SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00002885_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein R (SelR)
SpeciesXenopus tropicalis (Xenopus)
Transcript IDSPT00002885
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002793_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00002885_2.0 # Transcript # Selenoprotein R  (SelR) # Xenopus (Xenopus tropicalis) # Full length # Forward
ATGTCTGCATTCAACCTGCTCCATTTGGTGACAAAGAGCCAGCCAGTGACCCTGCGAGCC
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TCCCATCGGCTCCTTTGCCATGATAGGCCCGGGCCTGCCTGGTAGGCTAGTGCAACACAG
GGTGGATTCTCAGCCTCTCTATGAAGACAGATAACCTACCCTTATGCTGGCATAAAGCTT
CTTATTTGCCTGCACCCGGAAACCATTGCATCAGCCTGGGTGCAGGCACATAAGGCAGAT
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CCCAGCTTGCAGGCCCAATATTCATCTTATGTGTCACTAGCCTTACAGGCCTGTTTTCCA
AGGGAGACAGCTTGGTAAATATATTTCTGAAACTGGGCTTTTCTGTTTAGAGCATTTTAT
AGAATTAACATAGATGGTTGTAGTATTTTGCATGTAACCTTCACATTACAAGGTAAAAAA
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TGCTTCTTTGGTCGCCTCTTCTGACCCTGGCTTTATGCTTATGTGTAGTAGAGTGGAAAG
CCATCTTTTTGCTTTTAAGTTTAACTTTTCACTGTACTGTGCATGCACACCTAGACTAGA
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ACAAAGTTGCCTTTACGCAGCAAGAGTTGAGAGAGAGACTGACTCCTGAGCAATACCATG
TTACTCAAGAAAAAGGAACAGAAAGGTAAAAAGAGGGGCCATTTACATGAAACACACAAA
GTGTATTACCACTGCATTATACTAATTAAAAATGTGTTTTGTTTTACAAATTGTCACAGT
TTTGTTATACCTTCTTCATGCTTGGCTGATCTTAATTGGCAACAAAAAAACCAAAGCAAA
GAACCAGGCTAGTGATGGGTGTATTTCATGCATGCTCTGTTCTTAGTCAAGCGGGATAGA
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ATCAAATTTTTAATCCAGATAAGTAAAGATTAAGCAGTGTCGTTAAAGCATAATAAAGAA
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GGAAGTTTTGTTCAGTTTATTGAAACAAAATGTGTTCTCCAGTGCAATGAGGTACATTTA
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GATAAAGTCTCGGCATCTCTGGTGTAAGTTTTTTTGTTGTCTGAAACAGACAACAGAAAA
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CAAAATGACATACTTCTCCCCGAACGTTGAGTCTGATGTCCTTACTAAGATAGAAGCTGA
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TTCAGCATGTACTTTTGCCTATAATTGCCATGTTTGATTTCAGGACGTACATTCCTCCAA
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ATGGGGACCTTAACTCTGTGTGTCTCACAGTAAGGTAGAACAATGACATTTTTGAATGTT
TGCCATGAATTACTGCCCGGTGCAAATAGTGTTTATAAATGAGCCCCACTGTAAGATTCA
CTGGGTCGCTGGAAGTTTCAGCATATTATAGATAAGGATAACTGAACTCAAGATAGGTCA
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CCTGTTGAATGCAGTACTTTTTTGTTGCTATATATATATATATATATACAATACATCTAA
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TTATTGAGGTAGTCACGACAACTGACGTTTCGGCTGAACCACCAGCCTTTGTCAAAGTTA
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GTGAACACACGTCACAAATTCAAATGTGATGACATCACCCACCTCCCTGTGTCAGAACCA
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GTAGAACATTTCATAAGTAACGAAATGGTATTTTCAAGAGGTGCTTGCTGATATCGGAGC
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