SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003161_2.0
Identity
TranscriptMethionine sulfoxide reductase A (MsrA)
SpeciesXiphophorus couchianus (Monterrey platyfish)
Transcript IDSPT00003161
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003039_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00003161_2.0 # Transcript # Methionine sulfoxide reductase A (MsrA) # Monterrey platyfish (Xiphophorus couchianus) # Full length # Forward
AACGGGAATCCCACTGTGGAGCCTTTTCCAGGAGGCATGGAAACCATCATGTTTGGTGAG
GTGGCACAGTCATCCGTTTATAAAGCCTGAAACTTCACTGCATTCATGAAATCTCTGTGT
GACGCAGTGCAAAAAGGCCTAACTGTGCCTTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAGGAATGGGCTGTTTCTGGGGAGCTGAGAAGCTGTTCT
GGCGGCTTCCAGGAGTCTTCTCCACCCAGGTGGGCTTTGCCGGGGGCTTCACACCCAACC
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TCAACTACTCAGAATGCACTGCTCCAGATGGGCTGCACCCCCCCCAACATCCCCACTCCC
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GCAGACAGGTGGATGGCCTGACTGACAGAAACAGGGGAGGATGGAGAGCAGTCAGAAATT
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ATGAACGAAGTTACATCTTCAATGATTACCAAAGTAATAAATTAAGATATATTTGAAGGC
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GGTGCATGGACTCTGATTCTCTCGTCTGCAATTTTAAACCTGGAATTTCCTTTTGTTTTT
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GGTCTTCTCCCCTCAAGACATCAGCCTGGAGGAACTCCTTAGACAGTTTTGGGAGAATCA
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TCGTGCATGTTGCAGTGGGGGGAAGGTCTCATGGGTGCAAGTCAATGCCAGACAGTGTTA
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AAGATTGTGGAAAAAGTATTTCTTGCATTGTGCACAGCTTACACTTTAAAAAAAAACAAA
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GTGTGTGTCGGAGTATGTGGGGGGGTGGGGATGTGTGTGTGTGTGAGATGGCAGGAACGG
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TACACTTTTTTGTCTTTATAATCATAAATTTCAAGCGTTTGGTGTACATATGTATTCATT
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TTGAGACATCTTCAGTCTGTTAGAGAACATAACTAAATTCAAATTCACTTCAGTTCAAAA
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GTTGAACACAGAGTCCATAACATTAAACACAGAGTCCCATCATGCAGCTTTATATCAAAA
AGGACATAGAAGCTGGTCAAAGTTGGGCAATCCTGGAGGAAAGAGGCTACAAAAGACTTG
AAAATACAGTGGAGGTTTACCTTCCAACAGGCTAACTGTACAGCTAAATCTACAATCTAA
ATTTATCAATGTATTAAAATGGCCCAGTCAAAATTCAGACCTAAATCCGATTGAGAATCT
GTGGCAGTCTTCAAAATTGATCTAAATCTGGTAGAGAAATACAGCCGAGTTAAAACAGGC
AAAACAAATGCATGTTTTACGTCTGGTGAAGATCTTTAGTTTTACTAAACCTTCAATATT
TTTGTTTCTTTTCCACTTTACAATAACACTCTGTTCTGTGTTGGTCTGTCACACAAGAAC
AGCAATAAAATATTTTGAAGATTGTGGTGGCATTATGATGATCTGTGAAAATGTTTTGGT
TGGTGTTGTAAAATAAATCAAACGAGTCATGAGTTGTTTTGTTGCTGCTGTTCGGGTTTA
GGCCGTCCCATTGTTCGGTATGTTGAAGACGGGAGGCAGGGGAAGACATAGACTTTTTTT
TTTGGTTTATCTGAGAACCACATTCTCCTGATTAGAAGAGATTAGTCCCCTCTTCACAGT
AGCCGAGGGAAGAGACACGTCTTACCACAGGCAAAGTCGCAGACAGAGTTGAGCCGACAC
GCCACAGGGCAGAGGCAGCGAGGCCAAAGGAGTCGTCATACATTTCCCCCGATCACACTG
CCGTGGCTCATCTCATGTTTTATTAATAGCATGCAGCTAATTTTCTATGCACTCTGTTTT
TGTTAGTCACAGTTAAAACTGACCGACATATTGAAAAATCACCGCAAACTCAAAAGTACT
CGTATATATAAAAATTTTTCTAGGAGCTCTGCTCCTCACGCGTGACTTAAATGCGAATCG
GTGCCGTTCCCCTGCTCTCAGATCCGGGGTTCACGTGTAGCAGAAATTCTTCTGATTTGA
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CTTCAATTTATTCTGTCCACCTTAGAGCTGGGCTTAAAAGAGAATGAAGAAATTAAAGAA
GTTTTCTCTTTCCGCTTTGACCTGTGTAGATTCACGTGAGATGGTATGTGGGGAAAAGCC
GAAGAGCGTTTTGGGATCCCGTTTCCTCCTGATGTGCTTCATTACGGAGGCCAGGCTTAT
TTAATAATCAGTGTTGGCATGTGATTGAAACCGTGCATAGGTACTTATTTAGTTGCATGT
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GATATCTGTGCCTTTGCTGCTTTGCCTTAGTTCAAAAGGGTTTAGTCCCAACAACGTGAT
GTCGGGCTGCATCGGCTCCACCAATCCCGGCCTGGATAGCAACATTAGCAGCCAATCAGA
AACTCCCAGCAGCCTTTGCTATGTGCCCTCTTTCCATATTCAGCAACGTTAGTCTCAATC
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CTTTGTGTCAGAGGGTCACAGCAGTCCTGTTTTATCATCATGACTGAAAAGGTTGTTTGA
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AATACGGCCCACTAATAGCTTTATGTTATATTTTTGTTTATATTTTACCGTTTATTATTT
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GGTAAGCAGTGGAAAATGGATCATTTTGTGCAGCTTCTCTCTGTCTTTGCATCTTTGCAT
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TTTCTCCCCCGTTTCCCCCTCAGTTTTTGTGTTCTCTTCATGTTTGCACATTTTCCCATC
CTCCCCCAACTTGTCAGGTTCACCTGCACCCCCTTCCCCCTCCACCCTTGTCCTCTTTGC
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CGCAGAGCGGCACGCTGACTCGGCCGCTCCCTCAGGCCATCCGCTCATCACACAAACACA
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CCCTCCCCCCATCTTCCCTTCTTCTCCATCCCTTTCTTCAACCCCCAGCCGCCCTTCATC
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AAAACACAAATGCACAGCTAAAATGGCCGACGCAGCTGTCCTCATTTGATAACGTCTGCA
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ACATTCTGCATTTCTGTCTGACACGTTTTTGAGATGAAGTCGTTCACGGTTTGTTTTGAC
ATTTCGCAAAACCTAGATTTTTAGATTCCCCTGTAATCTGTGCAGCACCGATCCACAAAA
TGAAGATACACTTTTGCAGCTCATCACAGTTATAGGGTCAAACAATCAAACGGACATAAA
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CCTTAATATAATATCTTTACCCCAGCTGGCTGCGACACACGCCAATTCCCTGTTGGGGTA
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AAGCAAACCCCACTCCCATGAGGAGGCCTTGACCTCTGACCTGTGGCCCCAGTCACCCCC
ACACTCTCCTAACCTGACCCTGTTTCTCCTGCTTGGTTGGCTGATGATGGCCTGCTCATT
ACCAGGTGTCAGTCATTACACTCTCACACGTGCTGCAACCCTAATTTATGGAGATTGCAG
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TTTTGTAATATATGTTTTTAAAGAAGTCTTGTGTTTCTAAGAACATTATAGAATATGATG
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ATTTGTTTGCCTGGAAAGTCCGGTTTGTTTGTGGAAGTGTGAATATGTAATCAAACTCTG
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GGTCAGCGTTTGTTAAAGTTACGACCGAAGAGATTACATGTGCAGAATTCACAAGGTCTC
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CGTCCAGTGCACTTTGGGGAATCTTCTCTTATAGCAGACAATCACCACCACTCTAAATGT
TTGCAAAAAGCACATAAGAATCTTGCTTCTATTTTTTTTTTTTACTTTTAACACTGGAAT
ATCTCAGAAGAAGGTGGGGCTGTCCATGTGTTCATACTTCAGAATCTGGGCTGGGGTCTT
TCTGCAGGGAGTTTACATGTTCTCCCCATGCATGCATGCGTTCTCTCTGGGTACTCCGAC
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CACTTCCTGTTGTCGTTTTGTTCATGGTTTCCGCCAGTAGCAATGTCCGGTTGTTGATCA
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ATTCTCCCATTTTTGGGAGGGGCTATTAATTAATATTTTCAGCTCGGTGGGCGTAGGTCA
GTGACCCCTCAAGGCGACGTGTGCATGTGTGTGTGCACATGTGCGACCTCTGGCCCCTCC
TCTTCTGTCCACCCCCATTACCCTCTGCTTTCAGAGGCAAGGCTCTCATGCATAATGCAG
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TTCTTTTTATGGGGGGTTTTGTTTGATTTTTTAGTCATGGAGACGAGGATCTTATAGAGA
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GCCAACAACTAAACATTCCCCCTCTTTCGTTATTAACTTTTTACTTTTTATAACTCTGAA
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GGCGGATGGTTGCTTGTACTGAATCAAGTTCTGGTTCTTCTGGAGGTTTCTTTCTGCTAA
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TGAGGTTTGAAAGTAAAGGGGCTGAATATGTGCGCGCCACAAATTTTAGACTTATTTGTA
AAAATCTTTGAAGACCTTTTTCCTTCGTCCTCCTAATTTTGCGTTATGTTTGTTGGCCTA
TCAATTAAAACCTAATGGAACAGCATTAGGTTTGTTGTTGAAAAGTGCTAAAAGCAAATA
AATCTTAGGATAAGAAAATTTTTACAAACTGCAGCTCACTTTTATTTTTTAATTTAGGTG
TCTGATCACTGTGCTAACGTTTTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTGCTGGAACATACAGTA
GTTGTGACATTGTTCTTTAAGAACTGTCTACACTGAGAATATATAAACTTTCACAGATTA
ACTTTAGTGAAGTAAATTTTTGCAGAATTGCATCATCACTCAGCAATATTTCACAGAAAG
AATTTCTATGCAAGTGCTAGAGGGGTGAGCAATTCTGCAGCGTTCTGCTGCCGTAATGTT
AATGTCGGAAGTGGTTTTACTGGAAAACATCTGGATGTTGTTTGGGATTAAGATGTAAAG
AAAAACTTTAGTTCATTTGTAATGTTCTGAATTATTTAATGCATTATTGCTTCATAAAAG
AATAAGGAAAGTTCTTCAATAGCAATTGATATTTAAATGAGATATTTCCTCTGGCTCTTA
TGCAAAAAGATATACAAAGTTACTGATGGCAAAATAATTAAAAAGTTAATGTTGTTTTGT
TTAAATAATTGTAGGATGAATGTATGAACTGATATCACAACTACAGTAACTGCTTCTCTC
CTTTGTTTTCAAAATCTTTGTATTTGAAAAATGTTTCCCCTGAATGTTGTCAGCACAGGT
TTCTGTAATTCAGCTTTTCCCCTCCAATACACATTTTCATCATATTTGAACCACGCAAGA
ATGTAGTTTTATTGAGGAACATTGAGTGAAGCAGATTCTCTGAGGCAGCAAACATCCCTT
ATTGTGAGTTTATTCAGTGTGTGTCACAGAGCAGCCGCTGGTTGCTTGTCTGATTTGATT
TGAATGACGACCAGATGAATACTTATGGCCGTTCCGCTCCAGCAGGCCGCTTCGCAGATA
GGTTGTGACATTCCATGATGTAAGGTAACGTTTAATCTAAAGACAACAAGATATGCAGAT
TACTGTGTCAAGGAGACGTTTTCTGTGTCAGTGGAGATTGTTACTCTCCCGTGGTGAACA
CAGAAAGGCGACGCAGCAGTACTGCTGATGCATTACATCAGGGTTAACTTACAGTACTGT
GATCACAACTGATCCATTTATTACAACGGATAAATACAGGCAACATAATCTCAACCACTG
CTTTGAGGCCTTGGTTTCAGTAGTCAGGCTTCGGCCATCCTCGGTTAATGCAGCCAGAAG
TAACAAACATCTTAGTTAAAGAGCTTAGTGCATCCTCTGGGTAATTCCCAGGCTTGCCAA
ATGTCATGCCAGATTTTAAGATTCAGAGTAAATCGCACTGAGGTCAACATAAGTCCTGTT
GTATGAAATTGCACAAATGTTGAATTTTGGTATTTTTCTGGTCTAATTTCTCACCTATAT
ATGACAAACAGAAGTGCTTTACTAGGATGCAGCTGGACTTTTCTCCTGTTTCTTTTCACC
TTTCGCCTCTCATCCAAACTTTACAGCTCAGCGTTTGGGAAGTTGTTGCTTGTCGCTAAC
AATGCCATGTGAGCAGTTTTGGACACATGTCCCAATGTGTGAAGTGCTGACTCGTCTCTG
GGGAGAGAGCCAGAGCTACAGAGCAGTCTTACATCACTGCTACCTCCGTCCTTCTGATTT
TATTAAAGGGGCAATATTATGTGTTTTACAGGCACATAGTACCATTTTATAGTACATTAA
CACTAACTATGTTACCTTCAGTTGTTATAAAAATGTTTCGTACATCAAACAAGACGTAAA
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TTTCAGGGGAGATTGCAGGATGTCTCAAGCATGCATGAAAGAATCGAAGGTATGTTTTTG
ATGACGGAATAACATTGTAATGGTAAATGGACTGAATTTATATTGCGCTTTTCCAGTCAT
TTTGACCACTCACAGCACTTTGCACTAGAGTCACATTCGCACACACATTTATACACCGAT
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GAGCCACTGTCACTGTGGGTAGACTGCGTATTCATAAGTACTGTAAATATTTGTGTATTA
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GGCAGTATTATGAAATGGGATTATTATGATTGATATTATTAACCAATTTGTAAAATGATT
TACACTTTGTGTTATGTAAAAGATATCAAAGCTTGATAAAAACCATCAACTAATTATTAT
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AGCTCTGGCATATGGCAGCACTGAAAAACATCACCCAACCTGGACACCCTGAGTTACTAT
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TTTTTTATGCTGAAACTCAGATTTGTTGGATGAGCTCAAACACAGCTTGGAATCCAGCAC
TGGTGCATGTTTGATGTGCAACCAAGAAGCCGTTTGCCAACTCGTTCTCACGTCATCTTT
ATAAGGTGATTAGTAATCACTGTTGGGTTTACAGCTAGAGCTTCTCCTTGAATTAGTGCC
AGAAAATTACCTAACACAGTAAGAAACATTAGAGAAGTCCTGAAAGGGAAATGTGCCTCT
TTAGGGGAACGCTGCAGTTGTAATGATGTGAGCTGATGGTGCGTTCAGTTGGCTGGAAGG
CGTATCTGTTACAGCCTCCACTGACTGCAGCTCATAGCAACCAGTCAGAGATGGAGAAGC
GGCAGCATTTTCCAGTTATGGATGAGCATAAGAATCAGACAAAAAGCAAACGGTGCAGCC
AGCAGAGAGTTGCACACTGATGCATTCCTTGATGCAAGAGCTGCTCAGGATTGTAGCTTC
TTAAAACCTTAGAAGTGATGGAAGCTGTTTAGCCCTCTAAATCAAGGTGCTTTAGGCCTG
GCCTCCTTCCAAACCCACTGATGTAAACCTGATGAAAATGTTGAGAGCGTCTCTCAGATT
ACAGGAGACAAAAATTCATCTACCTACAGTCCTATTTGCTCCTCTGCAAATTAAAATCTG
CTTTTACTTTTTGTGATACTTAAAGATTTCAATAAACAAATCTTAATATCAGGCAAATAT
AAACCACAGTTTTTTAAATGGGAATTCGATTTACTAAGAAACAATAACTATCCAAACCAA
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GAACCAAATCTTATGTTTAACTGTTGTGAAAAGATTTTTGTGAATTCTTCTGCTTTTCCT
TTTTGCTTGTTTCAGATTGGCTAAAGAATTATATTGGAAGAAGATAATCTGAGTACATAC
AAAATGTAATTTTCTGAAAATGCTGCTTTTAAACAAAATGTGGCCTACTTTATGTTGTCA
GACAAGTTCTACTGAAGGGATTTCTAGGTTGTACATGTCCTGAGACTAATCAGGCCTGAG
CGTTGCAAATGAAATGAAACGCAGACTTGGTATTGGCAGTTTTTCTCATTTCATGAAAAT
GTGGTGTGATGACATATTCATGCAGAACATGTCCATCCTCTGATTGTGCTTCCCTTGTGT
GGCTTCTATGTTCATCCTGCTTTTTGTTTTCTGCAGGTATGAAGCAGCACAATGACAGCG
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