SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002552_2.0
Identity
TranscripttRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43)
SpeciesTaeniopygia guttata (Zebra Finch)
Transcript IDSPT00002552
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002459_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00002552_2.0 # Transcript # tRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43) # Zebra Finch (Taeniopygia guttata) # Full length # Reverse
CTACAACACGGCTGGGATCTCTGATGAGACCGTGTCCAAAGGCTGCCAATGACAGTCCAT
CAAGGCATCGTAGAGCTCTTCACTCTGTTCCATAAACTGCTTGTTTGCTTCATGGACATC
TAACTGAGGTGTGGGATCTATGGGAGGAAAGACAGACAAATAGGTCACACATCAAAGGTA
TTCAGAAAAAAAACACCCTTTAAACAAGTTTGTATATTAAAACAAACATGGGGGGAGTAT
CAATATTTCCAGGGCAGGTGTCAAAGGATAGTGCCAGACTCTGTTCAGTGATGCCCACTG
ACAGGACAAGGAGCAACCACCTCAACATGAACAAGAAGTTATTTTCATGGAGGGTGGCAG
AGCACCGGAACAGCTGCCCAGGGAGGGTGTGAAGTCTCCCTCTCTGGAGACATTCCAAAC
CTACCTAGATGTGTTCCTGTGTCCCATACTCCAGGTAAGCCTGTATTAGCAGGGAATTGG
ACTGGATGATCTTCAGAGGTCCTTCCAACCCCAAGTATTCTGTGATTCTGTGTGTCACCA
AACATTCCCACCACTTGCCCAGTCACAAACCTGACCAAATCAGTCAATCCTACTCAATCT
CTCTTCAATGAGATAAGGAATAACTACATCCAAACATGTCCCTTTTTACAACAGTGATTG
CCCCACAGGACAGCCAGTGGAGGGAACACACACCTGCACCTCACAGCCCAGTGAAGCCAC
CTGCACTGCCAGAAGGGGCTCGCCCTAATGGAAAGGCAGAAGCAAATGCAGAGGCACCCA
CTCCCTTCTGCTCCCTCCACTGTGAGGTCACAAATGATGGATGGACAGATGGATGGGAGC
ATCCTGTGCTGCTGCAAGCAGTCACCAGAACTCATCTGCCAAATCCTCCAGCAGCTCAAA
GCTGGAGTCACAGTTAGGAATGAAGGGAGTGTCAGTGGCACCACAGCATCATGGTGAGCA
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GTGCAGGTCCAATCCTGCTGCTCTGAATGCACAGTGATGGACTCCCCAAACCCCTGTAGT
ATGTAAAGCTCACCTGACAACTCCAGCAACCCAAAGCTCAGGTTATCAGAGTAGCACAAT
CACAACGGTGAGTGAATGACTCTCAATACAAAGCCGAATGAATGGAAAGACTCAAAAACA
CATCAGGAATATAATGTTTTTAAACATTTAACTTCCTTGTGAGGGAGGTGAGGCCCTGGC
ACAGGCTGCCCAGGGAAGCTGTGGTTGCCCCATTTCTTTAAGTGTCCAAGGCCAGGTTGG
ACAGGGCTTGGAGTGACCTGGTCAAGTGGAAGGTGTCCCTGTCCATGGCAGTGGGTGGAT
AAAGATGGCTTTGGAAGTTCCTTCCCACCCAAACTGTTCCAGGATTCTATTTGGTTTTAA
CTACATCATGTTGTAAGACATTACAGGAGAAGAGATTTAAGGAAAAGGAATGATACAGTG
ACAATACATGAATTCAGTTTCCTACAAAGGTAGGAATCTTTCATTTAATCAACCACAAAA
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GTGGATCCTGTAGATCTGTTACTATGTGATTTTTAATTTTTACTTTTTTTTTTTTTTTAG
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GAAAAAAAAACCCTAGTAAAAAAAGGTTAACAATTTCAGTACTACAGAAGATTAAAATCT
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GCAGTGCAGAACATACATACAACTTCAATACAGGATTTGAGAAACATACCTTCCAATGCA
TCCTCACCAACTTCTTCATATGTCTGCAAGGAAAAACAAACCCCTTAGGACAGTGGATAA
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CTGGAGTTATTACAACAGAATTCTTCACACATAAGCCTGTGTTCCATTCCTAACACTCCA
TGGGCAAGATCCTACACTAAACCTCTAACAGAGGCAGTTCTTGAAATTCCAGGGTTGAAG
TGGGGTGACTGTTCTGATGTGTTCTATCCCTTATAACAAAGTTTTTGAAGGATCCCAAAG
GCACTCTGAGCACTGCCTGTACCAAGAGAACTCTTCTACCATCACAACTGTACTAAGAGA
CCCTTTATGTCCACCAAACTTTTTTTTACCTCAGCAATATACTCTCCATAAGGCAACAGG
ACACACCAGGGGCTAAACACTAAATAGTAGCTATATTAAGACTTCATTATTAAGAGGTAT
ATACTAAGATCTCTTGGTGTGTTCAGTTTGGAGCAGAGCAGACTGAGGACAGAGCTCCTT
AGGGTCTGCAGCTCCTCCTGAGGGACAGCTCCAATCTCTGCTCTCCATGACCAGGGACAG
GACCTGCTGAGGGAACAGTTGGAGCCTCCTCCTGTCAGGGGAAGGTCAGGCTGGATATCA
GGAAAAGATTCTTCCCCTAGAGGGAGCCTGGCCACTGAACAGGCTCCCCAGCGAATGGTC
ACAGTTCCAAGGCTGCCTCAGCTCCAGAAGCATTTGAACAATGCTCTCAGGCACAGGGTG
GGATTGTTGGGGTGTCCTGGGCAGGGCCAGGAGCTGGACTCTATTCCTGTGGGTCCCTTC
GAGCTCAGGACATTCTGTGATTCTCAGAGCTGAAGATGACATGCTCTCATTCCACCTTTC
AAGCTTGTGCTGCCCTACCTGCATGGTGCTCTGCGTGTAGCCATACTGGGGGTAGCTGTA
GCTGTAACTGCCCGTGTTCTGGTCGTACCCCCACTGAGCGTATATTGTCCTTCGACTGTA
CTCCATGGTTCATCGATTATAAAAAATAAAGCAGAAAAATACCAATAAATAGATACCATT
TTTAAATGCAATACTCTGACGTACTCCATGGTTTCATCGATTACTTAAAAAAATCGTCTG
CGGTGGTACCCTGGGGGTAGCGTAGCTGTACTCCGGTTGTGTACCCCCATGAGGTAGTAG
TGGATACTGTGGTAATACAAGCTGGCCCTGGTACTGGGGGCTGCGAGAAACTCGATCATT
TTCTTGACTCCGGGGCATTGCTTAGCTTGGTAATCCTCTCGGGGGCGGCACGCTGAAAGC
CCCTCTTCGCCGGGGTTGGCGCGGCAGGTTTTGTCCACATCGAAGCATAAATTCCAGGTG
TTTCCGTAGGTTCGCGTTCCGTCCTCCAATTACGGGGGGAGTGGGGTGTCCTGGGAGGCC
AGGAGCTGGACTCTATTCCTGTGGGTCCCTTCGAGCTCAGGACATTCTGTGATTCTCAGA
GCTGAAGATGACATGCTCTCATTCCACCTTTCAAGCTTGTGCTGCCCTACCTGCATGGTG
CTCTGCGTGTAGCCATACTGGGGGTAGCTGTAGCTGTAACTGCCCGTGTTCTGGTCGTAC
CCCCACTGAGCGTAGTAGTTGTGATACTGTTGGTAATACTGGTTGTAATTATAGTTGTAC
ATCTGACTGTACTCCATTGGTTTCATACGATTACTTAAAAAAATAAAGCAGGAAAAAATA
CCAATAAAATAGCAATAAACCATTTTTTAAAGTTGCAATACAATAGCACAGAACAAGTAT
GAAAAAAGCAGTGAAATAGCTTAAGATACAATGTGGTAAAGAGACAAGGCTTAGTCTAAC
AAGAAAATTTCAGTCTTTAAAATATATTCACTATTTACCGCAGTAGTATTTATTATTTGC
ATATATTTGCATAAAGAAAGAAGTGTTTTAAATTTAATACCCTTTCCTGTATTCATATTC
CTTTTCATTAATAAACATTACTTTCATTCTTGATAAGTTAACTTGGTATCACTTCCTGGC
TCTGGGAAGGGAAGAGTTCAGGACTACAAGCTTCAGTTTAGAACAATCCTGAACCACAAT
CCAGATACTGGAGTCCCCTCTTCCGTCTGGTAAAGAGGATGAAGTAATCTGCAGCTTTCT
GAGAGAAAGTACTGAGCCTTGCTTTACAGGAAGAGTTAAAGACTTAAAGGCTGGCAAAAA
ACCTTGAGTTTTGTAAGAATGGATAAAACTCTCCTTTTTGCCACTGTCATACAGAAACCT
AAGCAAGGCCCTGTCCCCTTTCTCTCTGAGCCAGGTGGTCTTTAATGCACAGACTTGAAA
AAGTTAATGAAATAAGAACTACTAGTAATCCAAAAATAAACTTAAATGCTCTGAGAACTG
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GTCACACATAAAGCTATTTCTACTAATGATGACATTAGTGAGAAGCAGGAAGAAGGAAAC
ATCAATCTTCTCACCACAATGCACCCATTTTTTCTGCTTTTCTCTTCCTTCCCCCGCCAA
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GTATTACCCTAGTGCTACGAGCCCCAAGTCAGACCAGGATCTCATTGTATCAGGTTCTGA
ACAAACACAGAAAAAAAAGTTAATCTTTGCCCCAAAAGTCTTATATGTAGTAGATAGAAT
AATAGAATTAGCAAGGTAGTTGAGCTTTGCTATCCAGTCATCATTAAAAAGATTTAAACT
ATTTCGATTTAATGCAAAGGAACATACATTTTAAATACAATCATATTTAACTACAGTGTG
TGCGCATGTGTAGGGGTTTAATAATGTATACAATTCAAAACAGTGTAAAATGCTCAGTAT
TGAGCTAATGTTATAATTTCTTTGAACTCCAGGGCATTCTGATACTCCCCATATTCATCA
GTATTCTTTCATTTTGTGATTGAGACATCCAGGACATGTATCCAAAGCACTAAAAGGCAT
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AGCCACACTCAAGCGTACAGGTTTAGAGCCCAACCCCACAGCTCCCTGACACTCTGTCAG
TGCTCTCTTCTGTTCCAGTTCATCTGTGAATTTCACGAACCCGTAACCTCTGCAGAGACA
TAAAAAAATTCACATAAAACCAACCCCAAAGTGCAATGCCACGTTATAAAAATTAGTTAC
AGTGAAGTTTGATTTGGTTTGGGAAAAAGTGTACAGAAATGTTCCTTAGGGTTGTTATCC
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ACACACGGTAAAGCCCCAAATCTTTGCTGGGAGGATACTGATATTCTCAAGAGCACAGCT
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GCAGAACTGCACGTCAGCCAGACAGAAAACTCCAACTCCCTCCAACCCCAACAATCCTTT
GCGTGGGCTTTTGATGCTGTAGTGAGTCAGAAGCAATGCAACAGCATCCAAGAGGGCAGT
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TGGGAGGGTAAGAGGAATCCATCTAAGCAAAGGAAGAAATTTGGGAGGGAAGGACTTGTC
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TGTGGGAACTGCTAAACACCAAGTAATGTGCTATTTTGAAAGCAGCATTACCTACTTCTC
ATGGGAGGTCCCCACCAGCAGCTATTTCAGAGCAGTTCATGCCCCAGAAAATGCAGTACC
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ACAGACCCACGTTCATTTAACTTGCCCTCTGCCAAAGGATTATGGCAAATTAATCCAGTG
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GCCAAAAGACTCCTGCAGATTTTCAGATGGGAGCAGGAGTGTGAAAGAGAAAGTGGGAAG
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GGTGCTGCAAGGGAGACAGTGATTCTTCCAAGTCTTCCAGACACTGATTCTTCCAACTCT
TCCAGACATTTAGCTGTTCTCCACCAATGGCTAAACCATTGGTGGGGAAAGAAATAATTT
CTTCCTGGCCAGGACCTCCCTACAGACCTTCTGTCGTGCCCCTGAAGTTTGGAAAAGCCT
CAGCACCTGTACCCTCAGCAGAAAGCAGAGAAGTAGGCACACCACCACAGCACCATGCTC
CAAGCTCCTCTCCTGTCTGGACAAGAGGGTCTGGGAGGAGGCCTTCCTGATCCACCAGCC
TTGGCTGGAAGGGCCAGGGCTTGTCTGCAAGCTCTAAGCTCCTCTCTCACATCACACTGA
CACCTGCAGATGTCTCAGCTTTGAGCAATTGCATAAGTCCCAACAAAGCCCCTGGCACCA
ACACTGTGGCACTGCCAGGGGAGACAGCTTTGCTCTTCCCAGAAACAGGACTTTAAGTCC
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GCACAGTTCCCAACCTGCAGCACCAACAACTGTTCTATAGACAGAGACTGAAGCAGGTGC
AGCACAACAGGAACTGTGAGGTTTACACTGAGGAGGAGCAGAAGGCACACAGAGCCAAAC
ACAGCAGTGTCAGTCCCAGGGGAGGTGGCAATGACAGCATGAGGACAAAATAGCCAGAGA
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GACCAGAGACCTCCAGAGATTCCTTCAAACCAACCTGTCTAAGATTAAGAAACCACATAT
CAGAAGGTGGAGGGACCTACAGCCATAGCCTATATCTTATCCCAACATTCTCACAGGTGT
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CTGCTCCTCCTTCCTCTGGAAAAAACAGGCTTAATTGGCATGGCTATTTAAAAAAAGGTT
TCATGAATGGGGGAGTGCAGCTCTGGAAACAGAGCTGCCCCAGACAGGATTGAATAACTC
TTTTGTGGGGAGATTTTTACAGGCTACACAATTAATGGATGATATGTTCTAGAGCAGGCT
ACAGTCCTGTTAGGAGCTAGACCAGAGACCTCCAGAGATTCGTTCAAACCAACCCGTCTA
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CCAACATTCTCACAGGTGTTATATTACAGAATTGTGCTTCACTGAAGCCATGTTTTGCTT
TGAAAACAAGGATGCTCACCAACTGCTCCTTCCTCTGGAAAATACAGCTTAATTGCATGC
TATTTAGAAAATGTTTTAATTACATTAAGAAATCCAACTTTTTGATAGCTGTTTTTGTCA
AGACATTTTCAGGAAAGACAAACAAGGCAGCTACTGAGAACCTGACAGTGAATCACAGCT
TTGTGTGCCCTACCCTGTTTGAAAGAAAACCTGTACAGCTATCACAGGAATATACACTCA
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GTCCAAAACAACTTTTCCACCTCTACATGATGGATAAACTTTAACAAAAAATTCATATAA
CATCCCATCATCCACGTCAGGAGTCAGGTCTCCCACAAAAAGGGAATATTCTGGACTAAA
GAAATCAAAAGTAAACGTCTTAAATACAATCAAAAGAAAAACAAAAGGGACATGCTGAGT
GACAGTTACCATTTAGCTTAAATATTTGAACTCAGAGAAGAGTGATATTAAAAGACCATG
TAATGGAGATGTTGAAGTGCCACCAGTTAAGCTGCTTAACTAAAATTTTGATTGACACTG
CTTTTTCAAGTTAATCCAAGCAGGACAACCAACCAACTGAATACTGCTTTTTCTTTAAAG
ATTATTTCAATGCTTATTACTCAGGATATCTCTGATTTCTAAAACGACAAGAAAAAATAT
CTCATTTATAGAGATGTTATTTCCAATACATAGATCTCAAATTATAATACATAGATCTTA
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TCCTTCTACTAAAGACTGGCAGTGATGAACTTTGGGTTTATATATTTTGAATAATTTTTG
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ACCTGTTATCAGGCTGTTTTCCATATGTTGCATAATTCAATTTAAATCGCTTCGCCTGAA
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TAAGATTCAAAATTAAAGGGTTCTGAAAGAACTACTACTACTGAAAGGACACTGGAGCGC
TCTTTAAATTTTGCATCTGAATTTATTTTTGAAACAAGTTTCCCAGCAGCCCAGATTTGT
GCCCTCTGGCACATCTGGAACACTCTGTCCCCAACCTACCATACTTTTAGCAACTTTTAC
CCAGCTTACATTTAAGTTTAGACCAAGATCTAAGAAGACCAAGATCTTTGAATCAGCTCT
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CTTGTATGATGGATTTAATTCCCTCAAAAACAGGTAAGTAATTATTGGGAAATAGAGCAC
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CTACACAACCTTCTGTGGATCATTTACAAGCTAACACAAAATTTAGATTCCCCTTTGAAG
CACTTAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATCTCACTCTTCACTGCAATATTCTGGC
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GCTTGGAAAAGAGAGACAGCACCAGCACCATGGCTCTCTGTTATTCCTTTGACTGATTCA
GTATTTAAAAATAAATAAAAGCATGTACCACACTCAAGTTTTCTGTAAACAAAATTCTTT
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CTCTGCCTGACATCTGTAATTCTCTCCGTGTGTTATGCAAATCATCCCTCCACACTGTTT
TGAACAAAACTGTGAAGTAAGATGGGTATTCCCAAAACCAAACTTCCATTGTTATCTTAC
TCCTTGCAAGAGCTGCTCTCTTTGTCTCTCCAGTGATTATACAAGGCATCCGGGATGATC
AGCTTGCCTTAATCATGAGAAAACACGTGAAACAGGTATCTCCAGGCCTCTCATCAACTC
CTTTTAACAGGGCATGTCACCCACTCAGGAACGCTGACTAAACAGCTCAATCTGAACTTC
CCAGTCTCCTACTCTGGGTATTAACTACTCTGAAACAGGAACCCATTTACCTTGTATATC
ACACCGTAACTGAGGTGATTCTAGAGCTGCTTTATGAATCAGTCACCCCAGCTACTGCAG
CCAACTCCTGTGGGTACAACAGACAGCTGTGTTAGCCGTCTCATTTTAATCTACCACATA
TTCGAGTCAACATCCTAAAATTAGCCTCTCTGCCTATTCCTCCTCTTCTCCCTAACTACC
CAGCTTTTATGTAGAGGAGAGAGTTATGCACTGCAATTATTCAATACTCTCTCTTGTTCT
CCACTGTAAAGAGGTTTGAGTAACTTCTCTTTGCTAAGGGCCAAGAACAATGCAAGATTA
ATAGTCATGTTTCTCTTGCCAGTGTTACTCAAAAGACAGTGTGAACTTGCAAGTTCATCC
TGTACACATGTAACAACAAACACAGCTAAAGTCTCAGGTTGCCTCATCCCTGAAAGTGTT
CAAAGCCTGGCTGGATGGGGCTTGGAGCAATTTGGTCTAGTGGAAGGTGTCCCTGCCTGT
GGTAGGGGATGAAATACGATAAGCTTTAAGCTCCCTTCCAACCCAAACCACTCTGTGACT
CCATGATTACACAAAAGGACAGAGATGGAAGAATTGTGGCAGACATACACTATACTCAGT
CAAATTTCTTCCTTGCTCTTCTCAGATTTCTGATTAGTCCAACTTTGGTAACAGCAGCAA
TGGTCAGATATAAAAAACATCCCACAACACTTCTACACCTGAATTTTATCTAGACAGTCA
CAAAGAAATCAGTGGTTTTTCTCAACAGTTTTCAGAGCAAGAACATTAACGGTTTTATAG
TCATAACTTGAGTTCTAAAGCAAAGAAGAATCCCAGCTTGCTAAGTATTCAATTTATCTG
TAATTATTAAAATACACATTCTACACTATCTGTCCCTTCCAAGTTTTGGTTCTCAACTGG
CTGATCCCATTTACTTACCGGTGTAGCACCAGGAAGTGGTTTTCCATTGATTTTGTGCAA
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