SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002682_2.0
Identity
TranscriptMethionine-R-sufoxide reductase 3 (SelR3)
SpeciesTetraodon nigroviridis (Tetraodon)
Transcript IDSPT00002682
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002589_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00002682_2.0 # Transcript # Methionine-R-sufoxide reductase 3 (SelR3) # Tetraodon (Tetraodon nigroviridis) # Full length # Forward
ATGTCAGGCTTCAGTCTGCTGCACCTTGTCTCCAAGAGCCAGCCTGGAGCTCTGAGTCCC
CGCAAGCGTCTCTCAGGTCTCTGTGTCAGCACGAGTTTAGCTGTTTTTTATTTTATATGT
TCTGCTGTGAAGCTGCACAAAACACATAAATCCAGTTTCTGCACAATAACAAAAAAACGA
CTTGGTTTGTTAAATTTGCCTGAAGAAACTGTACCACTAAATGGTCCATCTGGTGTTCAC
TTTACTAACACACCTCATCCTGAGTAAAACCTGCTTGACTGTGACCTTTGACCTTTGTTG
TTCAAACTCATATTACCTGCGACAGTCTTTTGCACCAGGATGTTTTCTTCTAGGAACCAT
CAGTACCGTTTTGTTAGTCCCATTTCTCCAACCCTTGGAAGTCGGCCTTTAGACAGTTTG
TAAAGCACAAATTATTGACACACAACAACAACATTTTTGTTATTTTGTAATAACATAAGT
GAACATATGATAAAGTATGTGAACCCTTTCAGCTAGAAGCCATAACATTAGCCAAACATC
TACTCTAGTCTCTATTTCAAGCTCTCACGCAGCTGTTGGAGGAACATCTGGCCTGTACCA
ACTGGTTTAGATCACCACCACCTTTCAGTTAGATTGAGGTCTGGACATAGGGCCAATCCA
GAGTACCAGTCCTCTATCTCTAGAATTCGGCTCATTGTCTTGTTGCACCTTTCACTTTGG
TTTCATCTTCGACTTCCGAGTTGTAACAAACACTCTTGATACAACTTAGACGCATCATCA
GTGTTGTATCCTGGGTTTAATGGGTGTTTTGGGTCTCACAACAGTCACCCTTGCCTAGGT
GGTCTAGCCGGGGTTGATCAGGCTCCGGCTTGTGTCTAAGTAGCTTATGGCCACAGATAC
TCTGCTTGATCCACAGCCATCTAGACACTTTTTTTTTTGCCTTGTCAGTGATGTCTCTGA
TGGCTTTTGTGTTCTGCAGTCCCTTGACTCCGAACATCTTGAGTGCCCTGATGAGAGATT
GGCCAACAAACCCTCTGCAACCGACCTTGATGGGGTTGCACCGAGTCTTCCATCCCCTGC
TTTGGCAGTCGCCTACCAGGTCCTCATACGTGACGCTTTTCCTTTCAAAGGCCTACTCCA
GTCTTTCCAAGGGACAGTCAGCTCGAGCAGGACTACTTGTCTCAGTGTCTCAAGACACTT
GGACTATGTTTGGCCTGAGTGTGTGGATGTTCTCTGGGAACTTGAGCTGTCTTCTTAGGT
TGACTGTCAGCTTCCAGTCCCGATCTGCTGCCAGCAGCCCCTCTGCTCAACTCTAGTCCT
TCTGTGGCATCTCCCCAGCCCTAACAAAGGCGATGGACTGCCTTGTAGGTTGTTGGTGTT
GGTTGATGGTGGGAGATTATGCTAAAGACAGCTGACAGGCACAAGACTTCAGAATTCCTC
TGATAATACCGAGTGGCCCAGGTCTGAATGTTAGGAAACAGGATGTTGAAAACTCAAATG
GCTTGTGTTTTCACAGGTGTGGCCTTAGTTTCTACAAGGACAACCAGCCACAGGGGCTCT
GGGGCAACTTTAGCTTCTCCAGGGGCAGCTTCCCCTTCTTGGGCTGCTACCTTATTGTGG
TGGAGGGGTTTGAGTGTCCCAATGATCCTGTTGTTGTCTGGGGCTTTATGCTCTTGGTAG
GACCACCCATGGCAAACAGGTTCTAAGTGAGGGACCAGACAACGTGCAGCCCATAAAACC
CCTTATGATGAAGAAAATTATTGGTCCTGAGGTTTTCTCGCCTGGACGTGGGTCACCGGG
CCCCCTCCTGAAGCCAAGTCTGGGGGAGGGGCAGGATGGCAAGTGCCTGGTGACCAGTCT
TTGTCCATGGGGTCTGGCCGGGCACAGCCCCGAAGAGTCAACATGAGACACTCCTCCAGT
GTTATCACCTGCAGGAGGGGCCAAAGGGGTCGGGTGCAGTGTTGGGTGGGAGCCAAAGGC
GGAGACATTGGTGGTCCGATTCCCGGCTGCAGAAACTAGCTGTAGGGATGTTAAATGTCA
CCACTATGATGGGGAATAAGTTTGAGCTAGTGCATGAGGTTAAGATATTTTGATGAGATA
TAGTCAGCCTCACCTTGACGCATAGCAAGGGTTCTGGAACCAGCCTTCTCAAGAGAGCTT
GGACTCTGGAGTTGCTGATGGTAAGAGGCAATGGGCAGGGGTGGCGATTCTTGCATTCTT
ATATGCACTTGGCACTAGGGCACCTTAGGTCACAGTTTGATGATCGACTTTGTGGTCTTG
TCATTTGCGACCGCATGTCCTGAACACTAGAGTAAAGAGAGTGGCGGAGCTGTTAACCAA
ATCAGCACCTTTAAATCTGAGGTCATGGTCCTCAACCGGTGAAAAGGTGAAATTGTGAGG
GGCTGGCTTGACGGCCCTCTTTGATTTTAGTGGTGTGCCATGTGTTCTCCCTGCAGAGGA
TGCAGGTTCCCAGGATCCAGCAGCGGCACTCCTGTCAACTCATCTTCTTGTAGCCTCCCT
GATTTAGGGAGGCTACAAGGATTCCTTAAGAAGAGGTCTGAATTCTGGTCTTCTGACACC
TTGCAGTGGAGCTTTCCCATGATGAGTTTGCGTTTAGTTTAGTTTAAGGAGTTTGATCAC
AGTTCTGTCCTCTAGTGTAGCGGATTCTGTTTTTTTGTTTTTTGTGTACCCAATAAAAGG
GTTTTATTGTTGTAGAGCGAATGCCTCATATCTGCTTTTGGGTCCTAAACAACCACTTCA
CTCACCACTTGGGCCTGCAACCTGACCTTGGTTAAGCAGAAGAGATTGAATGGATGGAGG
GGCAGCTTCTGTCTCAGGCTCAAGGTCAGCTTCTACCTAGGCAGCCTCAACTGTTACGGA
TGCAGCCTCAGCCAGGGGCTTTGGAGCCATTTTTGCTTTAGCTAAGGCAACCTTAGGCAC
AGGTTTAAGGATAGCCTCAGCTTAATGTTCAGGACCAGCTACAGTGTCTACTGGAGGGTT
GCAGACACAGTCTCTGGTGCAGTTCTTGTTTCTTCAAACTGTGTTTCTTTGGGTTTCTGC
AGCCTCTGAAAGAGCAGTTTCATTTATGGCTTTAGAGAGAGCCTCTGCCTTCTCGGGGAT
GACCTCAGTCCAGAGTTCTAGAGCAGCATTAGCTTTGACTGGGACATCCTTTACCTGGGG
CTCAGGAGCAGCTCTAGCTTTGAGAGAGACAGCAGCCCTTGCTGCTGTTCGTCTGCACTG
TCTTTGGGACCAGCGTGGGCTTCAGTGCAGCGGTCAGAACTGGTACGCCCCAGTCTGGAT
CTGAGGTGCCTCCCACCTCTTGCCCTCAGATGCCTTTTTTCCTAGACCTGGAGCTGTCAC
TGGAACCTCCTACCTCAGGGTCTCTAAGAGTTCTAAGTCTCTAAAAGTGTGTGTACCTGA
ACCCAGAGAGGCACCCAAACCATTTCTGCCCAGACACTGCACTGGAAAATTCATATGGAG
CAGTCAGTCAGGGGCCAGCAGGAAGTGGAGAGGCCACAGTCAAGTCAAGTCGTCAAGTCA
GGTTTATTGTCATTTCCAAACATATATAGCTGGTACAATATAAACTGAAAATGAAACGTT
TCTCCAGGACTTGGTGCTACAAAAGATAACATAGAGGCACAAAAGACAACAAGAGCTTCG
TACGAAGTAAAGGCGCTGCTGGGCTTTCCTGCTGATTTGAGTGGTGTTAAGAGACCAGGT
GAGGTTCTCCTCCAGATGAACACCAGGGAATCTCCTAAAGTTGACAATGATCTTGTGGTG
AATTTCTTCTGTTGTCAGCCGAGCTGAGGTGTGTTGACGAATGAAGGAAACGTCACGGAT
GCTGTGACTCGGGTTAAATAGATGTTTATTAGAGAAAGTCGGGCGTCCCTCGGGCGCTGC
AGCTTGCCCGTGAGAAGTTTCGAGGGTCGGATTGGTGAAACTCGCCCTGAGTTCCTCTAG
TGGTGGCTTTATATAGTGTAGAATAAGTAAGTAAACACATTCTTCTCAGATAACCGCATC
GGAACTTCCAACCATATAAGGTACAGAGTCCAGAGATTTAATGAGAGGAGAAGAGGAGAG
AGGAGGACATCATACATCAAAAGCTACTGGTACCTCCTATCTCCTGAATGATTCCGTAAC
TAAGAGCAAGCTGACCTCGTCCAAAGTTACAGAGAATAGAAACATTTTTTCAGACACTAC
AATTTCCTTTGTCTTGTTGACGTTCAGAGACACACCATGCAGTTAGCTGTTGCACCTCCT
CTCTGTATGCTGACTTGTCGTTATTGCTGATGAGACCCACCACGGTTGGGTCATCGGCGA
ACTTGATGTGATTAGGGCTGTGCATAGTGGCACAGTCGTGATTCAGCAGTGTAAACAGCA
GGGGACTGAGAATGCAGTGCTGCTCAGTGTAGTGGTGCTGCACACGCACATACACTTCCG
CAGTCATCCACGGTTTCTGGTTGGAGCGCGTGGTGATGGTCTTGGAGACAGTCACGTTGT
TGATGCACTTGCTGTTGTAGCCGATCACTGACATCATGTACTCCTCCAAGTTAACCGAAT
TGTCGTTGGTTTCAGCCTCCGTAAACATGACCCAGTCAGTGCCCTCAAAACAGTTCTGGA
AAGCTGAAATGGCCAGGTGTTTACCTGCTTTAGAACTGTTTTAGATCATCTGACAATTGG
TCTGTATGCAGGAATTAGCATGACTGTGATGTGATCTGAGTATCCAAGATAGGGATGGAG
CTTTGTGTGGTATGCGCTGGCAATGTTTGTGTAAACAATATCCAGCATGTTTTTCCCTCT
TGCTGCAAAGTACAGATGCTGATGGAATTTAGGGAGAACTGACTTGAGATTTGCATGGTT
GAAATCTCCAGCAGTAGTAAACAGTCCGTCAGGGTGAGCATTCTATAGATTGCTAACAGC
CCTGTGGAGTACACATAAAGCTTTAGCATTAGCACTGGGAGGAATGTAAGCCCTGATGAT
GAATAATGTTGTGAATTCCTGTGGTAAATGAAACGGTCTACATCTAACAGTCACAAATTT
CAAAAGCAATGAGCAGTGTTTAGAAACTAACACAGAGTGTACACCATGTTTACATAAACA
CACGCGCCACCCCCATGAGTCCTACCGCACAGAGCTTTGTTTCTGTCGGCACAAAACCTC
ACTAGCCCATCTAGCTAATGGTGGCACTCTGTCACTTAGCCATGATTTTTTGAAAACAGA
GACGCAACAATCTCTAAACTCTCACCGATTGGACTGTTGGAGTTGGATGTAGTCCAGTTT
GTTATCCAGGGAGCAGACATTGGAAAGAGTGATGGATGGGAGAGCTAGCTGGCTAGGGTT
TGTTATTAGCCTAGCATGGATACCCACTCGCTTGCCTCGTTTTTGTTTCCTTGCACACCG
TTTAACGTCATCCCATCTCCTGGTCCGTCCGGCATGGACCGGCATTAGGCGACACCAAGG
GTTGGAGTCCTGGTCTCCGAAGGTATTTTAGCCCGCCATTTGTGTCGGGCTAAAATACAC
AAATAGCACCATTTTCTATCCGGAGAGGCTGCTGCGTGCTACTACCGCGCCACCATCTAA
TCACACATCTAAGCGGGGTTCCCAAGTGGAGACATTACAGCAGTACTCCACTGCGGTAAC
ATCTGTAGAAGAGCTTGAGGCTGGTTCAGGTGTGGGGCAGCGAGGTACCTAAAAAAACAG
AAATCTGGCGGGACGACTGGGATATAAGAAATTGGGGCTACCTCCTGCCTGAGTCCTTTT
TCTTTTCCACTAAGATAGCACAGATAGAGAGAAATCCAATTTACGTACAGTCTCTCTGTC
TTCACTTGTGCTCCACTGCCCCGCCATTTGTCACTCATGAAGGCAAAGCTGGATCAAGCA
CAGGCATCATAATGGCCCTTCAAAAGCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
GCGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGCACGCACACGTGTGTGCTTTTTTAACTTAAAGTATGA
GAGTAACTTTCAGGTCTAAAAATCTAATCTGATTTTAATCCAAAATTGTTGATAGATTTC
CTCCACCTTGTGTTACTCTTTAGGAGTTAGCGGGACTAAGAAGACACAAGTGAAAAGCTT
CTCCCAGGAGGACTTGAAGAAACGTCTCACACCACTGCAGTACCGAGTTACACAGGACAA
AGGAACCGAGAGGTCAGGCAAACCAATCATAAGGTCATGTCTGTTCAGGCTCTCGTACAT
CTTTTGTATTGTGCGAAGTGGACTAATTGTTGGTGGAGCGTAGTCAGACTGAAAAGATTC
CATCTGTGTGAAGGCTAATCTAAAAGTAGTTAGCTCATAATGCAATCAATCATATTCCTC
AAGAGATGACATAAGTGCTGTAGGACACTGACTTAAAAAGTACCCTGGAGAACCCTTAAA
GGACTCACCCCAGGAAACGTTGTACCTCTTTTAATCTAAATAACATCTAAAACACGATCA
AGTGAAATGCCCCATATTTTACATTTATAAAGGGCAAAATGTTGAATGGACAGGGTTGTT
CAGTGTACACTGTTACATGTGCTTGTTTGCAGACTTTTAATAGATTGGGCTCCTCTTATC
AAACCCACAAAGCTTCTCAAAACATCTTTTTCTTTTCGTTGTTCTAAAAAAAGGAAATAA
TTGCAATAATTTGTAGGGAAATGTGTGCACCCAGCAGCCAGCTAGTTGTTCTTGAGCTAT
GCGCATTTCTCATATTGTGCCTCTGTTGCAGGAATTTGTTTAGCCTTACCTAGATAGAAG
AACTTAGAAGACACCTGCTTGCGTGTTTGTGTCAAAAAGTGACACAGAGCATGTAGTAAA
TATCTGCTGAGACTCGTGATAATCATAATCATGTATAATCACCATAACTGTGTAGAATTG
TATATGAACATGTAACTGTAATAGGAGACCATGCACTAACCACCTACGCTTACGTCACTA
TCTCATGACTTTTACGTCACTGTCAGATACGCCTACTGGGTGTGGTCATGTATTCAAAAG
GTCTGTTTACGGAAAGAGAAGTGCTCTTCTCCTGCAGCAGCCATCATGAGAGTGATGGCC
AAGGTTGGTAGAAGAGTCCACAATTGTGTAATAAATCTTGCTTTACAGATCTGATTTCCT
GTTTGACTTCACGCCCGGACAAAATATACAACAAGCACCAGAGGCTGTCTTTTTTCAAAA
AACGTCGCCCAGAATTTTTTGAAAAAATAAAAAACCCATTGAAATTGAATTAGAAGAATA
TAAAAAAAACAGGGCAGAAACATAGTGGCATATCAAAACCCAAAATGGAGCAGAAGTCGC
TGTTGCCTGCCTCTGGTCTCCAGAGATGCCCCCAAAACACTTAGCCGAGACTATGGCACC
GCTCCGGACTTGGGATGCCATCTTCTGTGCTCCCCCTGGCTGCTGACACCCTGCTTTTTT
GTACCCCTGAGAGCCTCACCGCCGCATAAAGCTTACAGTTATCATTCTTCTACACTGTCC
TAGAACAGTGTCTCTCTGTCTCTCTTTCCCCAAAGACATGGAGTGCCGAGGCCCCAGATA
GCATGTGATTTAGAGAGGCACAACCTGACCTGTTAGCAAACTTCAGGCATATACATACAC
TCCACTTGTTGTTGCTCAGCTTCTGTATGAAACATCAGCTGCTTGGGTGATGTTTTGGCA
TACATAATGTACCCTTTTGGCAGTAGACTCTTTGTTGGACTTTGTTCAGTACCTCACAAG
GTTCAGCAGGTTGTTGATGACCCTAATAAATGATCATTCTCAGATTACTTTTTGGTTGTA
CAAGATAAGGACATGAGATGATCAGATGGTTAAGGCTTAAGCTTGGGCAACTCAAGGTTT
TGACTGTGACGATGAACTTTTCCCTCTTCACTCTTGCTGTCCTTGGTTTTGTTTATTTTT
TTTGAATTTGTTGTATTTCTCTCAGCTGAGACATTATTGCTGTGGAACCCTCTCAGAGCT
GAGAAACAATTTACTGTCCTATGTGCTTGATGATGAAAATCTTCTTCCCACAGTGCGTTC
TCTGGGGAATTTACTCATCATAAAGATGAAGGCACCTATGCGTGCGTTGTCTGCGCAGCT
CCTTTGTTCAGGTAAGATCAGGTTAAAGCAAAAGAGTCACGCTTGTTTTACCCCAAAACT
ATACACCACTGGGGCAAGATTATAAATCACGAACGACAATGCTCTTATAACTGCACATCC
CTTGCACCTTGCACTGTAGCCGGGGCTTTATTTTATCTTATGTACTTGTCCTGCAGCGTG
ATGTTACATGTTTGTCGCACTTGTCATATGTAGCTCTATGTTGTCCTTATGTAGCCCTGT
TGTCCTAACCCTAGCACCAAGTCCTGGAGAATTGTTGTTTCGTTTTCAATAAGTATTGCA
CCAGCTAAATATGTTTGAAAATGACAATAAAGCTCTCTTGACTTGACTTGACTTGACTTG
ACATGAATTTTGAGGTTTGTCTCCAATGTCTGCATTTGGAGGCAAATCTCACTGCCTTTG
TCATGTTTTGTGTTTCAATATGAAAATAACACTGAAGTAATATGAAGCAAAAAAAAAAAA
GCTAATTTAACTTTTTTTATTTTTATTTTCCCTCAGCTCACATGCAAAATTTAACTCTGG
ATCAGGTAACGTTTTGTCACCCCCCACCACAACACCCTTGAACAACAACTCAATCTACCT
CCACCTTTTAGCACTATGCCTTCCCTCTGAACTCTCACCTCTCATTCACCCAGATCATAG
TTGTCTAGTTAACTGGACATGTTAAGTTTTCTTTAAAGATATTTTGCATTCCTCTTAAAT
TTTAAACTTGCTAAGTGGAGAACTTCTAAATATAGCCCTTGTGGACCAGTAGCGTGCTAA
TGGTCTGGGTCTGCTGGATCACATGGTTATGAGTCACCAGGTCTCATGAATGATTTGAAC
TTTTGGACTGCTGACAGCTCAATACAGAGGTGCGCCATCTCCAGTATGTGTACTGGTCAG
AGAAGATCACTGATTTGAGAGGGGTGTCAGGAAAGCAATTTATGTCCATTTGGAAAAACA
ATCCTTAAACAGTGGTGGTGGCCTAAGGCACTTTTTATCACCAATGTGCAATGCAGTCCA
ACACTCTTTCCGTCAACAATCCAAAAGTTCACACATTTCACACATTATCGTGTGACCCAG
CAGACAAAGGGGAAGCACCCAAACTCAAACTAGCTGAATGACCCTGCCACAACTCTGCCA
ATGACTCTCAGGTGATCACCCAGATCATTAGCACGCTAATGATCCACAAAGGCTGTTTTT
TTACGCTGTCTTCAATGAGTTCAGAACTAAAAAAACCTACTGAAAAGAAGGAAAAACGTC
TCAGAGAAAACCTCAACAAGTCCAGGTAAACAGAGAGATCTAACCTTAGATGCCACCAAT
TATGTATCTATTTGTACAGTAACATTTCAATCAGTTATAATTTGTGTTCTTTTTGTTCTT
ATCATTAAAAACATGACATCTTTGGACTCAGTCCGCAGTACACTATTATCATGTTTTTTA
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GTGCTGTTGTTTGTTTAGGTTGGCCTTCTTTCTCTGACCTGCTGAAGAAGGACTCCATCA
CTGAGTCAGATGATTTCTCCATAGGCATACACAGGCTGGAGGTGGCCTGCAGCCAGGTAA
ACTGTATTAATCTATAATAATAGAAGACTTTATTATTTTATCGATTTACATGCACACTTC
TCTCAATTTCTCTCGCTCTACTTTTAATTTTCTTTCTACTCTTTCTCTCTCAGATGATTT
AACTTAGGTATCAGTTCCATGTTATTTTCCATTTTTTAAGTGATGTCCCCAAGTCTGGTT
TTTTTAGCCGCATAGAAACCCCAACACTTGAATGTTGGTTTGTTTGTGTCAACAAAGAAT
ATGCGATAACCAGGAAGCAGTTAGAATGCCTTCACAGCCACTCTGTTGTATATTAAACAC
TATATGTACAGTCATATGCACCTATAGTAGACAGTATAACTGTTGTGTACATTGTTAGGT
TAACAGTCATTTTCATTGTTGTTTCAGTGTGGAGCTCATCTCGGCCACCTGTTTGATGAT
GGACCAAAGCCCACAGGAAACCGCTATTGCATTAACTCTGCTTCCCTGTCTTTTCAACCC
AAGCAG
Chart Advanced