SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003095_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein M (SelM)
SpeciesGekko japonicus (Gecko)
Transcript IDSPT00003095
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00002973_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00003095_2.0 # Transcript # Selenoprotein M (SelM) # Gecko (Gekko japonicus) # Full length # Forward
TCTTGCGGAGGATGACGATTGAATCGCTTGAAAGAGGTAAGTGTTGCTTAAGCTTCTTGG
TGGTTCGATGTGAGAGCTGGCACAATCTAGCAGCTAGGCGAAGAAAGATAAGCAGGAACG
TCCCTGGCTCAGACCTTTCCTCAGTCCATGAATTTAGTAGTCGGTGGCCTTTGGCAAGTT
AGCTCCCCCACCCCCTCACCACAGAGGTGATGATGTTGGCCTACTTTCCTGGGCTGTTGT
ATGGACTAGTGAATCGTCTTTATTCAGTACAATTTTTAGCTCACCTTTCCTGCAGGGACA
TTAGAATGGCCTCTTCCGCTTGCCCTTCCCCAGTTTATCCCCACAATAACCCTGTCAGGC
TTGAGAGAAGTGCTCTGAGCAATTGAAATGGCAGCTTAAATGCTCAGTATTAATTGGGAA
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GGGAACCTGCAGGTGTTTCAGTTCACACCAAACCCAGGTGCAGTGTGGTGTGATCCTCAT
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TGATGACTTCCACCCTCACGTCACTGTGCTGCTATTGCACTCCCGTCTTCATGCGGACAC
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GTCCCTCTGTTCTTCGAACTTTCCCGTCCCTCTTGCTTGTTCCTCTGACTCACTGCTGGC
TTCTTGGGTCCCTCCCACTCTGCCCTTGTGTGGATCACCCTTCCCAATTTCCCAGGCTGC
TGAAGCTGAGACTGTAAGTTCACTAGGGGCACAAAAAAAGTCTTTTTACTTTTAAAGCTC
TATAAAGGGCATTTATACAGTGGTTGTATAAGTACTGACAGAGAGGATGACCACAATCAG
GGGCGTAGCCTGAAAATGTTGGTTGGTGGGGTGTGAGGAAATCTGGAGGGGAGCACTCCG
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AAACCTCTAGTCCTGTGGTTCTCAACCTTCCCAATGCCGCGACCCTTTAATACAGTTCTT
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TGCTACTGTTATGAATCGTAATATAAATATCTGATATTCAGGATGTGATTCGGTTCCCAA
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ATGCAAATTAGAGAAAGTCCAAATTTGTTCATTGCTAAGGTGGGTAACAGTCTCTGCCAC
TGCGTAACGGAAAGGGAAAGGCAGCATTTTATAAGCTGATGTGCTGTGCAAACCATTAGA
AGGTGAATCCAGTAGTAAGTACTGTGGGTCTACACAAGGTTCAGAGATTACCCCTCTGGT
CTGGGTTTGTTTTGTAGAGAATTCCATTGAGTGACATGACCCGGGAAGAGATCAACCAGC
TTGTGCAGGACTTGGGGTTCTACCGGAAGGAGTCGCCTGACTCGCCAGTACCTGAAGAGT
TCCATCTGGCCCCTGCTCGGCCC
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