SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003185_2.0
Identity
TranscriptSECIS binding protein 2 (SBP2)
SpeciesXiphophorus couchianus (Monterrey platyfish)
Transcript IDSPT00003185
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003063_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00003185_2.0 # Transcript # SECIS binding protein 2 (SBP2) # Monterrey platyfish (Xiphophorus couchianus) # Full length # Forward
GTGAAGCTTTCACCTGAAGTGGAACCATTTATCCCACTGAGGAAAGGTTTTGAAGGATCA
CTGGTCAGCATGAGTCTCTCTGGCGAGGCGGGCGGCGGCGGAGGAGGGGGAGCCAGCGGA
GGGGTGGAGGCTGCACCCATACCCAGCTACCTCATCACCTGCTACCCATTCGTCCAGGAA
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GCTATTTTAGCAGCTAATTTGCTTAAGTCTAAAACTATTGTTTCTCTTTGCACTTTATTA
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GAAAAGTTCAAAGATCGACTCTTGAATTATATGTTGGCCTAAAATACTGAGATTATCTTA
GGCAGCTTCGTCCTTTATGGTGCTATTTGAGGCATCAGTAGTTCCCACTAACGTAACGAC
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GATCCCGTTTGTGTTTGCCTTGGGCAGGAAAGCTCTTGGACGCTGCGTCAACAAGCTGGT
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NNNNNNNNNNNNNNNNNAGAACAGGAACTTGCTGTAAAACCACAATTATGCTGAGCCAGG
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AAAAATGGAAGAAACTTCTTTTCTTTTTTTCTTTCAGAGACGAACTGGAGGAGCATGATG
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GCCTCCCAGAGTAATAACAGTGAGACATCAG
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