SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002878_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein O (SelO)
SpeciesXenopus tropicalis (Xenopus)
Transcript IDSPT00002878
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002786_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00002878_2.0 # Transcript # Selenoprotein O (SelO) # Xenopus (Xenopus tropicalis) # Full length # Forward
CTGACTTTCGATAACTTAGCGCTGCGCTCCCTGCCCGTGGAGCCCGGAGACGGTACCGAA
GAGGAAGCAAGAACACCCCGGCAAGTACCGGGAGCCTGCTTCTCCAGAGTCCGGCCCACC
CCCCTACTCAACCCGACGGTAGTGGCACTGTCACGCTCGGCACTTTCACTTCTTGGTCTC
CAAGTCGGGGAGGAGGATGAGGAGGCGACCGAGTACTTCAGCGGAAACCGGTTATTGCCA
GGTTCGGAACCCGCCGCCCATTGCTACTGCGGGCACCAGTTCGGCAACTTCGCCGGGCAG
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GAGATCCAGCTCAAGGGAGCCGGCCTTACACCCTATTCCAGGCAAGTGAAGGGAGGCGGC
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CTCTGCCAAATAAAAAACTATTTATTCCATTTGTTAAATATAATTTGACAACTTTTTAAT
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CAAATCTGACCAGTTTTGCTTAGACGTAAACCTTTCAAAACGCATTGATGTCAATGGGCT
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AAATTGCCAGTGGGGTGGCATACATGGCGCCGCAATTTGCCGAAGTTGCAACTTCGGCAA
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ATTAATCAATTCAAATTCACATACCATATCAACAAGTGCCTTGTGCATCAGAAAGGGTTA
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CGCACCCACTCTTGCACAAGCAGAATTCCACCACTTTTATTTCCTTTTCGGTGCACCCAT
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CTTTTCCAGCTTGAATGGCTGCCCCCGTGGCTACACAGCAGCTTATTATATAAATTATAG
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TTGCTCTTTTCTTTGTGCATTAGTCCAAATTGCCTGTGGGCTAGTAGCCTTACAGTTACT
ATGAACATTAGGTCGGCAAACCTGAGCTGATAAGCACTTCTGACTCAGCCCCTCTGGACT
GAGTCGGCAGCTTATTGGCCCATGTACAGGGCCCTCAGGAGGTCTTGCCCAACTGATATC
TGGCCAGGAATCAAATGGATCTCTGTAGGCCTGCAGTATGATGTCAGCCTATTTTGGTCC
AGCACATGGGTGGCAACCTCTTCAAACAAGCAAATCTCAAAGTGTATAGCTAGGGTTAAA
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AATCCAGTCATAAGGGCTTCGCTGATTACACATTTTGCTGGTGCTGCACAGGCTACAAGC
ATAATTTTCTCTCATTGAAAACGGCAGGAACCAATACTTAACCTTTAATTAGCAGTCACA
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AGTTTGTCTGTCACAGATTAGGGCCAGAGCAGTCTCATGTTTTGGTGTGGAGATGTTTCT
GAAATCTTCTTACTTTGCAGACAAGCTGATGGGCGCAAAGTATTGAGATCCAGCATAAGG
GAGTTTCTTTGCAGTGAAGCCATGTCTCACCTCGGAATACCAAGCACACGGGCTGGTTCC
TGTGTAACTGCAGATTCCACGGTTATCAGAGATATTTACTATGATGGAAACCCTAAGAAG
GAGAAATGCACAGTGGTTTCACGCATTGCACCCACATTTCTGAGGTAATAGCAAATGCCA
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AGTTCTAACTGTTGACATCACTAAGCACCAATTATAAAGACATAATTTACAGAATAATCA
TGGCTTTTTTGTGTTTGCAGCCGTCTTGTAGTCATATTTTACACTAGTGTGTTCAAGTCC
ATTTTGAATGTGCACTGAAGAGAGGTCTTTTATTACTACATAACTGCTTGTGTAATATAG
AGTTATAGAGTTCACAAACACAGTGGTGGTATACATTTTGTTAATTTTTGTTTTTGTATT
GTTTGGAGGAGGAATATTATATTCTAATCTCCAAAAGCTTGGAATTGCCCAGAAAAGGAA
GCATTTAACTGATCACGTTTTTTATTCAATGCACTTACAATGCCATAACTTTTTTTTTTT
TTTTAAATTTCATATAATTTTTTTATCACCATATTTTATATTCATCAAAGAATTCTCCAT
TTGCAGCTTTGCAGGCCTTTGGAGGTGGGGTCATGACATGTGACTTTAGGGGAAGGGCCA
TGATATCAGACGTGTCATTGGCCAGACTTAGCTGTCTTGTAGGGATTTTTCTCTGATGTT
ACCATGAAGTTCTTCCTTCAAGAGCTGGTTAAGACTGAGGTCTGACACTTCTGCTGGCCA
GTTCGAGGCACTATTCCAGCTTCCTCTATCTTACCTTACCTTTTCCAAAGCTTACAATGG
AGCTTCAGTTAGTAGTCCTGCTACATGATAAAATGTGTATGAATCAAGTGCTGATCAAAA
TTAGATGGTATGACAAACATATTACTTAGTGATTCCAAACTTTCAAACACAAGTGTATAG
AACAACATTTTATTTAAAGTGTGCTCAAATACATCACTCCTTTATAATGCAGTTTAAGTG
GCATCACAATGTTGCTAGAAGAATCTTGAATCTAAATCTAGCAATTGAAATCAGTGGGTG
GTCCAGTTTTATAAAACATAGTGTAAATTCCAGAATACCTCCTCACAATCTGTGTTTTGG
ATTTGCAGTATGTTCAATTCTGCTGCAACAAAATTAAAACCCCTGTGTACTACCAAGTAT
AGTATATAGTGTTCTAGGTGGCACTAATGTGGCGAATCTATTGGCAGTAAAATGACAAAA
TAACTCTTTTTTTTCCTTTTAAAGTCATATATTTTGTTATAGATTTGTTATTACAATTCA
ACAATTCAGCATATTAAGAAAGCTGAAACAAAGTTTCCTGTAAATGTGAACTATGGCTTA
TGAGTTGAAAAAGGTCATAGGCAGTGATTTTGCAGTGATATTTTAGGAAATATTAAAAGA
GAAATCACTAAACCTGACTTGACAAAAACTGTATAGATAAATTGTTTTTGTATCAAACAG
TACTCCAGTATGTATATGCTGCTCATACTCTTAATATTTCTATATAGGTGGCCACACACA
GGCAGATTATGCATCCTCTCTGTCCATTGGCTCAGGGGCGGAATGGACAAAGAGCATAGC
CGCCTCCCTTTTGTTCCTGTCGCTCTTGCAGAGCTTACAAAAGATTGTAACGGCAGGAAG
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AATTTATAATATTTATAGTTCTAAATTGAGCTTTATGTCTGCATGTAAGATATGGGTTGA
TATTTTTTAGATGTAGAAAAACTTCTGTTTTTTCAAAGTGTATAAATGTGTAAATGTTTC
ATTCTGAACAGGTTTGGATCTTTTGAAATATTTAAGCCAACTGATGAGTTTACTGGCCGC
AAAGGTCCAAGTGTTGATAGAAATGACATTCGGATCCAGATGCTTGATTATGTGATCCGT
ACTTTCTATCCAGACATACAGGAGAAACATGCAGGAAATAATACTGAAAAGAATGCTGCA
TTCTTCCGAGAAGTAAGGACTTTTGTTTATTAATAAAACCTCTATATTTTTTCATCAGCA
TGTGTGATAAGTGAAACTGAAAAGGAGATCTGATTCATATACAAGCAGTAAAGTATTGTT
AGTCAAAAAAAAAAAGGTGCTTCTTGTAGTGTTTTGCCAAGAAATTCTCCCCCTACCCCC
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CCAAACTCACCTGTAGAAAACCTTTCACATGTGCTGAAAGAGCTGTGCCCATTTGCAAAT
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GGGTGGAAAACTTTCAGGTGCTATAAAACTAGACCAAGGCAACTGTGCTGGGGCATTTCT
GTTATAGGCCTGCTCTGAATTTCTCCTGATACAGTAAATTCTGAGTACAGCATTTCTATC
CTTATTTAATTTTAGGCTTCAGTTCTACTTTAAGGGCAGAGAAAATTTAAAATTTAGTAC
TAATGAAGGTGATTTTCTCATAGGGTCCAGTGTACACACTTATATAGTTACATTTACTAT
TTTCCTTAGAAAGATGGCTTGTTATTCTAATTGGTGCCTTATTTATTTGTGTTTTGTGCT
TATTGATATCTGTGGGAGTTGTCACAATTACTGTGATAAGTTTACTTTAACCATGGACTT
TTTAATGAAAAAGTATATTGCAGTGACCGAATTATCAAGAAAATAGGAGAGTTTCATATG
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GCAAGCCATATATGGTTACAGTAGGGGGCTGATGTACTAATCCACAAACGGTCCGAAGGC
GTCCGAATGCGTCTTTTTCGTAATGATCGGTATTTTGTGATTTTTTTCGTAAATTGTCGC
GACTTTTTCGTAGCCGTTACGACTGTTTCGCAAATTGTTGTGACTTTTTCGTAGCATTAC
GACTTGCTCAAATTGTCGCGACTTTTTCGTAGCCTTTGCGCCGAGTACGAAAGTTTCGGA
TTCATTCAAGCTTCAGTATCTTGACTTTTCTTGGGCCAGGTTGGAGCTGCAGAGTGCCAT
TGAGTCCTATGGGAGGCTTCCAAAATCATGCAAAGTCTGAAAGTTTTGCCCGCTGTTTAC
GAGCACTCAATACGAAAAAGTTGCGACAATATACGAGCAAATCGTAACGGCTACGAAAAA
GTCGCGACTTTTCGGGCAAGTCGTAACAGCTACGAAAAAGTTGCAACAATTTACGATAAA
GTCGTAACGGCGACGAAAAATTGCAAAAAATACGAAAAAGTCGCAAAATGTTTGTTTCCA
ATCCAAATTTTTCCCATTCGAATTCGTGGATTAGTAAATCAGCCCCTAGGTATTGTAATT
CTTGTAAAATGATTGAGAGGGAGATGTGATTGCAGTTATTCTGGCTCCAAGAAGGAGTTC
CCAGAGGACTAATTAGTATCCAACTGGAAGCCCCTTGTGGCCTTTGGTCTCATATTTTTG
CAATCTCTTCCCCCCCCCCCCATTTGTTTCCAGTTTGTTACTAATTTGTTTTGCGCTAAC
AGGAAAGGCTTTAGGGAAGCTTCTCTAAAAACCCTAAACATTGTTGCAATTTAAAATGGA
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TAGTAATATGGTATTTCTCAGATTAAGTTATGATTATTTATAGATTAATTATGCTGTTCG
GGGCCCCTCCCTATTTCTTGAGCATGATCTTGAGCTGTTGTAAACACCAAGCACAGCAGC
AGCATAAATTCACTTTCAGGTTGCTGTTGTTCCAGCTATTTTTAGTATGACTGTGCTTTT
CTCACTTTTAGCTACCTTTACTCCTTGATGTACATGCATGCCATAAGCCTAGCATATAAG
GCTGGATATGGTGCTACTTTATGGTCCCTGCAAAGTCTTATGTCATCCAGGCATCTGCAC
CTCTTCTGCAATTTTAATTCCATGTAGGTCTCTGCTGTTTGTAACACACAAATGCACCCA
ACATGTGGCTTGCTGCTCCCATCCAGATTCTCTACTTCCTTTGTCCTGTGAGCATCCTTC
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CACATGAGTGCCCTTTGTATCTTTTTCACTGATAATGTGCAAAATTAACTCCTACCCTGT
TCTACCTGTTCCTTTGTAAGCTTTGCCTCCTGCTTTTTGGCTCATGATACCCTACCCTTT
GACTTCGCCACCATGTTATCTTTTGTGACCTTTGTCTTTCTTAGTGCATTATGTGCTTTG
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TCTTTCACCAAAAACTGCAGTTGAGTTGAAATTTAGGCATATTTCTGTTTGTGAATATAG
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CAGTATCAGTCATCTGGCCTGCATATATGCTTCTAGACTACAAAAGGAAACTGAGGCAAT
CCCATATACACATGTGGAGAACATACTAACTCCATAAAGCTAGTGTTTTTATCAGAACTC
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TCCCACAAACTAACTTATAAAGATCATATACTGACACTGTGCAAGTGAATATGAGGTGAT
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TGCTATTTTAAATGATGACATGTCTGAGCTTTACCGTTTCCTGGGCTGTGGTTCCTAGTA
TCACTGTTGTGGGTGCCATTTCATGTTTTGTGTGTATTTTATTTAGATAACAAAAAGGAC
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GATGCCCTTTGTTAGTTGGACATATCATTTTAGAGGTCTACAGCCTCTGCAACAGCATAT
TGTGCTCTCCCCCCAAAAGCTAACAAAGATTTTTTTTATGACATATAAAATGTGCCCAAA
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GAGTTCTCCTTAAGAGTAGAAACTAGGTGCCAAATATTAGGCACCCCCCAGTAACTTAAA
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TGTACCCTTTTCTTTCTGTCTTCTGAATCCCAGGGCCGGTGCATGCACAGTAGAGTGAAA
AAGCCAACCTTTTTTTTTTTTTTAAAGTTCTGTTTTTCACTGTACTGTACGTGCACAAAG
GCAGGGAGAGGAGACACTCGCCTGCAGTAACCCCAGGCTGGTGCGGTTTTCTTCTCACAG
GAGCAACAGCCCAGGGTGAAAGGTATGCAAGTAAAGTCACTGGGGGTGCCTAACATTTTG
GCACACCCCAGTGGCGTAGCCTTTCCTTTTCCTTTAACACATAAATCAAATTTAATGCTG
TGAATGCTTTGTACTTAGGGCTGACTTAATTACTTGCCTATAGTGATGTGGGGGTCGAAA
AAAATTTCAACCCACACCAGACCCTAACACACTTGAATTTAATTGCATCCATTTATATAC
CCATGTCCAACTTGCCCCGCAAGGGTGGCAGGAAGAGCTCAGCCCACACCCGCCCGCCAC
CCGCATATTTGCTGTGTCTGTCAACCTGAACCTGCCCGACCCGCAGGTAAACCCACAGGT
TTGGGGCTGGCCTGCACATCACTACTTGCCTAGGGTGCCAAAATACCTTGGTCTGGCCCT
GTTTGTACTAAATAATAAGTATACTACAGTATATTAATTAAAGAATCCCAGTGATGTATT
GTAATCTTTTAATGACTGTTTTATGTAGGCTCAGATTTTACAAACACGTTTCGTGTGCTC
AGCAAATTCTCAGGAGATGAAGCAGAGATACAGGATTTCCTGAACATAATTATTGAGCAG
TGTGCCTCTGTAGAAGAATTAAAACTTGTCTTCAAACCCAAAATGGATCCAAGGTATTTA
AATTGCAATGATCATATCTGATCATAAGTACTCAAGGGTGTATTCCATAAGGCCCTGGGT
CCTTATTATTTTTGGTAAAACATTTTTGTTCAGCACTGACAAGTTGAGTATGAGGTGAGC
CATATGTTCTTGTAGGGGCCCATTAATTAAAGCATGGATTTTCGCTACTAAAAAGCATGA
TTGGAAACAATTTGGAATAACCACAATAAATTCTGATGTGCAAAAATTTCACATTCTTTT
CTTGGCTGTACGAAAATATCATGGTTGCGATCCGAAAGTCACAAAATTTTTGTATCAGAA
TGATTGTAAACGGCGCAAAAACCTTTCTGGCTTTGAAACAAAATGTATGATGTTGGAAGC
CTTCTATAGGACTCAATGGCACTGTACAGACCCAACCTGGCGAAAAGATAGTCACGATAG
CAAAGCTTCAATGAATAACGAAATTTACCACTTAAAATTTTGTACTTGAACAAACAACTG
TATTTTTTTTTAAGCTGTATATAGGCGCCATCTCAGTGCATTGTGCCTGAGTCTAAGCTT
TCAGAAGGAGCCAGCGCTACACATTAGAACTGCTTTCAGATAATCTATTGTTTCTCCTAC
TCCCATGTAACTGGAGGAGTCCCAAGCCAGACTTGGATTTCTTACTATTGAGTGCTATTC
TGATATCTACTGGGAGCTGCTCTCTTGCTACCTTCCCATTATTCTGCTGGTTGGCTGCTG
GGGGGTAAGGGTGATATCACTCCAACTTGCAGCGCAGCAGTAAAGTGTGACTGACGTTTA
TCAGAGCACAGGTCACATGGCTGTGGCACCCTGGGAGATGAAAAATATGGCTAGCCCCAT
GTGAGATTTCAAAATTAAATAAAAAAAATCTGTTTGCTCTTTTGAAAAAAATGGATTTCA
GTGCAGGATTCTGCTTGAGAAGCTATATTAATTGATTTGTTTTGGAAAAAAATGTTTTCC
CATGACAATATTCCTTTAACAATAGCATTTTGTCATTATAGGCAACTTTCAATGATGCTA
ATGTTAGCACAGAGCAACCCTCAGCTATTTTCAATGATTGGAACTCAATCCAACATTAAC
AAGGAGCTTGAAAGAATAGATCAATATACTAAACTTCAAGAAACTAGTGCAGATGATCTT
CTCAAAGATAACAAGAAACATTGGAAAGAATGGCTTCGTAAGTACAGGTATGTGACCAGC
AGCAAGTCTAATGTTGATTAACTAGAGAATATGATGTATTTTTTTTGTCCCATTTATACC
TTCCTTTTCTCTCTCCATGCTCTGGTGCATGTGCCCCTTTGGAGGCTGATGTAGATCACT
GCCATGGCTTTGTTGTACTGAATTTTTATGGAATTTCCCTTTAAAGAGAAAGTCCATTGT
TGGTGGATGAGGTAGATCACCCTGAGTTATAGACTGTTTATATAGAGATGTTATTCTCTG
AAAGACCACTTGTTTTGAACATGTGGATGATTGAAAACTTCTCCCCAGCCACATAGACTG
ATATCGCTTGTAATTATAGACCACTTTACCACTGAGCAGGTTGTGCCCACTCTCATGTTG
TGTGTATGCCACCACCACTGAAGGGAACTTCATATTTGCTCTGAGAGCCAGAAGAATCAT
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TTAGAGAGTTGATGACCTGCCCTCTTCCTTACTGAGCTGCTCTTGCCACACCAGATTTGC
CTTTGCATTAACATTTCTAACTATAGTTGTTTTTCACAGGTAGAAGTGAACAGGAAGTAT
TTTTTTTTTTTTTTCCAGTGTGCGGTTGGAGAAAGAAAGAGGTAGTGTTGAAGATAGGAA
AGCATTCCATGAGGAGCATGTGAAAACCATGGATTCAAATAATCCATCATACATCCTGAG
AAACTACATTGCGCAGAATGCCATAGATAGTGCAGAAAGCGGAGACTTCAGCGAGGTATA
GTATGGCAACCTGACTTGAAATCTTTTCTGTTATGTTGGCTGTGTTTTTAAAAAAACTGC
CCAACCCTAATTTTCACTTTATGTACTTAATGATAAGATTGTGCTATAAATAGTGTATGC
TAGGGTAACAGTGTGTTCTCTCGGTATGTGGTGTAATTTACTATAATGATCATAAACACC
AGAACAAGTAACATAGAGAACGATTCAGAGGGACTGCTCTGCTGAGTGTTAAGCACTTAT
AGTTTAGCCCAGATCAGTGATGACTTTAGTTTAGCCCAGATCAAGAGGACATCTTGAAAA
GCAGATCCATAATTCTAAATCGTATTGAGAGTTTTTCTTATAATTGTGGTCATTAGAAAC
CATAGTAGTTCTACTATAAACCAGTTATGTTCACAAATCTCTTGTTCCTTTTATAAATAG
TTTCTAATAGTGCTGCAGCTTTATGTAGGATGATTTCCTTCAGGGACTATATCCTACAAT
TATTACATAGCTTCAAGCAAAACTTGAATAAATGAGGGCATCCTGGGATCAAAATGTTGA
ATCCCTACCAATCAACACACTCTATAATGGGACTAATATGTTTTCAGGACTGTTAGCCTC
TTTGTTTCTTAGGGGTTTAATAAAAGTTGAGGTAATTGGGAACTTCAACTTTTAGCAAGT
AAATTTAAAATAAGTGCCTGTATTAATTTATACAGATTTATGGATTATATAATCTTGTTG
CATAGGTAAAGCGTGTGTTGCAGATGCTGGAAAATCCATACCAGGAAGGGGAAAGCTGCC
AAAGCATTGCAGACAAGTCACCAGAGGAAGATGTGGCTGTTGCTGCCTCTAGTGTCTCCA
CCAACCCATCCAGACTTCCTTATAACAGCAAGCCTCCGCTATGGGCTACAGAGTTATGTG
TAACATGATCTTCTTAGGTGCCTTTTTGATCATTAGCTGCTGAAGAACATGAATGTACCT
CAGCAGTTAGATCAACAAGGCCATACATAGCATGCATGAACTGGCTACTCTAACATGACA
TTTGGATGTTGCATATATTATGCATCCAGTAACACAGAGATGATATAAATATCAGGGCTC
TTCTCTTGACATGTCTTGCCACTGGTTGCTGAGCCAGATGATTCTAGCACTTCTAGTATA
AAACTAGCACAGCTCAGTGGAGTTGCTTGTAACTAGAAAATATAGGCTAAGGAAAAACAC
TAATAATCCATTAATCTCAGACTGTAAGAAATATAGTTGTCTTTTTTGAAAAAAAAAATC
CACTTCAACTTGGATGAAATACATCATTCTTTAGACATATTTATTTTTCTATACAAACGC
ATATATATGTATTTTTATCCAAATGTTTGTTTTACATGAAGGCAAAAATACCAATTCAGT
TATCTGAAATATTTTGGCCTGATGATAAGCCAGTT
Chart Advanced