SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002869_2.0
Identity
TranscriptSECIS binding protein 2 (SBP2)
SpeciesXenopus tropicalis (Xenopus)
Transcript IDSPT00002869
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002776_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00002869_2.0 # Transcript # SECIS binding protein 2 (SBP2) # Xenopus (Xenopus tropicalis) # Full length # Forward
CAGAATGGAAAATTGTCTGCTGAAGTAGAACCCTTTGTCCCTCAAAAGAAGGGGGCAGAA
GCACTTGCAATACCCATGGCCCTTCCTAGTGATGGTGGGAGTGTAGGTGGACTGGAACCC
ACGCCCATTCCAAGTTACCTTATAACTTGCTATCCATTTGTTCAAGAAAATCAGTCTAAT
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TTATTATATATGCATTTTTTTATACTCTGCTTCATAAATATATCTCCTTAATTTTAGCCT
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GAGAATTCTGGCAGCGGTGTTTAATATAGACCGTAGGGGGGAAAGATGGGAGTTAGGGAG
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GAGAGGCAGCTTCTCTTAAATTACATACCCTGCACTCCAACATGCTGTGAAAGGTGGAAT
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CATTCAGATGTTAATGATTATATGTTTTTCATTTCAGGTGGACTGGACGAAGCACTGTAT
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GCATTAGGGCGCTGTGTAAACAAATTGGTTCCTGTTAGTGTTGTTGGAATCTTCAGTTAT
TCTGGTGCAGAGGTAAGATTTGTTAAAACAACAGGCCTACTAAATTCCAAAATGTAAATT
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TGACACAGAGTTAGATAGTCCCATACAGGGACAAATAATATCCACCAAACTGCTCTCTAA
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ACATTTGCAAATTAGGATTCGGTTTGATATTCGGGCGAATCATTTACAAAGGATTTGGGG
TTCGGCCTAATCGGAAAATAATGGATTCAGTGCATCCCTACTCAATTTATCTCTAATTGG
TTTTTTTTCTACACCTTTAACCTTTTTGATTCAAACACATTTTCCCATAATAGCATTTAA
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ACGGAGGAAGCCAGGAAAGCATACAAGGATATGGTTTCTTCAATGGAACAAGAACAAGCA
GAAGAAGCTTTGAAGAACATTAAAAAGGTTCCTCACATGGGTCATTCTCGTAATCCATCT
GCAGCAAGTGCAATTTCCTTCTGCAGTGTGATCTCTGAGCCCATTTCAGAGGTGAACGAG
AAGGATTATGGTAAGTTCATTCTTCAAAACTACTTGGGATAGGATATAAAGTGTGTTTTT
TACAGCCCCCAGTGGCCTGATGACAGAAAACATATGAGAGATTATTGCATTTATAAATAG
TAGCTTGTCATTTCTATCAGCTATTGTCCAACTGCCAGTACCCAACGCCCCTTAACAGCA
ATATTCAGTTATGTGTGCTGGAAATTGTTAGTTTTTTATTATTTTATGCATATTTTTTAT
GAAAATGTTTGGAATTATGATACACTAGTGAAGGAAATGTTTCATGGCTATTTCTGCAGC
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GGTCACAGAAACAAACTGGCGAAATATGGTAGAAACATCCGATGGGCTTGAAACGTCCGA
AAATGAAGAATGTTCAGTCACAACTACAGGGTCAGAACAAGCAGCCAGCGCACCATTGGT
GCGAAACAACACACAAAAGCAAGAACCGAAAACTGCAAGCAGTACTACCTCATCAGCTAC
CCTTGAGAAACCAACTCCTGCTGACAAGGAAGAGGTAAAACAAGATGACAATCTTGAATG
GGCCTCGCAGCAGAGCACTGAAACTGGATCATGGGATGGGAGTGGCAGAGATGTTCTCAA
TTCATCCATGACTAGCACAGCAAGTACATTGGTACCAGAAATGCTTGAGGAAGATGATGA
TGAAGAAGAGGATGATGATGAGTATCCCCAAGAACCTATTTCAGTGAGCAGAATAGAATC
TTGGGTCTCTGAAACCCAGAGAACTATGGAATCCCTCCAGCTTGTAAACTCTAACAGCCC
TGAGGAGGATAATATTGAACACAGTGAAGAGGATGAGGTAGGGCAATGTGAACAGTCAGA
AGCTGCTGACTGCAAAGAAAGGACAGCAGAAATGCATGTCAGAAATGGATCACACACTCA
GACTGGTCGAAAGTCTTCACTAAAAGAAAAAGTTAACTCCACTTTTATGTAG
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