SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003234_2.0
Identity
TranscriptSelenocysteine synthase (SecS)
SpeciesIctalurus punctatus (Channel catfish)
Transcript IDSPT00003234
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003112_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00003234_2.0 # Transcript # Selenocysteine synthase (SecS) # Channel catfish (Ictalurus punctatus) # Full length # Forward
ATGAATGACGAAAACTTCCGGCTGAGTGAGAAGCTGGTGTCCGCTTCCTATGTGCGGCAG
GGTGTCCAGGCTCGCTGCGGTCATCAGCAACTCATCAGGACTCTGCTAGAGCAGGTAGAC
TTCTCATAAAACCCTGTACTGAGCACCTCAACCACCAGAAATATGCCAACAATATCCAAA
GAACAAAACAACAACAACCCGTTAGACAGTACGACAATATACAGGGGGGTCCAAAGGTTT
GAGAGCATCAGTGAAAATGCTTCTGTTGTGCCTTCTTTTCTAATTTAATACAGCAGCTTT
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GTCAAGTCGAGTGGATTTTTATTAGGGCTGGGTATTGCGACCAATTTGGCGATTCGATTC
TTATTTATATGGATTCGATTCAATTAGATTCTTATTTATATGGTTTCGATTCAATTAGAT
TCTTATTTACATGGTGTTGATTTGATTCTTATTTATATAGATTCGATTCTTGTTTATATG
GATTCGATTCTTATTTATATGGTTTCAATTCAATATCGATCAGTTATCAATATTTCATTT
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TATGTTGAATTACTTTTACTTTGAGTAACAAACATTGTAACAAGAAATCATAAATATGTG
CATACAATGCACACAAGGAGCAGAAACTGTACAATGCATATAACTGTAATAAAAAAACAA
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CTCAAGTAAAGTAATCTCTCAAGAAATCCCCGGATTTCCTGAATCAATTCCTAATGTGCG
TGCTTTAATTGAGAGAATGTGAATATTATCTCTACTTCGCCTCTCGTCCTGAATGTATTG
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AAAGTAAAAGTAATTAAACATAATTGTGTGAGCCTTATTGTTAAGGTAAACATTTCGTAT
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GTTTTTATTGTCATTCCTCTATACAGCTTGTGTGCAGTTGAACAAAAGGGCGTTTCTCCA
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AGTAATATTGGCAGCAAAAACAAGTTCCGTTACACAAGAGTGACTGATGCATGCAGCTTT
GTTGTTTTTGGATCTTACTGGGGTAGGTGTTTGGCTTGCCCAGGTGAGCATTGGGAAGCA
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TGGCATGGATGCTCCTGTACCTTCTGCCCGATGACAGGAGGGTTAAGAGTCCGTGAGAGG
GGTCATTTGCAATACTGGTGGTTTTGCAGATGCAGCGGTTGTTGAATGAGGTGTCGATTG
TGGGTAGAGTGACTCCAGTGATCTTTTCAGCTGTACACACAATTCTCTGTAGGGTCTTGT
GGTCAGAGGCTGTGTAGTTCCCGTAACATACGGTGCGACAGCTGGTCAGAACGTTTTCTA
TGGCCCCTCTGTAGAAGGTGAGGATGGGAGGGGGAAGTTTGGCTCTCTCCGCTTCCTGCG
GAGGCGCTGCTGAGCCTTCTTTACTAGGTAGGTGATGTTGAGAGGTCCTCTGTCATGTGC
ATACATAGAAACTTTTAGATTTTGACTCTCTTCATGGCTGTTCCGTTGATGTGCAGTAGT
GATTGGTCCACCTGGGTCCTCCTGAAGTCGACAATCATCTCTTTAGTCTTATCAACATGA
AGAGATGGATTGTTGTTTCTATTCTGCGAGCTGGTTCACCTCCTCCCTGTACTCTGACTC
ATCATTGTTGTTGTTGAGGCCCACGACTGTTGTATCATCAACAATCTCGATGATGTTATT
TGAAATGTACTTTGCAGCAGAGTCATGAGTCAGCACTGTGAACAGCAGTGGACTGAGCAC
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GATGGACTGAGGTCTCCCGGTCAGAAAGTCCAGAATCCAGTTGCAGAGGAAGGTGTTTAA
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GTCTGTGAACAGCATGCTCTTAAGTATATGTGCATGTGTAATAGTTTGCCCCACATCATT
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CTGTTGAGTTATTTATAGATTTAGATTTTAGCTCTCTCAGTTAATATCATGCTCATCGCT
CACTGTAGACTACTGTAATTGCAGTGCCTAGATGCTACAGTATGATTGACCTGTACCTTA
TTACTTAACACTTTCTTCTAAATAGGTAAAGGTGCTATTTGTGAGATGTTTCCCTGTCTT
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AGCTCGCAGTCATGGACAGTAATAATTTCTTGGGGAACTGTGGAGTTGGAGAGAGAGAGG
GCCGAGTTGCCTCTGGCCTGGTGGCCCGAAGACATTACAGGTAACTTACATGCTAAGTTT
CATTTACATTGGTAGAATGGTGGCCTGGTGAGCAACGGCACAACTTTGTGTAAAATGAGG
AGGAATGGAACTATTACATTAGTAGTTCAACCAGTCGCCATGCGTTTAGTGTCAATCCTA
GAGCTACAGTGTGTGTGTTTCCCACTGTCTTTGGTAACAATTAATAGAAATCTATAACAA
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CTATAATATAAGCATAACAGTAGGGTAAAATGCACATGCACCTTATGAAGAGCAGCCAAA
TATCAGCATTAAACATGAAAGTAAATAAAGTTTCTGACTATCTTTTAGTAACAAATGGCA
AAGGTAAGGCCTGACACAAATAGCTTAAGGCAAGGCACAATAAGGGAATAGGGTAATTTA
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TATATGGTATATTTTTGTACTGGACACAAGTACAAATATGCAACTATATTTTGTTTTTGA
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CATGTGCTTCCTTTGTAAAGCAGGAAATCTAGCCTTTGGATCATTCTTCCAAAAACTTAT
ATTTTTTATTCTGAATATAATTTAAAAAAAAAAAGATTTTCAGAAATTCATTTGTTTCCT
TTCTAGTAAGTGTGGTTTATACAGTTTCTAAAGGAAATGGCCATGTGATGATGACACTTA
AATTGACATACAGACAGGTGACAAATTAAAGTAAAAGACAGTTTATGTTTTAGTAACAGG
GTGTTGGACCAACATGAGCCACCAGAACAGCTTCAGTGCACTTTCGCACAGATTCTGCAC
ATTTCTGGATCTGTAGTAGAGTGTTGAATATTGTTCTTTCAAAAGAAATTTCTTCACTTG
TCTTTTTTTCATGATGGTGTTAGAGACCACCATATGCCATAGCATATGCTTTACATCATT
TTCATATTTCTCAAAACATTCATGACTTGTGGATGAGGACGTTAAAGAATAAAAGGTGCT
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TCAGCATGTTTTCCTTTAATTTGTCATGTTGTGTACATAGCAGGAAACAAGCTTTTCAAA
GATAATGACATTTTGAGTGACATTTAACATTTTCACTTAAACTGTTGTAATTAAAATACT
CAGCAAATGTTTATTTCACTGTATTGGCACCGACTACTGCATTATGTGTAAATGAGCAAC
TTTTAAAGTTTAGCTCCGCCCCACATAGCACTCATCATGTCGTTATCATATTTAAAAATC
TGAAAAAACTGATGTGACAAAACTCTGCATTTCTACCTTGAGTGTCTTGCCTTAAATATA
TACCTGTAATATACAAGAAGTTTACAGGACAATAGCAATAGTCATCAAATTATAACTCCG
TTCCACAGCAAAGTATAGAGTAGGTACAAATAGTTCATAGATCAAAAACCTTCAATTAAG
AATTATGATTAAAATGTTGGTGTAACAATTTGAATATATATTAGTGAATGCTGTGTTTGC
CTACATGCTCTTATATATCTATATGAGGACATATAAATGTCATATTTAAAAGTAAAAGAA
CTAGAAATAAATGTGTTGCAGAATAATGTAAAGGTCCAAGCATGTTACAAACTAAGCTGA
AGCTCATATTCAGTTCTCTGTCTTAGATTGATCCATGGCATCGGCCGCTCTGGTGATATT
GCTGCTGTTCAGCCGAAGGCCGCTGGCTCCAGTCTCCTCAACAAGATCACCAATTCAGTA
GTGCTGGATGTTCTCAGATTTAGCGGTGAATGTCACATGATTACTTGGAGAAATTTGCTT
TCTTGTATTAATGAATTTATTGGATGAAGCTGTTTTCTTCACACAGGTGTTAGAAGTGTG
TCATCATGCTTTGTGGTGCCCATGGCAACTGGAATGAGCTTGACGTTGTGTTTCCTGACA
CTCCGACACAGGAGGCCATCAGCACGCTACATTCTTTGGCCTCGCATTGACCAGAAGTCC
TGTTTCAAATCGATGGTCACTGCCGGTATGTCTGTAGTATGACATTAAAAATAATTAAAC
TAATAAATTAAAGAAAAGCTGATCACATAGTACAGTCAAGATTATATTTCTATTGCTGGT
AGACAGCTTGAGTTAGCTACATCTTACCATAGCTCTCATATGGTATTATATGGTATCCTA
TCCTTTATAATTGATTTTTGTTGTTGATATTATGCACAAAAAAGCTTCTCTGCATAGTCA
GCGTTGTTCTGTTTTAGTGGAGAGATGCATATAAACACATAAGCAATATATTTATTTTAT
GTCAAAAAAGATATAATACCTGTATTGTCTGGTCTAAATATGAGCAGGGTTTGAGCCGGT
GGTCATTGAGAATGTTCTGGAAGGAGATGAGTTGAGGACAGACCTGGAGGCTGTGGAGAA
GAAGGTCGAGGAACTTGGAGCTGAGAATATTCTGTGTGTTCATTCCACCACTTCCTGTTT
TGCTCCTCGCGTCCCTGACAGGCAGGTGAACTGGCCAGTTATGGTCTGTCTCAGACATAG
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GTTAATTACAGGTGCATCTAAAAAAAAATTAGAATATCGTGGAAAAGTTAATTTCTTTCC
TGTAATTTAATACAAAAAGTGGAACTTACATATATTCTAGATTCATTACACATAAAGTGA
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CAAAAATCCAGTATCTCAAAATATTACAGTAAAGAATTTATAATACAGAAATGTCGACCT
GAGAAGAGCTCTAATCAGCTAATTATCTCAAAACATCTGCAAAGGTTCCTGAGCCTTTAA
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CATTTCACTTGGAAATCAAGGTCCCAGAGTCTGGAGGAAGTGTGGAGAGGCACAGAACCT
AAGTTGCTTGAAGTCCAGTGTGAAGTTTCCACAGTCAGTGATGATTTGGGGGGCCATGTC
ATCTGCTGGTGTTGGTCTACTGTGTTTTCTCAAGTTGAGAGTCCATGCAGCGTCTACCAG
GAGATTTTAGAGCACTTCATGTTTCCATCTGTTGATAAGCTTTATGGAGATGCTGATTTA
CTTTTCCAGCAGGACTTGGCACCTGCCCACAGTGCCAAAACTACTAGTAACTGGTTTACT
GACCATGGTATTACTGTGCGTGATTAGCCAGCCAACTCACCTGACCCGAACCCCATACAG
AACCTAGGAGAGACAACAGACCCAACAATGCAGATGAGATGTAGGCCACTATCAAAGCAA
CCTGGGCTTCCCGAACACCTCAGCAGTGCCACAGACTGATTGCCTCCATGCCACGCCGCA
TTCATGCAGTAATTCGTGCAAAAGAATTAAAGCCCTGACCAAGTATCGAGTGCATACATT
AACATACTTTTCAGAAGTTCGACATTTCTGTATTATAAATTCTTTATTTGATTTTTGATT
TCCATGAGCTGTAAGCCGTAATCATCAAGATTAAAACAAAAACGGCTCGAAATATTTCAC
TTTATGTGTAATGAAGCTAGAATATATGAAAGTTCCACTTTTTTAATTAAATTACAGAAA
AAAACTAACTTTTCCACGATATGCTAATTTTTTTTTTAGATGCATCTGTATAAAGAGAAT
ATAAAAAATTTGCATTCAACTGTATTTAAGATTACCAACCCGGAAGGGCGAAGGCTATCG
TGTATTTTCTCTGAGTCAAGTGATGCCAGTCGACCGCATCTTTTTGAACAGCTGCTCATG
CACCGTCTGGGGCATATTTAAGTTTTAAGAAATAACCTGTCTACAATTAAGATAAATACA
TAAAAGAGATGCAAATCACTTTTATGCGTCTTGTCGTACAGGTTGGAAGAGCTCTCTGTT
ATGTGTGCCAAATATAACATCCCTCATATAGTCAACAATGCCTACGGAGTGCAGTCATCC
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GTTATCTTGCTTAGATTAAGCTGTTCAGACATGTGAGCTAATTGAGTGTATTTACAGGGT
GCGCGAGTGGGCAGAATTGATGCCTTTGTTCAAAGCCTGGACAAAAATTTCATGGTTCCT
GTTGGAGGTGCCATTATTGCAGGCTTTGATGAGGACTTCATTAAGGAGATCAGTAAAATG
TACCCTGGTTAGTGTGTGAATCACTTCCCCTTTGTCTCTGTGAATGTGTTTTGTAAATGA
CAGACTCAGTTTGAGCACTTTATCAACATTTCAGATCAATAAACAGTTCAGCATAAAGAG
CCCATTCGGTTTATTAGCTATGTAGCTGATTTCATGCAAACGCACAATGCATTCAGCTTC
TGAAGCTGTGGTTGTTAGGCTTGAGATATTATTTCTCTCTGCATGTTTTTTTTTTTGTCT
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ATATTGATTGTGCATTCCTTTATTATGGGACAGGTTTTACTATTTTGAGTACTCCATATC
CTGTACAATTTCTATCAGAATGTTCTTTTCTGTCAGAACTGTTAGCACAGATATTTTATA
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CTGTCCAACAGGTCGTGCATCAGCTTCCCCCTCTCTGGACGTGCTTATCACTCTGCTCAG
TCTCGGGGCCAGTGGCTATAAAAAACTCCTGTCTGAGAGAAAGGTAAACCGCAGACACAC
GGCACTGATGCACTCAGTGCCCAATATGCTGGAATGTTCTTTTCTCTGCAGCACCTGCTA
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GGTAGTTGTGTACAACTGTGCAGTGTTAGTGGATAAATGGCCATGTCACAGAGGAATAGC
TGCATTAATTCCTCTCCAGGCTTCAAAAAAGGAACAAAGGAAAATGATATTAACCTCACA
TGATACAGAGCATGCTTTATTTACACATTTACATTTATCTGTATCGTAAACCAATAAGAT
AATAGAAAAAAATAACTGTGTGTGTGTGTATATACAGTGAGGGAAAGAAGTATTTGATCC
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GCACACTCTTAAAGGGAGTGCTCCTAATCTCATCTTGTTACCTGTATAAAAGACACCTGT
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TCTCCAAGGATGTCAGGGACAAGATTGTAGACCTACACAAGTCTGGAATGGGCTACAAGA
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GTGGAGTTGCAACGATCATGAGAACAGTGAGGAATCAGCCCAGAACTACACGGGTGGATC
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TGAAAGTGTTGTGGTCAGATGAGACCAATATGGAGCTCTTTGGCATCAACTCAACTCGCC
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TGACCTCTGACCTCTGTGACTGCCAACAAGGGTTTTGCCACCAAGTACTAAGTCATGTTT
TGCAGAGGGGTCAAATACTTATTTCCCTCATTAAAATGCAAATCAATTTATAACATTTTT
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GAGTGCATTAAAATTGTGTAACGCACATCCTGTTTTACCACAGTCACTTGCCAGCATTGA
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TTCGTTATTTTATATACGGGTCGTTAGATCTAGAATTCTGCCCGCTGTAAATCATGCACA
GAGATAAAGTAGTGCGATAAGATTATATTTATTTGAATGGATTTGTAATAAATAGTTATT
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TCTGTTAAATTGTGTATTTTCAAATAACAAGCATTCAATAGACTAACTAGATTTGTTTCT
GTTTTCTTATTTTGTACACATGATTTAATGAACAAAATTAAATAAAAGATAATCATGTTG
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AAAATTGTTTTGAATGATCAACCTAATGCTGTTATTAGAGGATTTCACCATGTCAATATG
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TTTGTTTACTATGCTAACACAGGACTTATCATGTGTTGCTGCATAGATTCATTTTGTCCT
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TAAAGCATGAGGAGAGCTAATGGGATGCTAATAAAGGCATGTAGAGGAAGACAGGAAAAG
AGAAAGGGAGGGAGCGGGTGATAGGAGGACAGCAGGAGTGAGGAATAGAGAAGCAGATGG
AGGGAGTATGTCAGCAGATGGAAAATTGCAACATGAGCAGTAAACAGTGCGTGCAGCAAA
AAAAGGCTGATCATTGTAGGGCTATTTATAACTGTGATTTCGTACTGCCTGAAGGAGCTG
TACACCCACCTGGTTCAAGAGCTGAAGATACTGGCTGATAGCCATGGAGAGAGACTGCTG
CATACGCCACATAATCCCATATCACTGGGTGAGACATGCACACACTGATAGAAATCTGAG
AGCTGGAAATCAGAGGAAACATGAACCTAAATGATTCTAGTGATTTTATTCTTGCTTAAT
CTTATTAAGGGTATTCACATTTTTCTGAATTGCTGTTTAAATACTGCAGACTCATAGGCC
AGTTTAAGTTGGATGTCACGGGGGGAATTCCTTATATAAAAGTGTAAAATATTACGTAGT
GTGAAGCAGTCATCATTTCAAGTCTGCAGCAAAACACTGTCACCCACCGCATCACTTATT
TCCCTGTGAAAGTTATCGTATGTCAGTCAAGTTAGCGAACTGACGATAAAATACATTTTT
GTGCTTTAAAGGCTTTTGTCATTTTGTCCTCCTCAGCTATGTCTCTGGATGCTCTTCAGG
CTAACTGTGATAAAGCCATTACCCAGCTGGGCTCTATGCTCTTCACCAGGCAGGTGTCGG
GAGCCAGGTGAGCTTTTTCTGCCTACTGCGCAGTCCTGACCAAAATATGCGTTATATTTT
CATTCCCACTGTAGTCGACCTTTTTCCTCAATATTATACACTATATTCCTATATTATCCT
AATTAAACACTTGTTAATATACCCAAGTTAAGGTTAAGATATCCAAATGTGTTGTTCTTT
CTACAAATTCTTGATTTGAATATTAATGATTCAACCTCTTCATTTATATCAACTCTTTAA
ACTCCTACCTTTTTATTAAAGTTATTCATTATAACATACTGTATTATTTTCTACTAATAC
TATAGTATTATATATTACTATTAGAATATATTATACTATATAGTCTATCTAGAGTGCAGT
TTCTAGGTAAAGATGTAATGTAATGTAAGTGTGTGTAAGTGAGCATCATCAACAGGTCCT
AAAGGGTTAAGTTTCCAAAAGTTTTTTCCACATTATATTTTCCCGCAGTAAGAACCAATT
TCAGTTCACGGTGGATATAGAATGGATAAACTGCTGAATTGCATATTAATGTGAGGGCTA
ATTTAGTATTAATGAAGGGATTTAGTATTGCTGCCCAGTTTCATAACTGCAAGTGGAGCT
CTCTTTCTTATGTCTTGCTCTGCGGCAGTGATGGAGATACATAAATATTTTTGTTATCAT
AAATAACTTACTCAAGCGATTCCTGCTGTATCTTTAAATTTGTTCACCACTAATGTTTTC
TATTAGCAATTTTTATGTTGTCAAAAAAGCACCAGTTTGTCCATATAAATTCTTCTTCTT
TTTGTTTATAAAATAGTTCTTTTTTTTATAATGCAGCTAATCTGGTGCACTAGTCATTTT
TTCTTGGTGTAAGTGTATTTGCTCTGTGTAGAATTAATCAGTTTCATTAGAGATAACAGT
ACACTGCATGCAAACATCATTAATCCAAATGACAAATTTAAAATCAAATTAAAAATCACC
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CACTTTTAGTGGACTTCTAATAGATATACTAATGTGTTCTGCGCTGTGGTAGTCATGATT
GAGTATATTTAGAGCCATTAAATCAGTGAATTTTCAAAGCTGTAATATTTAAGACTAATT
ATGCGAGACTATAACGTGACTCTTTTTTTTCTATGATTATAATTATATAATTATTAAGAT
AATTTTGTTAGCCACACAAAACCTGACCATATGTCTTTATTCTGTTTTGAATAATAAACT
GTGTAATAAATTTACCTAAAAAAAAAATCTGTAGATAACAGTATAATGCACAGAAGCACC
TAAAACTTTATCCTTATCATGAAACTTAGGTTTTGAATATGCAAATTGTGAATACATCCA
CTCACGTCCTCTGGCTGTATTTCCATATTAGAACACGGCAAGCTGTTGTATTTTTATGGT
GCAATAACTGTTCTCACATTCAATATTAACTCAGATCGAGCTTTTCAGTTCCCCCATGTT
GCAAACCTGCAGTAGTGATGATTTACACACTTTGAGCAGTCAATTGACTCAAGTTAAAAA
GGACTCGATTGTAAAAACATTTAAATTGATATTTACAGCATTTTTTTTACAGGCACACCG
AACCAGAGCAACTTTATAGAAGTGCTTTGTAGCCTCTATATAAATAAAAAAACAAAAACG
CACATCTTCATGCTAATTCATGAGGTCAGGGACTAAGAATACCATCGAGCTAAAACCATG
TTGGGGGAGTTTATTACAACATGAACACAAGATAAGTTTTATTATGTATTTATTTATTTA
TTTATTAAATAGAAGTGTTAATACGAGTGCTTGGTGAGTGGTGGTTCTTCTGTCTTCATT
TGAAAACAGCCAGGTGAAGTTCATTTCACCACCTGGGTGCCAGGACGGTAAAGATTCTTG
ATGTATGTCTTCCTTATACCTTGTGGGCTGGTGGGTTAAGCGTTGCTAGAGGCTCGACAT
GATTGAGGTGCAGTGCAGGGTGTGATGAGTGCCTACAGTGCATTTTTGGCTTGCAGGATT
ATACTGGAGCCAGTGGAATTAACACAGTATCAGGGTGGTGTGGGAGAACTTGGGGAAGGT
TGAGTCTTGCAGATCTGTTCTGCATCAGGTGGATACTAGGGCAGACCTACACAAGAGACT
GAACAGGCATCTGATTGGCCACTATGGATAGAAATAGCCAGATCCTCCTGATGTTACAAA
GGAGAAATCTGCATGACTGAGTCTGAGGTTAGCAATGTGACACAAGAAGAATGTCCAGAA
CTACTCTAAGGTTGCGTGCAGTGTCAGATTGTGTGATCTGAGAGTTGCCGAGGAAGATCA
CAAAATATTGACATGGGGATGCATCTCCAGGGATGTACAGCAGCTCAGTTTTGCTGGGAT
TTAGTTTCCGCTGATGAGCTGCCATACATGATGAGATGTCCTTAATTAAAATACTGTTGA
TCAGAGTCCCAGCTTAATTTAATTGGAATTCACTGCTCTGTGAAATACTGTGAGAATCTG
TTTTTTTCAGCTAGCTTTACAGAGTAGCTGCGGCTGTCCTAAAATAGCTAAAACGGCATA
AAAATCAATTTGACTAGAATGTTTATCCAGCTTGGTCATTTCAATTGCACCTGTCTGAGC
TAGTGATGAAAAGATGTATGTTTGGACTAACAGAGAGCGACTCTTAGGATCTTGATCGAA
GCCCTTAATCCTCATAAGCTTGGATTGTGTTTTCTCTCAGTTGGAAGCCACTTTGGGGAA
AAAGATTCTGACAAATATGCTGTAAATATATTTGCTTCTACTCTTAAAATAAAATTCCTT
CTACTCTTCTTTTTGCAGGTTGATTTTACAATCACGTTTTGACATCCATTTAAAAGAGTG
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ACCAGAAAAGACGTG
Chart Advanced