SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002852_2.0
Identity
TranscripttRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43)
SpeciesVicugna pacos (Alpaca)
Transcript IDSPT00002852
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002759_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00002852_2.0 # Transcript # tRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43) # Alpaca (Vicugna pacos) # Full length # Forward
ATCCCAGCTGGCTACTGCTTTGTAGAATTCGCAGATTTGGCCACAGCTGAGAAGTGTTTG
CATAAAATCAATGGGAAACCCCTTCCAGGAGCCACACCTGTAAGGACATTCAGATAATCA
TGAAGTTGCCATTTTTATTGTCATTGATAACTGTCATTTATTGAGTCCCTACTGTATACT
TACTGTATTTAATCCTATCACAACACTGAACAGTAGGCATTGTTATCTTTGACAGACCAG
GAAACTGAAGCTCAGGGAAATGGAATAACTTGCCCAAGGCAACACAGGTAGTGGCAGAGC
CAGGATGCAGACTAAAGATTGGTTGCCTCTAAAATCCATGCCCTTTCCACTCTGCACCGC
TGCCTCCCTTAATGGAAGACTTGAAACTCTAGACCGCTTGCTTGATTGAGAAAGTAGAAC
AGGCTGGCAGCAGTAAGGACACGTTTCAAGAGAGTTACATTCTGCTCTTCCCACAGTTAC
TTAGCTTACAGCTGCACCGCGCTGGCACACCTGGGCTCATAGAACCATGGAGCTGGCAGT
GCCCTTAGCGGTCATCCGTGCAACCCCCTCATTTTATACAGGAGAAAAAGCTGAGGCTTA
GAAAGGGGGAGATGTTTTGGCCAAGGTAATTTATTTCAGTTTTTTTCAAATATTGTTTGA
CTCTTGAAACACCTTTCTCTGTTTTAGTTTGTTTGTTTTTAAATTCCCAGGCAAAACGTT
TTAAACTGAACTATGCCACTTATGGGAAACAACCAGACAACAGGTAAGTACAGAGTAGCC
CTAAGTTAGCTTCAAGCCCCAGGAAATGTCTAGATAGAGACAAGATGTGTCACTGTGTCT
GTCATTCCCAAAGAGGGAGATGGGGAGCTGAGTTTGGCCCCATTTTACCTCCCTTCTGAA
AGATGACATCCCCCACACCCATTGGTGGACCCCTCCCAGGATGCTTCTTGTCAAGTCCCA
TGTCGTTCTATATTTGGTCCCTCCGCCAGCCCCGTTACTGCCCACAGTACTGGTATTTTA
TTAGTAAGAACTGACCTGTTGTAGCAACATAAATTGATTAGCATTTAGATCGCTATTGGA
AAGGTTTAACAATGTATCAAATGCTTTAAATAGATTTGTGGCCATTGAACTTGTCATTCT
ACTTTTCAGAACTTATTCGTGGATGTGTATAAAGATTAACATCAAGAGTGTTCATTGACA
TATTACAATATTCGACATAGTCTACTTCCACACAAAATAAAAATTAAAAAGAATAATATT
CTGGGGGGAGGGTGCATGGTGGTAGAGTGCATGCGACAGAGGCCAGAGGTGTCCCCACAA
AGCCTAAAATATTTACTATCTGGCCCTTCACAGAAAAAGTTTCTGTGAAGTTACTGACCT
CTGTCCTCAAAGTTGAGAGATTTCATTTTAGCTCATCTTTAGGAGAGAAGGTCCAGTTAT
TCTCTCTGTCTTTCACCATTTGAATTAAAAATAGACAGAATATCTGGTTTTATCCTTTGA
GCACCTCTAGCCCTGCCCTCTATCTGCACTCCTGTAATGCTTGAAGCTAGAAAGGCTTTA
TTCAGTGGGTGAGGGATTTGGGACAGGGGACTCCTTCCGTAACTCTTCTGCCAGGACTGC
CAAGTGAAACAAATTAGGACCCATCAGAGGTTGTTCTCTAAGAAGACCTAGAAAAGATTT
ACTAGAATGGGCTAAGAGCAAAAGTTTTGTTCTTTGTCTCTGAATTTCGCTTTCTCTTCT
TAGCCCCGAGTACTCCCTCTTTGTGGGGGACCTGACCCCAGATGTGGATGATGGCATGCT
GTATGAATTCTTTGTCAAGGTCTACCCCTCCTGTCGGGGAGGCAAGGTGGTTTTGGACCA
GACAGGCGTGTCTAAGTAAGGCCTTACCTGTTGATTGATGCCTACCCTGTTGGTTGCAGC
ATTTTTCCCAGAAAAGGGGATGGTGTAGTGAGGCCATGCTGCACGGTGGTTAAGAGCACA
GGCTTTGGAGCCAAACTGCCTGGTGTGAATCCCAGCTTCAGTGCTGCCCAGGGCTTATGC
CACAGACGAGTAACTGAACCTCTGACCCTGTTTCCTCATCTGTGAAATGGGACTGATCAG
TAGTATCTGTATCTCTCAGGGGGTGGCATAAGGATTAAGTGATGTAATATAAATAAAGCA
ATAGGAAATGCTTTTTAGGTGTTTCCTCTTTTATTTATTATTGTTACTTTAGAAGTAGAA
AGACCTCACGAGAGGGTCATTCTTGATCTGAGTTGTAGTTATGAGCTTGAGCTTTGAATT
TGAATCCTGCTTCCACTATGACTTTGGGCAAGTTAGTAAACCTCTCTGAACTTTGATTCT
GTCTTCACTAAAATGTGGGTACCCCCTTCATCAAGCTGTGGGATAGTTCGGTGAGTTAAC
CATGGAAAGATGCTCAGCACAGATGAAAGAAATGCTCATTGAGTGTTAGCCATCATTCAT
TTATCCCCCAAGTAGAATGTGAGTTCAGGAGAACAGAACCTCATCTGCTTGTAATTGCTG
AGTCCCAGGGCCAGGTGTAACACCTGGCACACAGGGCAGACTTGGTAAATATTTGCTGAC
TGACCTTCTGTGACTGTTACTGCTACTGCTCCTACTAGTATTTGCCGGTAGATGGGAGGG
AAGCTACTATTTGGGAAAAAGCCCCATCAAGACAGCATGAAGGAGACTGGTGAAGTGAAA
GTCGGGGTTCCTAGAGATCTCAGGATCCTCCTGTGCCTGAATCTAGGGTAGCTCTATGGC
ACCCCTCCACTGATGGGGCTCTCACACGTCGTTTGATAGACTCTCTCCCTTCTCAGCCCC
TTTCCCAGTCTTAGACTTTACCTTCATCACATTTGTGTTCTAAATAGTGTGGGTTGTTTA
TTTTTCCCCCTGCAGGGGCTATGGTTTTGTGAAATTCACAGATGAACTGGAACAGAAGCG
AGCCCTGACAGAGTGCCAGGGAGCAGTAGGCCTGGGGTCTAAACCAGTGCGGCTGAGCGT
GGCGATCCCTAAAGCGTGAGTCCTGCACTGCTGGGGAGCAGAGGCCTCTGGACCGACCCC
CACCTGCATGCGCCTTGTCTGTTGTTGATAATCAGGGCATCGCCTATGTGCTGAATGGGA
GGCTGCCAGGAGATTCAGTTCAGACTGCAAATCATGAGTGCCTGATACTTGTCAGGCTGT
GTGCTGGGTGTTAGGGAGGAACTAATATAACCTTGCCCCTCCAGAAGTTTCTGGTTAAGG
AGAGAGCTCTAACTGGGGAAAGCAGATACATTCAGACGTCACTGGTAGCAATGCTGGAAA
AGCAGTTTGGCTGCACACAGTTACTGTCTCTGCTCTTTGCCCAGTAGTGCTGCTGTTAAA
AATTTATCCACGGAATTCATAAGAACTGAGCAGACAAAAATTACATCCAGTTTTAGCCTT
ATTTATATCAGTGAAACCTATGAAGCTCCAATGTGGTGGAATGCTATGGGAATGGCTAAG
AATTAATGCTCCAAACAGAACGGAATTTGTTTTTCATATTTTTTTCTATTTTTATATTTT
AATATAATTCATAAAACAGTGCTTGTATAAAAATTCACACAAAGTTGCTAGAAAACAGAA
TTTCCAAAAATGTCCTGGGTTTTTGTTACACTGAGTTTTCTAATGATGCACTCCACAATA
GACTATTAATACATCACTGTTACCTGTCACACTAGGCTGAAAACCCTCCGTCCCTTACAA
CACCAAGCAGGTTTTTCACTCAGATGTAAGACAGACTTTCTTTGCACAGAATCTTCCATT
CTTTGGCCCAAGCATTGGTTCTCAGCAGGGGACATTAGCAACACCTGGAGACAGTTTAAG
TTGTCACAACTTGGGGGAGGGCTACGACTGGCATCTAGTGAGTAGAGGCCAGGGATGCGA
CTGAACATCTTACAGTGCACAGGACAGTCCCCATGACAAAGAATGACCTGCTGCCACCCC
CAACAGTCAATTTTGCAAAGACTGAGAAACTGCCTGTTACAAGTAGAGGAGTGGCTGCAC
TCTTAGGGCAGGGCTTCCAACTGATCTTGGTTTTTAAAGCAGCAAAAGATTTGGAGGATT
TTTGCAGTTTAACCATGTTTTTTAATACAGCCTGAGTACTTCCTCCCCTCTCCAAATGTT
GTTTGTTCTCAACTCTATTCTATGTATAAAAACATTATAAAGAAAACATTTAGAAGAGAG
AAATTTCCTCATTACCCTAAGATGACTAATTAAAAGTTCTGAGTTCCTTTCCAAGCTTCT
CCATAAACTTCTGTGATGTATAGATGTAGATATAGACATGGGCATGGACACGCACACACT
TCATGTGGATCAGTTAACATGTGGTGGATTAATTTCTTTATTCATTTTTAATTATAATAA
CAGTGCTTATTCTTCTCTCCCCCCAGCTTACTCAGTGTACACACTCACTTTGCCATCTAG
TTGGACAGCTGTCATCATTATAATATTTTTTAACAGCTGCAGGATGTTCTTTTGATTGTA
TATTCTGTCTAGCAGCCTCTGATGTTGACTGTTACGGCTGTTTCTGATGTGTCACCATTG
TTCAGTCAATGATAACTGAGTTCCTATAACTCTGCAGGCCCTGTCCTGGACTTTGAAATT
ATAGCTGTAAATAAGAAACAAAGTCCTTTCTGCAGGGAGGTTATATTCTGTTATATTTGT
TTCTTCATTGAACATTGTCATCAGTATTTGATGCCTGCCTCTGGGGAGGTGCCCTCAAGC
ACTAGAAATTGAGGCTGATAAGGTAAGAGTCCCCTTTGAGAGTTAGACTGTAGGACCTGA
GTGTGGAGAAACAGAAGAGAAATGTACCTTCAGTGGCCTGAACATATCAGGAGGGGGACA
GACTCCTTGGACACGTGGAGGTGGAGTCATGGAAACGAATATTAGCAGTTTCCAGCCTTG
TGCTGGCCGGGGAGAGGGAATCTGCCATCAGACTTCATCGAGCCACCCCATTGGGAGGTG
ATGCAAACGCAGTCAGATGTGGAGTCTTTCTGACTGTTCTGAGTCCTGCTCACCAAGCAG
ACATTGAACTCATGAGGAATTTGGGAAGAGCTCACCACGCCTGATTTTTTATGTTTTTGA
AAGCAGTAGATCCTTTGCAAGCTTGACATTCTAGTTTTGGTTAGCAGTGGCTGGAATCAC
TGTGCAATCGGATAAGAAAGCTTTCTACTGACCCTGGGCCTCAGCCCTGATTGGTGAAGG
CAGGATGTGGGACACTGGCAAGCTGTCTTGAGTCTGTCGGTGCCGGGGCAGTGTGTATGG
TGTGGTAGGAGTGTGAGCCCTGGAGTTAAAATTGGTTCTAGTTGTAGCTGTGGTCTTGGG
TAAATCACTTAACCTTTCAGAGAAGTTCAGTGTTCTTATCTGTATATGGGAATAATAAAT
AATAGCTCTATCATAGGGTTGTACAGAACTTAAAATAAGAGACCATGTATGACAAATAAT
GGGCACAAGTCCCAAGTACCTACTCCATAAATGGTCGCTATGACTACAGCTCCAGTCTAC
TGGAATGCTGCTTTTTTTTTCCCCCTTTTTTTGAGGAGAAGAGGTGATTAGATATTTTGT
AGTTTGAAATGCTTCTTAGATCATCCTAAATCCAGATTCTCCAGGCCATGTTCACCTGAG
CCTTTGTGGCTGGCAGAAAAACAGCCCCCCAAGATCTTGAGAAGGGGAGAAGTCAGTACT
GACAAGGTTTGATTAGAGAGACAAACCTAATGATTGAAAGCTCTTGTCTTTAAAGCTGGA
CTCTGGGACCAGACTGCCTGGGTTTGAATCTCTTATTAGCTGTGTGACTTTGGACAAATT
ATGTAAGCTCTCTGTACCTCACTTTCCTCATCTGTAAAATAGGAATAATGGTATAGTTAC
TGCATAGCAGTATTGTGGGGATTAACTGAGTTAATCTGCTTAAAGCACTTAGAACAGTCT
CAGGTCACATAGTGTTATGGAAATGTTTGCTTACACTTGTTTGTTGACTTTTCTGTCTTC
ATTTAAGGAGTCGTGTGAAGCCAGTGGAATATAGTCAGATGTACAGTTACAGCTACAACC
AGTACTACCAGCAGTACCAGAACTACTATGCCCAGTGGGGCTATGACCAGAACACAGGCA
GCTACAGCTATAGTTACCCCCAGTACGGCTATACTCAGAGCACCATGCAGGTAACCGTGA
TCTGGCCAGTCTGGCCCTCTTGGGTTACATCATCCTGTAGAGACATGAATCACATTCTCC
AGGAAGGGATGGGTAAGGACGGGAGCTTGGGCTTCAGGAAAAACTGGGGGAAAGATGAAG
CAACCTAGTTCCTCTTGTTCAAAGTACACCATCTTTGGGGGGAGGGTATAGCTTAGTGGT
AAAGCGCGTGCTTTAGCACGGACGAGGTCCTGGGTTCAACTGCTTAAATAAACCTAATTA
TCTCCCCCACCATCAACAAAACAAAACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNCTGAAGCTCCAATGTGGTGGAATTCGCACGGACGAGGTCCTGGGTTCAACTG
AAATAAATAAACCTAGTTATCTCCCCCACCATCAACAAAACAAAACAAAACACCATCTTA
GTCACGGGCTGGGATTTCACTATGCTTCTCACGCACCTCTCTGGTCTCTTGGCAGACATA
TGAAGAAGTCGGAGATGATGCATTAGAAGGTAAGAAAGAAGTCCCTTCACTCAGTTCACA
CATCATTACAGTAAGATGTGTCACTTGAGGTGGAAGTGCAGCTCCCAAAGAGCCTGGGGT
GGGGGGTTTCGCTGACAGGGGAGGGAGCCTGTCACTCCCTAGATGTGTGGCATTCTACCC
CAGGATGTAGGTCTGTGGCAAAAATACCATTGCCTTATATTTTTTTCAGTTTGTAAAATT
CATTTTTCATGTTTTAATTTTTTCCCTTTTTTTTTTTTTTTTGGACGGGGAGGTAATTAG
GTTTATTTATTTATTTAACGGCGGTACTGGGGATTGAACCCAGGACCTTGTACTTGCTGG
GCATGTGCTCTACCACTGAGCTATACCCTCCCCCTTCCATCTGTTTTAAATTACATGATT
TTCTCATTCAAGTAACAGTTACGATTGAAAATTTGGAAAATACAGTAAAGTATTATGAAG
AAACTGAAAATCACAAGTATTTATTACCATTTTTACTGAATTTAACTAAAGAAAAAGAAA
GAAAAGTAAAACCGAAAGAATTGCTAACCTTCAGACAAATGTTTTTCCAGATGAGATATT
CATACATCTTAAAGGATTCACTAAGGTTTGGAAAAACTATAAAAACCGATTAAAAGTTTT
TTTCACCGTGTTTCTGGACAGATGTTAAGTCTTAAAGAAGTAAAATAACAGTTGTCATAA
AATCAGACATTATTGATTTCTGTGTACATAAAACTTCAAGGTAAAAGCCTCAAAGTTTAA
AATCTATTTTAAGAATTACTCTTCAAGAGGTCACAGGGAAAGTGTGATCTGTAAGCAAAT
ATCCTTTAAAGAAACATCACCTGCAAAGAACAGACTTTCTGCTTTGTAGCATTTTAAAGC
ACTTCCACATACATGCTGTCTTCTGATTCTAACAGCCGTGACCTTGGGGAGTGGGCAGGG
CAAGATACAGGAGCTCTAGTTGACAGATGGGGAGCTGGCCATCACTTCATCTGCTCAGGG
TTCCACTGTGAGTTAGGAGCAAGGGTGGACCTTGGTAAGCAGACTCAGCCAGAGCCATTT
GGCAGTCTTTCCGTATCCTCACCAATAGTTACTATTTTACATTTTAACCATCCTGGTATG
TATCTCATTCTGGTTTTTATTTGCATTTCCCTGATGGTTAATGATGTTGAGTGTCTTTTC
ATTCATGTTTATTGGCCATGTGTTTGGAGAAATGTCTATTCTTTTGCCCATTTTCAAATT
GGGTTGTCTTTTTATTGTTGAATTATGAGAATTCTTTATATTCTATTCTGTATACTAGTC
ACTTATCAGATATATGATTTGGAAATTACTTCTCCAGTTCTATGAATTATCTTTTCACTT
TCTTGATAATACCCTTGGAAGCACAAAAGTTTTTAATTTATATGAAGTCCACTTATTTTT
TCTTTTGGGGTCATAGTGTCATATCTAAGAAACCATTGCCTGTTTATACCTGTTCCCTTC
TGAGACTTTTTTCCTTTATTTTTTGGTTTTTGGTTTTTTTGTTTTTGTTGAGTTGTTGAT
TTATGGTTTTACATTTAGGACTTTGATCCATTTTTAGTTAACTTTTGTATAAGTTGTGAT
GTAGGGTCTCACTTCATTCTTTTGCGTGTAGTTACCCAGTTGTCCTGGCACCATTTGTTG
AAAAGGTTATTCTTTACTAATTGAGTTGTCTTCATACCCTTGTTGAATATCAATATACTC
TAAATGTATGGGTTTAGTTTTGGATTCTTAATCTTTTCCACTGATCTGTATGTCTGTGCT
TAGGCTACTGCCACAGCCTGTTACTGTAGCTTTAGTAAGTTTTGAGATGGGAAAATGTGA
GTCCTTGAACTTTGAAGATCGTTTTGGCTATTCTGGGTGCCTTGTATTTCCATATAAATT
TTATGATCAGCCTGTCGATTTATGAAAAAAAAAAGCAGCTGTGATTTTGATAGGGATTGC
ATTGACTCTGTAGATTAATTGGGGGAATATATTGCCATCTTAATGCAGATCTTCCTTGAC
TTACTATGTATGTCCCGATAAAGCCATCATAAGTTGACAATAACGTTAAATTAAAAATGC
ATTTAATACACCTAACCTACTGAACATTATAGTTTAGCCTGGCTTAAACATGCTCAGATC
AGTTAGCATTTACCTACAGTTGGGCAAAATCATCTAACATAAACCCTGTTTTATTAGTGT
TGATTATCTCATTAATTGGAGCAGTTCAAGGGTATCAGTTGTTTACCTGCCTGACCACGT
GGCTGACTGGGAGCTGCTGCCGCCCAGCGTCACTTGAGTGTAGTTACCACGTATCGCAGC
CTGGGAAACCATCAAAATTCCAAAGACAGTTTCTAACTGATGTGTATCACTTTTGTACCA
TTGTAAAGTCGAAAAATCTTAAGATGAACCATCGTAAATCGAGGACCATCTGTATTTGTC
TTCAAGTACAAGGGATGTGTTCATATTTTATTAAGGTCTTCTTCAATTTCTCCAGTTAAT
TTTAAATTGTTTCCATGAATGGGTGTGCGTGCATTTTAAACCAGCAAGATTAAAAGGAAA
ATATAAAGTGTTATCAGTCATAGTAGTTAAGGAATTTTTAAAATTTTAATTGTGAAATAT
AAACACTTGGAAAAGTACAGACAAAAAATGTAGTTTAACATGTAGTTACAAAATGCCCAT
GAAACCTTCATTCCGGTCAAGTAAAATATTGCCAGTCTCCTTCCCCAAGTCACAACCCAC
AATCCCACTAGGGAAAACTGTTGTTTTATAGTAACAAACCTTCCTTTTCTTTATAGGTTT
ATCATACATATGCATCCCTGAGCAGTATGGTTTAGTTTTGCCTGTTTTTGAGCTTTCTGT
AATGCAGTTGTGCTGAATGTACTGGCTTGCTTCTTTCATTCAACACTCACAGCATTTTGT
GTGATTCTTCCAAGTTGGATGTGGCTGAGGTTCATTTTCAGTGCTCTGTAATAGTCTCTT
CTAAGAAGTTTACTTGTTCTGGGTTTATTAAAAATACTATCATGTTATTTTGTCATTATT
TAACAAATACCACTTTTGCAATCAAAGTTTACATCAGGACTTGACCGTAACTCCTTCATT
AGACAGTCACTGTTAGTTCGTGATTTAGTCATTTTGATCAACTTCCTAAGCACAAATTTG
AAAGGACCACACCAGAAAATCCAGGCCATGTGACAGCTAGAGGTATAACAGCCACCATTA
TTTTGAGTACTGACTGTATGTTACATTCTCAGTTCAGCTGGCTGTTGATCATCTTGGGAT
TAGGGGCCCCTACCAACCACATGGTTGAAAATCCACATGTAACCTTTCCTTCGTTCCTCA
ACATCCTGATTCAACCAACTGTAGATTCTGTAAGACTAGCATTTACTCTTCAAAAAATCC
TCATACAAGTGGACCCAGTTCAAACCCATGCTTTCAGATGTGAACTGTACACCCAATTTT
CATCCTCACAAACCCTTCAAGGCAGTGCTGTCAGCTGGTGAGGAAGGAGGGAACTCTGGC
AGGGAGTTGGGAATGGAGTCTCTTGGGACTGCTGAGAGCCTCTCCCCTCTGCACTCCCTG
AACCAATTTTTGCTTCCCTTCCAGACCCCATGCCGCAGCTGGATGTGACTGAGGCCAACA
AGGAGTTCATGGAGCAGAGTGAGGAGCTGTATGATGCACTGATGGACTGTCACTGGCAGC
CTCTGGACACAGTGTCTTCAGAGATCCCTGCCATGATG
Chart Advanced