SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002869_2.0
Identity
TranscriptSECIS binding protein 2 (SBP2)
SpeciesXenopus tropicalis (Xenopus)
Transcript IDSPT00002869
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002776_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00002869_2.0 # Transcript # SECIS binding protein 2 (SBP2) # Xenopus (Xenopus tropicalis) # Full length # Reverse
CTACATAAAAGTGGAGTTAACTTTTTCTTTTAGTGAAGACTTTCGACCAGTCTGAGTGTG
TGATCCATTTCTGACATGCATTTCTGCTGTCCTTTCTTTGCAGTCAGCAGCTTCTGACTG
TTCACATTGCCCTACCTCATCCTCTTCACTGTGTTCAATATTATCCTCCTCAGGGCTGTT
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TCTGCTCACTGAAATAGGTTCTTGGGGATACTCATCATCATCCTCTTCTTCATCATCATC
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ACACTGTCACGCATTCATCTATTTCTTTACTCAAAACTTGATTGCAATACCTGAAATAAA
TTTAACAAATAATAACATCTGTAAATATACATAGTTTGTATTTTAAAATGCATTAAGGAA
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ATATTTTAATATTAAATAATCATATTACAATGTAAATATGGAAATAAGATTAAAACACAA
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GCGGCCCTCGACCCCCCTCTGTGTGGCCCCCCACCTGTCTGGCTGCTTTGATGACTTAAC
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CTTCCCACTGTTGCATCAAATCAGTTCAAAACTATGTAGTTCAATAGGATTTGTTTTCAT
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GACGAGCTTTCATTGCTTGTTGCTGTCTCTCCAGTTCTGCTAGCATATCTCCCAGGTCCA
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TATACTTTGCGACAAAAAGCGCAACAATTTGTGCGACAAAATCATATTTGTCGCGCTGAG
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TCTTACATGACATAAACGTGTTATACCTTGGCATTCTTTACCTGTTTGTTGACAGGCATC
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TGGCTGACAAATGTACCTTTCTTCTTTGTTTTTCAGGCTGACACTAAAAAATTTCTTTTA
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CTGTTTCTCCACATAAATCTTACTGAAGATCCTGAACCCGACTGTCTGGCAGCCCGACTG
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TCAAAGAGTTCCCCCTCCCTCCCTCACATAGCATAGCGTTGTGAACTAGATAACAGGCAG
GCTTGATCTTTCCGTTGCCTGCCTACTTCAAAGGGCTGAGCCCTCTCTCTGCTTCTCCCA
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TGCAGGTTTGTGATTGGGCATATTTATTCACTTGGGAGGCATTTCAATTAAAACCCGGAA
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GAAAAAACTTTTAAAACAGATTTAGTTTATAAGGAATTTAAAGCTGATACAAATTAAAAC
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AATAAATCCATGTATACAAACACTTATTTTCTTAATCTAATTGAGTTGTAAGACTTTATT
GCACTATGGGCACTCATTCATTGGGTTTTATGTTTTACTTTAATTACTGTCACATTTTCC
CATGTATCCCATAAGCTACTGCCAACTAAAAAGGACCATAAAATCGCCAGGGTAAGTCCT
GTACCCCATCTAGAGACTTCAATTCATTCTTAACTACCGTAGCATTAAGCCAATAATATA
GGTTTCATGGAAAAGTATTCCGTTATACAAATGGGCTACTTCAGGACTTCTCATACTTGC
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GCTGACTGAACTGCCTAAGGAATGCTTTATCAGAGCTCAGCCATGTATATAATAATAAAT
ATGACCATAAAACTTATTTTACTTTCCAGCATTAAGCAATGATTATCTCTGTAGCTATAC
CAGGGAATGTTATGAGTCACTAGGATATCTATCTGGTGCCTGTGTTGTTAAATTATGTAT
TTTATTCTTACGTAAACAGCAGTTTAACCACAAACCAGAACTTAATGACTGTTAGGGCCA
GGGTCAGCTGGAATATACAGGTATTCTATTGTCAGAAATATCCATGCAACGTGACAGTAT
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ATATTGTGGTTTCATGCTTCAGAACAGATTCCGGAGTAATTAAAAATGTCAGAGTGAAAA
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TCTTTAGAAAGACAATGAAAAACAACATATGAGTGCAATATTCCACTGAGATACATACTT
TGTGAATAAGTGGGGCTCTGGTATTCCTGTTTCTTTGACTGGTCAGGGCATTTATCTGGC
TCTGCTGGCTGGCTCGCTCACTGCAGTCTACGGATACTGCATTTGTCGCTTGCAGAGGAG
TGGTGTAGGGAGTTGGAAATGGGTGGTAGAATCCCATAACTTGAGCACATGGTGCCGGCA
TTAACTGATAGTACATGTAATCTTGAGACACAGGAGGTTGTGTAGATATAATAGGATAAG
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AAGGAAACTGTCTGAGAAATAGAAAAAAATATAAATATTTTAGCCTTTATTCCAGCAGGT
CTGGTATGAAAAGAAAAACCTCATGTAACATAACAGCTCATGATAATTTATAAATATAGA
AATAGAAAAATGTACATTAAGTAATGTGGATTTGTTTGTTTGTGTGTGTGCGCGTGTGTA
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CACTGTATGCACTCGTTCTTACACAAAAAAAAAGTAAATTACAATATATTAAAATATGAT
GAAGAGAGACAAGCTATTGGGTGGAAAAGTAATTGAAAATAGCATCTGCACTAAATTTAC
AAAACACGTTCATTATAGTCTAATATTGATCTGTTCTAGGGAGAGCTTCTTATTCCAGCT
TTGATGTTTAAATAAAAGTGTGTACTGACCCAGAGGACAGTAACTAGCTTTTAAAAGCTG
TTGTGGTTAACAGTGCAGGAATTCCTTCAATAAGTATCCAACGAATGAGGCTTTGCATTG
GCCGTCTGTTGCCATGACAGAACAATTCAGTAGGTATAACATGCCAGACGAGTAATGTAT
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TATGCACAAGACAAATAGGGTATAGTGTCTATTTATAGAACTGACCAGAACACAAAAGGA
GAATATATATCTGTTTACTCTCTGATTTTATAGATTACACAAAGAATTACCTATTAGACT
GATTTTCTTGAACAAATGGATAGCAAGTTATAAGGTAACTTGGAATGGGCGTGGGTTCCA
GTCCACCTACACTCCCACCATCACTAGGAAGGGCCATGGGTATTGCAAGTGCTTCTGCCC
CCTTCTTTTGAGGGACAAAGGGTTCTACTTCAGCAGACAATTTTCCATTCTG
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