SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003136_2.0
Identity
TranscriptEukaryotic elongation factor (eEFSec)
SpeciesXiphophorus couchianus (Monterrey platyfish)
Transcript IDSPT00003136
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003014_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00003136_2.0 # Transcript # Eukaryotic elongation factor (eEFSec) # Monterrey platyfish (Xiphophorus couchianus) # Full length # Forward
AAAACGCTGAACTTTAATGTCGGGGTGCTCGGCCATGTGGACAGTGGGAAGACCTCGCTG
GCCAGAGCGCTGAGCAGCACAGCCTCCACGGCCGCCTTCGACAAGAACCCGCAGTCCCGT
GAGAGAGGCATCACGCTGGACCTGGGCTTCTCCTCCTTCACCGTGGATTGTCCTGATCAC
CTGCGTGACAGCGGGGGACAGCAACCCTATGACAGCCTCCAGTTCACCCTGGTGGACTGT
CCGGGACACGCCTCTCTCATTCGGACCATCATTGGAGGTGAGCTCTAACGTTGGAGGTGC
AATAAACTTATATTAGACCATAGGAACTTATTGGTGTTTTTGTTTGAGCACATATACATT
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TATGATTCGAGCGAGTTTTACAAGCGCCAAACTGTGATGGCACTTGACGACTGAGATCAG
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ATTTCACGTCCTGTTTCCTAGTATTTTTTTGAATGTCTTGCTCCATTTTTGTAGCAGTAT
TCAACTACTGCTACAAAAACCCCCGCGACCCGACCCCGGATAAAGTGAAAGAAAATGGAT
GGATGGATGGATGGATGGATATTCAACTTCATGCTTGTAATGTTCTCAGTTTCTCTTTTG
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TTTCCAGGTGCGCAAATCATCGACCTGATGATGCTGGTGGTGGACGTGGTGAAAGGCGTG
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TGCTGTGGCAGCGAAGCCTGGAGGCCCAGAGGCCCCTGAAACAGAGGAGCCACAGGGAGT
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CTGTTGCTACAAACTGTCAGTCAGCTGGCTGTTCATATAAAACTTACTGATTGTTTTCCT
AAAGTTTTTAGAGACTAATAGGAAAATGTTTAATATGTTGTACAATGATATAAATAGTCA
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AAAAGAGACCAAAAACAAATAATTCCAGAGATGTTTTTTTACATTAATTGTGACATTTGC
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GGCCTCTTTGATTCACACTGAAGCTGGCTAACACATTTTTAAGCAGTTCCAAAATGTGAC
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CTGCTTCTCCATCCGCGGTCAGGGAACGGTCATGACTGGGACCATCCTGCAGGGATCACT
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ATATGAGGGGAATCGGTGCTTTTCTGACTGCAGATCCTGTGTTTAATCAAGACCACATGC
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ATTTCATCTGCTCCCGTCAATCTGGCTGATGAACGTTTTTGTTTCTTTACTTACACAATA
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ATTCTTAAATACCACAACTGAACAAAAAGGAGATTTACATTTTAATCTTGATTTTGTTCA
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TTGACAACAGTGTCACTTCTAAGGGGAAAAAAACATCCCGGGAGTTTTTGTTTGTCAATT
TACCAGTTTCCAAACATCTTATTGAGATATTGGAGAGTAAAACGTTTTTACAAATTTGTT
TCTGAACTTTAAAGCGTTTCCTCATCTGCTGCTGTTTAATCTGCGATCAGGTTCATGTTA
GGTATTGTGTATTTTTCTGTGGAAATGTGTTTTTAGGTGTGTCATTTATTGTGTCTGTGT
GCTCTCTGACATCAGGTGACCAAGAAAATAAAGTCGGTGCAGATGTTTCGGAAGCCGGTG
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CTGGAGCGCGGCTTGGTGTGCACTCCGGGTTCTCTGCGCACCCTCTACGCAGCCATCATC
TCCACCAGGAAGATCGGATACTTTAAGGGTTCCCTCGCCACCCGGGCCAAGTTCCACATC
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ACCAAACCGACTCCGTCAGAGCCGTCCTCACTGGAAACACCCTTCACCTTTGAGAGGGAG
TATTCCTACCAGGACGAGTACGTTAGCAGACAAAAAGAAGCGGCTTCGGGGCCCGACCCA
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ATCGGCTCCAAGCTGGACACAGATATCCACGCCAACGCGTGTCGGCTGGCCTTCCAAGGC
CGCTTGCTGCACGGGTTTGAAGACAAAAGTTACGCCGAGACTTCTCTGCCTCAACTACGC
ATCTTCAAGACCAAGCATAAGGAGGGACAGGTGGAGAGGGTGAGTGGTTCTCCAGCAGTT
AGCTATTTATTTTAAATCATATCAAACTATATTTATTGTTCCAATTAGCAAGTTGAGACA
GTGTTTCTACTGGTTCATCAAGGGAATTGTTTCAAAATTGATTTTGTAGATGAAACACAA
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TGTCATGTGTGCAACATCTGACTCCTTGCATTGAGTGTTTGGTCGGTGATTATATTTCAG
AGCTTGCATGAGAGCTCTGAATGAAAAGATATCTGGCTGGTTAACTGCACTTGCAAAAAC
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GAATATACATACAGAGCCAAAATAGACGGGCTTGAATTAAAGCATTTTGATGTGTTAGGA
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CCGCCATCCCTCGTCCTCACCTTGAACTCCTTCTTGCTCTAGTTCTTCAGATGTTTCTTG
GTGCCGCTGCAGCGTGCCTCCCAGACACTGGCCCCTATTGCATATTCACAAACAGACACG
TACACACAAACAATCATACATATGTGGCCGCGATGAGCCGCGTTTGAGGCATGGGTGGTA
CGCATGCCTTAGCATGTGCTGCGACAGAAGCATGCGTGGGTGGCCGGCTGACGCCAGTCG
CCCTGGTGCTGTCTAGCTATCGGAGGCTGGCGCTGTTTGGTCACACCTGAGTGGCGCAGG
AACATCCACACGTTCCGCATTTGTCTGAGCATCTTTCTCTCCCTGTCTGCATGCCGTTGT
TATCATTCCTGCATGTTTGCTGTTAGATTATGTCCCTAAACCTGAACCGTGTTCCTACAG
CTCATGCCGCTGGTGATGACTTTCGTCACGCTGTGTGTTACAGTTCAGCTTCTCCTTGTA
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GGTCAGACGGCGGTCATGTGATGTCGCGTTCGTCGCTCGTGCCGTCTTGCAGAATGACCC
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GAGATGTCACGAATCAGATGGTCTGTCAGACGTGTGTGACAACTGTACGCTGTTTTTCTT
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GTGGCCTGATGGCTCTTCTTCCTCTAGCATATATGTTATAGGAACATGTTTTTACTTATT
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AATTCTGGACTTTTGTCACATTTTGTCACTTAACAACCAAAAACATCATTTTATTGAGAT
TTTAGCTAATCAACACAGAGTAGTGCAAAATTAGGAAATGAAGGTTTTAACAAATAAAGA
AATCTGAAATGCATATTTTTGTATTAAACCCCCTATATTTGGATACCCCAAATAAAATCC
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CCTCTCCTTTGACCTTTGACCCCAATCAAAGGGGTCTAAAGTTCCTTTCATTGGGGACCA
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GCCGGAGCATTCTGGCTGCGCTGCAACCATAACGGCCCTCACCTTGGCATGATGATAACA
AGAAGAATGCTGGCGCCGATGTACACGGGGTCAGACAGCCTGCATGAAAAGCAGTGAACC
CAGAACGTCTTACCTGCTGTGTGGAGAAGGGGAAGCACACGCCGCAGTCGGTTCCAGGCC
TAAAACATTCAGGAAAGCAAACATGAGGGCAGATATAGGGAGGAGGAGGTTGCTTTTGCA
TGAGTTTGACAGTAAGGGAGGCTGTTTTTTAGATCATACGAAATACCTTCTGTTTACTGC
AACAAAGAAAAGATCCACATGATGCATCAGGTTAAGTTGAGGAAGGTTTTTGCACAGGAG
AAAGTAAAACGTGACACATAAAGGTTGTTTATCTGTTTAGATTCATATTATCCTCGTCTC
CTCTTGACCTGTCTGCTGGTGTATTTCTCAGAGGGTCTTCGCCCGGAGACCAAGCAGCTG
TTGTCCTCCAAGAAGAAGGGGAAAAGCGGCAGCAAAGGCGGGCTGGCATGCGAAGAGGAG
CCCAAAACAGAGTCCCAGCCTGTTGGCATTCACCTGCATTTCAAGAGATACGTGTTTGAT
CCCCATAAGAAGATGGTTCAGTCC
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