SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00003255_2.0
Identity
TranscriptThioredoxin reductase (TR)
SpeciesIctalurus punctatus (Channel catfish)
Transcript IDSPT00003255
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00003133_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00003255_2.0 # Transcript # Thioredoxin reductase (TR) # Channel catfish (Ictalurus punctatus) # Full length # Forward
ACAGGATCGTTTGATTATGACCTGGTGGTTATCGGTGGTGGATCTGGAGGTTTGGCGTGT
TCCAAAGAAGGTATATACAGGAGACTGTATATTTAGTAAAATATCTGAGTGTTGTGTTTC
CGTGTCTCGGTTTATTGTCCAGTTCCTACACGGTGCTTCTTACAGACTAAAGTACACACG
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GTCTGTCTGTCTCAGTTTAATTACTTCTGTTCAGCCTGTCAGTGATGGAAAGAAAATTAT
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TCGTTATCGCTCGGACGTTCCTACATGCGCACTGACTTCAGCAGCTTCGGAGGATGATTT
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CACCTTCTTCTTCACCTCCACCTTCTTCTTCACCTTCTCCTTCACCTTCTTCTTCTTCTT
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TTCACCTTCTTCTTCTTCACCTTCTTCTTCTTCTTCACCTTCTTCTCCTTCACCTTCTTC
TTCATCTCCTTCTTCTTCTCCTTCACCTCCTCCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCACC
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ACAATTACACATATTTTAATTTAAATGTTTACACGTCATCATCATTTGACTAGATTCCAT
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TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATCTCGCATGCGAACATAAAGAGCAAACCGCAGCGT
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AGGGGACGTGTTCATCACCGGCTCAGGATGCAGCAGGGCTCTGAGGGTCGCCATATTCCC
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CGGAGTTTATTTATTGGCAGTTGAACGATGTTTCCCTGAAAGCCGATGATGATGATGATG
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CTCTGATTTTCTTTCTTTATTTTTCTCTCTCTGTCTCTCTCTGTCTCTGTGTGTCTGTGT
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TGTGCAGATGTTTTGTTCAAAGAAAAGATTTTGAATGAGAAAATGGTTATCAAAACATAC
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GGATGACTGGCCACACCTCCTTCATTGATTTTGATTTGAGAAATTCATTGAATATAGTAA
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ATTACAGTAAAGCTCTGATTGCAGGTCGAGCTCCTGAAAGCGGAACACTGAACTTGCAGC
ACGTCGGCGTTGAGCTCAACACAAACACGGGCAAAATCATCGTAGCTGATGATGAGCGAA
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ACACACACACACACACACACTTCTTTCTGTCTATCTGTCTCACAGACTGATGCAACCACC
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TCTTTGTCTATCTGCCAGTCTCTACCTGTCTGTCTGCCCATCCCTCTGTCTCTCTCTGTC
TTTCTGATTTCTCTCTCTCTTTCTCTGGCTTGTATTCTGTCTGTTCATCTTTCTCTCACG
CTCTCTGTCAGTCTCCGTCTGTCTGTCTGTCTCTTTCTATCTCTCAGCCTGTCTCTGAAT
ATCTGTCTGTCAGTCAGTCTTTGTCTACGTGTCGGTGTAAGTCAGAGTGCTGGAGTGTTT
GCCTGCAGCTTTTCCCCTCTCTCTCTCTCTCTATCTATCTAATCCGCAGTATGACTGACA
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CGCACTTTTGGAGTGTGTTTGATTTGTCCGATAAAAGTTTTCACTTTTATCTTCACTGTA
TCCTTAATCCAGTGGATCCATCAGATTATTAGTCGCTGTTCCACAATAAGCTTTATACAG
TATATGTATCAGTATATGCTCATGCAGGTGCATCAGTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
GTGTTTCAGGGTCGTCCTGAGCTCACCCCGACGGCCATCAAAGCGGGTAAACTCCTGGCT
CAGCGATTAGCCGGTCACTCCAACCAGCTCATGAACTACGACAACGTGAGTTCAACAAAG
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GTGTGTGTGTGTGTGTCAGGTGCCCACCACAGTGTTCACTCCTCTGGAGTACGGATGTGT
CGGTTTATCCGAAGAAGAGGCCGAGAGGAGATACGGCAGTGACAATATAGAGGTACGACA
AACGTTGTGCGTTTCCTGGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACATGCATGC
TTACACACACCAGCCCTCTCACACCTGTGCATCAATGAATCCCGAACCCTTCTCCAGTGA
CTGACAGCTGAGTACAGGCTCTGATTGATGCGCGCTGAGCCCGACGACAGACGGGCGCCA
GTCAAAAGCGCCGCCTGCGATCGGCCGTGACAGGTGCGCGTCTGCGTCGGGGCTGCCTGC
ATCGGCACGCGGTTTTCTCTTATTGATGATTCGAGCGGGAAGGTGGGGGTGGATTGGGGG
GGGAACACATTATGAGAGCAGAACGTCCTTGAAGGTGGCGAAGAAAAAGAAACGGCCAAA
AACGTCCTGCCTGAAGAGGTGGGATGATGGTTAACTGTCAGGCGTGCCAAAACAAACAGA
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TAACAAATTCCTACGTTGTGCTGATCTTCACCACTGCTACGACTGTCTGGGAAAACAGAT
CTCTCAGTGGAGTTTCGAAAGCGAACGCCGTGGTTTTTGTCAATTTTTTTATTTTTTTTT
CTTTCTTTTACAGAGCAGTCAGAGAGGACGAAGGCAACATGGCTGCTACTAATGAATCAG
TATTTCTTCATGAAAAACAGTGAACTGTATTGTAGTCACGTGAACGTCTGTATGTTGATT
GTACACAGTTCTGGCATCATCTGATCAGATTTATACTTGGTAGCTTAATTGCGATTGGTT
TAACCGCGGTCTGTGGCTTACGGGGGCGTGTCGGAGAGTGAATCGGCACTAATGTATACA
ATAAAACACATCATCGTTAAACAGTGTTTTTGGTCATTTTAATATCCAAAGTTCTTATTA
TTCTTATTTTGGTTGCCAGGTGTATCACGCCTTTTACAAACCTCTGGAGTTCTCCGTAGC
CGAGAGAGACGCCAGTCAGTGCTACATCAAGGTGAGGACTAGGAGATTTGTATTCAAAGT
GCATCCGTGTGTACGTGTATATAACACCTTTTGCCATCGTTCCGTCAGGTGGTGTGTGAG
CGGGAAGAACCGCAGCGAGTGTTAGGGCTTCACTTTACCGGCCCCAACGCTGGAGAAGTG
ACCCAAGGCTTTGCGCTCGGCTTCCAGTGAGCGTTTCCGTCCTCCTTTCCGTTGTCTTGT
GTAGCATCTGCGACATTTGGGGTTTGTGGGTGTGGCCTGTCCAGCCTTTGATGAGAGAGC
TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGTAATTACGCCCTAACGCCA
CTCTCACCAAATGTCTAGCAGCTAAAACAAGGCTGATGTATGTTATTTGTTTGCTACGAG
TCCATCTCACCCAGAATCTTTTCTCTACTGATATTTCATGGCCAAACAATCGCTGCTGTT
GTGTTTTTTTTTTTTATTTTTATTTTTTTTTCCTTCTTCAGTGAAGTGAAAGCTCTAAAT
CTTCAGAAGTTAATCAGTTCATCGGTTAAGACCGTACTAGCATAAAGCTAAACATGGACA
CTCTGGACACATTTCGCCAGACTTTGTGGTTTTTTTTACGCCGGTTGTGTTGTTTTGTTT
TGTTTTCTTCGCAGGTTCGGGTTCACGTACTCTCAGCTACGCGATACGGTCGGTATCCAC
CCTACGTGCGCCGAGGAGCTCACCAATCTCCACATCACCAAGCGTTCCGGTCTGGACGCC
ACGGTGACTGGCTGCTGAGGTTAAACCCCCTCCCTACCTTAAATACGCCGAACACACGGA
CCCAAGAAAGGAAGCGATGTCATGCTCGTTTAGCGTCGTCCTCTCGTTTTCGGGTTCGTC
TCGGCTGCGGCCTGTCGTGACCTTTTGACCTCTCTAGTCTCAAAGAGCACAGTGTTAGGC
AGTCGACTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAACGTTCCT
GTAGACGGACCGCTCCGATGCTTATCAGTCGTTTATTTATTTATTTATTTATTTTGTTTG
GTTTTTATTTTATTTTTTAGCTCCATGATAACGCAGTAAGACTCTAGGGGAGCAGCAGTA
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