
CAGCATGTCCCTTTTGTTTTTCTTTTGATTGTATTTAAGACGTTTACTTTTGATTTCTTT
AGTCCAGAATATTCCCTTTTTGTGGGAGACCTGACTCCTGACGTGGATGATGGGATGTTA
TATGAATTTTTTGTTAAAGTTTATCCATCATGTAGAGGTGGAAAAGTTGTTTTGGACCAG
GCAGGAGTATCCAAGTAAGTTGTCTTTTATAAAATGCTGAAAAATATCTTGAGTAATATT
GAAACACTCTCTTCCTGGACTCTTGGGTGGAATTGTGCTTTACAAACTTTAGCCTATTGA
GTGTATATTCCTGTGATAGCTGTACAGGTTTTCTTTCAAACAGGGTAGGGCACACAAAGC
TGTGATTCACTGTCAGGTTCTCAGTAGCTGCCTTGTTTGTCTTTCCTGAAAATGTCTTGA
CAAAAACAGCTATCAAAAAGTTGGATTTCTTAATGTAATTAAAACATTTTCTAAATAGCA
TGCAATTAAGCTGTATTTTCCAGAGGAAGGAGCAGTTGGTGAGCATCCTTGTTTTCAAAG
CAAAACATGGCTTCAGTGAAGCACAATTCTGTAATATAACACCTGTGAGAATGTTGGGAT
AATATATAGGCTATGGCTGTAGGTCCCTCCACCTTCTGATATGTGGTTTCTTAATCTTAG
ACGGGTTGGTTTGAACGAATCTCTGGAGGTCTCTGGTCTAGCTCCTAACAGGACTGTAGC
CTGCTCTAGAACATATCATCCATTAATTGTGTAGCCTGTAAAAATCTCCCCACAAAAGAG
TTATTCAATCCTGTCTGGGGCAGCTCTGTTTCCAGAGCTGCACTCCCCCATTCATGAAAC
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AGCGTCCCTGTTTTCAAAGCAGAGCATGGCTTCAGTGAAGCACAATTCTGTAATATAACA
CCTGTGAGAATGTTGGGATAAGATATAGGCTATGGCTGTAGGTCCCTCCACCTTCTGATA
TGTGGTTTCTTAATCTTAGACAGGTTGGTTTGAAGGAATCTCTGGAGGTCTCTGGTCTAG
CTCCTAACAGGACTGTAGCCTGCACTAGATCATATCATCCATTAATTGTGTAGCCTGGAA
AATCTCCCAGAATAGAGTTAATTCAATCTGTCTGGGCAGCCTGTTCCAGAGCTGCACTCC
CCAGTCATGAAGTTCTTCTTCACGTGCATCTTGAACTTGTTGCAGAGCTACTCAGTCTCT
CTGGCTATTTTGTCCTCATGCTGTCATTGCCACCTCCCCTGGGACTGACACTGCTGTGTT
TGGCTCTGTGTGCCTTCTGCTCCTCCTCAGTGTAAACCTCACAGTTCCTGTTGTGCTGCA
CCTGCTTCAGTCTCTGTCTATAGAACAGTTGTTGGTGCTGCAGGTTGGGAACTGTGCATA
GGTGCAGACCTCAAGGAAAGGGAAACTGTGGTAGCTTGGGAAGTGGGGAAGGAGTAGGGA
CTTAAAGTCCTGTTTCTGGGAAGAGCAAAGCTGTCTCCCCTGGCAGTGCCACAGTGTTGG
TGCCAGGGGCTTTGTTGGGACTTATGCAATTGCTCAAAGCTGAGACATCTGCAGGTGTCA
GTGTGATGTGAGAGAGGAGCTTAGAGCTTGCAGACAAGCCCTGGCCCTTCCAGCCAAGGC
TGGTGGATCAGGAAGGCCTCCTCCCAGACCCTCTTGTCCAGACAGGAGAGGAGCTTGGAG
CATGGTGCTGTGGTGGTGTGCCTACTTCTCTGCTTTCTGCTGAGGGTACAGGTGCTGAGG
CTTTTCCAAACTTCAGGGGCACGACAGAAGGTCTGTAGGGAGGTCCTGGCCAGGAAGAAA
TTATTTCTTTCCCCACCAATGGTTTAGCCATTGGTGGAGAACAGCTAAATGTCTGGAAGA
GTTGGAAGAATCAGTGTCTGGAAGACTTGGAAGAATCACTGTCTCCCTTGCAGCACCCAG
CATCTATTCCTGTACACTGCATCCATCTCTATTTGTGTCTCTTTTGGAACTGCCAGTCTT
CCCACTTTCTCTTTCACACTCCTGCTCCCATCTGAAAATCTGCAGGAGTCTTTTGGCACT
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TGGATTAATTTGCCATAATCCTTTGGCAGAGGGCAAGTTAAATGAACGTGGGTCTGTGTA
GAGTTTTGCTTGTGTTTAATAATCTAGTTTGTATGTATATATATATATATATATATATAT
ATATATATATATATATATGTAAGATTTTTGGACTTGTGTGTGGAGCTTGCTGTGCAAGGT
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TAGATAATGCACTCTAAATTTACACCCTTGCTTATGGCTTGTTCTTTTCCCCAGGTAGAC
AAGTCCTTCCCTCCCAAATTTCTTCCTTTGCTTAGATGGATTCCTCTTACCCTCCCACAC
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GCCCTCTTGGATGCTGTTGCATTGCTTCTGACTCACTACAGCATCAAAAGCCCACGCAAA
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ATCACAATGAAGGCTTGTTGCAGAGTCCATGGGTTCTGGATGTGCTGTCTCTGTTCCAGC
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TCAGGCTTTTGGAAAAGCGGCTGGAAGGTAGAATAATTTCATCTCTCCCAAGAGCAGGGA
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ACTAATTTTTATAACGTGGCATTGCACTTTGGGGTTGGTTTTATGTGAATTTTTTTATGT
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CCTTTTAGTGCTTTGGATACATGTCCTGGATGTCTCAATCACAAAATGAAAGAATACTGA
TGAATATGGGGAGTATCAGAATGCCCTGGAGTTCAAAGAAATTATAACATTAGCTCAATA
CTGAGCATTTTACACTGTTTTGAATTGTATACATTATTAAACCCCTACACATGCGCACAC
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TTAAATCTTTTTAATGATGACTGGATAGCAAAGCTCAACTACCTTGCTAATTCTATTATT
CTATCTACTACATATAAGACTTTTGGGGCAAAGATTAACTTTTTTTTCTGTGTTTGTTCA
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TCATAGTAATTGCTCCCTGTTTGAATAATATTTAGATTTTCAGTGACCTCATAAATCTTG
GCGGGGGAAGGAAGAGAAAAGCAGAAAAAATGGGTGCATTGTGGTGAGAAGATTGATGTT
TCCTTCTTCCTGCTTCTCACTAATGTCATCATTAGTAGAAATAGCTTTATGTGTGACATA
TTTTCATTTCCAAACAATATTTGTCATCTTATTATTTGAAACCTTGATAGTTAGGTGAAA
TGGTGTTCCTTGGGAATGCTGTCACTTCCTAAAGTGGCAAGGAATAGGAATTTTAGTCAG
TTCTCAGAGCATTTAAGTTTATTTTTGGATTACTAGTAGTTCTTATTTCATTAACTTTTT
CAAGTCTGTGCATTAAAGACCACCTGGCTCAGAGAGAAAGGGGACAGGGCCTTGCTTAGG
TTTCTGTATGACAGTGGCAAAAAGGAGAGTTTTATCCATTCTTACAAAACTCAAGGTTTT
TTGCCAGCCTTTAAGTCTTTAACTCTTCCTGTAAAGCAAGGCTCAGTACTTTCTCTCAGA
AAGCTGCAGATTACTTCATCCTCTTTACCAGACGGAAGAGGGGACTCCAGTATCTGGATT
GTGGTTCAGGATTGTTCTAAACTGAAGCTTGTAGTCCTGAACTCTTCCCTTCCCAGAGCC
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AATAATAAATACTACTGCGGTAAATAGTGAATATATTTTAAAGACTGAAATTTTCTTGTT
AGACTAAGCCTTGTCTCTTTACCACATTGTATCTTAAGCTATTTCACTGCTTTTTTCATA
CTTGTTCTGTGCTATTGTATTGCAACTTTAAAAAATGGTTTATTGCTATTTTATTGGTAT
TTTTTCCTGCTTTATTTTTTTAAGTAATCGTATGAAACCAATGGAGTACAGTCAGATGTA
CAACTATAATTACAACCAGTATTACCAACAGTATCACAACTACTACGCTCAGTGGGGGTA
CGACCAGAACACGGGCAGTTACAGCTACAGCTACCCCCAGTATGGCTACACGCAGAGCAC
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GAGAATCACAGAATGTCCTGAGCTCGAAGGGACCCACAGGAATAGAGTCCAGCTCCTGGC
CTCCCAGGACACCCCACTCCCCCCGTAATTGGAGGACGGAACGCGAACCTACGGAAACAC
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TTCAGCGTGCCGCCCCCGAGAGGATTACCAAGCTAAGCAATGCCCCGGAGTCAAGAAAAT
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CTACCTCATGGGGGTACACAACCGGAGTACAGCTACGCTACCCCCAGGGTACCACCGCAG
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GGTATCTATTTATTGGTATTTTTCTGCTTTATTTTTTATAATCGATGAACCATGGAGTAC
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AGCTACCCCCAGTATGGCTACACGCAGAGCACCATGCAGGTAGGGCAGCACAAGCTTGAA
AGGTGGAATGAGAGCATGTCATCTTCAGCTCTGAGAATCACAGAATGTCCTGAGCTCGAA
GGGACCCACAGGAATAGAGTCCAGCTCCTGGCCCTGCCCAGGACACCCCAACAATCCCAC
CCTGTGCCTGAGAGCATTGTTCAAATGCTTCTGGAGCTGAGGCAGCCTTGGAACTGTGAC
CATTCGCTGGGGAGCCTGTTCAGTGGCCAGGCTCCCTCTAGGGGAAGAATCTTTTCCTGA
TATCCAGCCTGACCTTCCCCTGACAGGAGGAGGCTCCAACTGTTCCCTCAGCAGGTCCTG
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GAGCTCTGTCCTCAGTCTGCTCTGCTCCAAACTGAACACACCAAGAGATCTTAGTATATA
CCTCTTAATAATGAAGTCTTAATATAGCTACTATTTAGTGTTTAGCCCCTGGTGTGTCCT
GTTGCCTTATGGAGAGTATATTGCTGAGGTAAAAAAAAGTTTGGTGGACATAAAGGGTCT
CTTAGTACAGTTGTGATGGTAGAAGAGTTCTCTTGGTACAGGCAGTGCTCAGAGTGCCTT
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GAGATAGACTTTCTCAAATTGGCCCTAATTTCAATTTATAATATACCTCTATCTTCGAGT
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TGCTGCTCCTAGTCTGAACCTGGTGAGGACTGAAGCTGTTTGACTTCCCCAGCACTGAGA
TTTTAATCTTCTGTAGTACTGAAATTGTTAACCTTTTTTTACTAGGGTTTTTTTTTCTGA
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ATTTTAGATTTCTGTCTTGAGTGCAATATGCACTATGCAGTGTATCTTGCTCTATTCCTA
AAAAAAAAAAAAAAGTAAAAATTAAAAATCACATAGTAACAGATCTACAGGATCCACAGG
TATGAGTGATGATGTGTGTGGAAGCTGTTAATGGCTCTTAAAAGCATTCTAGGAGAGCTT
TCCTTTTGCTGAACCAAACATACCAGGACTAGAATTGGGATAGCTCTGGATATTTCTTTT
TGTGGTTGATTAAATGAAAGATTCCTACCTTTGTAGGAAACTGAATTCATGTATTGTCAC
TGTATCATTCCTTTTCCTTAAATCTCTTCTCCTGTAATGTCTTACAACATGATGTAGTTA
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AGGGCCTCACCTCCCTCACAAGGAAGTTAAATGTTTAAAAACATTATATTCCTGATGTGT
TTTTGAGTCTTTCCATTCATTCGGCTTTGTATTGAGAGTCATTCACTCACCGTTGTGATT
GTGCTACTCTGATAACCTGAGCTTTGGGTTGCTGGAGTTGTCAGGTGAGCTTTACATACT
ACAGGGGTTTGGGGAGTCCATCACTGTGCATTCAGAGCAGCAGGATTGGACCTGCACGCT
TGTTGTCCAGCTCGAAAATGCTTTCTAAACATTTCTTCCACATGTAAAATAGGGCTATGC
TCACCATGATGCTGTGGTGCCACTGACACTCCCTTCATTCCTAACTGTGACTCCAGCTTT
GAGCTGCTGGAGGATTTGGCAGATGAGTTCTGGTGACTGCTTGCAGCAGCACAGGATGCT
CCCATCCATCTGTCCATCCATCATTTGTGACCTCACAGTGGAGGGAGCAGAAGGGAGTGG
GTGCCTCTGCATTTGCTTCTGCCTTTCCATTAGGGCGAGCCCCTTCTGGCAGTGCAGGTG
GCTTCACTGGGCTGTGAGGTGCAGGTGTGTGTTCCCTCCACTGGCTGTCCTGTGGGGCAA
TCACTGTTGTAAAAAGGGACATGTTTGGATGTAGTTATTCCTTATCTCATTGAAGAGAGA
TTGAGTAGGATTGACTGATTTGGTCAGGTTTGTGACTGGGCAAGTGGTGGGAATGTTTGG
TGACACACAGAATCACAGAATACTTGGGGTTGGAAGGACCTCTGAAGATCATCCAGTCCA
ATTCCCTGCTAATACAGGCTTACCTGGAGTATGGGACACAGGAACACATCTAGGTAGGTT
TGGAATGTCTCCAGAGAGGGAGACTTCACACCCTCCCTGGGCAGCTGTTCCGGTGCTCTG
CCACCCTCCATGAAAATAACTTCTTGTTCATGTTGAGGTGGTTGCTCCTTGTCCTGTCAG
TGGGCATCACTGAACAGAGTCTGGCACTATCCTTTGACACCTGCCCTGGAAATATTGATA
CTCCCCCCATGTTTGTTTTAATATACAAACTTGTTTAAAGGGTGTTTTTTTTCTGAATAC
CTTTGATGTGTGACCTATTTGTCTGTCTTTCCTCCCATAGATCCCACACCTCAGTTAGAT
GTCCATGAAGCAAACAAGCAGTTTATGGAACAGAGTGAAGAGCTCTACGATGCCTTGATG
GACTGTCATTGGCAGCCTTTGGACACGGTCTCATCAGAGATCCCAGCCGTGTTGTAG
Chart Advanced