SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003199_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein P (SelP)
SpeciesParus major (Great Tit)
Transcript IDSPT00003199
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003077_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00003199_2.0 # Transcript # Selenoprotein P (SelP) # Great Tit (Parus major) # Full length # Forward
ATGTGGGCAGGTCTGGGGCTAGTTCTGGCCCTCTGTGTCCTCCCAGGAGGAGGGACAGAG
ATCCAGAACTGCCAGGAGCCCCCAGAATGGCGTATTGGGGAGGAGGACCCAATGTGGAAC
TCCAGAGGCTCGGTGACAGTGGTGGCTCTCCTCCAGGCTAGCTGATCATTGTGCCTGCGG
CAGGCTTCCAGGTAAGTGTGTCTCATCCCAGATTTTGCTCTCCAGCTGAGAATACTACGT
GTGCCCTGCCACAGATGCACTCCATCAACTCTAGCTACCCCAAATGCCACCATCACTGCT
GGCATGTGTGACCCAGTGACCAGGCTCACTATCAGCAGAAGGGTTCTGTGCCAGTGGGTA
AGATTATCTCTTGACCTATTCCTGACTTTCAGGAATAGATCATCTTCTCCAAATTATGTT
TACAACATAATTGTATGATCAACTTTAATGACATTAATGAAACCCAAACCACAAGAACAG
CAACAGAACCAACAGAAACAGCAATAGATGATTAATGTAGCAAAAATAGTGAAGCCAAGA
AACGTCACGATTCTTTAACATGGTTAGATCATCTTAAATAGAGATGTTATCACTGATTTC
TTATGTAAGATCTGTGGGGGGAAAAAATTAATCAAAACTTGTGCTTTTAATGTGGCCTTT
CAGCCTGTGTTCAGAGATCCTACATATATTTAAAAAATCCAGAAGTTAAGTTAAATACTG
TCCTTTCAAAAAATTGATGAAGCATTCAAGGAAGTCATTAGTTTTAGGTTTTCATCCACG
AACTGGGACAGTGATGCTCTATTTTCTAGAACTTAATCCTTGCAAATAAATAGCTAGCAT
GACAGTAACAGTAGTTACAAAATAATTTTCAGCTGACCCAAATAGGAATTGAATAAAGGT
TTTATTTTTGATTCATTTAGGGATTGCAAAATTATTTTGGTTTAAAAGTTCATAGTACCA
GTTTTAGATTTGGATTTTAGTCACAGTGAGCGCACCTTAGTTTTCCTCTCTAGGCTGCAT
GACTTACATATCATAATAAGCTTTGCAAGTTTATTAAGAATTGGATTTAAAAACATAGTG
GTAAATCTGTGTCTCTGTCAGAGTTAAAAGTGGGCTTTCTGTTTGGCTTTCAAGGTCGTT
GGTTTTGGTTCTTACATTTTAGAAAAAAATTAAAAGAATCTTCCACATTCTAAACTATTT
CCTGTAACTGAAAAATAGTTTTCTAGAGCAATTCCACAGGAAAGATACAAATGAAAAGGA
AGAAACTCCATGTCATACATCTATAATAAAAGCAAGATGGAGCATATTAACTCTTATGTC
AAATTTGTCTCATGATTCTCTAATGGTTTATGGTCTTGCTTCTTTGCATTCCCATTAGTT
TGGAGGACCTGCGCGTAAAGTTAGAGAATGAAGGATTGGTCAACATCTCGTATGTGGTTG
TCAACCATCAGGGACCTCAATCCCAGAGGGAATTTCACCTACTAAAAGAACGTGTTTCAG
ACTACATTACCGTCTACCAGCAAGATGAGCAGCAAGAGGATGTCTGGACTACTTTAAATG
GAAACAAGGATGACTTTCTCATCTATGACAGGTGTGCGCTTACAGACAAACATGGGAAAA
CATTCACATGTATTTTGAGTAATGATCCGTAAATCTCTGTATTATTTCATTGATGTGCAA
ATAACAAAGACATCATGCTCAGCGTTTAAGTTGAACTAAGTAAAGTGCTAGTATTTATTG
GAAAAACAAAGTTACAAAAGCTAAGTTTGCTTTTGCATGAGTAATTTTGGATTATTTTTT
TTTTTTTTATAATTAACATGGATTTAGATGATCATTAAATGCGCGTAAAATTTGGTAACA
TGTTCATGGTTTTATAGTGTTTTTATTTTCAGATAACTTTATTACATTCATGCATGTCAA
AGTTTTATCTTTTATTTCATGGAAACTTTTTGATGAGAGTTGTTGAAAATGCCATATAGA
CATAAGGAAAATTAGTCTTCCGGTCAAATTTAAAACTTCAGAAGAAAATTGCTTTTCAAT
ATAAGATTTTTCCCCAGGTATATTTTGGAAGCACCACTAGGTAATTAAAATCCCAGTTTT
TCAATTTTGATGTGATGGTAGTGACTCTAATAGTTACTACTCCTTGAAAAATCCTGCACT
TCAAACATGTCTATCCTTGTTACTTTATATTACTGTTAGGAACATTCCAAGCTCATACTA
AACCATAAATAAGCTTAATGAAGAGTTAGAAAGTTATTCTTTTTCTGTAATGTGATGAAT
TTAAATTAGATGAAGTTTGTGGGATGAAACTAACACTGGAATGAGTGATCTTGTATGTTA
CAGCAGCAAGTATGCCCAAGTAAGAAAGGCTGGTGTCATACAACAGGCAAACAGAGCAAG
GCTGTATTCCGTCTGGGAGCATTTGGAAGGTTGACCAGTTCTGTGCTGTTGACACACAGG
ACATATGTACATTTTGGACTGTTTTAATGGCCATGATCCATTATGGTTCTAGGAGTCTGT
GTTGTTATTGTGCCTTAGCTGTGAAAGCTTTGTCTGCTGCTGATTCTAAACGTGCAGTCC
CCAGTGGGGAGCTAAGGCCAGGGGACTGTGTGTTGGCATTGAACTGCCATTGTGTACAGG
TTCTGCATTTACTCCAGCTCCTTTGAGCAGATCAGTTGTATAGTTAAGTGTGTATCAGAA
CACTCAAGTGTAACATGGGGCAAGCAGGCACCATAACAATCCCCTCATGCACAATAAATC
AGTAATGCTGATTTACTGATTAACTGCACCACAATGCCCATCCCAGTCAAAATACCTTAG
GTTTCATAGAAACACGTGGTAAGGATGCAGCAATCACTATGCAAACAACCCATCTCATTG
TCCCAATGGGTCTGCAATGAGTGCACCTCTGCCATCCATAAGTGCCGCTAAGGGAGAGGC
AGTGCAGTTACCACATCAGCTGGAAATCATGCTTCACATACTGGGCAGTGCAGGTGAGCA
GGCAAGAATTTGTAAGGAAGACACTGGATTTGGCTGTGAACTGGAACAGAAACACTCCCC
ATGGAACTGGTACAGTGTGGGTGGATTGATGCAAGTAAAATGAGATATCATAAGAAGTGA
GGTTTAATTGTAGGTATTTGTATTTCTCTCCTTAGATGCGGCCGTCTAGTGTACCATCTC
GGTCTGCCCTACTCCTTCCTGCATTTTCAGTATGTGGAAGAATCTATTAAGATTGCATAC
TGCGAGAACAAGTGTGGAAACTGCTCCTACACGGTATTTTCTTGTCTCATTCTGTGTATG
GTAGAAAAGAAAACTGGATATGATTGGTATTTAAAAAAATATTTCAGTGATTAATCCAAA
AAGATTTCAAATTTTCACATTTCATGTATCTCGGCAGACAGCTTTTAAACATTTTTCTAA
GTGGATTAGATTTGATTTCTAATAGACTGACTGATTATCTGAATTCCTGTCCTCGATAGA
AATGCAACTAACTGTCAGAAATGTAAATTCAGTCTTGGAGGGTAATTCAATTTGTAGAGC
TATATAGAGGTAGTAGAGGTAGTGAGCAATTAACTACTCTAGTTTTGTAGGATGGGTAAG
TACATAAAAAACAGTATTTTTTTAAAACCTGGGAATGAAACTCAAGCTGGTTTGCATTAC
TATTCATTGTAGTTTGCATTTGAACACAGTTTACAAGAGTTATTTTTAAAAAGGTGATAC
AGTACAAGACAAACTATTGTTGCTGCTGTAAAAGAAGCTTTTTTCTAATGCATCATTCAA
GATCAGAAATGCTTTTAAGGATTATAATGAAATGTGAACACATAATCATAGAAGTTCAAT
GAGAACAATAATTTTTGATCCCAATGTGCAGTGTTCCGGCTAAATGTAGACCACATACAG
GTCAGATGTAGGATCTAGGATAAGAATACTTGTTATTGGCAATTTCTGAAATTTTAATTG
CTAAAAAGCCGTGTCTAGTTGACAGTAGTGTGACAACAGAAGGCTATTTCTGATATGCTC
ATACATTCTTCAACAAAATAGAACAAATAATTTAAAAGTGCCTTTCATGCTCTGCAAAAA
TGTTAGTTAATATTTTACAACTAGTTTAATTGAATACAGTGCCCTGTATTTAATACAGGT
GTCTGTTTTGCAGGAACCCGATATTGATGGTGTATGTGAAAACATCACTAAAAAAGCAGG
TGAAGAGCTGTCAGAGATAGAACCCAAGCCAACGGGTCAGCATTCCCATCCCAACCTGCA
CAGACATGGACACCACCATCGCCGCCACCACCACCACCATCACATGGGCAGTCGTGATCC
CAAACACGAGGACCACCAGGCTGCTTCTCAAACTGAGAGACATCATCCTCACGGCGGCTG
GCGTCACAGGCTTTTTGGCCGTCACAGACATGATCAGATAGGTAGTCAGGAGCACGTAGA
CACTGCCCCTCCAGGAGAAATTGTGGAAATTGCACAAGATAGAAAACTACGAAAGAAAGG
GAAAAACAGCTGCAAAAACCAGTTAACTTGAAATTGGGAGACAGGATCAGGCTCAGCCTC
TAGTAGCTGATCCTGTCATTGTCGACACCTTTTGTTTGAAGAGCTAGGGAATTCTGTCAC
TTGACAGTGTCGTGGTACACTACCAAATTCTTGCAGGTGACATGGGCAACTGGCAGCAGA
GGACATCACTGAGTCTTGACAGTGACGTCTGCTCTCTGCTGCCTGACATTCATCACCAGC
AGGAGCAAGTGAAACTAGTGACACCTGACAGTGACAGGAAAAAGCGAGAAACTGATCCTG
AAAAACAAACTAAGCACCTTCCAGAAACAAGAGAGTCCCACTAACTCAGTTCTTATAGTT
GCAAGAGCAGAAAAATGAACAAATTAAGTGTTTTCATTGCCCCAAATTCAAAATTAAACT
GACAGGTATGGGGATTTAAAATATTGCAAAGAAGTGTAATTTTAGAGCAGGGCTCTTAGA
ATAATAGAATATCCATCAAATTTCATCAGAGAAAAGCTTCATGATTTAAAGGAATTTGGT
TGACCCTTAGTTTGTTTTTCAGTTCCGCTGGGAAGGTGTCTGCATTCTCGATTAATTTGT
CTTTCTTGTTTCTCTTCTAACATTCTGCTTGCATTTGTGAGGACAGGAGCATAAACTATG
ACCTAGGGGCTCCTGTTTGATGTTTTGCAATCAAGAACAGAAGATAACCAAGAAAGATAT
TTTAATCATTTTTTATTAAGGGATAGATTCAGAAGTTGAGCTTTTTGGTTTTTTCTAACC
TGGGGATACAAATCACGTACAAGCAAAACTTACTCCTAAGCAATGTGACAGAACAATTCC
ACAACAAAAATGTAATATACAGACAGTAACTGCTTTATTTTCAAGTAACAGATAGATATG
CTTAACTTTTGTGGCTCTTAGATACAGTAAGAGGGTCCATTAACACATACTGCTACTGCC
TGTAAAATCCTACTGAATCAATAAGCAAGAAGTAGTGTTAACAACTGACAGGCAGAATCA
AAAAGAGGGTGGGATGAAACAAGTTTAATCTTGGTGTACTGTTGATCTTTGTAACAGTGC
TGAATTTGATAAATCTGTATCAATTAGTAACAAAATATACCACTTAAACTTGTATAACTT
CTCTGTTTGTAGCCTAGCATTTCTAATGTTTGATTAACTGAATGGAAGTAAATCCAGTTT
GAAGGATTCCTGGATGAAGAAAAGAATATTCATGAAAAGAAAACTGCTATGAAAGCATAC
ACCATAATTAATGATGGTTTAATAGGGAAATTACTACTCCTACAAAACCTGAATCTTTTT
ATTGTGA
Chart Advanced